1个免疫基因组学和炎症研究团队,里昂大学,爱德华·赫里奥特医院,法国里昂69003; frederic.coutant@univ-lyon1.fr 2免疫学部,里昂 - 苏德医院,里昂的医院公民,69310法国Pierre-bénite,法国3号Dendritics-Edouard Herriot医院,法国69003 Lyon,法国; JEAN_JACQUES_PIN@HOTMAIL.FR 4病毒学系,北部医院网络国家参考中心感染剂学院,法国里昂69004; flimence.morfinfin-sherpa@chu-lyon.fr 5 Virpath团队,CIRI,INSERM U1111,CNRS UMR5308,ENS LYON,ENS LYON,CLAUDE BERNARD LYON 1,69100 LYON,LYON,法国6,法国6,感染和热带疾病,HOSTICES CIVER NIVERS,HOSTESSICESS FIVERS,HOSTESSICESS HOSIDERS HOSIDESS HOSIDESS,FIRMANDE SESE SESE SESE,699004,69.9004 004 004 004; tristan.ferry@chu-lyon.fr 7 Stapath Team,CIRI,Inserm U1111,CNRS,UMR5308,Ens Lyon,University Claude Bernard Lyon 1,69100法国里昂,法国8里昂8,圣伊蒂恩大学医院stephane.paul@chu-st-etienne.fr 9 Gimap Team,Ciri,Inserm U1111,CNRS,UMR530,University Claude Bernard Lyon 1,CIC 1408疫苗,42023 Saint-Etienne,法国,法国; bruno.pozzetto@univ-st-etienne.fr 10传染病特工和卫生部,圣泰恩大学医院,42055法国圣伊蒂安,法国11 Sainbiose 11 Sainbiose,Inserm,inserm,U1059,U1059,里昂大学,42270 Saint-Etienne,42270 Saint-Etienne,France,France; myriam.normand@univ-st-eetienne.fr 12,法国里昂69003 Edouard Herriot医院免疫学和风湿病学系
1 悉尼大学悉尼传染病研究所,澳大利亚悉尼 2 韦斯特米德医学研究所,澳大利亚悉尼 3 悉尼大学药学院,澳大利亚悉尼 4 韦斯特米德医院药学系,澳大利亚悉尼 5 国家真菌学参考中心,SA Pathology,澳大利亚阿德莱德 6 卡洛斯三世健康研究所,西班牙马德里 7 维罗纳大学,意大利维罗纳 8 医学教育与研究研究生院医学微生物学系,印度昌迪加尔 9 伦敦大学圣乔治感染与免疫研究所,英国伦敦,埃克塞特大学 MRC 医学真菌学中心 10 古卢大学医学院医学微生物学与免疫学系,乌干达古卢 11 世界卫生组织抗菌素耐药性司全球协调与伙伴关系部影响力倡议与研究协调组,瑞士日内瓦 12抗菌素耐药性特别规划,传染病和环境健康决定因素,泛美卫生组织,美国华盛顿特区 13 世界卫生组织,东南亚区域办事处,印度新德里 14 世界卫生组织被忽视的热带病控制司,瑞士日内瓦 15 世界卫生组织非传染性疾病司,瑞士日内瓦 16 莫纳什大学阿尔弗雷德健康/传染病系,澳大利亚墨尔本 *通讯作者。Justin Beardsley,MBChB,FRACP,PhD,悉尼大学,悉尼传染病研究所,Westmead 2145,澳大利亚。电话。:+ 61 2 9351 2222;电子邮件:justin.beardsley@sydney.edu.au † 共同最后作者。
1 PET 科学中心、个性化医疗和生物样本研发部、阿斯利康公司,瑞典斯德哥尔摩 2 临床神经科学系、精神病学研究中心、卡罗琳斯卡医学院,瑞典斯德哥尔摩 3 陶布研究所、神经病学系、哥伦比亚大学欧文医学中心,美国纽约 4 Invicro,英国伦敦 5 神经影像科学中心、精神病学、心理学和神经科学研究所、伦敦国王学院,英国伦敦 6 耶鲁大学 PET 中心,美国康涅狄格州纽黑文 7 图尔库 PET 中心、图尔库大学和图尔库大学医院,芬兰图尔库 8 研发部、阿斯利康公司,美国马萨诸塞州沃尔瑟姆 9 临床神经科学系、卡罗琳斯卡医学院,瑞典斯德哥尔摩 10 法国 MSA 参考中心、临床研究中心 CIC1436、神经科学和临床药理学系、NeuroToul COEN 中心,UMR 1 214-ToNIC 和图卢兹大学医院、INSERM 和图卢兹 3 大学,法国图卢兹 11 CRMR AMS,神经病学-神经变性疾病服务中心,CHU Bordeaux,法国波尔多 12 波尔多大学,CNRS,IMN,UMR 5293,法国波尔多 13 奥塔哥大学医学系,新西兰基督城脑研究所,新西兰基督城 14 萨勒诺大学神经退行性疾病中心,意大利萨勒诺 15 因斯布鲁克医科大学神经病学系,奥地利因斯布鲁克 16 纽约大学格罗斯曼医学院医学系,美国纽约 17 因斯布鲁克医科大学神经病学系临床神经生物学分部,奥地利因斯布鲁克
访问微生物学是一个开放的研究平台。可以通过本文的在线版本找到预印刷,同行评审报告和编辑决策。收到2024年1月5日; 2024年6月4日接受;于2024年6月27日出版了作者分支:1个细菌学实验室,马达加斯加antananarivo的Chu Joseph Raseta Befelatanana; 2马达加斯加antananarivo的马达加斯加的巴斯德学院实验细菌学单元; 3小儿服务,楚约瑟夫·拉塞塔·贝菲拉塔纳(Chu Joseph Raseta Befelatanana),马达加斯加的安塔纳里沃(Antananarivo); 4 Madagascar Antananarivo的中心医院的细菌实验室Mère -enfantTsaralàlana; 5巴斯德研究所,感染部门的生物学,巴黎大学,INSERM U1117,巴黎,75015,法国; 6巴斯德研究所,国家参考中心以及法国巴黎的李斯特菌中心合作; 7传染病和热带医学司,Institut Imagine,APHP,Necker-Enfants Malades Malades University Hospital,法国巴黎,法国。*信函:Mamitina Alain Noah Rabenandrasana,Rabalainnoah@gmail。com关键字:致命案例;基因组表征;李斯特氏病;马达加斯加;脑膜炎。缩写:Bdal,Bruker Daltonics图书馆; BigSDB,细菌分离株基因组序列数据库; CGMLST,核心基因组多分解序列分型; CSF,脑脊液; IVD,体外诊断; MALDI-TOF MS,基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱; MLST,多级别序列键入; MSP,主要光谱曲线; PCR,聚合酶链反应。在Bioproject PrjNA1032442下,组件和SRA数据存放在NCBI上。000764.v3©2024作者†这些作者对这项工作也同样贡献了本文的在线版本提供补充表。
1 罗马涅肿瘤研究与治疗科学研究所 (IRST) IRCCS 医学肿瘤学系,Via Piero Maroncelli 40, 47014 Meldola,意大利; emanuela.scarpi@irst.emr.it (西班牙文); cristian.lolli@irst.emr.it (中文); giuseppe.schepisi@irst.emr.it (GS); tcursano@gmail.com(MCC); chiara.casadei@irst.emr.it (抄送); ugo.degiorgi@irst.emr.it (UDG) 2 意大利特伦托 38122 圣基亚拉医院肿瘤科; orazio.ca fffi o@apss.tn.it(OC); francesca.Maines@apss.tn.it (调频); Stefania.Kinspergher@apss.tn.it (SK)3 意大利国家癌症研究所基金会医学肿瘤学系,20133 米兰; pierangela.sepe@istitutotumori.mi.it (PS); Giuseppe.procopio@istitutotumori.mi.it (GP) 4 意大利比萨大学医院肿瘤中心肿瘤医学科 2,邮编 56126; lugal71@yahoo.it(LG); andreasbrana89@gmail.com (AS)5 意大利阿维亚诺肿瘤参考中心肿瘤医学系,33081 阿维亚诺-波代诺内; lfratino@cro.it 6 意大利莱切 73100 Vito Fazzi 医院肿瘤科; chiuriv@yahoo.it 7 意大利马切拉塔医院肿瘤科,62100 马切拉塔, mattymo@alice.it 8 意大利热那亚 IRCCS 圣马蒂诺综合医院肿瘤医学学术单位,16132; zanardielisa@yahoo.it 9 热那亚大学医学院内科和医学专科系(DIMI),意大利热那亚 16132 10 意大利博洛尼亚 40138 S.Orsola-Malpighi 医院肿瘤科; francesco.massari@aosp.bo.it 11 临床肿瘤学,Arcispedale Sant'Anna 大学医院,意大利费拉拉 44124; ilaria.toma88@gmail.com 12 意大利罗马生物医学大学肿瘤医学系,00128 罗马,意大利; d.santini@unicampus.it 13 联合医院帕多瓦 SUD,35043 帕多瓦,意大利; caterina.modonesi@aulss6.veneto.it * 通信地址:vincenza.conteduca@irst.emr.it;电话:+39-0543-739100;传真:+39-0543-739151
抽象目的是将富含抗完全胶质素的神经胶质瘤激活1(LGI1)脑炎的患者与神经退行性[阿尔茨海默氏病(AD),Creutzfeldt – Jakob疾病(CJD)和原发性精神病(Psy)disororders(Psy)disororders进行比较。患有LGI1脑炎的方法是从2010年至2019年之间的法国参考中心数据库中追溯选择的,如果可以使用CSF进行生物标志物分析,包括Tau(T-TAU),磷酸化的TAU(P-TAU),Amyloid-BetaAβ1-42,Neurofilofiliments Lights(NF)(NF)(NF)作为常规实践的一部分发送以进行生物标志物测定的样本,并被正式诊断为AD,CJD和PSY,用作比较器。结果二十四名LGI1脑炎患者与39 AD,20 CJD和20 PSY进行了比较。在LGI1脑炎和PSY患者之间,在T-TAU,P-TAU和Aβ1-42水平中没有观察到显着差异。LGI1脑炎(231和43 ng/L)的T-TAU和P-TAU水平明显低于AD(621和90 ng/L,P <0.001)和CJD患者(4327和4327和4327和55 ng/L,P <0.001和P <0.001和P <0.01)。NF L浓度(2039 ng/L)与AD相似(2,765 ng/L),与PSY相比(1223 ng/L,P <0.005),但明显低于CJD(13,457 ng/l,p <0.001)。较高的NF L。可以得出CSF生物标志物水平和临床结果之间的相关性。结论LGI脑炎患者的NF L水平高于PSY,与AD相当,并且在发出癫痫发作时,提示与癫痫发作有关的轴突或突触损伤时甚至更高。
摘要背景:多中心患者注册机构的发展通过使用现实世界数据来促进科学知识的产生。一项全国性的基于网络的视网膜营养不良(IRDS)的注册表赋予患者和社区组织,同时支持正式的伙伴关系研究。我们旨在描述一个全国范围内的设计,开发和部署,调查人员和利益相关者以全球旨在开发高价值,基于网络的高价值,基于网络的高级,用户友好和可互操作的IRDS-IRD-PT-PT。结果:IRD-PT是Retina.pt平台中包括的临床/遗传研究注册表(https://www.retin a.com。pt),由葡萄牙视网膜研究小组开发。Retina.PT平台收集有关诊断出患有视网膜疾病的人的数据,迄今为止,葡萄牙的几个地点,有超过1800名参与者和30,000多个领事。IRD-PT模块与Retina.pt Core System进行交互,该系统为患者数据管理提供了一系列基本功能,而IRD-PT模块则允许数据捕获数据。所有IRD均相应地编码为疾病和相关健康问题的国际统计分类(ICD)9,ICD 10,ICD 11和Orphanet罕见疾病本体论(ORPHA代码),以使IRD与全球其他IRD注册处的互操作性相互互操作。此外,基因是根据基因和基因组的本体和人类的在线孟德尔遗传来编码的,而符号和症状则根据人类现象本体论进行编码。IRD-PT模块在Centro Hospital eUniversitáriodeCoimbra预先发布的IRD-PT模块,葡萄牙最大的IRDS参考中心。截至2020年4月1日,可用于此初步分析的537名参与者的最终数据。结论:在稀有疾病的特定领域,使用注册表可以增加个人的研究可及性,同时为临床医生/研究人员提供促进研究所需的相干数据生态系统。适当的设计和实施患者注册表可以快速决策和持续的数据挖掘,最终导致改善患者的结果。我们在这里描述了基于网络的,用户友好和互操作的软件工具的设计,开发和部署的原则,旨在生成重要的知识并收集有关葡萄牙IRDS流行病学,基因组景观和自然历史的高质量数据。
项目摘要 - 摘要:Alpha1-抗胰蛋白酶(AAT)是由肝细胞产生的蛋白质,其主要功能是调节肺中中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)的蛋白水解作用。已描述了超过 420 种 SERPINA1 基因变体;病理变异会导致 AAT 生成减少,有时还会使蛋白质以聚合物的形式在肝细胞内积聚,使患者易患肺部和/或肝脏疾病。目前,严重 AAT 缺乏症 (DAAT) 患者的治疗方案包括肺或肝移植或替代疗法,即静脉输注源自纯化血浆的人类 AAT。肺或肝移植与技术和免疫并发症有关,并且都带来沉重的经济负担。标准替代疗法需要每周静脉注射 AAT,从而降低了生活质量。最近,一些基因编辑机制(碱基编辑器)经过测试,被报告为比其他方法更有效、更安全地纠正由 DAAT 等单核苷酸变异引起的疾病。碱基编辑器 (BE) 无需双链 DNA 断裂即可纠正核苷酸碱基,同时还可最大限度地减少基因编辑的不良后果,例如大片段缺失、插入/缺失、易位或其他染色体异常。意大利 AAT 缺乏症登记处 (RIDA1) 由 IRCCS Policlinico San Matteo 肺病科的意大利 AAT 缺乏症诊断参考中心协调,已登记了约 700 名因不同突变导致 DAAT 的患者。我们的目标是从具有不同病理基因型的 DAAT 患者的血液和尿液中生成诱导多能干细胞 (iPSC),并将其分化为肝细胞 (iHep)。由于肝细胞是 AAT 的主要生产者,我们将使用 iHep 测试不同的基因编辑方法来纠正各种突变。因此,我们希望最终纠正 SERPINA1 基因中存在的突变,为 DAAT 的治疗开辟新的治疗选择。项目开始时间: 项目结束时间: 项目总成本: 2023 年 9 月 1 日 2025 年 8 月 31 日 100,000.00 总计 5 x 1000 股: 参考年份 5 x 1000: 收到 5 x 1000 资金的日期: 31,000.00 2021 年 2022 年 11 月 22 日 预算
虽然神经系统免疫检查点抑制剂相关的不良事件的频谱正在扩大,但患者的结局并不能很好地进行。这项研究旨在评估神经免疫相关的不良事件的结果并确定预后因素。包括在两个临床网络(法国副塑性神经综合症中心,里昂;巴黎牛皮炎,巴黎的法国参考中心)确定的所有患者与神经系统免疫相关的不良事件。修改后的Rankin分数在一开始,6、12、18个月和上次访问中。在研究期间,使用多州马尔可夫模型来估计轻度残疾(MRS <3),严重的残疾(MRS 3-5)和死亡(MRS 6)之间的过渡率。使用最大似然估计了状态到国家的过渡率,并将变量引入不同的过渡中以研究其效果。在205名患者中,总共包括147例患者,怀疑神经系统免疫相关的不良事件。中位年龄为65岁(范围20-87),男性为87/147例(59.2%)。神经系统免疫相关的不良事件涉及87/147例患者(59.2%),51/147的中枢神经系统(34.7%)和9/147(6.1%)的全外周神经系统。副塑性样综合征。癌症包括肺癌(36.1%),黑色素瘤(30.6%),泌尿科癌症(15.6%)等(17.8%)。患者。在发作时108/144例患者(75.0%)和33/146例患者(22.6%)的严重残疾据报道(中位随访时间:12个月:12个月,范围为0.5-50); 48/147(32.7%)患者死于癌症进展(17/48,35.4%),神经毒性(15/48,31.2%),其他原因(10/48,20.8%)或未知原因(6/48,12.5%)。从严重残疾到轻度残疾的过渡率与黑色素瘤独立增加[与肺癌相比,危险比= 3.26,95%CI(1.27; 8.41)]和肌炎/肌炎/神经肌肉连接疾病[危险比= 8.26,95%CI(2.90; 2.90; 23.58; 2.90; 2.90; 2.90; 2.90; 2.90; 2.90; 2.90; (0.47; 0.99)]和副塑性样的syn dromes [危险比= 0.29,95%CI(0.09; 0.98)]。患有神经免疫相关的不良事件的患者,肌炎/神经肌肉连接疾病和黑色素瘤增加了从严重残疾到轻度残疾的过渡率,而年龄较大和副恐怖类样的syn液会导致神经系统差;需要未来的研究来优化此类患者的管理。
肾脏病,透析和肾脏移植部;法国淀粉样蛋白病的参考中心和其他单克隆IG沉积物,大学医院,POITIERS,法国单克隆肾上腺病具有肾脏意义(MGRS)是指由分泌的Monoclonal Ig(Migig(Migig)引起的肾脏疾病的小型B-cell Clone的关联,肾脏不适的肾脏疾病与肾脏差异有关。肿瘤负担的肾脏病变受肿瘤负担的独立,受MIG的物理化学特征的约束,涉及直接(MIG沉积或沉淀)或间接(自身抗体活性,补体活化激活)机制。与MGRS相关的肾脏疾病的频谱广泛,涵盖了拟南芥疾病(Fanconi综合征,晶体储存组织细胞增多症)和肾小球疾病。后者根据肾小球沉积物的组成和超结构外观分为三类:1)肾小球病(GP),带有有组织的MIG沉积物(免疫球蛋白[AL和AH}溶质膜[Al and ah} 8oloidisis [Al and ah} 8oloilidisis,Cyoglobobulobulic ogglobulic gp,Cyroglobulic GP,Immunotactactoid Gp,Light Chapoid Gp,Light Chandelline Cyry)Cyry)compy-Cyry)pody pody pody; 2)具有非组织沉积物的GP(单克隆IG沉积疾病[LCDD,HCDD,LHCDD],带有MIG沉积物[PGNMID]的增殖性肾小球肾炎[PGNMID]); 3)无IG沉积的GP(与MIG相关的C3GP和血栓性微血管病)。通过分析肾脏症状,尤其是蛋白尿,以及存在暗示性的肾上腺外表现,提出了每种特有MGRS相关的肾脏疾病的诊断。在大多数情况下,需要进行轻度,免疫荧光和电子显微镜研究,有时需要通过细胞瘤分析完成,在大多数情况下进行诊断确认是需要进行的。有必要识别和定量致病性MIG(SPEP,UPEP,血清和尿液免疫固定,无血清光链)的详细血液学检查,并用于表征下面的克隆(骨髓流式细胞仪,细胞遗传学)。敏感技术,例如基于RNA的Ig库测序,可能可用于检测微妙的克隆。早期诊断和通过以克隆为目标的化学疗法快速实现深血液学反应是影响长期肾脏和患者结局的主要因素。对浆细胞克隆的处理主要依赖于硼酸和基于抗CD38单克隆抗体的方案,这些方案不需要剂量适应,并且在肾脏损害患者中具有有利的疗效/毒性比。肾移植是选定的终末期肾脏疾病患者的宝贵选择,如果在手术之前已经实现了深层稳定的血液学反应(≥VGPR)。