XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System放线菌
NEP- 2020 理学学士 - 植物学课程大纲
第一单元：生命的起源和进化 生物多样性的进化史，早期地球和生命的起源，自发，生物起源，巴斯德的实验，疾病的细菌理论；生命史上的重大事件，生命多样性的分类，生命王国——原核生物、真核生物、古细菌，达尔文的生命观和物种起源，达尔文的进化论。第二单元：微生物多样性 微生物的分类- R. H. Whittaker的五界概念，Carl Woese的域系统。细菌特殊群体的简要介绍-古细菌、支原体、衣原体、放线菌、立克次体和蓝藻。第三单元：生物分子 碳水化合物：命名和分类。脂质：储存和结构脂质的定义和主要类别。蛋白质：氨基酸的结构；蛋白质结构的层次。核酸：核苷酸的结构和功能；核酸的类型。单元 4：生物学的遗传方法 遗传模式和生物学问题；孟德尔定律的变化；遗传信息的分子基础；遗传信息从 DNA 到 RNA 再到蛋白质的流动。实践 1.学习 a) 显微镜的使用 b) 固定和染色的原理。2.制备正常、摩尔和标准溶液、磷酸盐缓冲液、连续稀释液 3.使用微量移液器 4.通过纸色谱法分离 A) 氨基酸 B) 叶绿体色素。5.对细菌进行革兰氏染色。6.从永久载玻片研究细胞/组织中核酸和粘多糖的细胞化学分布。7.使用 Lowry 法定量估计蛋白质。使用绘制的标准曲线确定未知样品的浓度。8.通过薄层色谱法分离和定量糖。9.培养大肠杆菌并用浊度法估计培养物密度。根据现有数据绘制生长曲线。10.从大肠杆菌中分离基因组 DNA。建议阅读 1.Campbell, N.A.和 Reece, J.B.(2008) 生物学第 8 版，Pearson Benjamin Cummings，旧金山。2.Raven, P.H 等人 (2006) 生物学第 7 版 Tata McGrawHill Publications，新德里 3.Griffiths, A.J.F 等人 (2008) 遗传分析简介，第 9 版，W.H.Freeman & Co. NY
预印本 DOI：发布于 2022 年 6 月 30 日 https://...
基于全基因组测序的链霉菌属的表征。 6（4）：关注天然产品1 2 MarcelaProençaBorba1（0000-0003-4909-969X），JoãoPaulowitusk 1，DéboraMarchesan Cunha 1，Daiana deiana de Lima- 3 Mora-3 Morales 2,3 591-6514）4 5 1-农业和环境微生物学的研究生课程，基本健康科学研究所，6联邦大学里奥格兰德大学，巴西Porto Alegre，巴西Porto Alegre 7 2-生物信息知识从Porto Alegre开始阿雷格里、南里奥格兰德州、阿雷格里港、巴西 10 11 通讯作者：Marcela Proença Borba（ceh.proenca@gmail.com） 12 13 关键词 14 次生代谢产物、基因组挖掘、放线菌、生物合成基因簇、植物病原真菌。 15 16 数据摘要 17 该全基因组霰弹枪项目已存入 DDBJ/ENA/GenBank，登录号为 18 VIFW00000000。由于核苷酸序列数量巨大，在整个手稿和在线资源的补充数据中发现了数据库登录号。 20 21 摘要 22 我们对链霉菌属的整个基因组进行了测序。 6（4）是从番茄根部分离得到的，对植物病原真菌具有抗真菌活性，主要针对番茄根结线虫（Bipolaris sorokiniana）。该基因组有近 7 Mb 和 24 3,368 种假设蛋白质，这些蛋白质在 Uniprot 中进行了分析和表征，重点是 25 种生物化合物。为了表征和鉴定该分离株，进行了 MLST 分析，最终得到一种新的 ST，26 归类为 ST64。构建了表型和系统发育树来研究链霉菌属。 6(4)进化27和序列相似性，该分离株是与Streptomyces prasinus和Streptomyces viridosporus更接近的菌株。已知链霉菌属具有强大的代谢能力，并且存在隐秘基因。这 29 个基因通常以簇的形式存在，负责生产多种天然产物，其中主要是抗生素。此外，6（4）显示通过反SMASH扩增出11个生物合成基因簇，其中包括3个簇31PKS和NRPS类型。 32 33 34 简介 35
研究辅助对土壤微生物活性的影响
1。今天的引言，有机农产品的种植是世界上最重要的问题之一，它基于有机肥料的使用。包括；可以通过使用辅助物来实现。从这个角度来看，可以通过培养辅助作物，达到高生物质，粉碎栽培的生物量，在田间均匀散布，耕作土地，考虑到自然土壤和气候条件，从而满足有机肥料的需求。然而，微生物在将有机肥料转化为植物吸收的一种形式中的重要性是无与伦比的，他们的研究是紧迫的任务之一。辅助作物的种植可改善土壤水和空气状态。当种植尖峰的农作物时，这种情况尤其明显。同样，如果秋季和早春的辅助作物被粉碎在地面上，它们在土壤中扮演卫生作用，并为棉花疾病和害虫的略有减少提供了基础[1，2]。siderates在改善土壤生育能力和土壤中的微生物过程中起着重要作用。根据数据，土壤微生物包括细菌，放线菌和真菌，其中约70％是细菌，约27-30％是放线症，约1-3％是真菌[3，4，5，6]。如果土壤的农业物理，水物质特性是适度的，则其中的微生物被激活，因此土壤肥力会增加。因此，对土壤菌群和生物学的了解，对各种农业技术活动的评估是一个非常重要的问题。尤其是，在短行棉花旋转中从棉花中释放的辅助物不仅会影响土壤的农业物理特性，而且会影响植物中发生的所有生命过程以及土壤的微生物活性，因此其研究是紧迫的问题之一。从来源中知道，从棉花，冬小麦和其他农作物种植的区域清除的土地上，辅助作物对土壤生育能力（包括土壤特性和微生物）具有显着的积极影响。然而，在撒马尔罕区域的旧灌溉草地 - 抗土壤的条件下，纯和混合种植了辅助作物的效果，生物量的培养以及所得的生物量在土壤上对土壤微生物活性的应用，并未充分研究。因此，这项研究是在2019 - 2020年根据萨马尔桑德地区Ishtikhon区的农场“ Nurmon Abdullaev”农场灌溉的草地 - 抗原土壤的条件进行的。
在暴露于广谱氢氧化铜的烟草生态系统中微生物群落的反应
氢氧化铜是一种广谱铜杀菌剂，通常用于控制作物真菌和细菌性疾病。除了控制靶向病原体外，氢氧化铜还可能影响植物层生态系统中其他非靶向微生物。在施用杀菌剂后的四个时间点（在喷涂之前和5、10和15天之前），通过使用Illumina高通量测序技术和生物学工具研究了患病和健康的烟草微生物微生物对氢氧化铜应激的反应。结果表明，健康群体的微生物组社区比疾病组更受影响，而真菌群落比细菌群落更敏感。疾病组中最常见的属是替代植物，波兰菌，cladosporium，pantoea，ralstonia，pseudomonas和sphinghomonas;在健康组中，这些是替代人，cladosporium，symmetrospora，ralstonia和pantoea。喷涂后，健康和患病组的真菌群落的α多样性在5天后下降，然后显示出越来越多的趋势，健康组在15天时显着增加。健康和患病群体中细菌群落的α多样性在15天时增加，而健康的组有显着差异。在健康和患病的叶片的真菌群落中，替代品和cladosporium的相对丰度降低了，而波动脉症，stagonosporopsis，Symmetroppora，Epicoccum和Phoma的相对丰度则增加。Pantoea的相对丰度首先减少，然后增加，而Ralstonia，Pseudomonas和Sphingomonas的相对丰度首先增加，然后在健康和患病的叶片的细菌群落中减少。虽然氢氧化铜降低了致病真菌替代性和cradosporium的相对丰度，但它也导致有益细菌（例如放线菌和Pantoea）的降低，并增加了潜在的病原体，例如波里米亚和稳定性。用氢氧化铜处理后，患病组的代谢能力得到了改善，而健康组的代谢能力得到了显着抑制，随着应用时间的延长，代谢活性逐渐恢复。结果揭示了在氢氧化铜应激下，微生物群落组成和健康和患病的烟草的代谢功能的变化，为未来对植物层的微生态保护的研究提供了理论基础。
肠道细菌的新闻稿“项目”引起结肠癌
词汇表（注1）放线菌Odontolyticus（A.odontolyticus）：一种口腔中的一种居民细菌，据说与牙周疾病有关。据报道，2019年，它存在于结肠癌早期的肠道中。 （注2）细胞外囊泡：细胞释放的脂质覆盖的颗粒，直径约为100 nm。这些囊泡包含多种生理活性物质，被认为在与其他细胞交流中起着作用。细菌产生独特的细胞外囊泡，称为膜囊泡（MVS），它们是相似的结构，但是它们的生产机制和生理活性通常是未知的。 （注3）活性氧：一组高反应性分子作为使用氧气制造能量的副产品。如果产生过量，氧化应激会导致DNA损伤。 （注4）Toll样受体2（TLR2）：这是在人类细胞中表达的Toll样受体之一，并充当病原体（例如微生物）的传感器，到目前为止已经确定了10种类型的受体。 TLR2主要识别细菌细胞壁的成分，并将其传输到产生免疫反应的下游信号。 （注5）核细菌核（F.nucleatum）：一种口腔中的一种居民细菌，是引起牙周疾病的细菌之一。近年来，有许多与结肠癌关联的报道。 （注6）永生的人类结肠上皮细胞：出于研究目的，通过导致正常的，非癌症的人类结肠上皮细胞永生的细胞失去了限制细胞分裂的能力。 （注7）NF-κB信号：调节炎症反应的重要信号之一，调节响应特定刺激的炎症细胞因子的表达。它参与慢性炎症，并参与肿瘤形成和进展。 （注8）敲除：一种抑制特定基因表达的技术。 （注9）从人IPS细胞中得出的迷你肠：由人IPS细胞创建的2017年肠道的3D器官模型。这项研究中使用的肠道的特征是肠上皮的外部取向。 （注10）发育不良：形态与正常形态不同的疾病，这被认为是癌前病变的早期阶段。
胃癌手术后肠道菌群的变化
胃癌 (GC) 是一个全球性健康问题，是全球第五大最常见的癌症和第三大肿瘤死亡原因 ( 1 )。中国的癌症状况正在发生转变，癌症发病率更高 ( 2 )。胃切除术作为胃癌的治愈性切除术，旨在获得完整的组织病理学清除，包括原发部位的根治性切除以及必要时切除受影响的淋巴结和邻近器官 ( 3 )。人体胃肠道 (GI) 是一个复杂的微生态系统，栖息着多达 10 14 种微生物，包括细菌、真菌、病毒和原生动物 ( 4 )。人体肠道微生态中有400余种细菌，其中优势菌群主要有拟杆菌和芽孢杆菌，占细菌总数的70%以上，其他细菌主要有变形菌、梭菌、放线菌、疣微菌、蓝藻等（5）。不同肠道菌群相互制约，共同维持微生态系统的动态平衡，参与机体的能量转换、代谢、消化、免疫调节及肠黏膜屏障防御功能等（6～8）。随着16S rRNA基因序列分析技术的发展，胃切除患者围手术期肠道菌群的变化逐渐被揭示。鲁氏胃绕道手术 (RYGB) 后发现肠道微生物多样性增加、微生物组成改变和代谢改善( 9 )。此外，将 RYGB 手术小鼠的粪便定植于无菌小鼠体内可导致体重减轻和肥胖减少，这证明 RYGB 相关的肠道微生物群可以改善宿主的代谢( 10 )。这些临床研究表明胃切除术后微生物群发生了重大变化，而大多数研究对象是肥胖患者或接受 RYGB 手术的小鼠。与以往研究不同的是，胃癌患者围手术期面临多种临床暴露因素，包括抗生素、饮食、焦虑和医院内病原体，这些都会影响肠道菌群( 11 )。然而，人们对胃癌患者围手术期肠道微生物群的变化了解甚少。此外，由于消化道重建和肿瘤负荷减轻，胃癌患者的肠道微生物群可能受到进一步影响( 12 )。 Liang 等首次报道了根治性远端胃切除术对胃癌患者粪便菌群的影响，发现根治性远端胃切除术对肠道菌群组成有显著影响，主要表现为阿氏菌、大肠杆菌/志贺氏菌、乳酸杆菌和微杆菌相对丰度的变化（11），但该研究样本量仅为 6 例。本研究旨在描述胃癌患者住院期间手术前后粪便微生物群的变化。
在常规和综合有机农业下对土壤健康的评估
这项研究是在2021 - 2024年间，在北方邦Modipuram的ICAR-印度农业系统研究所进行，以评估综合有机农业系统（IOFS）和综合农业系统（IOFS）的影响，并在土壤生物学特性中对土壤生物学特性对植物，Enzyme Active and enzyme vepent and Freat and corod and Foreal and Frol and Frol and Frol and Froleal corpors and Frol and Foreal system and Frol and Foreal system，coreat和Glod corpors and Foreal systern。iof始终在土壤健康指标方面表现出卓越的性能。在IOF下观察到较高的微生物种群（细菌，真菌和放线菌），尤其是在蔬菜作物下。与IFS模型相比，谷物作物下的土壤（食品系统）显示IOFS模型中细菌种群增加了约41％。类似地，在蔬菜系统下的土壤显示IOFS模型中真菌种群增加了32％。酶活性，包括脱氢酶，β-葡萄糖苷酶，尿素酶和碱性磷酸酶的活性在IOF中显着更高，并显着改善了果实和蔬菜作物。 饲料系统在IOF中显示出脱氢酶（36.8％）和β-葡萄糖苷酶（34.7％）的脱氢酶的改善，与IFS相比。 IOF还显示出易于提取的肾小球素（EEG）和总肾小球素（TG）的水平增加。 蔬菜系统的脑电图和TG分别提高了32％和14％，这表明弧形菌根真菌的活性增强了，碳和氮隔离的潜力。 这些发现突出了有机养分和害虫管理实践在促进土壤生育和可持续性方面的好处。酶活性，包括脱氢酶，β-葡萄糖苷酶，尿素酶和碱性磷酸酶的活性在IOF中显着更高，并显着改善了果实和蔬菜作物。饲料系统在IOF中显示出脱氢酶（36.8％）和β-葡萄糖苷酶（34.7％）的脱氢酶的改善，与IFS相比。IOF还显示出易于提取的肾小球素（EEG）和总肾小球素（TG）的水平增加。 蔬菜系统的脑电图和TG分别提高了32％和14％，这表明弧形菌根真菌的活性增强了，碳和氮隔离的潜力。 这些发现突出了有机养分和害虫管理实践在促进土壤生育和可持续性方面的好处。IOF还显示出易于提取的肾小球素（EEG）和总肾小球素（TG）的水平增加。蔬菜系统的脑电图和TG分别提高了32％和14％，这表明弧形菌根真菌的活性增强了，碳和氮隔离的潜力。这些发现突出了有机养分和害虫管理实践在促进土壤生育和可持续性方面的好处。
胱氨酸胰蛋白胨琼脂
包括布鲁氏杆菌、棒状杆菌、巴氏杆菌、肺炎球菌和链球菌等难培养菌，在适当的温度下无需添加增菌剂（1,11,12）即可在较长时间内生长。甚至一些对光敏感的厌氧微生物也可以在没有特殊条件的情况下在该培养基中生长，但在还原气氛中，它们会得到理想的生长。该培养基在新鲜配制时效率最高，但可以长期保存，但注意避免脱水。为此，强烈建议使用螺旋盖或适当密封。在有二氧化碳的培养基中，牛放线菌、漏斗状拟杆菌和细毛菌（8）等厌氧菌在该培养基中生长良好。添加碳水化合物后，它可用于研究不在酚红经典培养基中生长的微生物的糖发酵。通过酚红指示剂的颜色变化可以轻易观察到酸化。在半固体琼脂中，酸性反应很容易检测到，因为形成的酸不会像在肉汤中那样立即扩散到整个培养物中。当不存在可发酵碳水化合物时，大多数培养物都会出现碱性反应。在半固体培养基中很容易检测到运动性 (13)。运动性培养物远离接种线生长。非运动性生物沿着接种线在接种区域生长，而周围区域保持清洁。胰蛋白胨、L-胱氨酸提供支持苛刻微生物生长所需的营养。碳水化合物发酵是通过培养基的可见颜色变化来检测的，这是由于 pH 指示剂染料酚红的掺入。当生物代谢存在的碳水化合物时，会产生有机酸，培养基会变酸。然而，培养基中存在的蛋白胨也会被存在的细菌降解，产生 pH 呈碱性的物质。当碳水化合物发酵产生的酸量大于蛋白胨降解的碱性终产物时，酚红指示剂会从红橙色变为黄色。酚红的颜色变化发生在 pH 值 6.8 左右，接近培养基的原始 pH 值。在研究奈瑟菌属的发酵时，只接种管状培养基的表面。对于兼性生物，例如链球菌和严格厌氧生物，接种方法是用接种针刺入培养基中心，深度约为培养基深度的 1/2。根据所测试的生物，使用松开的盖子进行有氧或厌氧培养。奈瑟菌应使用松开的盖子培养（7）；如果在 CO2 培养箱中培养（3,10），则应在非 CO2 培养箱中使用紧密的盖子培养（3）。为了更快地生长和更快地进行发酵反应，厌氧培养物最好在 CO2 以及氢气或氮气存在下进行培养。
西孟加拉邦大学
4。地衣：-4.1类型； 4.2繁殖； 4.3经济重要性。4.4地衣在植物继承和污染监测中的作用。5。经济和药用重要性：-5.1蘑菇 - 印度属品种的食品价值和二项式 - agaricus，calocybe，pleurotus和volvariella; 5.2真菌来源和用途 - SCP，贝克酵母，乙醇，柠檬酸，色氨酸， - 淀粉酶，核黄素，Griseofulvin，nystatin和Cyclosporin; 5.3医学真菌学 - 结局的定义；在菌丝中用作“环虫”或滴虫病和念珠菌病的因果生物和抗生素。微生物学1。微生物和微生物学研究 - 主要概念； 1.1原核生物（原核生物）和真核生物的微生物和王国的分类（G. E. Murray 1968＆R。H. Whittaker 1969）[初步想法]； 1.2现代分类，签名密码子，三个领域的分类概念（Carl R. Woese 1978）和通用系统发育树的概念（Norman R. Pace 1997）[仅基本概念]。2。古细菌：-2.1特征（简短概述）； 2.2细胞壁； 2.3发生。3。4。病毒：-4.1病毒和植物病毒的类型； 4.2植物病毒的传播； 4.3 TMV - 理化特征及其繁殖模式； 4.4 T 4噬菌体 - 结构，感染和裂解周期； 4.5 lambda（）噬菌体 - 溶酶体的机制和意义； 4.6病毒和王室。5。细菌：-3.1一般特征； 3.2细菌生长 - 二进制裂变，指数生长和生长曲线（具有单个碳源的封闭系统中的一般模式 - 单相）3.3化学本质，糖卵形，粘液层，果皮层，鞭毛，pili，pili和fimbriae的化学性质，超结构和功能； 3.4细胞壁 - 革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌之间的化学性质和差异； 3.5细菌基因组和质粒； 3.6遗传重组 - 转化[DNA摄取的一般过程，自然和诱导的能力和机制]，结合['F'因子，F +和HFR男性以及染色体动员]和转导[一般概念和适用性]； 3.7细菌多样性 - 以下组的一般概念和系统位置： - 光合细菌（蓝绿色，紫色和绿色细菌，氧合和氧合群的概念），衣原体，氮固定细菌（符号和非肌生物）（符号和非肌生元），结实和结构细菌，又有细菌，又有元素，且异常，且群体，以及构成的，构成的，构成的，构成的，构成的，构成的，以及构造的群体，及其群体和群体，构造和群体及其群体，放线菌科。应用细菌学：-5.1来源（仅名称）和用途 - 杆菌蛋白，新霉素，链霉素，氯霉素，两性霉素B，淀粉酶，纤维酶，纤维素酶，蛋白酶，赖氨酸，赖氨酸和右旋烷； 5.2生物肥料，生物气体和生物农药的生产中使用的细菌（仅）； 5.3霍乱，细菌痢疾，伤寒，白喉，结核病，结核病，瘟疫和肺炎的因果生物（只有名称）。
补充芽孢杆菌法属芽孢杆菌对断奶猪的性能，全身免疫和肠道菌群的影响，并用致病性的肠毒素大肠杆菌F18
这项研究的目的是研究饮食补充芽孢杆菌的影响（B.）淀粉菌对断奶猪的生长性能，腹泻，全身免疫和肠道菌群的实验感染了F18肠毒素大肠杆菌（ETEC）。单独容纳50只断奶猪（7.41±1.35 kg bw），并随机分配给以下五种治疗方法之一：假控制（con-），Sham B. amyloliquefaciens（bam-）（BAM-），受到挑战的控制（con +），受到挑战的B. amyloliquefiquefaciens（B. amyloliquefiquefaciens）（BAM +）（BAM +）和挑战Carbadex（agp）（agp + carbadex）。实验持续了28天，适应7天，第一次ETEC接种后21天。ETEC挑战减少（P <0.05）猪的平均每日增益（ADG）。 与CON +，AGP +增强（p <0.05）ADG相比，而B. amyloliquefaciens的补充趋于（p <0.10），以将猪的ADG从接种后第0天增加到21天（PI）。 ETEC挑战在第7和21 pi上增加了（p <0.05）白细胞（WBC），而BAM +猪在第7天PI的WBC趋于较低（p <0.10），并且与CON +相比，在第21天PI的WBC较低（P <0.05）WBC。 与AGP +粪便菌群相比，BAM +在第0天的Lachnospileaceae的相对丰度较低（P <0.05），在第21 pie PI和梭状芽孢杆菌科的相对丰度较低（P <0.05），但较高（p <0.05）的相对丰度在0。ETEC挑战减少（P <0.05）猪的平均每日增益（ADG）。与CON +，AGP +增强（p <0.05）ADG相比，而B. amyloliquefaciens的补充趋于（p <0.10），以将猪的ADG从接种后第0天增加到21天（PI）。ETEC挑战在第7和21 pi上增加了（p <0.05）白细胞（WBC），而BAM +猪在第7天PI的WBC趋于较低（p <0.10），并且与CON +相比，在第21天PI的WBC较低（P <0.05）WBC。与AGP +粪便菌群相比，BAM +在第0天的Lachnospileaceae的相对丰度较低（P <0.05），在第21 pie PI和梭状芽孢杆菌科的相对丰度较低（P <0.05），但较高（p <0.05）的相对丰度在0。在回肠摘要中，BAM +中的香农指数高于AGP +中的div>。bray-curtis pcoa在第21 pi pi中从假猪与ETEC感染的猪收集的卵植物中显示了细菌群落组成的不同。但是，用BAM +中的猪的富度（p <0.05）的相对丰度更大，但在卵形 +猪中，放线菌和杆菌的相对丰度（p <0.05）的相对丰度低于AGP +中的猪。iLeal Digesta具有比BAM +中的Pig较高（p <0.05）的塞梭菌strictu stricto 1，但比猪更低（p <0.05）。总而言之，补充淀粉芽孢杆菌倾向于增加ADG，并且对ETEC感染的猪腹泻的影响有限。