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Rokas Grigaitis,博士EMBO博士后研究员,Vu LSC-Embl合伙伙伴研究所的高级研究员,在体外生物化学中高通量:从噬菌体生物学到基因组编辑摘要,通过允许对大型实验数据集的习惯和/或处理高级数据集的处理,使一定的领域成为了一定的领域。但是,由于机械生化研究在很大程度上取决于经典的重组蛋白表达和纯化技术,因此它们在很大程度上保持了昂贵且耗时。未经细胞表达方法发展的最新进展有可能促进对内部和功能数据的高通量获取,从而大大增强了我们对生化系统的理解。在本次研讨会中,Rokas Grigaitis博士将介绍高通量无细胞的蛋白质表达技术,并提供有关他如何利用/计划利用它们在噬菌体以及潜在新型基因组编辑工具的发现和表征的研究中的见解。Bio-Sketch Rokas Grigaitis是Vu LSC-Embl合作研究所的博士后研究员,他正在开发高通量方法,以研究噬菌体和CRISPR核酸酶中核酸代谢的研究。在他的博士后工作之前,Rokas曾在维尔纽斯大学学习细菌抗流量防御系统,以及Eth Zurich和Vienna大学的真核DNA重组和维修。
利什曼病是一种由利什曼原虫属的原生动物寄生虫引起的传染病,目前尚无获批的人类疫苗。感染以物种特异性的方式定位到不同的组织,由杜氏利什曼原虫和婴儿利什曼原虫引起的内脏疾病对人类最为致命。尽管利什曼原虫属寄生虫主要在细胞内,但可以通过给狗接种婴儿利什曼原虫前鞭毛体培养物分泌产物的复杂混合物来预防内脏疾病。由于细胞外寄生虫蛋白可直接与疫苗诱导的宿主抗体接触,因此它们是良好的亚单位疫苗候选物,因此我们在此尝试发现对体外生长和宿主感染至关重要的蛋白质,目的是确定亚单位疫苗候选物。通过对杜氏利什曼原虫基因组进行计算机分析,我们确定了 92 个编码蛋白质的基因,这些蛋白质预测会通过单个跨膜区或 GPI 锚点分泌或外部锚定在寄生虫膜上。通过选择一种同时表达荧光素酶和 Cas9 核酸酶的转基因杜氏利什曼原虫,我们系统地尝试通过 CRISPR 基因组编辑靶向所有 92 个基因,并确定了体外生长所需的四个基因。对于 55 个基因,我们用每种突变寄生虫感染了小鼠群,并通过使用生物发光成像纵向量化寄生虫血症,结果显示 9 个基因有减毒感染的证据,尽管所有基因最终都建立了感染。最后,我们将两个基因表达为全长可溶性重组蛋白,并在小鼠临床前感染模型中将它们作为亚单位疫苗候选物进行测试。这两种蛋白质都对脾脏感染的不受控制的发展产生了显著的保护作用,值得进一步研究作为针对这种致命的热带传染病的亚单位疫苗候选物。
摘要浆细胞样树突状细胞 (pDC) 是一种具有多方面功能的稀有免疫细胞,但由于可从血液中提取的细胞数量稀少,它们作为细胞免疫疗法的潜在用途受到挑战。在这里,我们系统地研究了从造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 生成 pDC 的培养参数。使用优化条件结合 HSPC 预扩增的实施,我们从 100,000 个脐带血衍生的 HSPC 开始生成平均 4.65 亿个 HSPC 衍生的 pDC (HSPC-pDC)。此外,我们证明这种方案允许从全血 HSPC 生成 HSPC-pDC,并且这些细胞显示出 pDC 表型和功能。使用符合 GMP 的培养基,我们观察到 TLR7/9 反应显著丧失,通过补充抗坏血酸可以挽救这种丧失。抗坏血酸诱导与 pDC 特异性先天免疫途径相关的转录特征,表明抗坏血酸对 pDC 功能具有未知作用。这构成了从全血中生成 pDC 的第一个方案,并为研究 HSPC-pDC 的细胞免疫疗法奠定了基础。
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简单摘要:多发性骨髓瘤(MM)是一种血液癌,仍然无法治愈,因为患者对可用治疗不敏感。MM中的癌细胞滥用信号途径,称为NFκB途径,使MM更难治疗。在我们的研究中,我们使用了一种新方法来测量疾病不同阶段MM患者癌细胞中NFκB途径活性。我们发现NFκB途径活性在疾病发育过程中保持不变,与MM患者的预期寿命无关,并且无法预测癌细胞对治疗的反应程度。然而,在治疗MM患者治疗后生存的癌细胞确实显示出更高的NFκB途径活性。在这些患者的亚组中,癌细胞还显示出更高的BFL-1基因表达。bfl-1可以在治疗后增强癌细胞的存活,因此可能是这些患者靶向的新候选者。