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World File Search System克雷伯
银纳米颗粒的进展
采用情境化和特定于应变的风险评估范例对于在众多行业和应用中持续开发和安全地使用微生物，尤其是细菌至关重要。将细菌物种标记为有害或有益的一种过于简单的方法不适合其与宿主和其他微生物的相互作用的复杂性，在这种情况下，朋友，敌人和无辜的旁观者之间的界线通常不清楚。在人类微生物组研究中已经描述了许多这种细微的关系，这说明了定义细菌安全的固有挑战。任何有效的风险评估框架都必须考虑细菌的利基和环境，拟合度，宿主健康，暴露路线和范围以及应变表征。克雷伯氏菌Vaiicola是一种在世界各地分离的重生土壤细菌，一直是对环境和临床方面越来越感兴趣的主题，并且在商业上已用作数百万英亩的农场。在这里，我们回顾了其人群结构，在临床和环境环境中的相关性，并根据所述风险评估框架作为生物培训剂。
项目详细信息项目代码MRCIIAR25EX Harmer头衔开发针对最危险的抗生素抗生素细菌研究主题
项目详细信息项目代码MRCIIAR25EX HARMER头衔开发针对最危险的抗生素抗生素细菌研究主题感染，免疫，抗菌抗性和维修摘要抗菌抗菌耐药性是一个日益严重的社会问题，在2019年造成了约5,000,000,000件死亡，2019年。最高优先细菌是埃斯卡普病原体，其死亡率和发病率占一半以上。该项目将通过在蜡蛾梅洛内拉（Galleria Mellonella）中开发新的体内Eskape病原体感染模型来有助于抵抗抗菌耐药性。这些将用于测试我们的新型化合物，使细菌更容易受到常规抗生素的影响并促进化合物的进一步发展。该项目将加速我们的化合物的开发，并为抗菌发现提供新的体内模型。描述所谓的“ Eskape病原体”（肠杆菌，金黄色葡萄球菌，肺炎克雷伯氏菌，baumannii acinetobacter baumannii，Pseudomonas铜绿假单胞菌，铜绿和粪肠球菌）是最严重的严重的抗抗菌抗菌抗抗抗菌剂。在2019年，据估计，全世界有超过3,000,000人死亡与这些细菌的抗菌素抗性菌株有关。如果没有新的治疗选择，可能会继续增加死亡人数，并可能使某些现有的医疗程序不可行。提出的一种方法是开发增强的药物，以削弱特定细菌的辅助功能，使它们更容易受到常规抗生素的影响。这些在药物发现的铅开发/铅优化阶段，需要在整个生物体中证明这种方法的有效性。对于学术项目而言，情况尤其如此，因为如果没有这些概念证明数据，这种药物开发将无法提供资金。模型有机体Galleria Mellonella已被用作感染的模型。Galleria幼虫很便宜，容易饲养，并在鼠标中复制结果。急性感染和慢性感染都可以建模，并且可以通过预防和感染后进行治疗。埃克塞特大学的Galleria Mellonella研究中心已经开创了Galleria的基因工程。重要的是，这提供了对荧光标记的幼虫的访问。将它们与细菌的标记结合在一起，可以通过成像流式细胞仪的幼虫血液抑制仪高效地检测感染进展。但是，这仅证明了少数细菌的感染。我们开发了抑制巨噬细胞感染增强剂（MIP）蛋白的化合物，几乎所有感染细菌都发现。我们的化合物显着增强了针对肺炎克雷伯氏菌的小鼠的护理抗生素标准。他们对许多细菌表现出强大的有效性（例如baumannii a acinetobacter，Neisseria Gonorrhoeae，Burkholderia pseudomallei）在基于细胞的模型中。我们希望这些化合物将对所有Eskape病原体显示出与护理标准的共同治疗的有效性。
猪精液中耐多药细菌的生长动态和杀精作用阈值
摘要：本研究的目的首先是检查在为期七年的精液监测计划中，精子质量下降与细菌相关的普遍性，其次是研究四种不同的耐多药细菌的生长动态及其对精液储存期间精子质量的影响。在来自精子中心的 3219 个样本中，0.5% 的样本因细菌污染而导致精子质量下降。在添加了粘质沙雷氏菌和产酸克雷伯氏菌的样本中，在 17 ◦ C 的温度下储存时，细菌生长了六个对数级，导致精子活力、膜完整性、膜流动性和线粒体膜电位丧失，>10 7 CFU/mL（p < 0.05）。在 5 ◦ C 的 Androstar Premium 稀释剂中储存可有效抑制它们的生长。木糖氧化无色杆菌和洋葱伯克霍尔德菌在 17 ◦ C 下生长受限，最高可达两个对数级，且不会损害精子质量。总之，精子可以耐受中等量的耐多药细菌，低温、无抗生素的精液储存可有效限制细菌生长。应重新考虑在精液稀释剂中持续使用抗生素。
评估益生菌在堆肥床上用品中的使用用于饲料奶牛
当您想用具有优质基因型的动物增强生产时，奶牛的饲养场将被广泛使用。饲养场系统（如堆肥谷仓或游离摊位）可能是由于床上用品的高湿度以及引起乳腺炎的微生物的存在而有害的。这些因素可能会损害奶牛的健康，然后损害产生的牛奶的质量和数量。这项研究的观察性是为了消除益生菌对饲料奶牛堆肥床中温度，相对热度，总细菌计数（TBC）和微生物培养的影响。这项研究是在巴西南部的四个奶牛场进行的。三个农场使用堆肥谷仓系统，一个农场使用了自由失速系统。在六个星期内注册了相对湿度数据，环境温度，床温度和床TBC。它被完全随机的设计，两种治疗方法（无益生菌）和四个通过治疗复制，随着时间的推移重复测量。益生菌在奶牛床上的应用不会改变TBC，温度或湿度，平均值分别为38,042 x 1,000 cfu/g，26.9ºC和61,2％。益生菌的使用减少了一些微生物的数量，例如大肠杆菌，青霉和s。dysgalatiae，并增加了阿尔塞氏菌的数量为克雷伯氏菌和trichoderma。
厌氧生物反应器中四溴双酚A降解菌的蛋白质组学鉴定
四溴双酚 A (TBBPA) 是全球使用最广泛的阻燃剂，已成为水生生态系统的威胁。先前对这种微污染物在厌氧生物反应器中的降解的研究已提出了几种假定的 TBBPA 降解剂的身份。但迄今为止尚未鉴定出在原位条件下主动降解 TBBPA 的生物。蛋白质稳定同位素探测 (蛋白质-SIP) 已成为微生物生态学中的一种尖端技术，用于在原位条件下将身份与功能联系起来。因此，我们假设将基于蛋白质的稳定同位素探测与宏基因组学相结合可用于鉴定和提供对 TBBPA 降解生物的基因组洞察。已鉴定的 13 C 标记肽被发现属于植物杆菌属、梭菌属、芽孢乳酸杆菌属和克雷伯菌属的生物。对已识别标记肽的功能分类表明，TBBPA 不仅通过共代谢反应转化，而且还被同化到生物质中。通过应用标记微污染物 (蛋白质-SIP) 的蛋白质组学和宏基因组组装的基因组，可以扩展目前对废水中 TBBPA 降解剂多样性的视角，并预测假定的 TBBPA 降解途径。该研究为活性 TBBPA 降解剂和哪些生物有利于优化生物降解提供了联系。
与牛津纳米孔测序和甲基化诱导的误差的降低的准确细菌爆发
我们的研究调查了牛津纳米孔技术的有效性，通过重新陈述33个长达3年的克雷伯氏菌肺炎爆发的33个分离株，并以Illumina的短阅读测序数据作为参考点。我们通过对牛津纳米孔技术测序的基因组进行CGMLST和系统发育分析检测到相当大的基本误差，从而导致从暴发群集中错误排除某些与暴发有关的菌株。附近的甲基化位点会导致这些误差，也可以在肺炎K. k. tneumoniae以外的其他物种中找到。基于这些数据，我们探讨了基于PCR的测序和掩盖策略，这些策略既成功解决这些不准确性，又可以确保准确的爆发追踪。我们将掩盖策略作为生物信息学工作流（MPOA），以无参考的方式识别和掩盖有问题的基因组位置。我们的研究强调了使用牛津纳米孔技术对原核生物进行测序的局限性，尤其是用于研究暴发。对于牛津纳米孔技术无法等待进一步的技术发展的时间关键项目，我们的研究建议我们基于PCR的测序或使用我们提供的生物信息学工作流。我们建议在发布结果时应提供基于质量的基因组质量基因组。
通过伊拉克国际边界进口的罐头食品的微生物负载
背景：罐头食品可能被微生物污染，主要是孢子形成细菌。本研究旨在提供有关通过伊拉克易卜拉欣·哈利尔国际边界进口的罐头食品的微生物负载的信息。方法：总共有119种包括35种家禽肉，40条鱼类和44种番茄酱的罐头食品样本，从易卜拉欣·哈利尔国际边界收集。使用常规方案，评估样品的总板数（有氧和厌氧微生物），变质的致病性和大肠菌菌生物。通过单向方差分析（ANOVA）起诉GraphPad Prism（V.5.01），对获得的结果进行了分析。结果：在37°C孵育时的总有氧板数为1.30±0.2 log sumoning单位（CFU）/g，鱼类的1.32±0.3 log cfu/g，番茄酱占2.11±0.5 log log cfu/g。另一方面，在肉样品中的厌氧板计数为0.95±0.2 log cfu/g，鱼类的1.08±0.2 log cfu/g，西红柿的评分为0.95±0.2 log cfu/g。枯草芽孢杆菌，肠分裂芽孢杆菌，灌注梭状芽胞杆菌和克雷伯氏菌属。。结论：比家禽肉类产品相比，西红柿和鱼类的微生物相对多。这些数据表明，加工线中的卫生标准差可能导致微生物控制损失。
合成、分子对接、动力学、量子...
摘要：本研究设计并合成了一些新的抗菌化合物，它们是通过苯基桥连接到苯并咪唑环的 2 位上的 2-氨基噻二唑衍生物。通过 1 H 和 13 C NMR 光谱、高分辨率质谱和元素分析鉴定了化合物的结构。测试了合成化合物对白色念珠菌、克柔念珠菌、光滑念珠菌和近平滑念珠菌的抗真菌活性。化合物 5f 对白色念珠菌和光滑念珠菌的活性比标准氟康唑和伐康唑更高。还评估了化合物对革兰氏阳性菌大肠杆菌、粘质沙雷氏菌、肺炎克雷伯氏菌、铜绿假单胞菌以及革兰氏阴性菌粪肠球菌、枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌的拮抗活性。化合物 5c 和 5h 对粪肠球菌的最低抑菌浓度接近标准阿奇霉素。对念珠菌的 14-α 脱甲基酶进行了分子对接研究。5f 是对念珠菌活性最强的化合物，其对接相互作用能最高。采用 100 ns 分子动力学模拟测试了化合物 5c 和 5f 与 CYP51 的稳定性。根据理论 ADME 计算，化合物的曲线在限制规则方面是合适的。 HOMO−LUMO分析表明，5h的化学反应性比其他分子更强（用较低的ΔE=3.432eV表示），这与最高的抗菌活性结果相符。
蛋白质组学研究噬菌体与细菌宿主Klebsiella肺炎之间的相互作用
抽象的噬菌体和细菌已经获得了保护机制。在这种情况下，本研究的目的是分析从肺炎克雷伯氏菌的21个新型裂解噬菌体中分离出的蛋白质，以寻求针对细菌的防御机制，并确定噬菌体的感染能力。还进行了一项蛋白质组学研究，以研究受噬菌体感染的两种肺炎的临床分离株的防御机制。为此，对21个裂解噬菌体进行了测序并从头组装。宿主范围是在47个肺炎的47个临床同核中确定的，揭示了噬菌体的感染能力可变。基因组测序表明，所有噬菌体都是属于Caudovirale s的裂解噬菌体。噬菌体序列分析表明，蛋白质是在基因组内的功能模块中组织的。Although most of the proteins have unknown func- tions, multiple proteins were associated with defense mechanisms against bacteria, including the restriction-modi fi cation system, the toxin-antitoxin system, evasion of DNA degradation, blocking of host restriction and modi fi cation, the orphan CRISPR-Cas sys- tem, and the anti-CRISPR system.Proteomic study of the phage-host interactions (i.e., between isolates K3574 and K3320, which have intact CRISPR-Cas systems, and phages vB_KpnS-VAC35 and vB_KpnM-VAC36, respectively) revealed the presence of several defense mechanisms against phage infection (prophage, defense/virulence/resistance, oxidative stress and plasmid proteins)在细菌和噬菌体中的ACR候选者（抗CRISPR蛋白）中。
摘要。 Amelia T，Liliasari，Kusnadi，Aditiawati P.2023。
摘要。Amelia T，Liliasari，Kusnadi，AditiawatiP.2023。从铝土矿采矿区分离和表征重金属还原的土著细菌。生物多样性24：5096-5104。这项研究旨在隔离，鉴定和表征来自印度尼西亚Bintan Island的Tanjungpinang以前的铝土矿采矿区的某些土著细菌菌株。此外，这项研究的重点是评估这些细菌减少重金属铅（PB）和铬（CR）的潜力。在四个采样点上的重金属浓度，土壤样品作为细菌来源的收集以及实验室评估都进行了生物驱动能力。进行了筛查实验，以使用基本的生长培养基，例如营养琼脂（NA）和富含100 ppm pb和Cr金属的营养汤（NB），以鉴定对重金属抗性的细菌菌株。用原子吸收分光光度法（AAS）分析了重金属的还原，而使用MALDI TOF-MS测定了细菌物种。柯比鲍尔方法的修改版本用于降低毒性测试。两种细菌菌株被鉴定为PB和CR还原器，并表现出对两种金属的抗性。基于99.9％的相似性值，分离株被鉴定为阿甲基芽孢杆菌（分离株A）和肺炎克雷伯氏菌（分离株B），将PB降低了约72.7％和34.5％，CR分别降低了87.4％和86.2％。结果表明，富含金属的培养基的毒性降低，在孵育三个小时后，细菌生长，但在21小时后没有毒性。