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Wnt/β-catenin途径中的基因组改变以及结直肠癌细胞对靶向靶向疗法的抗性
AIM：结直肠癌是最普遍的胃肠道恶性肿瘤，在转移性环境中治疗选择有限。Wnt/β-catenin/腺瘤性息肉大肠杆菌（APC）途径通常在疾病中失调，并为治疗性开发提供了合理的靶标。方法：使用癌症基因组图集（TCGA）的结直肠癌队列（TCGA）的公开基因组数据定义了与Wnt/β-catenin/apc途径的APC或其他关键基因改变的结直肠癌的组，并确定每个组感兴趣的基因组特征。针对途径的药物的体外敏感性数据是根据癌症（GDSC）项目中药物敏感性的基因组编辑的。结果：三分之三的结直肠癌具有APC改变，其中大约四分之一的情况也具有Wnt/β-catenin/apc途径的其他基因，包括RNF43，CTNNNB1和TCF7L2。结直肠癌在Wnt/β-catenin途径，RNF43，CTNNB1和TCF7L2的三个基因中有一个或多个发生变化。在三个基因中具有相同变化的癌症具有或没有APC改变的癌症表现出受体酪氨酸激酶，PI3K/AKT途径基因和DNA损伤响应基因的高频率突变。在Wnt/β-catenin/apc途径中没有突变的细胞系在体外表现出对途径抑制剂的数值敏感性。结论：Wnt/β-catenin/apc途径改变的结直肠癌群体具有不同的基因组景观，这些景观可能对途径抑制剂的合理发展具有治疗意义。
小鼠相关的脂肪性肝炎 eLandaloussi，Yannis等。了解小脑结构与社会能力之间的关系。在：分子自闭症，2023年，第1卷。 14，n° Wacker Bou Puigdefabregas，Julie Caroline等。先天性核心肌病和延迟发作的限制性CA 的成功心脏移植 有限的利润和充分性 朝两极分化纠缠的宣传分布 经颅多普勒超声检查 假肢术语的词汇表2023：第十版 重新定义未知初级>的癌症 扩展触点会破坏流量 Kropp，Martina等。简短的沟通：糖尿病患者的泪液中催泪液的独特代谢特征 Ramzy，George Mourad等。人类中的Folfoxiri抗性诱导和表征
肌肉营养不良，需要心脏移植，在明显的骨骼肌受累之前6年。神经肌肉疾病。1999; 9（8）：598-600。 22。 Wu RS，Gupta S，Brown RN等。 在肌营养不良患者中进行的腹腔直接移植后的临床结局。 j心脏肺移植。 2010; 29（4）：432-438。 23。 Hanke SP，Gardner AB，Lombardi JP等。 BARTH综合征中的左心室非压实心肌病：一个起伏的心脏表型的例子，需要机械囊性支撑作为移植的桥梁。 儿童核心。 2012; 33（8）：1430-1434。 24。 Feingold B，Mahle WT，Auerbach S等。 美国心脏协会心脏病患者心力衰竭委员会Y，Y，临床C委员会，心血管委员会R，心血管委员会R，干预委员会，功能性G，Translations B，Stroke B，Stroke C.心脏参与的管理与Neuromuscu-神经司法疾病有关：与美国心脏协会的科学疾病有关。 循环。 2017; 136（13）：E200-E231。1999; 9（8）：598-600。22。Wu RS，Gupta S，Brown RN等。在肌营养不良患者中进行的腹腔直接移植后的临床结局。j心脏肺移植。2010; 29（4）：432-438。 23。 Hanke SP，Gardner AB，Lombardi JP等。 BARTH综合征中的左心室非压实心肌病：一个起伏的心脏表型的例子，需要机械囊性支撑作为移植的桥梁。 儿童核心。 2012; 33（8）：1430-1434。 24。 Feingold B，Mahle WT，Auerbach S等。 美国心脏协会心脏病患者心力衰竭委员会Y，Y，临床C委员会，心血管委员会R，心血管委员会R，干预委员会，功能性G，Translations B，Stroke B，Stroke C.心脏参与的管理与Neuromuscu-神经司法疾病有关：与美国心脏协会的科学疾病有关。 循环。 2017; 136（13）：E200-E231。2010; 29（4）：432-438。23。Hanke SP，Gardner AB，Lombardi JP等。 BARTH综合征中的左心室非压实心肌病：一个起伏的心脏表型的例子，需要机械囊性支撑作为移植的桥梁。 儿童核心。 2012; 33（8）：1430-1434。 24。 Feingold B，Mahle WT，Auerbach S等。 美国心脏协会心脏病患者心力衰竭委员会Y，Y，临床C委员会，心血管委员会R，心血管委员会R，干预委员会，功能性G，Translations B，Stroke B，Stroke C.心脏参与的管理与Neuromuscu-神经司法疾病有关：与美国心脏协会的科学疾病有关。 循环。 2017; 136（13）：E200-E231。Hanke SP，Gardner AB，Lombardi JP等。BARTH综合征中的左心室非压实心肌病：一个起伏的心脏表型的例子，需要机械囊性支撑作为移植的桥梁。儿童核心。2012; 33（8）：1430-1434。 24。 Feingold B，Mahle WT，Auerbach S等。 美国心脏协会心脏病患者心力衰竭委员会Y，Y，临床C委员会，心血管委员会R，心血管委员会R，干预委员会，功能性G，Translations B，Stroke B，Stroke C.心脏参与的管理与Neuromuscu-神经司法疾病有关：与美国心脏协会的科学疾病有关。 循环。 2017; 136（13）：E200-E231。2012; 33（8）：1430-1434。24。Feingold B，Mahle WT，Auerbach S等。美国心脏协会心脏病患者心力衰竭委员会Y，Y，临床C委员会，心血管委员会R，心血管委员会R，干预委员会，功能性G，Translations B，Stroke B，Stroke C.心脏参与的管理与Neuromuscu-神经司法疾病有关：与美国心脏协会的科学疾病有关。循环。2017; 136（13）：E200-E231。2017; 136（13）：E200-E231。
使用重生方法的方法，用于在结核分枝杆菌中对全基因胺抗性的全基因组测序预测的改进目录。
。CC-BY 4.0国际许可证。根据作者/资助人提供了预印本（未经同行评审的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月25日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.01.30.635633 doi：biorxiv preprint
Kropp，Martina等。糖尿病性视网膜病是失明的主要原因和级联并发症的早期预测指标 - 风险和缓解措施。在中 道德，监管和S Siffredi，Vanessa等。早产后的皮质改变以及与社会的联系 档案中的库弗特·Unige疫苗在护理中犹豫... frei，Anja等。在高度感染发生率时期，杂交免疫力的发展。在：国际流行病学杂志，2 小鼠相关的脂肪性肝炎 eLandaloussi，Yannis等。了解小脑结构与社会能力之间的关系。在：分子自闭症，2023年，第1卷。 14，n° Wacker Bou Puigdefabregas，Julie Caroline等。先天性核心肌病和延迟发作的限制性CA 的成功心脏移植 有限的利润和充分性 朝两极分化纠缠的宣传分布 经颅多普勒超声检查 假肢术语的词汇表2023：第十版 重新定义未知初级>的癌症 扩展触点会破坏流量 Kropp，Martina等。简短的沟通：糖尿病患者的泪液中催泪液的独特代谢特征 Ramzy，George Mourad等。人类中的Folfoxiri抗性诱导和表征
1医学物理系，IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna，意大利博洛尼亚； 2纽约纽约的纪念斯隆·凯特林癌症中心医学物理部； 3威斯康星大学 - 威斯康星州麦迪逊分校放射学系； 4马里兰州格伦·伯尼（Glen Burnie）核医学研究所； 5澳大利亚新南威尔士州瓦格·瓦格（Wagga Wagga）查尔斯·斯特特大学（Charles Sturt University）牙科与健康科学学院； 6康涅狄格州纽黑文市耶鲁大学医学院放射学和生物医学成像系； 7密苏里州圣路易斯的华盛顿大学生物医学工程和Mallinckrodt放射学院； 8拉脱维亚拉脱维亚大学临床与预防医学研究所； 9纽约纽约的纪念斯隆·凯特林癌症中心放射学系；纽约纽约市威尔·康奈尔医学院放射学系10； 11加利福尼亚州戴维斯戴维斯分校生物医学工程系；瑞士伯尔尼大学核医学系12； 13加拿大不列颠哥伦比亚大学不列颠哥伦比亚大学放射学系； 14放射学和放射科学系，约翰·霍普金斯医学院，马里兰州巴尔的摩； 15瑞士日内瓦日内瓦大学医院核医学和分子成像司； 16荷兰格罗宁根大学医学中心格罗宁根大学核医学与分子成像系； 17加拿大不列颠哥伦比亚省的不列颠哥伦比亚大学放射与物理学系；和18 United Theranostics，贝塞斯达，马里兰州
在铜绿假单胞菌菌群中抗菌抗性的降低，铜绿菌菌血症之后的抗菌血症是199大流行病的：一项纵向观察性研究
在研究期间，观察到333例患者的总共493例PA菌血症实例。MDRPA的比例从21％（62/291）前流行降至9％（19/202）后p，调整后或0.38，95％CI 0.18-0.79，p = 0.01）。在最初的非MDRPA菌血症初期住院期间，MDRPA的发生很少见，不太可能比两周后发生。抗菌消耗模式在大流行开始后发生了变化，随着amikacin和ciprofloxacin的使用降低，头孢酸和美皮烯类的使用增加。MDRPA菌血症患者的总体不尸体死亡率仍然很高（28％），大流行前后没有实质性差异（调整后危险比1.57，95％CI 0.43-5.67，p = 0.49）。
双重作用抗生素可以使细菌抗性几乎不可能
“这种抗生素的美在于它通过细菌中的两个不同靶标杀死，” UIC的杰出药物科学教授亚历山大·曼金（Alexander Mankin）说。“如果抗生素以相同的浓度击中两个靶标，则细菌通过在两个靶标中的任何一个中的随机突变获得抗药能力而失去了抗性的能力。”
重新定义未知初级>的癌症扩展触点会破坏流量Kropp，Martina等。简短的沟通：糖尿病患者的泪液中催泪液的独特代谢特征 Ramzy，George Mourad等。人类中的Folfoxiri抗性诱导和表征Kropp，Martina等。简短的沟通：糖尿病患者的泪液中催泪液的独特代谢特征Ramzy，George Mourad等。人类
摘要：folfoxiri，即5-脂肪酸，奥沙利铂和伊立替康的组合是对结直肠癌（CRC）的第一线治疗，但非人性化和侵略性。在这项研究中，为了模仿被诊断为晚期CRC并接受Folfoxiri长期治疗的患者的临床状况，我们已经生成了用Folfoxiri长期治疗的CRC细胞克隆。与未得到治疗的调用相比，在所有四个细胞系中，对Folfoxiri的敏感性均显着损失，如2D培养和异型3D共培养所示。通过在肌动灯的组织中形态变化观察到获得的耐药性诱导。块状RNA测序表明，在SW620抗性细胞系中，葡萄糖转运蛋白家族5（GLUT5）的重要上调，而在LS174T耐药细胞系中，蛋白质酪氨酸磷酸酶磷酸酶S（PTPRS）的显着下调和氧气磷酸化酶脱氢酶含量（oxoglutarate eDhifeNAPE）（蛋白酪氨酸磷酸化酶受体S（PTPRS）的显着下调。通过RAS-RAF-MEK-ERK途径作用的优化的低剂量协同药物组合（ODC）克服了对Folfoxiri的抗性。ODC抑制了SW620和LS174T 3DCC中的细胞代谢活性，分别抑制了高达82％。
交互式网络工具用于分析与癌细胞系的遗传特征相关的药物敏感性和抗性
广泛的治疗曲目已适用于肿瘤学家，包括放射性和化学疗法，小分子和单克隆抗体。但是，药物疗效可以受到使癌细胞逃脱治疗的遗传变化的限制。在这里，我们设计了一个网络工具，可促进癌症中药物敏感性基因组学（GDSC）数据库的数据分析，并在265种认可的化合物上与癌细胞系百科全书中的1001个细胞系（ccle，ccle，cbioportal）中的1001个细胞系有关的大量遗传变化进行了批准。WebTool计算一组遗传改变的耐药性比值比。它提供了分配给细胞信号通路的单个化合物或一组化合物的功效的结果。使用此网络工具，我们复制了已知的遗传驱动因素，并确定了新的候选基因，种系变体，共同享受和药物基因组耐药性和药物重新利用的药物基因组修饰剂。WebTool可用性：https：//tools.hornlab.org/gdsc/。
癌细胞上调tau以获得对DNA损害剂的抗性
摘要：最近的报告表明，微管在双链DNA断裂修复中起着作用。我们在这里研究了微管相关蛋白TAU在放射和化学疗法中的作用。明显地，乳腺癌细胞系中TAU的表达降低导致阿霉素或X射线治疗后小鼠 - 六边形乳腺肿瘤体积的显着降低。此外，tau的敲门损害了经典的非同源最终结合途径，并导致对博来霉素和X射线的细胞反应得到改善。研究了Tau保护作用的机制，我们发现DNA中对双链断裂的反应的主要介体之一，肿瘤抑制剂p53结合蛋白1（53BP1）是在细胞质中隔离的，这是Tau下调的结果。我们证明了TAU允许53BP1通过伴侣伴侣微管蛋白传播来响应DNA损伤而转移到核。此外，TAU敲低化学敏化的癌细胞对形成DNA加合物（例如顺铂和奥沙利铂）的药物，并进一步提出TAU在调节DNA修复蛋白的核traffiffiffinfim tau中的一般作用。总的来说，这些结果表明，癌细胞中的tau表达可能是对响应DNA损害抗癌药的反应的分子标记。临床靶向tau可以使肿瘤对DNA损害治疗敏感。
无疤痕去除大型抗性岛可导致抗生素的敏感性和增加的鲍曼尼杆菌的自然转化性
摘要在基因组成方面具有巨大的多样性，包括多种推定的抗生素耐药性基因，阿巴岛是鲍曼尼杆菌杆菌多药的潜在贡献者。但是，ABAR对抗生素耐药性和细菌生理学的有效贡献仍然难以捉摸。为了解决这个问题，我们试图准确删除Abar Islands并恢复其插入站点的完整性。为此，我们设计了一种多功能无疤的基因组编辑策略。我们在最近的两个鲍曼尼菌临床菌株中形成了这种遗传修饰：分别携带19.7 kbp和86.2 kbp的Abar1和Abar1岛的菌株AB5075和菌株AYE。然后，在父母菌株及其固定衍生物之间进行抗生素敏感性。通过该岛的开放阅读框（ORF）的预测功能所预期的，抗抗性的抗抗药性在野生型和ABAR11固定的AB5075菌株之间相同。ABAR1具有25个ORF，预测抗生素类别具有抗性，并且AYE ABAR1固定衍生物显示出对多种类别的抗生素的可疑性。此外，ABARS的固化恢复了高水平的自然转化性。的确，大多数阿巴群岛都被插入与自然转化有关的通讯基因中。我们的数据表明，Abar插入有效地失活，并且还原的通信是功能性的。固化始终导致高度转换，因此很容易遗传诱因。ABAR的修改提供了对Abar获取功能的洞察力的见解。