XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System叶绿体
CMFRI在印度和发展中的海藻中的作用...
海藻因其细胞壁多糖（例如琼脂，阿尔金，角叉菜胶等）以及肥料，饲料和生物活性代谢物而被商业地利用。海藻也代表了脂肪酸，维生素和矿物质的极好来源。它们是由分类学杰出的绿色（叶绿体），棕色（Phaeophyta）和红色（Rhodophyta）海藻组成的海洋大植物。这些海藻资源在我们的半岛海岸线以及安达曼 - 尼科巴尔（Andaman-Nicobar）和lakshadweep群岛上的潮汐和潮汐间水中最佳增长。印度被赋予超过206万吨的湿湿生物质，属于700种。，将近60种对它们的多糖和继发代谢物在经济上很重要。每年从印度的野外收获约20,000吨（湿重）。印度对海藻的商业开发已于1966年开始。海藻（例如Gelidiella，Gracilaria和Sargassum）一直从印度出口到1975年。，但是，印度政府考虑到当地琼脂和阿尔金工业的需要，后来禁止出口。但是，印度的海藻行业尚未生产所需数量的藻酸钠和琼脂。结果，印度每年都会进口琼脂和阿尔金，花费大量外汇。目前，来自古吉拉特邦海岸的海藻和泰米尔纳德邦的许多地区都是由小型和大型行业收获的。该电台还开发了一种用于从Gracilaria spp生产琼脂的家庭手工业方法。自1972年以来，印度的ICAR中央海洋渔业研究所（CMFRI）一直在印度开展海藻马养殖和海藻利用率。CMFRI的Mandapam区域站开发了用于使用筏，coir-Rope Nets/Spore方法的琼脂Gracilaria Edulis的商业规模种植技术。和sargassum spp的藻酸。在1980年代，并向许多农民和企业家展示了琼脂和阿尔金的生产。这些示威活动为在泰米尔纳德邦Madurai的许多小规模琼脂行业开发铺平了方法。
Bafilomycins：一类来自微生物、动物细胞和植物细胞的膜 ATPase 抑制剂
在原核生物和真核生物中，大多数已鉴定的离子泵 ATPase 属于以下三种结构类型之一。（i）F1Fo ATPase（F 型）存在于线粒体内膜（2）、叶绿体类囊体膜（3）和细菌细胞质膜（4）中。（ii）E1E2 ATPase（P 型）存在于真菌（5）、植物（6）和动物的细胞质膜中[包括 Na'，K4-ATPase（7）和 H +，K + -ATPase（8）]，以及肌细胞的肌浆网（Ca 2+-ATPase）（9）和细菌细胞质膜（K+-ATPase）（10，11）。 (iii) 已鉴定出第三类 ATPase（V 型），并从真菌和植物液泡（参考文献 12 及其中的参考文献）、包被囊泡（13、14）和嗜铬颗粒（15、16）的膜中部分纯化。正如 Mellman 等人（17）所建议的，我们使用术语“液泡 ATPase”来指代第三类 ATPase。F1Fo ATPase 通常使用 H+ 的电化学梯度（18）或偶尔使用 Na+ 梯度（19）来合成 ATP。这种类型的酶也表现出 ATPase 活性，在某些情况下仅在用蛋白酶活化后才表现出 ATPase 活性（20）。叠氮化物和 N,N'-二环己基碳二酰亚胺可抑制 F1Fo ATPase 的酶活性；寡霉素也可抑制线粒体 ATPase（21）。在 E1E2 ATPases 中，ATP 水解释放的能量与阳离子跨膜转运偶联。酶循环通过构象状态，包括形成磷酸化中间体。酶活性不受叠氮化物或寡霉素的影响，但被钒酸盐特异性抑制，在大多数情况下被 N-乙基马来酰亚胺和异硫氰酸荧光素抑制，而对于 Na4 ,K4-ATPase，则被乌巴因抑制 (5-11)。液泡 ATPases 似乎会水解 ATP，产生质子梯度，用于酸化细胞内区室 (12、17、22)。这组 ATP 酶因其抑制剂特异性而与其他两组 ATP 酶区分开来。液泡 ATPase 不受叠氮化物、寡霉素、钒酸盐或乌巴因的抑制。相反，
博士Manoj Kumar_faculty profile_cv aige
Manoj Kumar博士指定：Amity基因组工程研究所教授（AIGE）专业：植物发育生物学，非生物压力，植物营养，拟南芥，水稻，农作物开发，基因组工程，细胞信号传导，表观遗传学，基因组学和大数据分析。联系人：mkumar18@amity.edu，kmanojt@gmail.com， +91-8130606394（M）在获得麦克斯·普朗克植物育种研究所和德国大学的博士学位后植物如何感知和响应温度。他在发现植物色素B如何感觉温度和调节植物生长方面做出了贡献。他进一步证明了拟南芥中的叶绿体信号通信门的耐热性。他在各种国际会议/会议和研讨会上积极参与并进行了会谈。他目前的研究兴趣是探索细胞如何感知并响应外部线索并使用不同的模型系统来探索分子机制。他的实验室的主要目标之一是发展气候弹性和富含营养的农作物物种。除了研究外，他还参与了与分子生物学以及研究方法相关的教学课程。奖项和荣誉：2016年印度科学技术系的“年轻科学家奖” 2015年DS Kothari博士DS Kothari博士博士博士博士博士奖学金授予印度大学授予委员会，2011年，2011年，由约翰·英恩斯（John Innes）奖学金，约翰·英恩斯（John Innes）奖学金，由诺威奇英国（John Innes）Center，Norwich UK，UK 2012德国科隆大学2004年，2004年，印度CSIR-UGC的国家生命科学讲座（NET）的国家资格：2023 - 2026年ICMR-Extra壁画研究赠款（CO-PI）（CO-PI）（250万INR 250万）2019 - 2022年ICMR-Extra-Extra Research Grant（CO-PI）（CO-PI）基因组编辑技术（100万印度卢比的资助）2016 - 2020年启动研究赠款塞尔布DST，印度（440万印度卢比的资金）精选出版物：
微生物生物技术
1。为学生提供有关基因组学和蛋白质组学的基本知识2。对基因组映射，结构/功能基因组学，基因组学和蛋白质组学涉及的技术的广泛知识。课程内容单元1：OMICS的基因和基因组介绍；基因组学类型；基因：orf;外显子；内含子；原核，真核和线粒体/叶绿体基因组； shot弹枪DNA测序； c-value＆paradox;人类基因组项目。单元2：基因组图和分析基因组映射的基因表达类型；涉及基因组图和基因表达分析的技术（RFLP，RAPD，SSCP，SSLP，STS，RT-PCR； DD-PCR，SNP，FISH，FISH，NUCLEASE保护测定，分子杂交）。单元3：蛋白质组学概念和蛋白质组成分的基础；蛋白质组学在生物学功能中的重要性；蛋白质 - 蛋白质相互作用和研究它的方法：蛋白质阵列，交叉链接方法，亲和力方法，酵母杂种系统。单元4：蛋白质质谱法（MS）的质谱分析 - 肽质量指印，质量精度，分辨率，灵敏度；离子来源：电喷雾电离，基质辅助激光解吸和电离；质量分析仪：四极，离子陷阱，飞行时间，圆形，傅立叶 - 转换离子回旋共振，混合分析仪；探测器； MS-MS; LC-MS。教科书：-1。基因组分析和基因组学原理S.B. Primrose和R.M. Twyman，第三版（Blackwell Publishing）。2。Liebler，“蛋白质组学简介” Humana出版社3。Conard，爱德华。 基因组学。 2.Pennington，SR，Dunn MJ，“蛋白质组学：功能的蛋白质序列”。Conard，爱德华。基因组学。2.Pennington，SR，Dunn MJ，“蛋白质组学：功能的蛋白质序列”。Apple Academics参考书：-1。ODD RW，Primrose SB，“基因操纵原理，基因工程概论”，Blackwell Science Publications。viva书3.生物技术的质谱法：Gary Siuzdak。
B.Sc.工业微生物学（H）（6个学期持续时间）... 配置文件 配置文件 配置文件
学期I BTM -111：生物化学I（3+0）1。生物分子的基本化学：碳水化合物，脂质，蛋白质和核酸2。氨基酸：分类和特性3。蛋白质：基于结构和功能的分类，蛋白质的结构组织（主要，次生，第三和第四纪结构）。4。光合作用：光合作用仪的结构，光和暗反应，C 3和C 4周期5。脂质：结构，属性，分类和功能BTM -112：微生物I（3+0）1。微生物学的历史，微生物学的范围，微生物多样性的概念2。显微镜：荧光，相对比，电子显微镜3。Eubacteria，古细菌，海洋资源和多样性和真核微生物的简介4。革兰氏正，革兰氏阴性和古细胞细胞之间的结构差异5。微生物生长：批次，连续和同步培养物6。微生物营养：光营养，趋化性，异育7.微生物介质：简单，微分和选择性8。纯文化技术：隔离，保存和维持培养物BTM -113：细胞生物学（3+0）1。简介：细胞理论，原核生物和真核细胞的结构组织。2。质膜：跨膜的结构组织，功能，运输。3。细胞细胞器：粗糙和光滑的内质网，高尔基体配合物，蛋白质运输，溶酶体，过氧化物酶体，液泡，线粒体，叶绿体的结构和功能。4。8。核和核仁，染色质结构和组织5。细胞骨架和额外的蜂窝矩阵6。细胞分裂：细胞周期和细胞周期的控制，细胞死亡（凋亡和坏死），癌症。BTM -114：生物化学Lab -I（0+2）1。生物化学单位2。生化实验室中使用的仪器/设备和玻璃商品3。溶液的浓度4。PH和确定5。缓冲区，它使用6。碳水化合物的定性测试7。通过O-甲硅烷法估计葡萄糖。 氨基酸的定性测试9。 蛋白质的定性测试。 10。 通过Biuret方法估计蛋白质。 11。 滴定强酸和弱酸的混合物12。 纸色谱法通过O-甲硅烷法估计葡萄糖。氨基酸的定性测试9。蛋白质的定性测试。10。通过Biuret方法估计蛋白质。 11。 滴定强酸和弱酸的混合物12。 纸色谱法通过Biuret方法估计蛋白质。11。滴定强酸和弱酸的混合物12。纸色谱法
全基因组识别和硅内表达...
抽象类胡萝卜素裂解酶（CCOS）酶通过产生多种杀伤型及其衍生物，在植物生长和发育中起重要作用。这些化合物对于为花朵和水果以及合成的植物激素（例如脱甲酸和strigolactone）而言至关重要。尽管其重要性，但尚未确定向日葵中CCO酶的基因家族响应。在这项研究中，我们确定了葵花籽植物的CCO基因，以填补这一知识空白。系统发育和同步分析表明，在不同植物物种中保守的Helianthus annnus cco（Hacco）基因可以根据其保守域将其分为三个亚组。使用模因工具和多个序列比对分析在HACCO基因序列中鉴定出保守的基序。顺式调节元素（CRE）分析Hacco基因表明存在与植物激素，发育以及对生物和非生物胁迫的反应有关的各种响应元件。这意味着这些基因可能会对植物激素，发育提示和干旱胁迫反应，从而在发育更具耐药作物的发育中提供了潜在的应用。属于9-CIS-环氧类胡萝卜素双加氧酶（NCED）亚组主要表现出叶绿体定位，而在其他组中发现的基因主要位于细胞质中。通过60个miRNA调节了这21个鉴定出的Haccos，表明microRNA在向日葵中基因调节中的关键作用。在干旱胁迫下的基因表达分析显示，Hanced16和Hanced19的显着上调，这是ABA激素生物合成中关键的基因。在器官特异性基因表达分析中，HACCD12和HACCD20基因在叶片中表现出较高的活性，表明在叶子色素沉着中具有潜在的作用。这项研究为未来的研究及向日葵基因家族的调节和功能的研究奠定了基础。有可能开发可用于在育种计划中使用的分子标记物，以创建对生物和非生物胁迫具有抗性的新向日葵线。
摘要。 Mahmudi M，Arsad S，Lusiana ED，Musa M，Fitrianesia F，Ramadhan SF，Arif AR，Savitri FR，Dewinta AA，Ongkosongo AD。 2023。微藻多样
摘要。Mahmudi M，Arsad S，Lusiana ED，Musa M，Fitrianesia F，Ramadhan SF，Arif AR，Savitri FR，Dewinta AA，Ongkosongo AD。2023。印度尼西亚东爪哇省Pasuruan和Sidoarjo沿海地区不同栖息地特征的微藻多样性。生物多样性24：4418-4426。微藻是生活在各种栖息地中的微观真核生物。这项研究的目的是确定几个亚藏人中微藻的类型和丰度，包括沉积物，红树林，水柱和人造底物；并分析影响丰度微藻的环境因素。这项研究是在印度尼西亚东爪哇省帕苏鲁安和西多尔霍的沿海地区的多个地点进行的。使用目的抽样方法应用了一种定量描述方法。使用净用于浮游微藻的净和采样图收集样品。使用NMD（非金属多维缩放）对微藻进行分组，并使用CCA（规范对应分析）分析了微藻丰度与水质参数之间的关系。结果表明，在所有研究地点都发现了芽孢杆菌科，氰基科和叶绿体类别，但是trebouxiophyceae和dinophyceae仅在帕苏鲁安海滩发现。在Sidoarjo的Wughoyo Beach的沉积物栖息地中发现了最高的微藻，并以706,605 Ind。cm -2。CCA分析表明，在所有部位都发现了芽孢杆菌科，表明其适应性很高。两个沿海地区的多样性，均匀性和优势指数范围为1.43-2.61； 0.71-0.96;和0.06-0.27。使用NMDS的相似性分析表明，这三个站点之间没有相似性，这表明每个位点都有很高的微藻变化。该分析的结果表明，特定栖息地具有独特的微藻多样性，因此保留多种栖息地类型很重要。
BiodateM.Sc.微生物学M.Sc.微生物学
课程目标：细胞生物学课程提供了对细胞细胞器和组件的结构和功能的基本理解，以及细胞与其微环境单元I-I：细胞结构和功能的功能相互作用：细胞大小和形状的多样性；细胞理论；原核细胞和真核细胞的结构；细胞细胞器及其组织，细胞内室内化 - 肾上腺素 - 类型和功能，过氧化物酶体，内体和溶酶体的结构和功能，线粒体的结构功能和叶绿体；细胞外基质，微生物中细胞壁的结构和功能。UNIT-II: PLASMA MEMBRANE STRUCTURE AND FUNCTION: Chemical composition and molecular arrangement (lipid bilayer, membrane proteins and carbohydrates), models of membranes (fluid mosaic)., Membrane Transport: Active and passive transport of ions, Na+/K+ pump, ATPase pumps, Co-transport, Symport, Antiport, Endo cytosis and Exocytosis.单位-III：细胞相互作用和细胞骨架：细胞粘附分子：钙粘蛋白，类似于分子的免疫球蛋白，整联蛋白和Selectins。细胞连接：紧密连接，脱骨体，半底体和间隙连接。微管，微丝及其动力学。Centrosome，Cilia，Flagella。有丝分裂仪和染色体的运动。单位IV：细胞周期和检查点和癌症：细胞周期 - 细胞周期，相间，有丝分裂，减数分裂和细胞因子的细胞周期控制和检查点的各个阶段，细胞周期中断；癌症;类型和阶段。肿瘤抑制基因和原子基因。癌症的分子基础。wnt，jak-stat途径。单位V：细胞信号传导，凋亡和坏死：概述，胞质，核和膜结合受体，次级使者的概念，CAMP，CGMP，CGMP，蛋白质激酶，G蛋白，信号传输机制。衰老，坏死分类，坏死的形态模式，坏死原因，凋亡 - 程序性细胞死亡；凋亡的机制；由内部信号触发的凋亡；由外部信号触发的凋亡；凋亡诱导因子；癌症细胞凋亡的凋亡 - 程序性细胞死亡；凋亡的机制；由内部信号触发的凋亡；由外部信号触发的凋亡；凋亡诱导因子；癌症的凋亡。
NEP- 2020 理学学士 - 植物学课程大纲
第一单元：生命的起源和进化 生物多样性的进化史，早期地球和生命的起源，自发，生物起源，巴斯德的实验，疾病的细菌理论；生命史上的重大事件，生命多样性的分类，生命王国——原核生物、真核生物、古细菌，达尔文的生命观和物种起源，达尔文的进化论。第二单元：微生物多样性 微生物的分类- R. H. Whittaker的五界概念，Carl Woese的域系统。细菌特殊群体的简要介绍-古细菌、支原体、衣原体、放线菌、立克次体和蓝藻。第三单元：生物分子 碳水化合物：命名和分类。脂质：储存和结构脂质的定义和主要类别。蛋白质：氨基酸的结构；蛋白质结构的层次。核酸：核苷酸的结构和功能；核酸的类型。单元 4：生物学的遗传方法 遗传模式和生物学问题；孟德尔定律的变化；遗传信息的分子基础；遗传信息从 DNA 到 RNA 再到蛋白质的流动。实践 1.学习 a) 显微镜的使用 b) 固定和染色的原理。2.制备正常、摩尔和标准溶液、磷酸盐缓冲液、连续稀释液 3.使用微量移液器 4.通过纸色谱法分离 A) 氨基酸 B) 叶绿体色素。5.对细菌进行革兰氏染色。6.从永久载玻片研究细胞/组织中核酸和粘多糖的细胞化学分布。7.使用 Lowry 法定量估计蛋白质。使用绘制的标准曲线确定未知样品的浓度。8.通过薄层色谱法分离和定量糖。9.培养大肠杆菌并用浊度法估计培养物密度。根据现有数据绘制生长曲线。10.从大肠杆菌中分离基因组 DNA。建议阅读 1.Campbell, N.A.和 Reece, J.B.(2008) 生物学第 8 版，Pearson Benjamin Cummings，旧金山。2.Raven, P.H 等人 (2006) 生物学第 7 版 Tata McGrawHill Publications，新德里 3.Griffiths, A.J.F 等人 (2008) 遗传分析简介，第 9 版，W.H.Freeman & Co. NY
工程picochlorum藻类了解巨型病毒感染和
picochlorum，是微藻生物学的新兴模型。是绿藻进化枝（Trebouxiophyceae）的成员，并于2004年发现，P。senew3的基因组于2014年首次出版，发现是在真核生物中最小的（13MB）和最小的基因密集（7k基因）之一，在真核生物中（Henley等人）（Henley等人（Henley等）（Henley等人）（Henley等人，2004年； 2004年； fofllonke an an an al an an al an al an an an an an al al an an an an an al al an an an al an an an an an an an an an an。picochlorum非常耐受性，并且具有快速的增长率，使其成为了解气候变化和病毒感染的良好候选者。尽管具有工业潜力，但其光合作用反应和新陈代谢仍未清楚。此外，地中海沿海泻湖中越来越多的皮克洛鲁姆盛开量是牡蛎养殖（THAU）的环境问题，从而损害了牡蛎的生长，无法消耗小藻类。因此，了解picochlorum种群在本质上，尤其是病毒的调节是一般的重要性。在Biam和Mio Labs之间的新兴合作中，该项目的假设（已经由AMU Transivir 2022-2025项目资助），我们已经与Berre Lagoon隔离并测序了一个Picochlorum，并将其测序为“ Pico A”。我们还隔离了在PICO A中复制的各种巨型病毒，这些病毒的一部分具有基因组，其中包含两个非常古老的辅助代谢基因（AMG）。巨型病毒在这些酶中可以使用什么使用？它们是否在感染过程中调节宿主细胞代谢以提高复制效率？使受感染的宿主在人群中更具竞争力？picochlorum sp。这些基因代码对于血红素氧化酶（HMOX）和植物苯胺蛋白：铁毒素氧化还原酶（PCYA）一种在藻类叶绿体中产生色素具有重要调节功能的途径：具有重要调节功能：叶绿素合成的叶绿素（Zhang et al。稳定光系统I（Wittkopp等，2017）。我们博士项目的主要目的是将分子生物学和遗传学方案调整为PICO A，目的是通过操纵HMOX和PCYA来了解巨型病毒 - 微藻相互作用。博士学位候选人还将尝试使用工程化的CRISPR/CAS9 PICO A作为底盘，以在感染期间设计我们的巨型病毒（Noel等，2021； Bisio等，2023）。由于其对温度和盐度的耐药性高以及前所未有的2小时双倍时间，作为可再生生物量的来源，人们获得了越来越多的兴趣。但是，它的光合作用和异养代谢几乎完全没有表征，并将提供理解其适应性的关键之一。因此，我们在该项目中的支持目的是对电子流，光保护途径和二氧化碳摄取机制进行完整的光合特征，并评估其在还原碳源上生长的能力。共同服务员