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DNA甲基化与转录噪声相关，响应于东部牡蛎（Crassostrea virginica）的PCO2升高
抽象分子模拟扩展了我们学习生物分子相互作用的能力。由具有不同理化特性的不同脂质组成的生物膜是参与细胞功能的高度动态环境。蛋白质，核酸，聚糖和生物兼容的聚合物是细胞质和脂质膜界面中细胞过程的机械。脂质物种直接调节膜特性，并影响其他生物分子的相互作用和功能。天然分子扩散会导致局部脂质分布的变化，从而影响膜特性。将生物物理和结构膜和生物聚合物的特性投射到二维平面可能是有益的，可以在降低的尺寸空间中量化分子特征，以识别感兴趣界面的相关相互作用，即膜表面或生物聚合物表面接口。在这里，我们提出了一个工具箱，旨在将膜和生物聚合物特性投射到二维平面上，以表征脂质 - 脂质与脂质聚合物接口之间的相互作用模式和空间相关模式。该工具箱包含两个使用MDakits体系结构实施的枢纽，一个用于膜，一个用于生物聚合物，可以独立或一起使用。三个案例研究证明了工具箱在GitHub中具有详细教程的多功能性。该工具箱和教程将定期更新其他功能和决议，以扩展我们对生物分子在二维中的结构 - 功能关系的理解。
系统发育学：一种用于处理和分析系统基因组数据
动机：生物学过程中的各种学科并分析了多个序列比对（MSA）和系统基因树，以评估其信息含量，推断进化事件和过程并预测基因功能。但是，由于缺乏统一的工具包，MSA和树木的自动处理仍然是一个挑战。为了填补这一差距，我们介绍了Phykit，这是一种使用30个处理MSA和树木的函数的工具包，包括但不限于估计突变率，序列组成偏见的评估，计算分子时钟的违规程度以及与下属的分子抗体（内部分支）（较低的支撑）。结果：为了证明Phykit的实用性，我们详细介绍了三种用例：（1）总结MSA和系统发育树中的信息内容，以诊断出序列或树数据的潜在偏见； （2）评估基因 - 基因的共同变异，以鉴定基因之间的功能关系，包括新颖的关系，以及（3）标志性的系统发育树中缺乏分辨率事件或多构象，这些事件暗示了快速辐射事件或缺乏数据。我们预计，植物会对处理，检查和得出生物学意义有用。可用性和实施：phykit在GitHub（https://github.com/jlsteenwyk/phykit），pypi（https：//pypi.org/project/phykit/）和Anaconda Cloud（https：//pro）云（https：//p：org/project/phykit/）和Anaconda Cloud（https：httpps：htttps：/带有广泛文档和用户教程的Cense（https://jlsteenwyk.com/phykit）。联系人：jacob.steenwyk@vanderbilt.edu或antonis.rokas@vanderbilt.edu补充信息：补充数据可从Bioinformatics Online获得。
典型相关分析和偏最小二乘法识别大脑行为关联：教程和比较研究
摘要典型相关分析 (CCA) 和偏最小二乘 (PLS) 是用于捕捉两种数据模态（例如大脑和行为）之间关联的强大多元方法。然而，当样本量类似于或小于数据中的变量数量时，标准 CCA 和 PLS 模型可能会过度拟合，即发现无法很好地推广到新数据的虚假关联。已经提出了 CCA 和 PLS 的降维和正则化扩展来解决此问题，但大多数使用这些方法的研究都有一些局限性。这项工作对最常见的 CCA/PLS 模型及其正则化变体进行了理论和实践介绍。我们研究了当样本量类似于或小于变量数量时标准 CCA 和 PLS 的局限性。我们讨论了降维和正则化技术如何解决这个问题，并解释了它们的主要优点和缺点。我们重点介绍了 CCA/PLS 分析框架的关键方面，包括优化模型的超参数和测试已识别的关联是否具有统计意义。我们将所描述的 CCA/PLS 模型应用于来自人类连接组计划和阿尔茨海默病神经成像计划的模拟数据和真实数据（n 均为 .500）。我们使用这些数据的低维和高维版本（即样本大小与变量之间的比率分别在 w 1 – 10 和 w 0.1 – 0.01 范围内）来展示数据维数对模型的影响。最后，我们总结了本教程的关键课程。
通过最终用户参与增强神经技术研发的基础指南
抽象的神经技术越来越多地与我们的日常生活，身体和精神状态融为一体。随着神经技术的流行和影响，我们有责任确保我们了解其对最终用户的特殊含义，以及更广泛的道德和社会含义。有许多不同的术语和框架可以阐明最终用户参与技术开发生命周期的概念，例如：“公众和患者的参与和参与”（PPIE），“生活经验”，“共同设计”或“共同生产”。本教程的目的是利用PPIE框架来制定明确的指南，以实施当前和未来的最终用户在神经技术中的强大参与过程，重点是患者参与。介绍将用户参与的有形和概念上的好处进行了介绍之后，我们首先指导读者制定一般策略来建立自己的PPIE流程。然后，我们帮助读者绘制其相关的利益相关者，并提供有关如何考虑用户多样性和表示形式的建议。我们还提供有关如何量化参与结果的建议和工具。我们将各种在线资源到方向单个团队（及其资助者）的建议巩固了自己的建议，以阐明自己的有意义的参与方法。关键输出包括一个利益相关者映射工具，衡量参与影响的方法以及用于透明报告的结构化清单。使最终用户和其他利益相关者能够参与神经技术的发展，即使在其最早的概念阶段，也将帮助我们更好地围绕道德，社会和可用性考虑，并提供更具影响力的技术。总体目的是建立金标准的方法，以确保患者和公众见解处于我们科学探究和产品开发的最前沿。
I＆II学期的教学大纲B.Sc.生物技术
根据Sukhdeo Thorat教授委员会领导的州教育政策的建议，卡纳塔克邦政府从2024-25学年开始加强了三年制学位课程。新的变化紧随其后的学生和学院的脚跟，他们对根据NEP进行四年计划缺乏明确性表示担忧。根据建议，现在的大学可以在所有六个学期中提供三个专业的学位；三个专业的三个专业，最多四个学期，在第五学期和第六学期中专门研究一个学科或；第一学期的单一主题专业人士与未成年人。除了专业和专业课程外，这三个科目还必须是强制性的。首先是具有实用（技能）取向的课程，该课程与理论主要课程有关，并有望提高就业能力。学生必须学习两种语言：卡纳达语/其他印度语言和英语。第三个强制性主题是价值或道德教育，其中包括教授宪法道德价值/平等，自由，兄弟会，民族统一，非歧视和类似价值观的原则。学生可以根据课程的可用性选择两种选修课，这可能是基于纪律或与基于纪律的专业明显相关的纪律。建议包括提供或涉及实用经验的技能增强科目。还建议将基于基于调查/实验室的教程的基础研究方法课程引入第五学期和第六学期的深度专业化和深度专业化。学期考试的考试模式将为80：20-80，内部评估为20。同样，对于实用的科学学科，学期实践考试的考试模式将为40：10-40，内部评估为10。
这是这个长期运行的半导体会议83周年纪念日。 。 。 2025年设备研究会议宣布请求论文Durham
这是这个长期运行的半导体会议83周年纪念日。。。2025设备研究会议宣布呼吁北卡罗来纳州达勒姆（Durham）的论文（2025年1月6日） - 全球运行时间最长的设备研究会议（DRC）宣布了该会议83周年纪念日DRC 2025的论文呼吁。第83届DRC将于2025年6月22日至25日在北卡罗来纳州达勒姆市的杜克大学举行。DRC将来自学术界和行业许多学科的主要科学家，研究人员和学生汇集在一起，分享了他们在设备科学，技术和建模方面的最新研究和发现，包括许多关键设备技术的第一个披露。drc宣布抽象提交的截止日期是2025年2月15日。要提交摘要，请下载2025年的文件。DRC 2025技术计划提供了丰富而多样的议程，其中包含三个全体会议，七个主题演讲和40位受邀演讲者，涵盖了广泛的与设备相关的主题。该计划将包括口头和海报会议，展示电子和光子设备中的先进研究，晚间面板讨论以及有关异质整合设备的特别关注会议。全体会议将由设备科学技术领域的世界知名领导人进行：Eli Yablonovitch，Nicky Lu和Suman Datta。其他计划的重点包括有关异质整合，建模和模拟教程的简短课程以及充满活力的学生参与以及学生纸张奖励奖励出色的贡献。DRC 2025与电子材料会议（EMC）协调，认识到设备和电子材料研究之间的牢固相互作用，为两种会议的参与者之间的信息提供了有意义的信息交流的机会。DRC 2025在以下领域中寻求纸张摘要：
全球政治经济学 - ECON074
经济学系会议记录会议主题：通用选举（GE-24）IV/VI/VIII SEM。课程：全球政治经济学 - ECON074学分：4（3L+1T）会议日期：2024年1月24日，地点：德里经济学系，德里大学经济学院，德里大学召集人：Surender Kumar，Manish Kumar，Manish Kumar，由教师名称大学名称1。Saumyajit Bhattacharya，Kirori Mal College 2。Devendra Kumar，Daulat Ram学院3。C. Saratchand，Satyawati学院的资格标准选择此课程：XII类选择此课程的先决条件：零课程目标•本课程从政治经济的角度向学生介绍了世界经济中的当代结构，趋势和发展。•所涵盖的时期是从第二次世界大战结束到2008年全球经济危机。所涵盖的领域包括生产和公司结构的组织；劳动过程和劳动制度的变化； •世界经济的金融化；以及对全球化国家的性质和作用的理解的转变。学习成果本课程使学生能够对当代全球经济有批判性的理解，改变了过去五到六十年的政治经济关系和发展动态。考试方案最终考试的最大分数为90，其余70个分数分配如下：内部评估的30分和基于教程的评估40分。在期末考试中，应将回答文件分为两个部分。问题可能跨越教学大纲的单位。varoufakis，y。A部分将有5个问题，每个问题都有15分，其中学生将不得不回答两个问题。B部分将有6个问题的6个问题，其中学生将不得不回答任何三个问题。课程概述和阅读注意：带有星号（*）标记的读数对于教师至关重要。可能会鼓励学生阅读他们，但是从这些读物中不应提出任何直接的问题。单元1：简介（6小时）全球化政治经济学，理论和历史概述。（2011）。全球牛头怪：美国，财务的真正起源
1 量子光学中的状态、模式、场和光子...
摘要 光的量子特性使革命性的通信技术成为可能。推进这一研究领域的关键是清晰地理解状态、模式、场和光子的概念。场模式的概念源自经典光学，而状态的概念在以量子力学的方式处理光时必须仔细考虑。术语“光子”是一个重载标识符，因为它通常用于指代量子粒子或场的状态。这种重载通常不结合上下文使用，可能会混淆描述我们测量的现实的物理过程。我们使用现代量子光学理论回顾了这些概念之间的用法和关系，包括光子波函数的概念，该概念的现代历史由 Iwo Białynicki-Birula 在本期刊上发表的一篇开创性论文推进，本文就是向他致敬。 1. 简介 在开始研究量子光学时，很自然地会问：“什么是光子？”但也许更好的问题是：“什么是量子场？”鉴于量子理论与我们赋予该理论的数学元素的名称无关，那么我们如何命名和解释它们何时重要呢？在没有完整的数学解决方案的情况下，尝试对问题建立直觉时，正确地概念化和命名理论元素会有所帮助。这篇献给 Iwo Białynicki-Birula 教授的特刊以教程的方式回顾了状态、模式、场和光子在量子光学中的作用，承认了他对该主题的重要贡献。i 我们希望启发那些可能刚进入该领域的研究人员，例如那些在经典网络领域工作并且现在开始考虑量子网络潜在有用应用的研究人员。我们回顾了光子波函数的概念，它的现代历史大致始于 Białynicki-Birula 在本期刊上发表的一篇论文 [1] 和 John Sipe [2] 的一篇同期论文。状态、模式和场是适用于经典和量子领域的概念。本文以教学的方式回顾了这些概念在两个领域中的产生和定义，描述了电磁场激励的量化如何引入新的（可测量的）行为，并阐明了两个领域之间的联系。
地面激光扫描理论与实践
序言本出版物编译了在2006年10月至2008年9月的项目框架内准备的培训材料，该项目“用于风险意识项目的高级三维测量工具（3driskmapping）”。本教程是来自欧洲大学和行业的多学科专家的国际合作的结果，其中包括：•Mario Santana Quintero和Bjorn van Genechten，应用科学科学圣利文大学（比利时）•Marc Deven Bruyne，Marc de Bruyne，Marc Deven，BNS（Belgium）•Ronaldalalman，Dellandsech（dentherlands）（Denthellands）。•Martin Hankar，Globezenit（比利时）。•Simon Barnes和Huseyin Caner，Plowman Craven（英国）•Iasi技术大学Luminita Budei（罗马尼亚）。•Erwin Heine和HansjörgReiner：自然资源大学和应用生命科学（奥地利）。•何塞·路易斯·莱尔马·加西亚（JoséLuisLuisLermaGarcía）和瓦伦西亚理工大学（西班牙）理工学院（西班牙）的Josep Miquel Biosca Taronger。内容基于实质性的科学研究和实践经验，用于应用陆地激光扫描以捕获我们的建筑环境。该教程的理论部分是由Bjorn van Genechten编辑的，Huseyin Caner，Erwin Heine，JoséLuisLuisLermaGarcía，Ronald Poelman和Mario Santana Quintero的贡献；以及所有参与者的支持。在鲁文市，鲁汶大学和植物的支持下，教会的扫描是可能的。Bjorn Van Genechten的遗产案例研究是由Huseyin Caner，Erwin Heine，JoséLuisLuis LermaGarcía，Ronald Poelman和Mario Santana Quintero以及Mario Santana Quintero以及所有参与者提供支持的遗产研究。扫描项目是由Huseyin Caner，Tomasz Skiba，Tim MacDonald，Leive Spincemaille，Stuart McLeod，Bjorn Van Genechten和Mario Santana进行的。由HansjörgReiner，Josep Miquel Biosca Taronger，Erwin Heine，JoséLuisLuisLermaGarcía和所有参与者的支持制备了有关监测水力发电大坝变形的民用基础设施案例研究。Illwerke AG，Vorarlberg（奥地利）以及因斯布鲁克大学（奥地利）的Thomas Weinold使该领域的数据获取成为可能。Marc de Bruyne和Martin Hankar在Ronald Poelman和Bjorn van Genechten的贡献中编写了有关扫描危险环境（石化平台）的工业案例研究；以及所有参与者的支持。
学生对布洛赫球的理解
匹兹堡大学物理与天文学系，宾夕法尼亚州匹兹堡 15260 * 通讯作者，电子邮件：pth9@pitt.edu 摘要 量子信息科学是一个快速发展的跨学科领域，吸引了学术界和行业专家的广泛关注。它需要来自各种传统领域的人才，包括物理学、工程学、化学和计算机科学等。为了让学生为这样的机会做好准备，重要的是让他们打下坚实的量子信息科学基础，量子计算在其中起着核心作用。在本研究中，我们讨论了布洛赫球面教程的开发、验证和评估，布洛赫球面是一种有用的可视化工具，可用于培养对单个量子比特（量子位）的直觉，而单个量子比特是任何量子计算机的基本组成部分。在学生接受有关必修主题的传统讲座式指导后，以及在参与教程后，我们对他们的理解进行了评估。我们观察、分析并讨论他们在教程中涵盖的概念上的表现进步。简介 量子信息科学与工程 (QISE) 是一个令人兴奋的跨学科领域，可在量子计算、量子通信和网络以及量子传感中应用，这些应用因多种原因而吸引着科学家和工程师。计算机科学家和工程师正在开发用于解决各种问题的量子算法，包括传统计算机无法大规模解决的问题。例如，在传统计算机上，对大素数乘积进行因式分解的问题会随着素数的大小呈指数增长，但在使用 Shor 算法的量子计算机上，该问题的大小大致为多项式。对于未来科学应用，物理学家和化学家也对量子计算机解决其学科中重要问题的潜力感到兴奋，其中求解薛定谔方程起着重要作用。开发强大的量子比特 (qubit) 和可扩展的量子计算机需要物理学家和工程师的专业知识。由于所有这些原因以及其他原因，这一研究领域对于许多来自科学和工程学科、对 QISE 相关领域感兴趣的学生来说，具有巨大的发展前景 [1,2]。用于介绍量子态及其可视化的教学工具之一是 Bloch 球，它允许可视化量子比特（量子计算机的基本功能单元）的状态。它可以成为理解双态系统特性的重要而有力的辅助手段，但学生往往难以理解。此外，Bloch 球是当前研究（包括量子传感和断层扫描）中非常有用的工具，该领域的实验者经常使用它来表征工作中的单个量子比特。布洛赫球面可以让人们以图形方式了解单量子比特状态，包括通过密度矩阵的混合状态，以及可以通过单量子比特门完成的操作。