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![植物生物技术 37: 20.0404b (2020) [adv.pub.]](/simg/7\79f64403bd75f8328112fa08a0b4888c68c1ea25.webp)
植物生物技术 37: 20.0404b (2020) [adv.pub.]
摘要 利用 CRISPR/Cas9 进行基因组编辑对普通小麦非常有用，因为普通小麦具有异源六倍体的特性，并且可以同时在三个同源基因中诱发突变。虽然农杆菌介导的转化在基因组编辑方面具有优势，但它在小麦中仍然效率低下且需要相对较长的时间。因此，使用具有高效体内诱变功能的向导 RNA (gRNA) 是在短时间内产生基因组编辑突变系的关键因素之一。在本研究中，我们针对普通小麦中的三个基因，建立了一种快速检测由基因枪瞬时表达系统诱导的突变的方法。在未成熟的小麦胚中实现了 gRNA 和 Cas9 的基因枪瞬时表达。一周后使用 PCR-RFLP 检测到突变，并通过基因组克隆测序进行验证。我们确认了几种类型的突变，这些突变的发生率取决于靶序列。此外，在农杆菌转化的植物中，以较高速率编辑的靶标处的突变频率往往更高。这些结果表明，这种快速检测编辑突变的方法可用于多种应用，例如筛选目标序列或修饰载体以实现小麦中有效的 CRISPR/Cas9 基因组编辑。
本格拉海流大型海洋 - ais.unwater.org
本格拉洋流大型海洋生态系统 (BCLME) 位于非洲西南部海岸，从南赤道好望角东部一直延伸到安哥拉北部地缘政治边界附近的安哥拉前线（见图 1）。它涵盖了世界四大沿海上升流生态系统之一，位于海洋的东部边界。与洪堡、加利福尼亚和加那利系统一样，本格拉是海洋生物多样性和海洋食物生产的重要中心。BCLME 独特的水深、水文、化学和营养动力学使其成为世界上最富饶的海洋区域之一，年平均初级生产力为每平方米每年 1.25 克碳 - 大约是北海生态系统的六倍。孟加拉湾海洋生态系统的高初级生产力水平支撑着全球重要的生物多样性和浮游动物、鱼类、海鸟和海洋哺乳动物的生物量，而近海和离岸沉积物中则蕴藏着丰富的珍贵矿物（尤其是钻石）以及石油和天然气储量。沿海地区的自然美景也使一些地区旅游业蓬勃发展，其中许多地区以全球标准来看仍属原始状态。然而，工业污染以及规划和管理不善的沿海开发和近海活动正在导致脆弱的沿海栖息地迅速退化。
易转化普通小麦品种‘Fielder’的染色体规模基因组组装
我们已为六倍体普通小麦品种“Fielder”建立了高质量的染色体水平基因组组装，Fielder 是美国软质白色糕点型小麦，于 1974 年推出，以易受农杆菌介导的转化和基因组编辑而闻名。使用 HiFi 方法的 PacBio 环状共识测序获得了准确的长读序列。使用 hifiasm 组装器组装的 16 个 SMRT 细胞的序列读数产生了 N50 大于 20 Mb 的组装体。我们使用 Omni-C 染色体构象捕获技术将重叠群排序为染色体水平组装体，得到 21 个伪分子，累计大小为 14.7，未锚定重叠群为 0.3 Gb。对含有已编辑的种子休眠基因 TaQsd1 的转基因小麦植物的已发表短读段进行定位，确定了转基因插入小麦染色体的四个位置。在伪分子中检测向导 RNA 序列为脱靶突变诱导提供了候选。这些结果证明了使用 PacBio HiFi 读段进行染色体规模组装的效率及其在小麦基因组编辑研究中的应用。
认知增强蓝图（BDNF 指南）
● 提高 BDNF 水平的最佳持续时间：长时间（约 40 分钟）中强度至高强度运动（至少达到最大心率的 65%）对年轻健康男性的 BDNF 水平影响最大，比运动前高出近三分之一。然而，在大多数研究中，30 分钟的运动相对常见，似乎足以引起持续（24 小时）的记忆力改善。● 短期飙升，长期影响：运动后 BDNF 水平的上升是短暂的，通常在运动后不到一小时。然而，长期影响是相当大的，动物研究表明，运动会增加大脑中的神经发生。 ● 高强度骑行比长时间骑行更能增加 BDNF：六分钟高强度骑行间隔（6 个 40 秒间隔，100% VO2 峰值）使循环 BDNF 的每个指标比长时间低强度骑行（90 分钟，25% VO2 峰值）增加四到五倍。血浆衍生 BDNF 增加四到五倍与血浆乳酸增加六倍相关。● 增强老年人的血浆 BDNF 和脑容量：参加为期六个月的舞蹈课程后，老年人的脑容量在对记忆至关重要的区域增加，血浆 BDNF 水平显着上升。
本格拉海流大型海洋 - ais.unwater.org
本格拉洋流大型海洋生态系统 (BCLME) 位于非洲西南部海岸，从南赤道好望角东部一直延伸到安哥拉北部地缘政治边界附近的安哥拉前线（见图 1）。它涵盖了世界四大沿海上升流生态系统之一，位于海洋的东部边界。与洪堡、加利福尼亚和加那利系统一样，本格拉是海洋生物多样性和海洋食物生产的重要中心。BCLME 独特的水深、水文、化学和营养动力学使其成为世界上最富饶的海洋区域之一，年平均初级生产力为每平方米每年 1.25 克碳 - 大约是北海生态系统的六倍。孟加拉湾海洋生态系统的高初级生产力水平支撑着全球重要的生物多样性和浮游动物、鱼类、海鸟和海洋哺乳动物的生物量，而近海和离岸沉积物中则蕴藏着丰富的珍贵矿物（尤其是钻石）以及石油和天然气储量。沿海地区的自然美景也使一些地区旅游业蓬勃发展，其中许多地区以全球标准来看仍属原始状态。然而，工业污染以及规划和管理不善的沿海开发和近海活动正在导致脆弱的沿海栖息地迅速退化。
本格拉海流大型海洋 - ais.unwater.org
本格拉洋流大型海洋生态系统 (BCLME) 位于非洲西南部海岸，从南赤道好望角东部一直延伸到安哥拉北部地缘政治边界附近的安哥拉前线（见图 1）。它涵盖了世界四大沿海上升流生态系统之一，位于海洋的东部边界。与洪堡、加利福尼亚和加那利系统一样，本格拉是海洋生物多样性和海洋食物生产的重要中心。BCLME 独特的水深、水文、化学和营养动力学使其成为世界上最富饶的海洋区域之一，年平均初级生产力为每平方米每年 1.25 克碳 - 大约是北海生态系统的六倍。孟加拉湾海洋生态系统的高初级生产力水平支撑着全球重要的生物多样性和浮游动物、鱼类、海鸟和海洋哺乳动物的生物量，而近海和离岸沉积物中则蕴藏着丰富的珍贵矿物（尤其是钻石）以及石油和天然气储量。沿海地区的自然美景也使一些地区旅游业蓬勃发展，其中许多地区以全球标准来看仍属原始状态。然而，工业污染以及规划和管理不善的沿海开发和近海活动正在导致脆弱的沿海栖息地迅速退化。
在出现前的ALS抑制剂应用可有效控制抗性barnyardgrass生物型，具体取决于耐药机制
echinochloa物种是稻米作物中最麻烦的杂草之一，由于除草剂的耐药性，它们的控制受到了阻碍。这项研究的目的是确定imazethapyr和Penoxsulam在Barnyardgrass [echinochloa crus-galli（L.）Beauv。] Beauv。具有不同的ALS基因突变。26个生物型，23种具有抗糊状抗性，其中10种对甲氧克氨甲抗性。Ser653ASN的imazethapyr的电阻指数（RI）为5.7 - 19.5，ALA122THR和ALA205ASN为26.7 - 68.3，TRP574LEU的电阻为ALA122TH和ALA205ASN，为70.9 - 252.9。只有TRP574LEU也导致对毒素的耐药性。双重ALS突变ALA122ASN + TRP574LEU导致imazethapyr和Penoxsulam的RI高于2800。在出现前施用的penoxsulam的ED 50分别比易感和抗性生物型的出现后三分和六倍。仅对于低耐药水平突变Ser653ASN的生物型，在出现前的iazethapyr在出现前的效果比出现后更有效。除草剂Quinclorac的疗效对于易感和抗性生物型的出现前后的应用相似。ALS突变ALA205ASN和ALA122ASN + TRP574LEU首次在Barnyardgrass中报道。在出现前的ALS抑制剂的使用应优先于具有抵抗性barnyardgrass的田间出现后出现，并且需要使用这些产品来控制其他非耐药杂草。
Mourkas, E., Yahara, K., Bayliss, S C., Calland, J K., Johansson, H. 等人 (2022) 宿主生态学调节细菌的跨物种重组
摘要 水平基因转移 (HGT) 可以使一种细菌物种中进化的性状转移到另一种细菌物种中。这有可能迅速促进新的适应轨迹，例如人畜共患疾病转移或抗生素耐药性。然而，要做到这一点，需要在给定的时间范围内消除重组障碍。这些障碍中最重要的是生态环境不同的物种在不同的生态位中的物理分离。在弯曲杆菌属中，存在生态环境各异的物种，从很少孤立的单宿主专化者到多宿主通化者，它们是人类细菌性胃肠炎最常见的全球病因。在这里，通过表征这些对比鲜明的生态环境，我们可以量化自然种群中同域和异域物种的 HGT。通过分析 30 种弯曲杆菌基因组中的受体和供体种群血统，我们发现在同一宿主中共存可导致物种间的 HGT 增加六倍。这占特定物种内所有 SNP 的 30%，并识别出具有宿主适应性和抗菌素耐药性等功能的高度重组基因。正如在一些动物和植物物种中所描述的那样，生态因素是细菌物种形成的主要进化力量，宿主景观的变化可以通过 HGT 促进不同物种的部分趋同。
基于OpenCL的设计的FPGA仪器框架
摘要通过使用开放的计算语言（OPENCL）提高了对高性能重新确定异质计算（HPRHC）系统的生产率。但是，在可编程的门阵列（FPGA）中，OpenCL编译器生成的硬件可能会导致严重的性能瓶颈解决方案。问题是由于生成的NetList细节杂乱无章的事实，使它们大部分不可读取，并且仅对设计师而言仅部分可见。本文提出了一种FPGA仪器方法和一个新的框架，用于提取基于OpenCL的设计的FPGA周期 - 准确的时间表演。结果清楚地表明，基于OPENCL的设计的选择执行模型在未正确实现时会强烈影响时间性能。我们的框架是在包含CPU和两个ARRIA10 FPGA的HPRHC平台上实现的，并通过各种具有不同复杂性的基准进行评估。在报告的基准测试后，一个插入仪器的平均逻辑开销是自适应查找表（ALUTS）总量的0.2％，而FPGA中总寄存器的0.1％。此资源利用率比最佳先前发表的作品中报告的资源低1.5至六倍。还可以通过插入多达50个乐器来评估框架的可伸缩性。实验结果表明，当插入50个仪器时，每工具的平均逻辑利用率为0.19％的Alut和0.17％的寄存器。
事实说明书：野火 - 最终
●虽然森林大火自然发生了干扰，这会导致许多森林生态系统的健康和更新（加拿大森林部长委员会2019年），但随着气候的温暖，火灾越来越热，更狂野，造成了更大的破坏。●整个加拿大野火活动越来越频繁（Hanes等人。2018）。2023年燃烧的地区是历史平均水平的六倍以上（加拿大森林森林消防中心2024年）。●气候变化在2023年加拿大东部极端火灾状况的可能性增加了一倍以上（世界天气归因2023）。●过热的气候正在使加拿大夏天更热，更风，降雨量更不稳定，包括一些地区的夏季降雨（Bush and Lemmen 2012; Gifford et al。2022）。●火灾季节开始早些时候，持续更长的时间，并且很难包含（加拿大的气候地图集n.d。；加拿大自然资源2024b；加拿大自然资源2022）。僵尸大火甚至在整个冬季开始闷烧（Shingler 2024）。●随着气候温暖，照明罢工变得更加频繁（McKabe 2023）。2023年在加拿大燃烧的地区的百分之九十三是来自闪电点燃的火灾。人口统计只有7％（Jain等人2024）。●升高的野火风险意味着，无论出于何种原因，开火，传播并更容易失控。