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固定和石蜡包埋的新鲜脑组织染色......
术中组织学对于手术指导和决策至关重要。然而，冷冻切片苏木精和伊红 (H&E) 染色的准确性较低，而金标准福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) H&E 染色时间过长，不适合术中使用。受激拉曼散射 (SRS) 显微镜已显示出具有脂质/蛋白质对比的脑组织学快速组织学，但很难产生与病理学家可解释的基于核酸/蛋白质的 FFPE 染色相同的图像。在这里，我们报告了一种半监督受激拉曼 CycleGAN 模型的开发，该模型使用未配对的训练数据将新鲜组织 SRS 图像转换为 H&E 染色。在 3 分钟内，可以生成与真实 H&E 完美匹配的受激拉曼虚拟组织学 (SRVH) 结果。盲检结果表明，经认证的神经病理学家能够在 SRVH 上区分人类神经胶质瘤的组织学亚型，但在常规 SRS 图像上却很难区分。SRVH 可提供比冷冻 H&E 更好的术中诊断，速度和准确性都更高，可扩展至其他类型的实体肿瘤。
通过冰片包埋水凝胶局部治疗酪氨酸激酶 2 抑制剂：对牛皮癣的预防、治疗和复发管理的评估
银屑病是一种免疫介导的炎症性皮肤病，其特征是慢性复发-缓解过程，目前主要通过局部疗法进行治疗。虽然口服酪氨酸激酶 2 抑制剂 (TYK2i) 是治疗银屑病的有效方法，但局部应用 TYK2i 的潜在疗效仍未得到探索。本文将卡波姆/海藻酸水凝胶与冰片 (BO) 一起包埋作为 TYK2i 的新型局部载体，以增强透皮渗透性和抗银屑病功效。表型图像、银屑病严重程度评分指数 (PSI)、组织学、免疫组织化学染色和 PCR 分析证实，水凝胶系统 TYK2i-BO-gel 在小鼠银屑病样皮炎模型中表现出显著改善的预防和治疗效果。值得注意的是，TYK2i-BO-gel 的效果优于传统的外用皮质类固醇疗法，可显著预防银屑病病变复发，衡量标准是耳朵厚度变化 (p < 0.0001)、PSI (p < 0.0001) 和表皮厚度 (p < 0.05) 减少了近 50%。此外，在人体皮肤外植体模型中也观察到 TYK2i-BO-gel 引起的增强的抗炎作用，这意味着它对人类患者有潜在的应用价值。加入 BO 后，TYK2i-BO-gel 不仅可以增加皮肤渗透性，还可以抑制角质形成细胞中抗菌肽的表达，并通过抑制 STAT3 的激活来促进 TYK2i 的抗 Th17 反应。因此，这项研究代表了 TYK2i-BO-水凝胶作为一种新的抗银屑病管理外用制剂的可及性和有效性，并显示出巨大的临床应用潜力。
优化从长期保存的福尔马林固定和石蜡包埋的肺癌和淋巴结组织中提取基因组 DNA
1医学研究实验室，圣保罗大学医学院，圣保罗大学，SP，巴西2组织术和肺基因组学实验室，圣保罗大学医学系，圣保罗大学，SP，SP，SP，Brazil 3实验室，用于分子遗传学，Centeries for Centerime for Centerime for transolies for Centerime for intiment fornation intications forsy inticatitions contiment fornations for poll州癌症研究所，放射学和肿瘤学系，圣保罗大学，圣保罗大学，巴西SP，4病理学系，医院DasClínicas医学院，圣保罗大学，SP，SP，SP，SP，Brazil Pathology 5实验室ICAL病理学，病理学系，医院DasClínicas，医学院，圣保罗大学，圣保罗，SP，巴西SP
实现即时护理脑肿瘤分类：福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 病理的纳米孔甲基化测序
摘要 基于牛津纳米孔技术 (ONT) 的甲基化测序因其快速准确地对脑肿瘤进行分类而受到越来越多的认可。这一过程对于最佳患者治疗至关重要。然而，目前广泛的临床应用受到对新鲜冷冻活检的需求而不是标准福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本的限制。我们的研究探讨了 FFPE 对 DNA 甲基化的影响，并提出了一种基于 ONT 的 FFPE 肿瘤分类的开发和验证方案。我们提出了一种实用的解决方案，用于在常规临床环境中精确诊断脑肿瘤，并在护理点及时做出治疗决策，而不会干扰手术室标准。关键词：肿瘤分类、牛津纳米孔技术、表观遗传分析、DNA 甲基化、FFPE 活检样本、中枢神经系统肿瘤、精准医学、病理学。准确分类肿瘤类型和亚型对于促进全面精准的患者治疗至关重要 1-3 。例如，世界卫生组织 (WHO) 对中枢神经系统 (CNS) 肿瘤的分类涵盖 10 多个主要肿瘤类别，每个类别又包含许多亚类，总共有 100 多个不同的实体，需要不同的治疗方法，并且与不同的预后和临床病程相关 4。这些肿瘤实体在形态、空间和遗传特征上经常表现出相似性 5–7，因此难以区分它们。此外，神经病理学家可能会对组织病理学结果提供不同的解释，这增加了该过程的主观性 8。另一方面，表观遗传学，特别是 DNA 甲基化——已被证明是一种强大而稳定的工具，可准确区分绝大多数这些肿瘤亚型 2，因此基于甲基化的分类已纳入 2021 年 WHO 对 CNS 肿瘤的分类 4。因此，检查肿瘤甲基化模式最近已成为临床诊断程序的一部分，基于甲基化的分类器已经可用于中枢神经系统肿瘤和肉瘤，其他用于不同肿瘤类型的分类器正在开发中 9 。然而，将 DNA 甲基化纳入脑肿瘤的诊断检查已被证明具有挑战性。评估这些甲基化模式的“金标准”方法是 DNA 杂交阵列，例如 Infinium MethylationEPIC 阵列 10 ，但它具有明显的缺点，包括费用高、周转时间长、所需起始材料量大（最低 500ng DNA，最好是 1ug DNA），需要积累多个样本才能获得结果，并且需要训练有素的人员，这与临床需求通常要求的短时间范围不符 。
kingfisher-instruments-experience-brochure.pdf
特色仪器应用 9 癌症研究 9 无细胞核酸分离 9 用于癌症研究的福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本 10 血液癌症研究 11 外泌体和细胞器分离 12 循环肿瘤细胞 (CTC) 分离 13
STARD-AI 指导小组
致编辑 — COVID-19 疫情凸显了收集和处理冠状病毒 SARS-CoV-2 状态不明的人类生物样本的风险，无论是出于诊断、治疗还是研究目的。在疫情期间，继续收集并存储在生物库中的癌症患者生物样本很可能感染了 SARS-CoV-2。除尿液外，所有类型的生物样本（组织、生物流体和拭子）和器官都可能受到影响 1 – 6 。加热至 56 °C (133 °F) 7 的福尔马林固定石蜡包埋样本可能会灭活 SARS-CoV-2。然而，由于 SARS-CoV-2 可以在各种类型的表面上存活，因此尚不清楚这是否也适用于含有福尔马林固定、石蜡包埋样本的盒式磁带 8 。出于这个原因，并且由于 SARS-CoV-2 具有高度传染性，必须准备、储存、处理和运输人体样本，以确保接触生物样本的人不仅熟悉处理潜在传染性液体或组织样本的适当安全程序，而且有能力并愿意实施这些程序。
组织鉴定/验证 DNA 检测
我们的检测可用于解决病理样本贴错标签、组织“漂浮物”或标本混淆的问题。我们可以使用福尔马林固定石蜡包埋组织、未染色的载玻片和染色的载玻片。载玻片上的组织将在检测过程中被消耗。目前的费用为每个样本 1,100.00 美元。
对先天性巨细胞病毒病病例中甲醛固定、石蜡包埋的组织中的整个人类巨细胞病毒基因组进行 DNA 测序
。CC-BY 4.0 国际许可证 它是永久可用的。 是作者/资助者，已授予 medRxiv 许可以显示预印本（未经同行评审认证）预印本 此版本的版权所有者于 2025 年 2 月 3 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.30.25321147 doi：medRxiv 预印本