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供体来源的游离 DNA：有吸引力的生物标记物寻求使用环境
寻找用于肾移植监测临床应用的生物标志物有时似乎是一项诱人的折磨。关于供体来源的游离 DNA (dd-cfDNA) 在移植后监测中的潜在应用的第一个暗示可以追溯到 25 年前 [ 1 ]。dd-cfDNA 主要在细胞死亡时由供体组织细胞（移植物细胞或移植物内的供体造血细胞）特异性释放，与移植物状态紧密相关，因此是一种很有前途的非侵入性生物标志物（图 1 ）。更全面、可扩展的 DNA 测序技术的进步，再加上 cfDNA 的易获取性和较短的半衰期，为开发用于测量移植接受者血浆中 dd-cfDNA 的商业化检测方法铺平了道路。在过去 10 年中，在证明了分析的稳健性之后，这些检测方法已在肾移植接受者的临床实践中得到验证，并始终证明血浆 dd-cfDNA 水平与移植物损伤之间存在显着相关性 [2-5]。这些有希望的发现促使临床采用 dd-cfDNA 检测来监测美国肾移植接受者的移植物排斥和损伤的发生情况。这得益于 2017 年的医疗保险报销以及多家商业支付方的积极承保决定。然而，在欧洲，dd-cfDNA 检测在临床实践中的应用
使用环境DNA 在生态系统中测量所有生命形式的生物多样性的一种新的突破方法
通过将来自多个季节性样本的Edna片段序列与来自所有已知物种的大型参考序列数据库进行比较，研究人员能够检测到整个生命之树的生物。他们估计，奇利卡泻湖的总分类学多样性在整个生命之树中约为1071个家庭，包括大约799个真核生物家族，230个细菌家庭，27个古细菌家庭和13个DNA病毒家族。研究人员还发现，生态系统中不同位置和季节的生物家庭的相对丰度差异很大。这表明该方法还可以帮助监视跨空间和时间的生物多样性的变化。
使用环境DNA可以更好地告知围绕近海石油和天然气基础设施退役替代方案的决策
人造礁被全球用于帮助自然资源管理，保护，恢复或创造独特的海洋栖息地。讨论了人造礁的最佳建筑材料和设计，对生物社区的影响以及由此产生的生态和社会益处的讨论。本讨论还包括重新利用的海洋基础设施的生态价值，例如退役的石油和天然气平台。平台通常具有数十年的运营寿命，在这时他们可以开发广泛而独特的社区组合。通过重新利用石油和天然气平台来创建人造礁石可以具有生态，经济和社会学优点。但是，由于需要在全球范围内退役的12,000个平台，因此需要对与这些平台相关的生物社区进行整体评估，以告知不同退役方案的潜在结果。我们在泰国湾（GOT）的八个平台和附近的五个软泥沙栖息地位置，使用水，生物量和沉积物样品的环境DNA元法统计（EDNA）来普查。我们在平台上（浅，中，深，深，深，深，深，深）采样了三个目标深度，并在平台上检测到430个分类单元，与中（30 m收集深度； 261个分类群）和
使用环境DNA分析技术的淡水鱼类调查方法
综合分析方法（MIFISH方法）metabar缩合分析等。物种识别等。物种特定检测实时PCR分析等。成本（每个样品）约20,000至40,000日元 *3约30,000至50,000至50,000日 *4 *1参见试验调查（环境环境部工作部）。 *2监测站点1000湖：请参阅《淡水鱼类调查手册》。 *3尽管主要重点是分析成本（阅读），但数量取决于分析公司（分析结果的检查是单独的成本）。对于特定于物种的检测，
2023年1月18日，使用环境DNA（E-DNA）
海带修复是Ocean Wise的Seaforestation计划的主要支柱。Ocean Wise和Canadian海带资源（CKR），Rendezvous Dive Adventures共同努力，在Barkley Sound的Rainy Bay建立了海带恢复示范地点。具体来说，在2021年后半段，CKR在雨湾生产和植入了三种海带的绿色砾石。研究物种包括：巨型海带（大环藻），公牛海带（Nereocystis luetkeana）和Sugar Kelp（Saccharina latissima）。该实验的成功将在2022年和2023年进行评估，重点是了解海带恢复的生物多样性益处。我们在加拿大温哥华岛的Barkley Sound中使用Edna为此目的。与潜水样品相比，我们在这里评估了该方法的有效性和效率，以鉴定物种组成。
使用环境了解非马克维亚开放量子系统
在模拟开放量子系统时，追踪自由度是必要的程序。是推导可拖动的主方程的重要步骤，它代表了信息丢失。在系统之间存在强烈相互作用的情况下，自由群体的环境程度这一损失使得理解动态具有挑战性。这些动力学在孤立的情况下没有时间 - 局部描述：它们是非马克维亚语和记忆效应的诱导复杂的效果，这些复杂效果很难解释。为了解决这个问题，我们在这里展示了如何使用任何方法计算的系统相关性来推断高斯环境的任何相关函数，只要系统与环境之间的耦合是线性的。这不仅允许重新构建系统和环境的全部动力，而且还可以为研究系统对环境的影响而开放。为了实现准确的浴缸动力学，我们利用了模拟系统动力学的数值精确方法，该方法基于代表该开放量子系统的过程张量的张量网络的构建和收缩和收缩。使用此功能，我们能够准确地找到任何系统相关功能。为了证明我们方法的适用性，我们显示了当耦合到受阳性驱动器的两级系统时，热量如何在波音浴的不同模式之间移动。
使用环境 DNA（eDNA）来评估存在...
关于合作者科学系列：合作者科学系列丛书于2013年启动。其目的是促进研究项目报告的归档和检索，主要是由美国支持的调查鱼类和野生动物服务（FWS），尤其是野生动植物和运动鱼修复计划。选择了在线格式，以立即访问FWS，州和部落管理机构，保护界以及整个公众的科学报告。本系列中的所有报告均经过与进行研究的机构和实体一致的同行审查过程。对于美国地质调查局作者，同行评审过程（http://www.usgs.gov/usgs-manual/500/502-3.html）还包括局在传播之前的批准官员的审查。提供这些报告的作者和/或机构/机构对其内容完全负责。FWS不提供这些报告的社论或技术审查。本系列报告中的评论和其他信件应针对报告作者或机构/机构。在大多数情况下，本系列发表的报告是以当前或修订的格式出版的，在同行评审的科学文献中。在科学文献发表之前进行进一步的同行审查或其他数据和/或分析后，可以修改报告中包含的数据的结果和解释。合作者科学系列得到了西弗吉尼亚州Shepherdstown国家保护培训中心FWS的支持和维护。101-2013。该系列依次编号为参考的出版年度，并从报告号FWS已将其他各种编号系统用于类似但现在停止的报告系列。从编号101对于当前系列而言，旨在避免与早期报告编号的混淆。使用合同的研究机构和机构，贸易，产品，行业或公司名称或产品或软件或模型（无论是否商业上）仅出于信息目的，并且不构成美国政府的认可。合同参考：本文件符合美国资助的研究报告要求鱼类和野生动物服务避难所（G15AC00021）。先前发布的文档，该文件在适用时会在其中一部分履行本合同的任何部分。（USGS IPDS＃：IP-106157）。推荐引用：Brewer，S。K.，J。B. Mouser和R. van den Bussche。2020。使用环境DNA（EDNA）评估Ozark高地洞穴中的洞穴鱼和小龙虾种群的存在。美国内政部，鱼类和野生动物服务部，合作社科学系列FWS/CSS-135-2020，华盛顿特区
使用环境DNA的研究人员必须在道德上与土著社区互动
环境DNA（EDNA）的分析是一个快速发展的研究领域，其生态学和保护生物学1 - 4。从环境样本（例如水，土壤，空气或沉积物）中提取遗传物质，可以提供有关人，环境以及与其他物种的相互作用的当前和历史信息。许多环境样本是从土著土地上的沉积物，水和其他材料中合法收集的，没有广泛考虑这些发现可能影响土著传统所有者和知识持有人的情况。考虑到可以在某些环境样本中保存EDNA的数千年5 - 7，这些考虑可能尤其至关重要。土著人民经常被排除在遗传研究之外，部分原因是道德犯罪的历史以及与研究人员缺乏信任关系9 - 11。尽管土著社区与遗传学家之间的合作正在以增强的道德监督发展，但这并未扩展到源自Edna的新颖道德，法律和社会含义上。由于环境样品可能包含来自许多不同生物体的DNA，因此研究人员选择范围或广泛地瞄准其测序工作。越来越多地，埃德纳（Edna）的研究正在摆脱针对特定有机体的靶向和扩增子研究，而朝向全基因组或shot弹枪测序方法，这些方法可以揭示样品8中存在的DNA的总多样性。这种不加区分的方法提出了关键的道德问题，尤其是在土著环境中。在澳大利亚等定居者的环境中，土著人民被边缘化，被剥夺和