,也可以根据CC0许可使用。未通过同行评审认证)是作者/资助者。本文是美国政府的工作。不受此预印本版权持有人的版权持有人的版权(该版本发布于2024年4月12日。; https://doi.org/10.1101/2024.02.16.580778 doi:biorxiv Preprint
图7肝脏类器官中的脂质代谢。(a)在未处理的条件下用DAPI(蓝色,核)和尼罗河红(红色,脂质液滴)染色的左图,肝脏器官,以及在胺碘酮(40μm)或乙醇(200 nm)24小时处理下。右图,荧光定量(n = 5)。(b)左图;肝癌与LDL-Bodipy(绿色)在未经治疗的情况下和甲伐他汀治疗后孵育。核用DAPI(蓝色)染色。右图,荧光定量(n = 7)。使用未配对的t检验评估统计显着性,其p值截止设置为p <0.05。*,p值<0.05; **,p值<0.01; ***,p值<0.001; NS,并不重要。
由Nucleus Biologics开发和制造的 VITRONECTIN XF™是一种定义的,无XENO的细胞培养基质,支持HPSC的生长和分化。 Use with mTeSR ™ 1 ( Catalog #85850 ), mTeSR ™ Plus ( Catalog #100-0276 ), TeSR ™ -E8 ™ ( Catalog #05990 ), or TeSR ™ -AOF ( Catalog #100-0401 ) medium to provide a defined culture system for the maintenance of ES and iPS cells and greater control over the culture environment, resulting in more consistent在下游应用中,细胞群体和可重复的结果。 人类ES和IPS细胞在玻璃连蛋白XF™上培养的细胞保留多能性和正常菌落形态,而无需适应步骤(图1)。 与温和的细胞解离试剂(GCDR;目录#07174)或RELESR™(目录#05872)搭配以维持高质量的培养物。VITRONECTIN XF™是一种定义的,无XENO的细胞培养基质,支持HPSC的生长和分化。Use with mTeSR ™ 1 ( Catalog #85850 ), mTeSR ™ Plus ( Catalog #100-0276 ), TeSR ™ -E8 ™ ( Catalog #05990 ), or TeSR ™ -AOF ( Catalog #100-0401 ) medium to provide a defined culture system for the maintenance of ES and iPS cells and greater control over the culture environment, resulting in more consistent在下游应用中,细胞群体和可重复的结果。人类ES和IPS细胞在玻璃连蛋白XF™上培养的细胞保留多能性和正常菌落形态,而无需适应步骤(图1)。与温和的细胞解离试剂(GCDR;目录#07174)或RELESR™(目录#05872)搭配以维持高质量的培养物。
失明构成了日益增长的全球挑战,约有26%的病例归因于退化性视网膜疾病。虽然基因疗法,光遗传学工具,光敏开关和视网膜假体为视力恢复提供了希望,但这些高成本疗法将使很少的患者受益。因此,了解视网膜疾病是提高有效治疗的关键,需要在体外模型复制病理学并允许定量评估药物发现。多能干细胞(PSC)提供了独特的解决方案,因为它们的无限供应和分化为包含所有细胞类型的光响应性视网膜组织的能力。本综述着重于PSC的光感受器和视网膜色素上皮(RPE)细胞的历史和当前状态。我们探讨了这项技术在疾病建模,实验疗法测试,生物标志物鉴定和毒性研究中的应用。我们考虑可伸缩性,标准化和可重复性的挑战,并强调将脉管系统和免疫细胞纳入视网膜器官的重要性。我们主张在数据采集和分析中进行高通量自动化,并强调了高级微型生理系统的价值,这些系统充分捕获了神经视网膜,RPE和绒毛膜毛细血管之间的相互作用。
色素性视网膜炎和与年龄相关的黄斑变性是世界上不可逆视觉障碍的最常见原因。现有的治疗方法可能更有效,强调了新治疗的必要性。通过人类多能干细胞的移植来重建视网膜感受器,代表了一种有吸引力的恢复视力方法,已经获得了动力。本文详尽地说明了该领域已知的内容,发现的结果以及最近的进步。本评论论文概述了视网膜损伤/退化的病理生理学的视网膜组织,以及在视网膜再生中使用多能干细胞的背后推理。本文研究了分化策略,决定细胞类型规范的分子成分以及在体外进行视网膜发育的娱乐,遗传工程和操纵表观遗传标记,使用各种技术来驱动特定的细胞命运并提高治疗疗效。
摘要:自闭症谱系障碍(ASD)是一组复杂的神经发育障碍,会影响沟通和社交互动,并以受限的兴趣和重复行为模式出现。对ASD的敏感性受到遗传/可遗传因素的强烈影响;但是,了解ASD神经生物学的基础机制仍然存在很大的差距。在识别ASD风险基因以及在开发过程中这些基因网络调节的可能收敛途径已取得了显着进步。通过细胞重编程技术的突破使综合症和特发性ASD个体的诱导多能干细胞(IPSC)产生,从而为机械研究提供了患者特异性细胞模型。在过去的十年中,已经建立了从这些细胞开发脑器官的方案,从而导致人脑发育早期步骤的体外可重复性的显着进步。在这里,我们回顾了有关脑器官在ASD研究,提供当前艺术状态的最相关文献,并讨论了此类模型对未来发展的领域,局限性和机会的影响。
随着蛋白质结构预测的进步,RNA结构预测最近从深度学习研究人员那里受到了越来越多的关注。rnas引入了实验性RNA结构的稀疏性和较低的结构多样性,因此引入了实质性的chal。现有文献通常对这些挑战的解决通常很差,其中许多报道由于使用培训和测试集具有显着的结构重叠而导致的性能。此外,最新的结构预测批判性评估(CASP15)表明,RNA结构的深度学习模型目前的表现优于传统方法。在本文中,我们介绍了从蛋白质数据库(PDB)推出的结构化RNA的数据集RNA3DB,该数据集旨在培训和基准测试深度学习模型。RNA3DB方法将RNA 3D链条分为不同的组(组件),这些链在序列和结构方面都不冗余,提供了一种可靠的方法来分割训练,验证和测试集。确保这些结构上不同的组件的任何分裂可以产生测试和验证集,这些测试集与训练集中的序列和结构不同。我们提供RNA3DB数据集,这是RNA3DB组件的特定火车/测试拆分(以大约70/30的比率),该数据将被更新时期
• 与美国教育工作者合作开发“K-12 量子学习工具”(初中和高中的推广、大学的学习材料等以及量子相关的课程基础设施),以激励下一代量子领袖。 从提供实践经验的课堂工具,到开发教学材料,再到支持量子职业道路,确保强大的量子学习环境。使教育工作者能够为学生提供量子职业机会。
当前对人类多能性的转录调控的知识是不完整的,缺乏种间保护。对人类胚胎的单细胞转录组学分析以前使我们能够鉴定出富含人层和幼稚的人类胚胎干细胞(HESC)的转录因子,包括锌指蛋白KLF17。在这里,我们表明KLF17与人类胚泡发育中已知的多能相关因素Nanog和Sox2表示同时表达。我们使用启动和幼稚的hESC来研究KLF17的功能,以获得功能丧失分析。我们发现,在启动hESC中KLF17的异位表达足以诱导幼稚的转录组,并且KLF17可以驱动转基因介导的重置以重置为幼稚的多能性。这意味着KLF17在建立幼稚的多能性中的作用。然而,CRISPR-CAS9介导的敲除研究表明,在体外幼稚的多能习得并不需要KLF17。幼稚hESC的转录组分析鉴定了KLF17功能丧失后对代谢和信号通路的微妙影响,并可能与其他KLF旁系同源物进行冗余。总体而言,我们表明KLF17在给定的体外条件下的幼稚多能性是足够但不是必需的。
• 与美国教育工作者合作开发“K-12 量子学习工具”(初中和高中的推广、大学的学习材料等以及量子相关的课程基础设施),以激励下一代量子领袖。 从提供实践经验的课堂工具,到开发教学材料,再到支持量子职业道路,确保强大的量子学习环境。使教育工作者能够为学生提供量子职业机会。