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World File Search System多倍体
使用Sommer软件包的定量遗传学
SOMMER软件包的开发是为了为R用户提供功能强大可靠的多元混合模型求解器，用于在二倍体和多倍体生物中的不同遗传和非遗传分析。此软件包允许用户估算混合模型的差异组件，并具有指定随机效应的方差 - 稳定率结构的优势，指定异质方差，并获得其他参数，并获得其他参数，例如浮肿，布鲁斯，蓝调，残留的值，填充的值，for for for for for for for for for for for for for for for for for for for of of of。使用Armadillo库将软件包的核心算法编码在C ++中，以优化DERECT INVERTION算法中常见的密集矩阵操作。尽管Vignette显示了使用MMER函数的示例，但是使用MMEC功能可以比供估计的系数多的记录更快，我们强烈建议您转移到MMEC功能的使用。
农业 - 302 NCET 25
（a）细胞及其结构，细胞分裂有序和减数分裂及其意义（b）在染色体，DNA和RNA（c）Mendel的遗传定律中组织遗传材料的意义（b）。Mendel在实验中取得成功的原因，Mendel的实验中没有联系。（d）植物的定量遗传，连续和不连续的变化。（e）单基因和多基因遗传。（f）遗传学在植物育种，自我和交叉授粉的作物中的作用，在田间作物引入，选择，杂交，突变和多倍体，组织和细胞培养中的繁殖方法。（g）植物育种，客观和植物育种作用的历史和重要性，在自我和交叉授粉作物（H）植物生物技术中的育种方法 - 作物生产中的定义和范围，植物育种的生物技术
农业 - 302 Cuet（UG）的教学大纲
（a）细胞及其结构，细胞分裂有序和减数分裂及其意义（b）在染色体，DNA和RNA（c）Mendel的遗传定律中组织遗传材料的意义（b）。Mendel在实验中取得成功的原因，Mendel的实验中没有联系。（d）植物的定量遗传，连续和不连续的变化。（e）单基因和多基因遗传。（f）遗传学在植物育种，自我和交叉授粉的作物中的作用，在田间作物引入，选择，杂交，突变和多倍体，组织和细胞培养中的繁殖方法。（g）植物育种的历史和重要性，植物育种的客观和作用，繁殖方法在自我和交叉授粉作物（H）植物生物技术定义和作物生产中的范围，植物育种的生物技术
细胞生物学，遗传学和进化学分：4（3+1）
1.1。生物分子，碳水化合物，脂质，蛋白质，核酸的结构和简要描述。1.2。细胞：质膜和细胞质的物理化学性质。1.3。Ultrastructure of plant cell with a brief description and functions of the following organelles: Endoplasmic reticulum, Plastids, Mitochondria, Ribosomes, Dictyosomes, Vacuole, Microbodies (Glyoxysomes and Peroxisomes) 1.4 Nucleus: Nuclear membrane, nucleolus, ultrastructure and morphology of chromosomes, karyotype analysis; 1.5。在体细胞和胚胎细胞中繁殖；有丝分裂和减数分裂；细胞周期； 1.6。染色体畸变；染色体数量，非整倍性和多倍体的变化；染色体，缺失，重复，反转和易位的结构变化，特殊类型的染色体，染色体系统（染色体生成和apomixis）。2。遗传学和进化：
使用 CRISPR/Cas9 对无融合生殖四倍体草皮和牧草（Paspalum notatum Flügge ́）进行多等位基因编辑
多倍体在禾本科植物中很常见，对传统育种提出了挑战。基因组编辑技术绕过了杂交和自交，能够在一代中对多个基因拷贝进行有针对性的修改，同时保持许多多倍体基因组的杂合背景。巴哈草（Paspalum notatum Flügge ́；2 n =4 x =40）是一种无融合生殖的四倍体 C4 物种，在美国东南部广泛种植，作为肉牛生产和公用事业草坪的饲料。叶绿素生物合成基因镁螯合酶（MgCh）被选为在四倍体巴哈草中建立基因组编辑的快速读出目标。含有 sgRNA、Cas9 和 npt II 的载体通过基因枪法递送到愈伤组织培养物中。通过基于 PCR 的检测和 DNA 测序对编辑植物进行了表征，并观察到高达 99% 的 Illumina 读数的诱变频率。野生型 (WT) 巴哈草的测序显示，MgCh 的序列变异水平很高，这可能是因为存在至少两个拷贝，可能包含八种不同的等位基因，包括假基因。MgCh 突变体表现出明显的叶绿素消耗，叶片绿度降低了 82%。两种品系显示出随时间推移的编辑进展，这与体细胞编辑有关。获得了嵌合 MgCh 编辑事件的无融合生殖后代，并允许在一系列叶绿素消耗表型中识别出统一编辑的后代植物。高度编辑的突变体的 Sanger 测序显示 WT 等位基因的频率升高，可能是由于频繁的同源定向修复 (HDR)。据我们所知，这些实验是首次报道将基因组编辑应用于多年生暖季草皮或牧草。该技术将加速巴哈草品种的开发。
利用尖端高通量测序技术对兰花基因组和功能基因组进行深入分析
高通量测序技术为研究植物基因组和亚基因组的起源与进化、群体驯化以及功能基因组学等提供了新的方法和途径。自然界中兰科植物有数以万计的成员，许多在生态链的延长与保护、观赏花卉的园艺利用、植物药材的利用等方面有着巨大的应用潜力。然而，兰花种质资源的改良还缺少大规模的基因敲除突变体文库和完善的遗传转化体系，新型基因编辑工具，如目前备受青睐的CRISPR-Cas9或一些碱基编辑器，尚未在兰花中得到广泛应用。除了品种繁多之外，与性状相关的功能基因的挖掘也需要高精度、高通量的基因组测序技术。目前兰花基因组学的研究重点已转向物种的起源和分类、基因组的进化和缺失、基因复制和染色体多倍体以及花形态发生的相关调控。这里讨论了过去几十年来兰花分子生物学和基因组学所取得的进展，包括基因组大小的进化和多倍体化。LTR 逆转录转座子的频繁插入在兰花基因组的扩展和结构变异中起着重要作用。核基因组的大规模基因复制事件产生了大量近期串联重复的基因，从而驱动了新基因的进化和功能分化。质体基因组的进化和缺失主要影响与光合作用和自养相关的基因，这表明兰花比任何其他陆生植物经历了更多的向异养的独立转变。此外，大规模重测序为构建遗传图谱提供了有用的SNP标记，这将有利于培育新的兰花品种。高通量测序和基因编辑技术在兰花性状相关基因的鉴定和分子育种中具有重要意义，它为我们提供了具有代表性的性状改良基因以及一些
桥接脂质代谢和线粒体基因组维持
线粒体是细胞能量代谢和主要信号中心的联系，可将内部和没有细胞内部信息整合到实现细胞功能的主要信号中心。mito-Chondria携带一个独特的多倍体基因组线粒体DNA（mtDNA），该基因组编码能量生产所需的呼吸链成分。mtDNA突变和延伸与人类的肥胖和代谢综合征有关。在细胞和亚细胞水平上，mtDNA合成由与脂质转移的膜接触位点协调，将基因组维持到脂质储存和稳态。在这里，我们研究了mtDNA与脂质流通性的关系，脂毒性对mtDNA完整性的影响以及在原发性mtDNA疾病中如何破坏脂质代谢。
农业 - 302 Cuet（UG）的教学大纲
（a）细胞及其结构，细胞分裂有序和减数分裂及其意义（b）在染色体，DNA和RNA（c）Mendel的遗传定律中组织遗传材料的意义（b）。Mendel在实验中取得成功的原因，Mendel的实验中没有联系。（d）植物的定量遗传，连续和不连续的变化。（e）单基因和多基因遗传。（f）遗传学在植物育种，自我和交叉授粉的作物中的作用，在田间作物引入，选择，杂交，突变和多倍体，组织和细胞培养中的繁殖方法。（g）植物育种的历史和重要性，植物育种的客观和作用，繁殖方法在自我和交叉授粉作物（H）植物生物技术定义和作物生产中的范围，植物育种的生物技术