摘要 蛋白质的正确折叠对于维持功能性活细胞至关重要。因此,蛋白质的错误折叠和聚集与多种疾病有关,其中非天然分子间相互作用形成具有低自由能的大型高度有序的淀粉样蛋白聚集体。一个例子是阿尔茨海默病 (AD),其中淀粉样蛋白-β (Aβ) 肽聚集成淀粉样蛋白原纤维,这些原纤维在 AD 患者的大脑中沉积为神经斑块。淀粉样蛋白原纤维的成核是通过形成较小的成核前簇(即所谓的低聚物)进行的,这些低聚物被认为具有特别的毒性,因此在 AD 病理学中具有潜在重要性。Aβ 聚集的详细分子机制知识对于设计针对这些过程的 AD 治疗非常重要。然而,由于低聚物物种的丰度低且多分散性高,因此很难通过实验研究它们。本文使用自下而上的生物物理学在受控的体外条件下研究了 Aβ 低聚物。主要使用天然离子迁移质谱法研究高纯度重组 Aβ 肽,以监测水溶液中低聚物的自发形成。质谱法能够分辨单个低聚物状态,而离子迁移率则提供低分辨率结构信息。这与其它生物物理技术以及理论建模相辅相成。还研究了调节内在因素(如肽长度和序列)或外在因素(如化学环境)的低聚物。研究了与两个重要的生物相互作用伙伴的相互作用:伴侣蛋白和细胞膜。我们展示了 Aβ 低聚物如何组装并形成可能与继续生长为淀粉样蛋白原纤维有关的延伸结构。我们还展示了不同的淀粉样蛋白伴侣蛋白如何与不断增长的聚集体相互作用,从而改变和延迟聚集过程。这些相互作用取决于伴侣和客户肽中的特定序列基序。另一方面,膜模拟胶束能够稳定 Aβ 寡聚体的球状致密形式,并抑制形成淀粉样纤维的延伸结构的形成。这可能有助于体内毒性物质的富集。与膜模拟系统的相互作用被证实高度依赖于 Aβ 肽异构体和膜环境的特性,例如头部电荷。还展示了如何添加设计的小肽结构来抑制膜环境中 Aβ 寡聚体的形成。
b“蛋白质折叠是一个细微的过程,由原代氨基酸序列和细胞蛋白质质量控制机制编码并取决于错误折叠的蛋白质可以汇总成有毒的寡聚物或淀粉样蛋白原纤维,并与包括阿尔茨海默氏症和帕金森氏病以及II型糖尿病在内的疾病有关。这些淀粉样蛋白沉积物具有共同的跨结构,无论其主要氨基酸序列如何。最近的研究表明,生物分子冷凝物的形成是某些淀粉样蛋白蛋白质固有的另一种共同点。冷凝物的新兴生物物理特性可以调节蛋白质聚集;因此,了解淀粉样蛋白形成的结构和动力学基础以及蛋白质质量控制机制对于理解蛋白质错误折叠疾病和治疗剂的下游发展至关重要。本期特刊需要进行多样化和全面的概述,这些概述说明了来自生物物理,生化或细胞生物学观点的蛋白质错误折叠和神经退行性疾病。”
iacoangeli,1,2,3 Mamede decarvalho,14 Vivian在Drory中,15,16 Jonathan D Glass,17 Mark Gotkine,24 Susana Pinto,32 Jan Herman Veldink,Jan Herman Veldink,Jan Herman Veldink,iacoangeli,1,2,3 Mamede decarvalho,14 Vivian在Drory中,15,16 Jonathan D Glass,17 Mark Gotkine,24 Susana Pinto,32 Jan Herman Veldink,Jan Herman Veldink,Jan Herman Veldink,
https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2025-vcwq2 orcid:https://orcid.org/000000-0001-5564-0679 consect consect consect notect content contem许可证:CC BY-NC-ND 4.0
非小细胞肺癌(NSCLC)作为与癌症相关死亡的主要原因,在全球范围内提出了严重的健康问题。在晚期或遇到的阶段诊断出约30%的NSCLC患者,总生存率(OS)率为7%–18%2。与局部NSCLC不同,可以通过治疗意图进行治疗,NSCLC转移性NSCLC患者通常接受全身治疗,以延迟进展和延长生存率。寡聚症的概念是1995年首次描述的,是指局部疾病与广泛传播转移3之间的中间阶段。寡聚量传统上被定义为有限数量的射线照相转移。国际肺癌研究协会(IASLC)共识声明提出,在多达3个器官4中,寡聚型NSCLC的定义最大为5个远的转移。对于有限的转移性爆发患者,局部治疗(例如手术或放疗)可能会提供治愈的可能性。可以在全身治疗之前先进行局部治疗,也可以在诱导的全身疗法作为局部巩固疗法(LCT)后提供少量转移NSCLC患者的残留性。对全身治疗的最大反应时残留疾病表明
116 试剂和酶。除非另有说明,试剂和酶均从 Sigma-Aldrich(英国)购买。碳网格(400 平方目铜)从 Micro to Nano(荷兰)购买,醋酸铀酰溶液由巴塞罗那自治大学的显微镜服务部门提供。Sup35- 121 SAC 肽从 CASLO ApS(Scion 丹麦技术大学)购买。122 蛋白质的表达和纯化。克隆到带有 His6 标签的质粒 pET28(a) 中的 Sup35- 123 5aa-DHFR 的 cDNA 是从 GenScript 获得的。通过在 128 质粒 pET28(a)/Sup35-5aa-DHFR 上进行诱变,获得了构建体 pET28(a)/Sup35-8aa- 126 DHFR、pET28(a)/野生型 DHFR (DHFR-wt) 和 pET28(a)/ 127 Sup35-5aa-DHFR-Z。用相应的质粒转化大肠杆菌 BL21 (DE3)- 129 感受态细胞。130 然后,将转化细胞在 10 mL 溶源性肉汤 (LB) 中培养
数据生成的迅速增加,结合了大型数据集的不切实际性以及机器学习任务的日益增长的复杂性,促进了分布式学习技术的发展。在其中,联邦学习(FL)由于其隐私保护方法而受到了极大的关注,在这种方法中,多个客户在不共享本地数据的情况下协作训练全球模型。但是,FL面临着几个关键的挑战,包括数据异质性,高计算成本和效率低下。这些问题在客户数据分布是非IID,计算资源有限的现实情况下变得更加明显,并且可以限制通信。本论文通过开发用于个性化联合学习(PFL)的有效算法和受到限制的联邦学习来解决这些挑战。所提出的方法旨在处理异质数据,最大程度地减少计算开销并降低沟通成本,同时保持强大的理论保证。具体而言,论文介绍了三个关键贡献:(1)PFL MF,一种基于低级矩阵优化的新型PFL公式,利用burer-Monteiro分解以实现个性化,而无需依赖预定义的距离指标。(2)PERMFL,一种用于多层PFL的算法,该算法介绍了针对团队和单个设备的个性化决策变量,从而在具有分层客户端结构的情况下有效地优化了。(3)FedFW,一种用于约束FL的无预测算法,该算法强调了通过稀疏信号交换的低计算成本,隐私保存和通信效率。通过解决FL中的关键问题,例如数据异质性,计算成本和通信瓶颈,拟议的算法推进了联合学习的领域,为实地世界应用提供了可靠的可扩展解决方案。
亚特兰大埃默里大学罗林斯公共卫生学院环境卫生部的加加罗萨;伦敦卫生与热带医学学院公共卫生,环境与社会部的B环境与健康建模(EHM)实验室,英国伦敦; C统计,计算机科学和应用部“ G。父母,”意大利佛罗伦萨佛罗伦萨大学;马萨诸塞州波士顿哈佛大学公共卫生学院; E瑞士伯尔尼大学社会与预防医学研究所;瑞士伯尔尼大学气候变化研究中心; G气候研究基金会(FIC),西班牙马德里;西班牙马德里的H ciber deepidemiologíay saludpública(Ciberesp);我是西班牙巴塞罗那西班牙科学研究理事会环境评估与水研究所;马萨诸塞州波士顿哈佛大学公共卫生学院; E瑞士伯尔尼大学社会与预防医学研究所;瑞士伯尔尼大学气候变化研究中心; G气候研究基金会(FIC),西班牙马德里;西班牙马德里的H ciber deepidemiologíay saludpública(Ciberesp);我是西班牙巴塞罗那西班牙科学研究理事会环境评估与水研究所;
摘要:双环戊二烯(DCPD)的线性低聚物是热塑性和热固性材料的反应性前体。与臭味的父母单体不同,由DCPD组成的低聚物是无味的。通过对末端组或骨干化学的适当修改,远程技术DCPD寡聚物具有潜在的效用,作为交联的跨链接器和宏观工程学前体,用于块和移植共聚物。但是,大多数现有的产生寡核DCPD的方法需要溶剂,相对较慢,需要无空气的技术。在这里我们表明,纯dCPD和其他垂体衍生物的额叶开环差异寡聚(Fromo)在几分钟内迅速生成数百克材料,催化剂载荷为0.5 mm。这种节能催化过程利用反应产生的热量在整个液体单体中自我传播的寡聚化。使用末端烯烃(例如苯乙烯),其中交叉 - 弥弥教反应(即链转移)与开环的分解(即传播)竞争。 Kendrick质量分析能够快速鉴定和分配所有链端类型,并量化了不频繁的环戊烯开环反应所产生的分支程度。 这种分析技术还检测出源自单体或链转移剂中痕量杂质的低聚物物种,这些杂质在其他表征方法中很难观察。 获得的低聚物具有明确的链端和分子量分布。使用末端烯烃(例如苯乙烯),其中交叉 - 弥弥教反应(即链转移)与开环的分解(即传播)竞争。Kendrick质量分析能够快速鉴定和分配所有链端类型,并量化了不频繁的环戊烯开环反应所产生的分支程度。这种分析技术还检测出源自单体或链转移剂中痕量杂质的低聚物物种,这些杂质在其他表征方法中很难观察。获得的低聚物具有明确的链端和分子量分布。
DNA双链断裂(DSB),以确保基因组稳定性。至关重要的是,必须将DSB末端保持在一起才能及时修复。在酿酒酵母中,两种知之甚少的途径介导了DSB的终端。使用MRE11-RAD50-XRS2(MRX)复合物在物理上桥接DSB末端。另一个要求DSB通过EXO1转换为单链DNA(ssDNA),但桥接蛋白是未知的。我们发现该粘着蛋白,其加载器和SMC5/6用EXO1作用于Tether DSB末端。非常明显的是,寡聚中特异性受损的粘着蛋白未能束缚DSB,从而揭示了粘着蛋白寡聚的新功能。除了姐妹染色单体内聚力的已知重要性外,基于显微镜的微流体实验通过确保DSB终端连接来揭示凝聚蛋白在修复中的新作用。总的来说,我们的发现表明,粘着蛋白的低聚可防止DSB的末端分离并促进DSB修复,从而揭示了粘连在保护基因组完整性中的新型作用和作用。