XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System切酶
克隆，表征和表达的大肠杆菌中的CpG DNA甲基酶的基因中的大肠杆菌中的克隆，表征和表达。菌株MQ1（M SSSI） 一种用于检测蛋白质的酵母交配选择方案 快速板法，用于筛选透明质酸酶和软骨素硫酸硫酸酶 - 生产微生物 schizosacchomyces pombe突变体在细胞壁中有缺陷的孤立和表征（1-3）1-d-葡聚糖 数学模型用于研究遗传变异的限制性核酸内切酶 在体外向海马的层特异性纤维投影形成 回顾文章的DNA复制和损坏检查点和减数分裂细胞周期控制，并在酵母中进行酵母 DNA依赖性腺病毒基因A ... 的转录 核酸研究 kilodalton核帽结合蛋白
噬菌体FD，FL和OX174是已知的最小病毒之一。它们属于具有单链圆形DNA作为其遗传物质（1-4）的一组良好特征的副觉。他们的DNA的分子量约为2 x 106，仅包含有限数量的基因。fd和fl是丝状噬菌体，在血清学和遗传上相关。ox174是一个显然与丝状噬菌体无关的球形噬菌体。dev> deNhardt和Marvin（5）通过DNA-DNA杂交进行了表明，尽管这两种类型的噬菌体（即丝状和球形）在每种类型的DNA之间没有检测可检测的同源性，尽管在每种类型内部都有很高的同源性。最近，已经推出了一种相对较快的分馏和序列大嘧啶寡核苷酸的技术。已经确定了9-20个基碱残基的FD DNA中长嘧啶裂纹的序列（6）。在本报告中，提出了来自FL和OX174 DNA的大嘧啶产物的序列。将这些序列与先前从FD DNA获得的序列进行了比较。
数学模型用于研究遗传变异的限制性核酸内切酶
它。因此，如果像mtDNA这样的圆形DNA具有m识别（限制）位点，则该酶在消化后将其分散成M段。限制位点的数量和位置随核苷酸序列而变化。相比，两个DNA序列的相似性越高，裂解模式越接近。因此，可以通过比较限制位点的位置来估计两个同源DNA之间的核苷酸取代的数量。同样，可以从两个或分类的DNA片段的比例中估算核苷酸取代的数量。Upholt（8）研究了这两个问题，但他的锻炼并不一般，似乎涉及一些错误。fur-hoverore，upholt不关注种群中DNA序列的异质性明显高度（5）。当研究紧密相关的物种之间的遗传差异时，有必要消除这种异质性的作用。本文的目的是开发一个更严格的DNA遗传差异数学模型，并提出了一种统计方法，用于分析限制酶研究的数据。在前四个部分中，我们要么假设人群中没有多态性，要么仅考虑一对生物（个体）之间的遗传差异。在第五部分中将删除无多态性的假设。
CRISPR/Cas 内切酶在体内视网膜基因编辑中的比较
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者，此版本于 2020 年 6 月 9 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.06.09.141705 doi：bioRxiv 预印本
真核 RNA 引导的核酸内切酶是从一类独特的细菌酶进化而来的
1 加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系；美国加利福尼亚州伯克利市；2 加州大学创新基因组学研究所；3 加州大学伯克利分校加州定量生物科学研究所 (QB3)；4 加州大学伯克利分校霍华德休斯医学研究所；美国加利福尼亚州伯克利市；5 加州大学伯克利分校地球与行星科学系；6 加州大学洛杉矶分校分子、细胞和发育生物学系；7 加州大学伯克利分校计算生物学中心；8 加州大学洛杉矶分校霍华德休斯医学研究所；9 格拉德斯通研究所；美国加利福尼亚州旧金山市；10 格拉德斯通-加州大学旧金山分校基因组免疫学研究所； 11 劳伦斯伯克利国家实验室分子生物物理和综合生物成像部；美国加利福尼亚州伯克利市；12 加利福尼亚大学伯克利分校化学系；美国加利福尼亚州伯克利市；
MLH1-PMS1核酸内切酶使用ATP将DNA不连续性作为链歧视信号来促进不匹配维修
图2。MLH1-PMS1的固有ATPase活性失去了PCNA刺激。（a）TLC ATPase分析测量了线性4.3 kb DNA上由MLH1-PMS1水解的ATP量。灰色条代表完整的线性4.3 kb DNA（n = 3），蓝色条代表了线性的4.3 kb DNA，具有4个单链断裂（n = 3）。底物。灰色和蓝色条带有对角线，代表了包含PCNA的实验（n = 3）。（b）灰色条代表在4.3 kb放松，无迹线的圆形DNA上水解的ATP百分比（n = 3），蓝色条代表圆形的4.3 kb DNA，其中包含4个迹线（n = 3）。4.3 kb PBR322。使用nt.bstnbi进行单链断裂。（c）MLH1-PMS1在完整DNA上与包含单链断裂的DNA的ATPase活性模型。
对具有临床相关流感核酸内切酶变体抑制剂的结构研究 基于源的形态测定法揭示了22Q11.2缺失综合征的结构性大脑模式异常 哥斯达黎加城市和农村老年人的神经心理电池的测量不变性 机载DNA揭示了真菌的可预测的空间和季节性动态 UC Merced 赢得电子竞技竞赛的最佳大脑条件：与电子竞技相关的额叶和顶叶皮层中的脑电图振幅 顽固的多变体lichen planus成功地用口服baritodinib和局部ruxolitinib奶油处理 Shen Hu编辑 - 癌症代谢组学 圣地亚哥UC 健康心理学评论ABCD特刊2023 怀孕的心血管疾病
摘要：对流感的治疗至关重要的是使用抗病毒药，例如Oseltamivir（Tamiflu）和Zanamivir（Relenza）；但是，对于这些治疗剂而言，抗病毒药抗性正成为越来越多的问题。RNA依赖性RNA聚合酶酸性N末端（PA N）核酸内切酶是流感病毒复制机制的关键成分，是一个抗病毒靶标，最近经批准Baloxavir Marboxil（BXM）经过验证。尽管BXM取得了临床成功，但BXM表现出对抗性突变的敏感性，特别是PA n的I38T，E23K和A36 V突变体。为了更好地了解这些突变对BXM抗性的影响并改善了更健壮的治疗剂的设计，本研究研究了蛋白质 - 抑制剂与两个抑制剂的关键差异，以及I38T，E23K和A36 V突变体。通过使用两种生物物理方法测量与PA N结合的变化来评估抑制剂结合的差异。用野生型和突变形式的Pa n晶体学确定了两个不同抑制剂的结合模式。总的来说，这些研究对这些突变体的抗病毒抗性机理有了一些深入的了解。■简介流感病毒导致疾病的重大负担，仅在2018/19季节，在美国造成了约3550万例，500,000例住院和35,000例死亡。1个儿童和老年人群特别容易受到复杂的流感病例，占住院和死亡的最大百分比。3，42在19009年大流行期间，非药物干预措施（NPI），例如在家中订单，掩盖，社会疏远和增加的消毒措施在公共场所实现，以防止SARS-COV-2的传播。这也导致全球流感感染在2020/21和2021/22季节中大大减少，这对流感疫苗的年度重新印象产生了影响。重新制作在很大程度上取决于循环菌株的先前传染病季节的数据，以预测即将到来的流感季节最有效的疫苗组成。3因此，预测最佳2022/23疫苗的数据较少，这解释了2022/23季节观察到的流感的实质性复苏。
对具有临床相关流感核酸内切酶变体抑制剂的结构研究
NIMH，授予/奖励号：U01MH101719，R01MH085953，U01MH119741-01，U01MH119758; NIH，赠款/奖励号：U54HD079125，R01MH107018，U01MH101724，U01MH119738，5U01MH119737-04，R01 MH064824，R01 MH064824，R01MH129636，R01MH129636，K01271MH1127744.11MH1174 HH1174 HH174H HH174 HER RESR R.R0144，R01MH1174 HH1194 HER RESR RES RIS。 R01AG058854-02，R01MH116147-04;创新药品计划2联合承诺，赠款/奖励号：777394，115300; Wellcome Trust临床研究培训奖学金，赠款/奖励编号：102003/Z/13/Z；汤米神经精神研究中心；惠康信托战略奖“定义”； MRC，赠款/奖励号：MR/L011166/1，MR/N022572/1，MR/T033045/1； Fondecyt，赠款/奖励号：192064，1211411，1171014； Sickkids精神病学助理发育心理病理学主席；欧洲委员会赠款，赠款/奖励号：QLGU-CT-2001 - 01081； NWO-VENI赠款，赠款/奖励号：2006-916.76.048；荷兰大脑基金会，赠款/奖励号：15F07（2）.55
限制性核酸内切酶消化质粒DNA
此过程描述了如何用各种限制性核酸内切酶消化纯化的质粒DNA。使用各种缓冲液和盐条件，将质粒DNA切成各种长度DNA片。然后，可以使用E-Gel功率SNAP电泳和SAP-23132 Chemidoc MP Imaging Imaging Systems使用E-Gel Power Snap Extrophoresis和SP-23132 Chemidoc Imaging Systems使用E-Gel Power Snap Systems和SEOP-23132 ChemIdoc Imaging Systems，并具有来自Bio-Rad的Image Lab touch软件。限制性核酸内切酶识别短的DNA序列，然后在识别序列内或附近的特定位点上裂解双链DNA。限制性核酸内切酶将DNA裂解为离散片段是分子生物学中最基本的过程之一。基本协议描述了如何为任何酶和缓冲液条件切割DNA。这些包括用一个以上的内切酶消化给定的DNA样品，并用相同的内切酶消化多个DNA样品。
flap核酸内切酶1通过ADP-核糖基化Yilun Sun 1*，Lisa M. Jenkins 2，Lara H. El Touny 3，Ukhyun Jo 1，Xi Yan
抽象的DNA-蛋白交联（DPC）是最普遍和有害的DNA病变之一，是由于暴露于代谢应激，药物或交联药物（如甲醛（FA））而引起的。fa是甲醇代谢，组蛋白脱甲基化，脂质过氧化和环境污染物的细胞副产品。无法修复FA诱导的DPC几乎所有基于染色质的过程，包括复制和转录，导致免疫缺陷，神经变性和癌症。然而，它在很大程度上仍然未知细胞如何维修DPC。由于缺乏鉴定DPC的技术，我们不理解FA的蛋白质类型会阻碍DPC修复的研究。在这里，我们通过将氯化葡萄球菌差异超速离心与HPLC-MAS-MAS光谱法（MS）耦合，从而设计了一种新型的生物测定法，以介绍FA诱导的DPC。使用该方法，我们揭示了FA诱导的人类细胞中FA诱导的DPC的蛋白质组，发现形成DPC的最丰富的蛋白质是PARP1，拓扑异构酶I和II和II和II，甲基转移酶，DNA和RNA聚合酶，组蛋白，组蛋白，以及核糖体蛋白。为了鉴定修复DPC的酶，我们进行了RNA干扰筛选，发现皮瓣核酸内切酶1（FEN1）的下调使细胞对FA过敏。由于Fen1具有5'-FLAP内切酶活性，因此我们假设FA诱导了DPC偶联的5'-FLAP DNA片段，可以通过Fen1处理。的确，我们证明了FA会损坏通过碱基切除途径（BER）转化为5'-FLAP的DNA碱基。我们还观察到受损的DNA碱基与DPC和FEN1共定位。从机械上讲，我们显示了FEN1在体内修复FA诱导的DPC和裂解5'-FLAP DNA底物，这些DNA具有模拟于体外的DPC。我们还发现，FEN1修复酶拓扑异构酶II（TOP2）-DPC，由其抑制剂依托泊苷和阿霉素诱导的诱导的酶促蛋白酶和阿霉素独立于BER途径，而FEN1和FEN1和DPC靶向的蛋白酶sprtn是对两种FA诱导的非Zym Zym Zym Zymations sprapterations spr的可行途径top2-dpcs。值得注意的是，我们发现FA诱导的非酶DPC和酶ToP2-DPC迅速通过聚辅助核糖基化（ParyLation）迅速修饰，这是一种由PARP1催化的翻译后修饰，由PARP1催化的，这是一种由Paryling DNA损伤损害蛋白和DNA Reparion Reparte resation and DNA损伤蛋白的关键DNA损伤效应器和DNA Reparte resation and dna Reparte stotes和DNA Reparte stotes。，我们用HPLC-MS的抗PAR抗体进行了免疫沉淀（IP）测定，并将Fen1鉴定为parylation底物。接下来，我们表明DPC底物的填充信号发出了Fen1，而Fen1的抚养也将Fen1驱动到DPC位点。最后，使用末端ADP-ribose-MS方法的酶促标记，我们将FEN1的E285残基确定为主要的荷置位点，这似乎是FEN1迁移到DPCS所需的。综上所述，我们的工作不仅揭示了FA诱导的DPC的身份，而且还发现了前所未有的PARP1-FEN1核酸酶途径，是一种通用和势在必行的机制，可以修复其他DPC并防止DPC诱导的基因组不稳定。