XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System按宏
优化的机器学习模型，以准确检测念珠菌属。在革兰氏染色的显微镜图像中
摘要：图像解释对于临床微生物诊断至关重要。革兰氏阴性幻灯片的手动阅读是时间耗尽和复杂的。基于机器学习（ML）模型的人工视觉系统的使用可以加快感兴趣的微生物的检测，从而确保丢弃无关的图像，并考虑与诊断相关的图像。这种自动诊断过程大大减轻了微生物学家及其主观性的负担。可以通过鉴定酵母样细胞或指示念珠菌属的丝状结构来自动化晶体染色样品的形态学研究。已经实施了几种多类机器学习模型（XGBoost，人工神经网络和K-Nearest邻居），从图像中采取了相关的形态特征。使用目标函数对酵母和菌丝的特定检测，使用创新的元启发式算法优化了数据集维度。最佳优化模型的精度为0.821，精度宏为0.827，召回宏为0.790，F1宏的宏为0.806。
阳性血液培养液的宏基因组测序，以进行精确细菌和真菌鉴定：一项初步研究
摘要：随着血流感染（BSI）代表了全球死亡率和发病率的主要原因，血液培养物在诊断中起着至关重要的作用，但是它们的临床应用会因长时间的转弯时间而抑制，并且仅检测到可培养的病原体。在这项研究中，我们直接从阳性血液培养液体中直接开发了shot弹枪元基因组学测序（MNG）测试，从而可以更快地鉴定出挑剔或缓慢生长的微生物。该测试是基于先前验证的下一代测序测试而构建的，该测试依赖于细菌和真菌识别的几个关键标记基因。新测试利用开源宏基因组学CZ-ID平台进行初始分析来生成最可能的候选物种，然后将其用作下游，确定分析的参考基因组。这种方法具有创新性，因为它利用了开源软件的不可知分类呼叫能力，同时仍依靠更具成熟和先前验证的基于标记基因的识别方案，从而增加了最终结果中的态度。对细菌和真菌微生物的测试表现出很高的精度（100％，30/30）。我们进一步证明了其临床实用性，尤其是针对厌氧和分枝杆菌的临床实用性，它们要么是挑剔，生长缓慢或不寻常的。尽管仅适用于有限的设置，但血液培养的阳性MNGS测试在解决诊断有挑战性BSI的临床需求方面提供了逐步改善。
对表面沉积物中微生物群落的宏基因组学和培养基分析，以及原始河中抗生素抗性基因的流行：
摘要：居住在河流地区沉积环境中的微生物群落是原始河流生态系统的关键指标。虽然已经建立了抗生素抗性与致病性与核心肠道细菌之间的相关性，但存在着一个很大的知识差距，即抗生素抗性基因（ARGS）与人类病原细菌（HPB）与河流中的特定微生物的相互作用，通常引用了“ terrestrial terestrial gut”。在自然栖息地内，了解微生物组成，包括细菌和居民遗传因素，例如ARGS，HPB，移动遗传因素（MGE）和毒力因子（VFS）（VFS），在全球变化的背景下是必须的。为了解决这一差距，在本研究中进行了一种基于富集的培养基互补培养物和宏基因组学，以表征微生物生物库，并提供初步的生态见解，以介绍兰坎河源流域中ARG的传播。根据我们的发现，在兰开河源盆地的主流中，有674种细菌菌株在厌氧条件下包括540个菌株，在有氧条件下有124个菌株，已成功地分离出来。其中，有98种被确定为已知物种，而4种是潜在的新物种。在这98种中，有30种与人类健康有关的HPB。此外，Baca和Bacitracin分别作为该河中最丰富的ARG和抗生素出现。此外，对ARGS的风险评估主要表明危害人类健康的风险等级（等级IV）。总而言之，基于富集的培养基学被证明可有效分离稀有和未知细菌，尤其是在厌氧条件下。ARG的出现显示与MGE的相关性有限，表明对兰开河源源盆地主流内人类健康的威胁很小。
在人类肠道微生物组的代谢组学和宏基因组学及其临床应用的整合进步
人类微生物组及其代谢产量在塑造人类健康和疾病中起着重要作用。通常使用代谢组学和宏基因组来表征宿主微骨串扰，但是很大一部分微生物代谢物和肠道微生物的分子功能仍然未知。本评论总结了人类肠道微生物组的注释和发现新代谢产物的策略，即单独使用代谢组学或与元基因组相结合，并提出了将这两种类型的数据组合以获得生物学见解的数据分析方法。还讨论了肠道微生物组研究在生物标志物筛查，精密医学，微生物组医学和药物发现中的应用，以及该研究领域的观点，挑战和局限性。
宏基因组中细菌和古细菌DNA患病率的大规模估计揭示了生物群特异性模式
宏基因组通常包含许多来自真核生物的读物。但是，通常没有17种可靠的方法来估计18个元素组中非微生物读数的普遍性，迫使许多分析技术使所有读取都是微生物的经常构成假设19。例如，元基因组组装的20个基因组（MAG）恢复工作的成功是根据映射到21个恢复的MAG的读数的数量来评估的，如果存在真核生物22读，该程序将低估真正的保真度。在这里，我们介绍了“ Singlem Microbial_fraction”（SMF），这是一种可伸缩的23算法，可稳健地估计24元组的细菌和古细菌读数的数量，以及平均微生物基因组大小。SMF不使用真核25参考基因组数据，可以应用于任何Illumina Metagenome。基于26个SMF，我们提出了“域调整的映射率”（DAMR）作为改进的27公制，以评估从元基因组中回收的微生物基因组回收率。我们在模拟和真实数据上基准为28 SMF，并证明DAMR可以指导基因组29恢复。将SMF应用于136,284个公开可用的元基因组，我们报告了30个微生物分数和微生物特异性的微生物31丰度模式的实质性变化，从而提供了有关微生物和真核生物如何分布在地球上的32个。最后，我们表明，大量的人类宿主33个DNA序列数据已存放在公共元基因组存储库中，34可能反对在35释放之前对这些阅读进行筛选的道德指令。38随着宏基因组测序的采用持续增长，我们预计36 SMF是评估基因组恢复工作的宝贵工具，以及37个全球微生物分布模式的恢复。
PDMS在体外生物模型中的最新进展用于流量可视化和测量：从宏到纳米级应用
1个指标机械工程和资源可持续性中心，Minho University，Azur校园的机械工程系M，葡萄牙4800-058 Guimar-4800-058； andrewsv81@gmail.com（A.S。）; glaucotvn@hotmail.com（g.n.）; neves.lucas17@gmail.com（L.B.N.）; a88077@alunos.uminho.pt (f.b.)2 cmems-number-Center for Microelectromechanical Systems, Mechanical Engineering Department, University of Minho, Azur Campus is M, 4800-058 Guimar ã ES, Portugal 3 Cimo-Smuntain Research Center GANÇA, 5300-252 BRAGANÇA, Portugal; jribeiro@ipb.pt 4政治研究所是BragançaCnico，5300-252Bragança，葡萄牙5 Ingenier I A MEC A MEC，MEC，Energ是Los Materiales，de Extremadura大学，06006 BADAJOZ，西班牙Badajoz； cfll@unex.es 6Computación科学研究所（ICCAEX），de Extremadura大学，06006西班牙Badajoz，西班牙7 CEFT-Transport现象研究中心，Porto大学工程学院（FEUP），FEUP），Rua Roberto Frias Frias Frias Frias friias，4200-465-465-465 Porto，Portugnal * coodence
利用叶片光谱和偏最小二乘回归估计东亚森林树种的六个叶片性状
作者：Nakaji, Tatsuro;小熊，弘之；中村正宏；帕尼达姐妹；希望，路；马罗德，多克拉克；相叶正宏；黑川，弘子；小杉，Y；卡西姆，阿卜杜勒·拉赫曼；日浦津
2022 年年度报告
2022年全球经济受到疫情、战争、通胀、加息、地缘政治等因素冲击，抑制市场需求，造成库存过剩。旺宏电子长期耕耘高质量应用市场，成效显著，有效缓解终端需求波动影响，逆势维持相对稳定表现，让旺宏电子营收维持高位，以优质服务与高质量维持产品价格。旺宏电子全年毛利率较上年(2021年)增加2.6%，表现不俗。面对经济下行、产业与客户库存调整等因素，旺宏电子紧随推出减产措施，控制库存水位，并转移资源加速技术开发，让旺宏电子在制程技术上抢占先机，进一步提升长期竞争力。 2022年营运表现如下：全年合并营业净额为新台币434.87亿元，全年合并毛利为新台币192.38亿元，全年平均毛利率提升至44.2%，税后净利为新台币89.7亿元，EPS为新台币4.85元。营业活动现金流入为新台币116.56亿元，投资活动现金流出为新台币103.39亿元，期末现金等价物为新台币197.64亿元，负债率降低至37.3%，每股账面值提升至新台币28.38元，股东权益回报率为18%。旺宏电子多年来致力创新研发，专利强化其与竞争对手的壁垒。以专利为例，旺宏电子2022年在各国申请专利共计240件，截至2022年底，旺宏电子全球专利数达8,894件，除专利数量位居半导体产业前列外，更在全球拥有大量优质关键技术及商业机密，这些对于维持公司竞争力，在全球非挥发性内存市场占据领先地位至关重要。去年(2022)，旺宏电子不仅荣获2022 EE Awards Asia 车用电子解决方案供应商殊荣，更连续第二年荣获年度最佳内存产品奖。此外，旺宏电子也于2023年入选LexisNexis全球百大创新者，这些肯定，都显示旺宏电子勇于创新，坚持产品改良，并有能力为客户创造增值应用，这也是旺宏电子能在众多竞争对手中脱颖而出的原因。在制程与产品开发方面，ROM在2022年占年营收的25%。NOR Flash 占年营收 55%，目前正向高附加值市场拓展，例如 256Mb 以上高密度产品占 NOR Flash 营收比重逐年提升，截至 2022 年已达 50%，并正加速开发全球首款超高密度 3D NOR Flash，有助拓展高容量 NOR 市场。此外，来自车用、工业、医疗、航太等优质应用领域的 Flash 产品营收已达 41%，将成为旺宏业务成长的最大推动力之一。车用应用领域营收较上年 (2021) 大幅增加 43%，位元出货量也创下历史新高，过去五年位元出货量年复合增长率达 30%，累计出货量突破 5.6 亿颗。 NAND Flash方面，全年营收占比11%，96层3D NAND Flash产品已于去年底(2022)开始量产，将逐步贡献营收，预计今年(2023)可完成192层3D NAND Flash产品的开发，并持续开发更高层数堆叠技术，满足客户更高容量产品的需求。随着数据中心、人工智能、车用市场、5G等快速发展，内存芯片的应用也愈加广泛，旺宏电子秉持研发技术、产能、严谨品管的精神，以及为客户提供高效能、高可靠度内存解决方案的承诺，获得多项优异的认证与肯定，例如Octaflash取得ISO 26262车用电子功能安全最高等级ASIL D认证，获得全球各大车用芯片厂的认可。而96层3D NAND Flash产品已于去年底(2022)开始量产，将逐步贡献营收，预计今年(2023)可完成192层3D NAND Flash产品的开发，并将持续发展更高层数堆叠技术，满足客户对更高容量产品的需求。随着数据中心、人工智能、车用市场及5G等快速发展，内存芯片的应用也愈加广泛，旺宏电子秉持研发技术精神、生产能力、严谨品管，以及提供客户高效能、高可靠度内存解决方案的承诺，并因此获得优异的认证与认可，例如Octaflash取得ISO 26262车用电子功能安全最高等级ASIL D认证，受到全球各大车用芯片厂认可。而96层3D NAND Flash产品已于去年底(2022)开始量产，将逐步贡献营收，预计今年(2023)可完成192层3D NAND Flash产品的开发，并将持续发展更高层数堆叠技术，满足客户对更高容量产品的需求。随着数据中心、人工智能、车用市场及5G等快速发展，内存芯片的应用也愈加广泛，旺宏电子秉持研发技术精神、生产能力、严谨品管，以及提供客户高效能、高可靠度内存解决方案的承诺，并因此获得优异的认证与认可，例如Octaflash取得ISO 26262车用电子功能安全最高等级ASIL D认证，受到全球各大车用芯片厂认可。
对DNA病毒的宏基因组分析，其靶向序列捕获犬叶轨道腺瘤和正常结膜
摘要：我们的研究目的是：（1）评估表型正常的犬类结膜和轨道组织和组织中的犬叶状轨道轨道腺瘤（Cloas），以便存在病毒基因组材料，并且（2）将检测到的DNA病毒分类以确定DNA病毒是否与Cloas相关。在本研究中包括31种植物固定的粘膜嵌入蛋白蛋白蛋白乳蛋白组织样品，4个乳头状瘤或sarcoid，以及10种新的临床正常结膜组织。基因组DNA，并制备了测序文库。库是分子索引并合并的，并通过使用virocap捕获的靶向序列捕获病毒DNA。库是在Illumina Hiseq平台上测序的，并将其与已知的病毒DNA参考基因组进行了比较，以鉴定病毒DNA。分别在6.4％和20％的克洛阿组织和正常的结膜样品中鉴定出食肉动物细节病毒。这项研究表明，来自健康狗和颈毛的结膜组织却罕见地携带了DNA病毒，并且没有与这些肿瘤有关的DNA病毒。需要进一步的研究来评估披针对的病因。
蜂蜜批量 DNA 宏基因组分析，用于识别蜂蜜的生物成分并监测蜜蜂病原体
1 Celvia CC AS，塔尔图，爱沙尼亚 10 2 塔尔图大学临床医学研究所妇产科系，塔尔图，爱沙尼亚 11 3 卡罗琳斯卡医学院和卡罗琳斯卡大学医院临床科学、干预和技术系妇产科，12 瑞典斯德哥尔摩 13 4 塔尔图大学分子与细胞生物学研究所，爱沙尼亚 14 15