食品行业对葡萄渣产生了浓厚的兴趣,因为它具有众多健康益处,并且含有高浓度的生物活性化学物质。本研究调查了从白葡萄和蓝葡萄的副产品中获得的葡萄渣的抗菌特性。我们研究的目的是探究蓝葡萄品种(Alibernet、Dornfelder、Cabernet Sauvignon)和白葡萄品种(Blaufränkisch、Sauvignon Blanc、Welschriesling、Weisser Riesling、Irsai Oliver、Pinot Blanc、Palava、Müller-Thurgau、Grűner Veltliner 和 Feteasca Regala)葡萄渣提取物的抗菌活性。用纸片扩散法评估了葡萄渣提取物对九种微生物(革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和酵母)的抗菌活性。发现蓝葡萄渣提取物对枯草芽孢杆菌的抗菌活性最好。白葡萄品种 Sauvignon Blanc、Welschriesling、Weisser Riesling、Irsai Oliver、Pinot Blanc 果渣提取物对枯草芽孢杆菌最有效,Müller-Thurgau 葡萄果渣提取物对 C. koseri 最有效,Grűner Veltliner 和 Feteasca Regala 对枯草芽孢杆菌最有效。最敏感的细菌是枯草芽孢杆菌。
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微生物的品种对人类有益。益生菌微生物通过平衡肠道中的微生物菌群来起作用。整个基因组测序(WGS)技术已用于识别和表征新型微生物。在本研究中,WGS进行了枯草芽孢杆菌(枯草芽孢杆菌)菌株的遗传表征。分别使用Illumina和Nano-Pore产生的短读和长读数,得出了43.58 mol%g+c的43.58 mol%g+c的单个支架。核酸基因组注释管道(PGAP)通过基因注释导致鉴定4296个编码序列(CDS),86个TRNA,30 RRNA和5 NCRNA。组装基因组的爆炸表明,枯草芽孢杆菌KCTC 3135是最接近的菌株,表现出约99%的身份。对与安全性有关的基因(例如抗生素耐药性,毒力因子和毒素)的基因分析均未发现所鉴定的基因对人类健康构成风险。 存在定期间隔短的短文重复序列(CRISPR)和缺乏功能性预言序列的存在似乎在维持基因组稳定性方面是有利的。 此外,存在促成益生菌特性的基因,例如酸和胆汁盐的耐受性,锚定在肠粘膜上和PLSSC基因组中的抗微生物活性,确保菌株的生存能力,从而提高其定殖并降低肠道中的病原性依从性。 总体而言,基因组分析强烈表明枯草芽孢杆菌菌株PLSSC是一种安全的应变,可用作益生菌。均未发现所鉴定的基因对人类健康构成风险。存在定期间隔短的短文重复序列(CRISPR)和缺乏功能性预言序列的存在似乎在维持基因组稳定性方面是有利的。此外,存在促成益生菌特性的基因,例如酸和胆汁盐的耐受性,锚定在肠粘膜上和PLSSC基因组中的抗微生物活性,确保菌株的生存能力,从而提高其定殖并降低肠道中的病原性依从性。总体而言,基因组分析强烈表明枯草芽孢杆菌菌株PLSSC是一种安全的应变,可用作益生菌。
摘要:枯草芽孢杆菌是一种多功能的微生物细胞工厂,可以生产有价值的蛋白质和增值化学物质。长片段编辑技术对于加速细菌基因组工程以获得理想且遗传稳定的宿主菌株至关重要。在这里,我们开发了一种有效的CRISPR-CAS9方法,用于枯草芽孢杆菌基因组中的大规模和无疤痕基因组工程,该方法的阳性率为100%,最多可删除高达134.3 kb的DNA片段,是先前报告的3.5倍。还研究了使用异源NHEJ系统,线性供体DNA和各种供体DNA长度对工程效率的影响。然后将CRISPR-CAS9方法用于枯草芽孢杆菌基因组简化和一系列个体和累积的缺失突变体的构建,这些突变体进一步筛选了新一代生物燃料的异丁醇过度生产剂。这些结果表明该方法是一种强大的基因组工程工具,用于构建和筛选具有增强功能的工程宿主菌株,突出了合成生物学和代谢工程的潜力。
2020年7月29日收到; 2021年1月11日接受;于2021年2月4日出版:作者隶属关系:1个非编码RNA技术与健康中心,哥本哈根大学兽医和动物科学系,1871年,丹麦Frederiksberg,哥本哈根大学; 2荷兰荷兰癌症研究所的致癌基因组学司,荷兰阿姆斯特丹1066; 3哥本哈根大学生物学系计算和RNA生物学部分,丹麦哥本哈根1165;丹麦的Bagsværd4 Novozymes。*通信:Jan Gorodkin,Gorodkin@rth。DK关键字:B。uttilis;基因组注释;非编码和结构化RNA;操纵子。缩写:Asrna,反义RNA; CD,编码序列;去,基因本体论; GRNA,导向RNA; Ji,Jaccard索引; ncRNA,非编码RNA; SRNA,小RNA; TMRNA,转移Messenger RNA; TSS,转录开始站点; TTS,转录终止位点; TU,转录单元; UTR,未翻译区域。†目前地址:英国索尔福德大学科学,工程与环境学院。数据语句:文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据,代码和协议。本文的在线版本可以使用四个补充表和九个补充数据。000524©2021作者
摘要益生菌枯草芽孢杆菌29784(BS29784)通过生物活性代谢物低黄嘌呤(HPX),烟酸(NIA)(NIA)和Pantothenate(PTH)来维持鸡的肠道健康,从而增强动物的韧性和性能。在这里,使用肠球菌在体外模型中,我们确定了这些代谢产物与肠道弹性的三个支柱之间的功能联系:免疫反应,肠壁和微生物群。我们在体外评估了BS29784营养细胞,孢子和代谢产物的能力,以调节全球免疫调节剂(使用HT-29-NF-κB和HT-29-AP-1报道细胞),肠道完整性),肠道完整性(HT-29-MUC2报道细胞)(HT-29-MUC2报道细胞和CACO-2细胞)以及CACO细胞(CACO-2),以及CACO-2-2。最后,我们使用鸡肉肠含量作为接种,模拟了肠发酵,以确定BS29784代谢产物对微生物群及其发酵型的影响。BS29784营养细胞比孢子更有效地降低了炎症反应,这表明它们的益处与代谢活性有关。为了评估这一假设,我们分别研究了BS29784代谢产物。结果表明,每个代谢产物都有不同的有益作用。pth和niA降低了促炎性途径AP-1和NF-κB的激活。HPX通过增强MUC2表达上调粘蛋白的产生。HPX,NIA和PTH增加了细胞增殖。PTH和HPX通过限制渗透性的增加来提高上皮弹性对炎症挑战。在盲肠发酵中,nia增加了乙酸乙酸盐,HPX增加了丁酸酯,而PTH则增加了乙酸乙酸酯,丁酸酯和丙酸酯。在回肠发酵中,PTH增加了丁酸酯。 所有分子调节菌群,解释了不同的发酵模式。 总的来说,我们证明了BS29784通过其分泌的代谢物在弹性的三条线上作用,从而影响了肠道健康。在回肠发酵中,PTH增加了丁酸酯。所有分子调节菌群,解释了不同的发酵模式。总的来说,我们证明了BS29784通过其分泌的代谢物在弹性的三条线上作用,从而影响了肠道健康。
纺织品和制革厂废水污染的抽象土壤污染是环境的一个极大关注,复杂的废水在土壤中积聚了许多染料,通过污染环境和土壤中微生物物种的损失。样品,并确定物理化学分析。pH是基本的,分别来自制革厂和染色部位的8.0和10.1。有机碳非常低,0.76%和0.06%,氮(0.067%和0,095%),磷0.8mg/kg和1.62mg/kg),钙(两种样品中的1.35mol/kg)镁记录了0.30mol/kg和1.65mol/kg,钾,0.85 mol/kg1.65mol/kg,钠,钠3.13mol/kg和30.0 mol/kg,分别在坦纳(Tannery)和染色点中。记录的沙子,淤泥和粘土(78.8%和90.6%)(7.3%和5.3%)(13.9%和4.1%)。确定土壤样品的重金属含量分别从制革厂和染色地点铬的浓度分别为0.0258和0.0043,而镍在-1.0700和-1.0756的位置几乎无法获得。铅记录的浓度非常低,为-0.9164和-7803。鉴定出13种细菌种类,芽孢杆菌的兰氏菌,枯草芽孢杆菌的频率为23.07%,枯草芽孢杆菌的频率为23.07%,枯草芽孢杆菌和肉芽杆菌的杆菌,而杆菌,杆菌菌,蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶,蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶,蛋白蛋白蛋白蛋白酶每个7.69%。 用枯草芽孢杆菌,巨型芽孢杆菌和铜绿假单胞菌从染色的土壤样品中分离出 15种,其发生频率最高,每个发生频率最高,每个发生率为13.33%。鉴定出13种细菌种类,芽孢杆菌的兰氏菌,枯草芽孢杆菌的频率为23.07%,枯草芽孢杆菌的频率为23.07%,枯草芽孢杆菌和肉芽杆菌的杆菌,而杆菌,杆菌菌,蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶,蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶,蛋白蛋白蛋白蛋白酶每个7.69%。15种,其发生频率最高,每个发生频率最高,每个发生率为13.33%。Burkholderia cepacia, P. florescense, Bacillus laterosporus,Bacillus amyloliquifeciens, Bacillus brevis and Proteus vulgaris had 6.66% each, all these were determine with the use of Microgen identification kit, molecular analysis was done on two bacterial isolates and were confirmed to be Alishwanella solinqauinati and Bacillus subtilis.这些表明,孤立的物种可以抵抗大量的有毒化学物质,并可以承受任何恶劣的环境,因此它们可以作为廉价成本来对受影响环境进行生物修复的潜在生物吸引者的能力。
淀粉酶通常在人类,动物,植物和微生物中发现。但是,为了满足工业需求,大多数淀粉酶酶都是从微生物中获得的[3]。与植物或动物相比,选择了从微生物衍生的酶的分离。其中包括快速的微生物增长,能够设计重组酶生产的能力,易于扩展生产以及不受自然因素(例如季节和时间)影响的生产条件[4]。先前的几项研究成功地鉴定了来自芽孢杆菌属的淀粉酶产生细菌种类,包括蜡状芽孢杆菌[5],叶丘犬杆菌[6],阿特罗氏芽孢杆菌[7] [7],枯草芽孢杆菌[8],枯草芽孢杆菌[8],甲虫[9]和牛肉杆菌[11],以及其他型杆菌[11]。铜绿假单胞菌[12],lutetiensis链球菌[13]等。