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开发高流行糖缀合物的C型凝集素面向表面：旨在模仿细胞表面上的多价相互作用
摘要：复杂碳水化合物与寡聚C型凝集素之间的多价相互作用控制着广泛的免疫恢复。最新，标准的SPR（表面等离子体共振）竞争测定在很大程度上是为了评估从单糖单元（低亲和力，MM）到多价元素拮抗剂（中等亲和力，µm）的结合特性。在此，我们报告了SPR竞争测定法的典型案例研究表明，它们低估了糖类群体抑制DC-SIGN和固定的糖缀合物之间相互作用的效力。本文描述了在DC-Sign取向的表面上的SPR直接相互作用的设计和实现，可扩展到其他C型凝集素表面，如这种Langerin。此设置提供了从多价糖类群体以及来自细胞内存纳米群中组织的DC-SIGN四聚体同时发出的内在亲戚生成的微观概述。为此，通过链球菌 /链霉菌素相互作用对DC-sign的共价生物构捕获提供了四聚dc-sign的保存以及所有活动位点的可访问性 /功能。从经过测试的糖类群落文库中，我们证明了脚手架结构，价值和基于糖基的配体对于达到DC-Sign的纳摩尔亲和力至关重要。GlyCocluster 3.D说明了此组中DC-Sign表面（KD = 18 nm）的最紧密结合伙伴。此外，可以在多价尺度上轻松分析胶质d的一致尺度的选择性，以比较其在不同C型凝集素固定的表面上的结合。这种方法可能会引起对导致亲和力的多价结合机制的新见解，并为有希望的特定和多价免疫调节剂的结合效力做出了重大贡献。
使用综合生物信息学方法设计针对多种水痘带状疱疹病毒株的多价疫苗
2 孟加拉国吉大港大学生物科学学院遗传工程与生物技术系，3 印度浦那 Sinhgad 技术教育协会 Sinhgad 药学院药物化学系，4 孟加拉国达卡圣母学院，5 孟加拉国吉大港国际伊斯兰大学药学系，6 内蒙古自治区高校人畜共患病预防与控制重点实验室，内蒙古民族大学医学院，中国通辽，7 郑州大学第二附属医院脑血管病科，中国郑州，8 加拿大阿尔伯塔省卡尔加里大学微生物学、免疫学和传染病系，9 孟加拉国吉大港大学生物科学学院微生物学系
多价阳离子脂质体-DNA复合物介导的体外CRISPR/Cas9转染和基因编辑
摘要：成簇的规则间隔短回文重复序列 (CRISPR) 和 CRISPR 相关核酸酶 9 (Cas9) 基因编辑为癌症、心血管、神经和免疫疾病等遗传病因的疾病治疗提供了令人兴奋的新治疗可能性。然而，由于缺乏安全、多功能和有效的非病毒递送系统，其临床转化受到阻碍。本文我们报告了两种阳离子脂质体-DNA 系统（即脂质复合物）的制备和应用，用于 CRISPR/Cas9 基因递送。为此，使用了两种阳离子脂质（DOTAP，单价，和 MVL5，多价，+5 e 标称电荷），以及三种辅助脂质（DOPC、DOPE 和单油精 (GMO)）。我们证明，编码 Cas9 和单向导 RNA (sgRNA) 的质粒（由于其较大 (>9 kb) 通常难以转染）可以通过基于 MVL5 的脂质体成功转染到 HEK 293T 细胞中。相比之下，基于 DOTAP 的脂质体转染率非常低。基于 MVL5 的脂质体表现出逃离溶酶体的能力，这可能解释了其卓越的转染效率。在基因编辑方面，基于 MVL5 的脂质体实现了有希望的 GFP 敲除水平，在电荷比 (+/-) 为 10 时达到超过 35% 的敲除率。尽管敲除效率与 Lipofectamine 3000® 商业试剂相当，但基于 MVL5 的制剂中的非特异性基因敲除更为明显，这可能是因为这些制剂具有相当大的细胞毒性。总之，这些结果表明，多价脂质基脂质体复合物是有前途的 CRISPR/Cas9 质粒递送载体，通过进一步优化和功能化，其可能成为合适的体内递送系统。
针对产肠毒素大肠杆菌菌毛的多价候选疫苗，可广泛预防猪断奶后腹泻
摘要 菌毛介导的初始粘附是产肠毒素大肠杆菌 (ETEC) 感染所需的初始和关键步骤。因此，已经开发出针对这些菌毛并诱导特异性抗菌毛抗体以阻断 ETEC 初始粘附的候选疫苗。虽然这种疫苗可以有效预防 ETEC 相关的断奶后腹泻 (PWD)，但由于这些抗原之间的免疫异质性，开发一种广泛有效的针对 ETEC 初始粘附的疫苗仍然是一个具有挑战性的问题。在这里，我们应用多表位融合抗原 (MEFA) 技术构建了 FaeG–FedF–FanC–FasA–Fim41a MEFA，使用主要菌毛 K88 和 F18 的粘附亚基作为骨架，它还整合了来自稀有菌毛 K99、987P 和 F41 的粘附亚基的表位；然后我们生成了一个 MEFA 计算模型并在免疫小鼠中测试了这种 MEFA 蛋白的免疫原性。接下来我们通过体外评估其抗菌毛、抗体导向的细菌粘附抑制作用，评估了针对菌毛的 MEFA 作为疫苗候选物有效预防 PWD 的潜力。计算模型表明，所有相关表位都暴露在 MEFA 表面，并且用 MEFA 蛋白皮下免疫的小鼠产生了针对所有五种菌毛的 IgG 抗体。此外，MEFA 蛋白诱导的抗菌毛抗体显著抑制了 K88 + 、F18 + 、K99 + 、987P + 和 F41 + ETEC 菌株对猪小肠 IPEC-1 和 IPEC-J2 细胞系的粘附。综合起来，这些结果表明 FaeG–FedF–FanC–FasA–Fim41a MEFA 蛋白诱导了针对五种目标菌毛的特异性抗菌毛中和抗体。至关重要的是，这些结果显示了菌毛靶向 MEFA 的潜力，并表明它们有望成为一种广泛有效的 PWD 疫苗。关键词：ETEC、PWD、菌毛、MEFA、疫苗
通过在百里香独立的DNA折纸支架上显示多价抗原显示的抗体反应
基于蛋白质的病毒样颗粒（P-VLP）通常用于空间组织抗原并通过多价抗Gen显示器增强体液免疫。但是，p-vlps是胸腺依赖性抗原，它们是自我免疫原性的，可以诱导可能中和平台的B细胞反应。在这里，我们研究了使用SARS-COV-2峰值蛋白的受体结合结构域（RBD）的多价抗原显示的替代性DNA折纸，这是Neu-Tralization抗体反应的主要靶标。用基于DNA的VLP（DNA-VLP）对小鼠进行顺序免疫，以依赖于显示的抗原和T细胞帮助的抗原价值的方式，会在SARS-COV-2中保护对SARS-COV-2的中和抗体。重要的是，与p-vlps相比，免疫血清不包含针对DNA支架的抗体抗体，而P-VLP会引起针对靶抗原和支架的强B细胞记忆。因此，DNA-VLPS增强了目标抗原免疫原性，而无需产生支架定向免疫，从而为颗粒疫苗设计提供了重要的替代材料。
从研究到紧急使用授权的Covid-19疫苗的路径
FDA研究人员开发了用于制备包括疫苗在内的多价免疫结合物的新方法。通过使用氢化化学来合成多价免疫原性共轭物，将多种多糖（以所需比例）与至少一个载体蛋白的结合混合物（以多种比例为单位）结合。基于肼的化学方法在将多糖与载体蛋白结合在一起方面非常有效，从而导致疫苗在诱导每种多糖成分的小鼠抗体方面非常有效。共轭方法也不需要复杂的纯化程序，例如色谱和/或硫酸铵沉淀，
通过反疫苗技术设计有效的多价表位疫苗候选tsutsugamushi -tsutsugamushi - 生物信息学和免疫信息
磨砂鼠伤寒是由革兰氏阴性细菌（Orientia tsutsugamushi）引起的一种威胁生命的，未分化的发热疾病。细菌菌株是应考虑的全球健康问题。尽管为开发有效的免疫原性疫苗开发了数年的努力，但仍未获得成功的许可疫苗。该研究的目的是使用反疫苗学方法来构建表位反应。TSA56和SCAA蛋白合并可能是针对O. tsutsugamushi的最有希望的亚基疫苗。预测了 b细胞，CTL和HTL表位，随后，所有表位分别由KK，AAY和GPGPG接头连接，以及N末端区域的佐剂。此外，进行了分子对接和MD模拟，对TLR-2表现出较高的属性。鉴定并验证了16个线性B细胞，6个CTL和2个HTL表位。最终疫苗构建体显示高抗原性，稳定性和溶解度。分子对接和MD模拟表明与TLR-2和稳定的疫苗受体复合物相互作用。通过在计算机克隆中成功实施了疫苗在PET28A（+）载体中的表达，以及免疫模拟的显着结果表明，在先天性和适应免疫反应过程中，疫苗在免疫细胞相互作用中的效率证明了免疫反应中的效率。总而言之，结果表明，如果通过实验进行进一步研究，新开发的疫苗将是控制和提供针对SCRUB TYPHUS的明确预防措施的有前途的候选人。
叶酸功能化增强多价 DNA 纳米笼对三阴性乳腺癌细胞的细胞毒性
摘要：DNA 是一种出色的可编程聚合物，可用于生成可用于生物医学应用的自组装多价纳米结构。在此，我们开发了 (i) 叶酸功能化纳米笼 (Fol-NC)，可非常有效地被过度表达叶酸受体 α 异构体的肿瘤细胞内化；(ii) AS1411 连接纳米笼 (Apt-NC)，通过核仁素内化，核仁素是一种在许多类型癌症的细胞表面过度表达的蛋白质；以及 (iii) 同时具有叶酸和 AS1411 适体功能化的纳米结构 (Fol-Apt-NC)。我们分析了所有类型的纳米结构的特定 miRNA 沉默活性，这些纳米结构含有与 miR-21 互补的 miRNA 隔离序列，以及在耐药三阴性乳腺癌细胞系中装载阿霉素时的细胞毒性作用。我们证明，与用 AS1411 功能化的纳米笼相比，叶酸作为靶向配体的存在提高了 miR-21 沉默的效率。与游离阿霉素相比，装载了阿霉素的双功能化纳米笼 (Fol-Apt-NC) 对 MDA-MB-231 细胞的细胞毒性作用增加了 51% 以上，除了选择性之外，还证明了纳米笼能够克服阿霉素化学抗性。叶酸功能化纳米笼的更高效率归因于进入方式，它诱导了四倍以上的细胞内稳定性，并表明当叶酸和 AS1411 修饰同时存在时，叶酸介导的细胞进入途径比核仁素介导的途径更有效。
RPA在单个链DNA上的快速长距离迁移是通过使用多价相互作用的段转移发生的
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年12月8日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.12.07.566476 doi：Biorxiv Preprint
通过秀丽隐杆线虫胚胎中的有丝分裂polike激酶1（PLK-1）拆卸的核孔复合物的机制
在有丝分裂过程中拆除了保护和组织基因组的核包膜。在秀丽隐杆线虫合子中，父母原核的核包络崩溃（NEBD）在有丝分裂过程中是空间和节气调节的，以促进母体和父亲基因组的统一。核孔复合物（NPC）拆卸是NEBD的决定性步骤，对于核通透性至关重要。通过结合实时成像，生物化学和磷蛋白质组学，我们表明NPC拆卸是一个逐步的过程，它可以将类似polo的激酶1（PLK-1）（PLK-1） - 依赖性和独立步骤。plk-1靶向多个NPC子分类，包括细胞质丝，中央通道和内环。PLK-1被募集到并磷酸化几种多价接头核孔蛋白的内在无序区域（IDR）。值得注意的是，尽管磷脂在人和秀丽隐杆线虫核孔之间并不保守，但它们位于这两个物种的IDR中。我们的结果表明，靶向多价接头核孔的IDR是有丝分裂过程中NPC拆卸的进化保守的驱动器。