下一代测序需要高质量的核酸,但是分离的DNA和RNA通常具有挑战性,尤其是在植物组织中。尽管开发了各种试剂盒和试剂,但这些产物是根据模型植物的分离而定制的。在这里,我们引入了一种通用裂解缓冲液,以将核酸与包括顽固植物在内的各种植物种类分开,以促进分子分析,例如定量PCR(QPCR),转录组学和全基因组测序(WGS)。该方案是对原始CTAB方法的修改,该方法导致从许多植物物种(包括单子叶植物和eudicot)中分离出核酸。裂解缓冲液由六烷基三甲基溴二铵(CTAB),氯化钠(NaCl),Tris碱,乙二胺甲乙酸抗乙酸(EDTA)和β-苯二甲醇(βME)组成。修饰的CTAB方法可以及时从少量植物组织(例如15-100 mg)中分离出核酸,这非常适合大量样品,并且当适当的样品收集是一个限制因素时。方案不仅分离出来自各种植物物种的DNA,还分离出RNA。这使得与先前描述的用于DNA分离的CTAB方法相比,它对分子分析非常有效。成分的适当浓度可以同时从植物组织中分离出高质量的DNA和RNA。此外,此协议与市售列兼容。使DNA和RNA有资格用于下一代测序平台,该方案补充了柱,以纯化同一组织中的DNA或RNA,以满足高标准以进行测序分析。该方案提供了一种理想的方法,可以克服从各种植物物种中分离出高质量DNA或RNA的潜在障碍,以进行下流的分子分析。
越来越高的耐多药 (MDR) 病原体水平迫使人们发现新的生物活性化合物。为此,首次从埃及 Kafr El Sheikh 的黑沙滩分离出两种放线菌菌株,即灰红链霉菌和罗氏链霉菌,该地区是几家大型养鱼场的所在地。通过表型、生化和 16S rRNA 序列协议对分离株进行了鉴定。这两种菌株都对三种严重的 MDR 病原体表现出强大的抗菌活性:枯草芽孢杆菌、肠炎沙门氏菌和铜绿假单胞菌。使用气相色谱-质谱 (GC-MS) 鉴定了分离株滤液的生物活性化合物。对于 S. griseorubens ,可检测到的抗菌化合物是己酸、2-乙基-、2-乙基己基酯、正癸烷、十六烷酸甲酯、苯乙酸、蓖麻油酸和对羟基苯甲酸乙酯,而 S. rochei 则分泌十七烷、2,6-二甲基-、苯乙酸、邻苯二甲酸二丁酯、二十八烷、二十六烷和维生素 A 醛。这些结果强烈鼓励使用这些环保分离物作为生物防治剂,以对抗攻击养鱼场的 MDR 病原体。
作者:W Yu Jin · 2023 · 被引用 6 次 — 存在“对细菌的防御反应”和“防御反应......在细胞防御中发挥作用,并可能在细胞系统中发挥抗炎功能。
摘要。由细菌xanthomonas Campestris引起的细菌病被认为是栽培植物最危险的一种。在有利的农业季节,对于病原体的发展,问题尤其鲜明。同时,目前缺乏对这些杀菌作用的有效和现代作用的方法。建议的解决方案之一是使用噬菌体生物制作,其中对微生物的“田间”培养的活动很重要。在这方面,从36种种子材料样品中分离出22种Xanthomonas campestris细菌菌株。尽管种子材料有所不同,但所有分离的菌株均具有该物种的典型生物学特性,并且相互对应以及与工作中使用的参考菌株相对应。同时,在21种菌株中建立了与白菜有关的分离微生物的致病性。页面布局
摘要。Bamrungpanichtavorn T、Ungwiwatkul S、Boontanom P、Chantarasiri A。2023. 从泰国东部两片红树林土壤中分离出的产纤维素酶细菌的多样性和纤维素分解活性。生物多样性 24:3891-3902。东南亚国家拥有世界上最大的红树林面积。红树林是分离经济微生物酶的潜在来源。纤维素酶是一种广泛用于各种行业中纤维素降解的微生物酶。因此,本研究旨在从泰国东部两片红树林的土壤中分离、遗传鉴定和酶学表征产纤维素酶的细菌。分离了 26 种产纤维素酶的细菌,随后通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 (PCR-RFLP) 分析 16S rRNA 基因进行基因分型。获得了 13 种不同的 RFLP 模式,并对其进行了遗传分析,分为 6 个细菌属,包括 气单胞菌 、 芽孢杆菌 、 金黄杆菌 、 赖氨酸芽孢杆菌 、 假单胞菌 和 弧菌 。芽孢杆菌属是研究地点产纤维素酶的主要细菌。此外,产纤维素酶的金黄杆菌和赖氨酸芽孢杆菌几乎从未被报道过。芽孢杆菌属菌株 RY08B 是活性最高的产纤维素酶细菌,CMCase 酶活力为 1.510 0.060 U/mL。确定了 CMCase 活性的最适温度和 pH 值为 50°C(pH 为 7.0),热稳定范围为 25-50°C(pH 为 7.0)。这种细菌可应用于多种对生产过程要求温和的环保行业。
益生菌是活的微生物,如果以足够的量为宿主提供健康益处,例如乳酸细菌是革兰氏阳性生物,它们在生产和储存包含它们的产品的过程中可以承受不同的环境压力。本研究旨在评估从菠萝和水瓜中分离出的乳酸细菌(LAB)菌株的益生菌潜力。对评估中使用的材料进行了适当的灭菌,包括De-Man Rogosa&Sharpe Agar(MRS),兄弟夫人,通过条纹方法,营养琼脂和Mueller Hinton琼脂隔离实验室,使用Disc扩散方法进行抗生素敏感性测试。在168种细菌上对板数琼脂进行计数,根据其文化和生化特征,总共筛选了6种菌株。筛选果实的抗菌活性及其抗生素敏感性;这六个分离株表现出对革兰氏阳性和革兰氏阴性人病原体的抗菌行为(Proteus mirabilis,Escherichia Coli,Pseudomonas铜绿假单胞菌,枯草芽孢杆菌,枯草芽孢杆菌,金黄色葡萄球菌和金黄色葡萄球菌和Corynenebacteria spp。抗生素敏感性测试也有望,P1显示针对阿莫西克的31毫米。分子鉴定分析(16sRNA测序)表明,分离株是属于同一基团的不同物种,乳酸乳杆菌发酵乳杆菌,lactobacillus plantarum和weissella cibaria。最终的结果表明,从果实样品中分离出的细菌具有有趣的特性,并且有可能用作益生菌并制备功能性水果产物。
成功实施了在串联perovskite光伏设备的顶部细胞中的成功实施,但受到卤化物种族隔离现象的阻碍,[27-29]遭受了混合的碘化碘 - 溴组成,用于实现宽带式的(> 1.7 ev [> 1.7 ev [22,23,23])。太阳光谱的高能部分。在带有袋中的照明下[27]或电荷载体注入,[30-32]这些伴侣经历了一个混合过程,从而形成了富含碘化物和溴化物的富相的局部区域。[33–36]去除外部刺激导致从隔离中恢复。[27,37–39]尽管这种可逆的相分离仅影响钙矿体积的少数族裔,[34,40]在空间上,空间不均匀的bandgap严重破坏了混合壁孔孔孔的适用性,不仅可以通过限制了频带的范围,而不仅会限制频带的范围,而且还限制了对频段的效果[41] [41] 41] [41] [41] [41–43]和重组,[44]并导致电压损耗。[40,45]因此,正如最近的几篇评论文章中列出的那样,已经大量的研究注意力用于理解这一案例以防止这种情况。[46–50]
压力反应,4或某些疾病,5等。除了其在自然现象中的重要性外,LLP还发现了合成生物学的应用。6,7该过程通常是由蛋白质和/或核酸等生物聚合物驱动的,形成致密的分子间网络。核酸,尤其是RNA,通常参与细胞中观察到的相分离过程。例如,参与重复膨胀障碍的RNA可以在细胞核中形成核糖核蛋白体。5中的核仁,DNA,RNA和蛋白质与周围环境分开以调节转录。8应力颗粒是相分离的聚集体,可在应力条件下增加适合度。4确切的相位分离是如何发生的,以及如何受到生物聚合物序列的影响。该过程被认为是由诸如分离物种的浓度和序列,翻译后蛋白质修饰(例如,sumoylation),4,9温度和阳离子物种。10,11
摘要:采矿和加工磷酸盐是包括阿尔及利亚在内的一些发展中国家的经济基本分支之一。常规的矿石益处方法可能会通过消耗大量的水资源(洗涤和流量),潜在的危险化学物质和热能来损害环境。矿水中含有有毒金属,释放后会干扰环境功能。因此,根据环境需求,应逐渐用安全的生物技术过程逐渐取代常规方法。这项研究旨在研究从Djebel Onk Ore(Algeria)中分离出的天然微生物的生物吸附和粘附能力。所检查的细菌菌株的金属积累效率有所不同。磷酸盐与天然菌株HK4的孵育显着增加了Mg和Cd的恢复(分别为pH 7、8147.00和100.89 µg/g/g -1)。HK4菌株还显示出比枯草芽孢杆菌的参考菌株对矿石颗粒的粘附更好。因此,使用天然HK4菌株时,生物吸附可以更有效,该菌株可以在pH 4-10范围内去除CD和/或MG。此外,关于HK4独特的粘附能力,可以在生物流动方法的设计中考虑菌株,以及开发一种环保的矿石和流动性废物造成的方法。