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粘液产生，宿主 - 微生物组相互作用，激素敏感性和先天免疫反应在人宫颈芯片中建模
顺式调节元件（CRE）与反式调节剂相互作用以编排基因表达，但是在多基因基因座中如何协调转录调控尚未实验定义。我们试图表征控制相邻共刺激基因CD28，CTLA4和ICO的动态表达的CRE，并编码了T细胞介导的免疫的调节剂。平铺CRISPR干扰（CRISPRI）筛选在常规和调节子集的原代人T细胞中，发现的基因，细胞子集和刺激特异性CRE。与CRISPR敲除筛选和针对转座酶可访问的染色质的测定（ATAC-SEQ）分析确定了在特定的CRISPRI-RESPONSIME元素上影响染色质状态的反式调节剂，以控制共刺激基因表达。然后，我们发现了一个关键的CCCTC结合因子（CTCF）边界，该边界增强了与CTLA4的相互作用，同时还可以防止CD28的混杂激活。通过系统地绘制CRE和相关的反式调节剂直接在原代人T细胞子集中，这项工作克服了长期存在的实验局限性，以解码与免疫稳态至关重要的复杂的多基因基因座中的上下文相关基因调节程序。
补充材料
图 S2。反式配对切口方法导致人类 HSPC 中的 HDR 效率低下。(A) 使用 CRISPR/Cas9、单切口或反式配对切口方法在 HEK293T 细胞中将 T2A-mCherry 插入人类 B2M 基因座的靶向策略。使用没有 (pDonor) 或有 2 个靶序列 (TS) (pDonor-Nick 2) 的供体质粒。靶向 B2M 的常见 sgRNA 以红色表示。使用所示方法靶向 B2M 基因座六天后，对 mCherry + HEK293T 细胞的百分比进行 FACS 分析。图表总结了通过 FACS 测量的 mCherry + (HDR) HEK293T 细胞的频率。(B) 使用 CRISPR/Cas9、单切口或反式配对切口方法在人类 HSPC 中将 T2A- mCherry 插入人类 B2M 基因座。使用单链 (ss) AAV 和不含 (scAAV) 或含 2 个 TS 的自互补 (sc) AAV (scAAV-Nick 2 ) 作为供体模板。FACS 分析显示靶向三天后 mCherry + HSPC 的频率。条形图显示 HDR (mCherry + ) 效率。数据显示为四次独立实验的平均值 ± SD。
扩展现实跨技术：桥接数字和物理世界以支持跨性别者
扩展的现实（XR）技术变得越来越普遍，并且可能有能力帮助跨性别者等边缘化群体。通过n = 18的跨性别技术创建者的访谈绘制，我们研究了XR技术的发展方式，并且可以支持跨性别者。我们发现了XR Technologies支持反式体验的许多创造性方式。反式技术创建者正在设计增强现实（AR）和虚拟现实（VR）系统，这些系统可以帮助人们探索跨性别的身份，体验新型的身体，教育和展示跨性别的故事并策划了跨性别的内容，操纵身体世界，并创新性别 - A rming手术技术。此外，我们展示了如何将XR作为反式身份的类比，可以帮助我们以新方式思考跨性别身份固有的UISIDE和UCTAILIAN，这反过来又使设想技术可以更好地支持复杂和不断变化的身份。尽管XR具有支持跨性别者的潜力，但当前的AR和VR系统仍面临限制其大规模使用的限制，但是随着访问XR系统的访问，它们的限制会增加，因此它们可以改善跨性别的生活。
损伤相关分子模式纤维三糖改变蛋白质的磷酸化模式
摘要 我们最近证明，纤维素分解产物纤维三糖是一种损伤相关分子模式 (DAMP)，可诱导与细胞壁完整性相关的反应。下游反应的激活需要拟南芥马来酸二酯结构域内含有的纤维寡聚体受体激酶 1 (CORK1) 1。纤维三糖/CORK1 通路可诱导免疫反应，包括 NADPH 氧化酶介导的活性氧产生、丝裂原活化蛋白激酶 3/6 磷酸化依赖性防御基因激活以及防御激素的生物合成。然而，细胞壁分解产物的质外体积累也应激活细胞壁修复机制。我们证明，在将纤维三糖施用于拟南芥根部后数分钟内，参与活性纤维素合酶复合物在质膜中积累以及负责蛋白质运输到反式高尔基网络 (TGN) 和在反式高尔基网络内运输的多种蛋白质的磷酸化模式就会发生改变。参与半纤维素或果胶生物合成的酶的磷酸化模式和多糖合成酶的转录水平几乎不受纤维三糖处理的影响。我们的数据显示，参与纤维素生物合成和反式高尔基体运输的蛋白质的磷酸化模式是纤维三糖/CORK1 通路的早期靶标。
酵母的调控进化机制 - NSF-PAR
1 密歇根大学分子、细胞与发育生物学系，密歇根州安娜堡，美国 2 密歇根大学生态与进化生物学系，密歇根州安娜堡，美国 通讯作者 Patricia J. Wittkopp，wittkopp@umich.edu 生态与进化生物学系 分子、细胞与发育生物学系 4010 生物科学大楼 1105 北大学大道 密歇根大学，密歇根州安娜堡 48109-1048 美国 电话：+1-734-763-1548 所有作者电子邮件地址 siddiqm@umich.edu (MAS) wittkopp@umich.edu (PJW) 简称：酵母的调控进化机制 关键词：基因表达、调控网络、顺式调控、选择、突变 摘要 酵母调控变异的研究——在新的突变水平、物种内的多态性和物种间的分化——为真核生物基因表达进化的分子和进化过程提供了深刻见解。酵母基因组越来越容易被操纵，表达也越来越容易以高通量方式量化，这最近加速了对多个进化时间尺度上的顺式和反式调控变异的机制研究。例如，这些研究确定了影响其进化命运的顺式和反式突变性质的差异，通过实验表征了顺式和反式调控变异发挥作用的分子机制，并说明了调控网络如何在有或没有基因表达变化的物种之间出现分歧。
OSE Immunotherapeutics 和勃林格殷格翰...
1 顺式靶向：双特异性抗体能够以顺式或反式结合方向靶向细胞。在反式结合过程中，抗体识别两种不同的抗原，每种抗原表达在不同的细胞群上，并且可以将两种不同的细胞群相互连接（例如 T 细胞接合剂）。顺式结合双特异性抗体靶向表达在同一细胞上的两种抗原，从而优先激活所需的免疫细胞类型，同时最大限度地减少其他免疫细胞的激活（Segués A. 等人，《国际细胞和分子生物学评论》，2022 年）。2 Schechter M、Melzer Cohen C、Yanuv I 等人，《糖尿病-心脏-肾谱流行病学：140 万名成年人的横断面报告》。《心血管糖尿病学》。2022；21(1)：104。doi:10.1186/s12933-022-01521-9