传染性胰腺坏死病毒 (IPNV) 是虹鳟养殖业动物福利和经济的主要威胁之一。先前的研究已表明,对 IPNV 的抗性存在显著的遗传变异。这项研究的主要目的是调查虹鳟鱼苗对 IPNV 的抗性遗传结构。为了实现这一目标,610 条虹鳟鱼苗(来自 5 个公鱼和 5 个母鱼的全因子交配)接受了来自商业养殖场养殖的大西洋鲑鱼的 IPNV 分离株 (IPNV-AS) 的浴池攻击。使用三种不同的表型评估对 IPNV 的抗性;在 40 天的攻击测试期间记录在鱼上的二元存活率 (BS)、总存活天数 (TDS) 和病毒载量 (VL)。所有鱼都使用 57K Affymetrix SNP 阵列进行基因分型。IPNV-AS 分离株导致总死亡率为 62.1%。生存性状(BS h 2 = 0.21 ± 0.06,TDS h 2 = 0.25 ± 0.07)和 VL 性状(h 2 = 0.23 ± 0.08)的遗传力估计值为中等,表明在虹鳟鱼选择性育种计划中可能选择提高对 IPNV 的抗性。两个生存性状(BS 和 TDS)之间的统一估计遗传相关性表明这两个性状可被视为同一性状。相反,在 VL 和两个生存性状之间发现中等正向负遗传相关性(- 0.61 ± 0.22 至 - 0.70 ± 0.19)。许多 QTL 跨越染色体范围的 Bonferroni 校正阈值的性状的 GWAS 表明所研究性状的多基因性质。发现 10 个可能识别的基因中,大多数与免疫或病毒致病机制有关,这可能是导致 IPNV-AS 存活率显著遗传变异的原因。QTL 验证分析表明,检测到的 QTL 的三种基因型在死亡率和 VL 方面没有显著差异。VL 性状在死鱼苗中表现出较大的变异,并且与两种存活表型具有一致的模式,但死鱼苗和活鱼苗中 IPNV VL 阳性样本的比例没有显著差异
结果:14个领域实验中的平均DI范围为2.1%至70.4%。在经过测试的加入中观察到了DI的高度差异,在红色品种中,DI最低的DI在红色品种中检测到了最低的DI,Reed of the良好的选择,红色飞溅COS,步兵,甜蜜的情人节,Annapolis和Velvet。多个线性回归模型揭示了在DI上的四个分析决定因素中的小但显着的影响(P <0.005)。DI值较低的加入的植物发育较慢(PD,r = 0.352),ACI含量较高(r = - 0.284),TFD较低(r = 0.198)和较低的SPAD含量(r = 0.125)。一项全基因组关联研究显示,在九个生菜染色体中,位于八个di的13个QTL(例外是Chr。8)。最常见的QTL(QINSV2.1)位于Chr上。2。DI的DI QTL与PD,ACI和SPAD的QTL相同的基因组区域。chr上的di的另外三个QTL。5和8。