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双曲矩阵分解可提高药物预测
过去，计算系统生物学的研究更多地侧重于高级统计和数值优化技术的开发和应用，而较少关注对生物空间几何形状的理解。通过将生物实体表示为低维欧几里得空间中的点，最先进的药物-靶标相互作用 (DTI) 预测方法隐含地假设生物空间具有平坦的几何形状。相比之下，最近的理论研究表明，生物系统表现出具有高度聚类性的树状拓扑结构。因此，将生物系统嵌入平坦空间会导致生物对象之间距离的扭曲。在这里，我们提出了一种用于药物-靶标相互作用预测的新型矩阵分解方法，该方法使用双曲空间作为潜在生物空间。与经典的欧几里得方法相比，双曲矩阵分解表现出卓越的准确性，同时将嵌入维度降低了一个数量级。我们认为这是双曲几何支撑大型生物网络的额外证据。
氢混合天然气对现有高压管道线束能量的影响
摘要 本研究旨在研究在管道运行的紧急情况下，氢气混合天然气对线路能量的影响。通过电解从可再生能源中生产氢气，然后将其注入天然气网络，为电网调节和能量存储提供了灵活性。在这种情况下，了解氢气百分比含量对于输电网络运营商至关重要，因为氢气百分比含量可以在氢气-天然气混合物运输过程中安全地影响长期钢制管道服务中的材料。本文首先回顾了现有管道系统中可以与天然气混合的氢气的允许含量，然后研究了压缩机启动和关闭两种情况下对线路能量的影响。在后一种情况下，使用非稳定气体流动模型。为了避免解域中的虚假振荡，在数值近似中使用了通量限制器。使用 GERG-2008 状态方程来计算物理性质。本研究选取已运行多年的树状高压天然气管网作为案例研究，研究结果对管道运营商评估供气安全性具有重要意义。
树实例细分和特征估计林业环境利用移动机器人收集的LIDAR数据
摘要 - 森林在我们的生态系统中起着至关重要的作用，充当碳汇，气候稳定剂，生物多样性中心和木材来源。根据其规模的本质，监视和维护森林是一项艰巨的任务。林业中的机器人技术可能有可能实现高效和可持续的森林实践。在本文中，我们解决了通过利用移动平台收集的LIDAR数据自动生产森林清单的问题。要构建库存，我们首先从点云中提取树实例。然后，我们处理每个实例以提取林业清单信息。我们的方法提供了“胸高直径”的每个树几何特征，以及一个地块中的单个树位置。我们验证了我们的结果，以实地试验期间森林人收集的手动测量结果。我们的实验显示出强大的细分和树状估计表现，这强调了自动化林业服务的潜力。结果与该域中使用的流行基线方法相比，结果表现出了出色的性能。
图形切割广泛用于计算机视觉中。为了加快优化过程并提高大图的可扩展性，Strandmark和Kahl
图形切割广泛用于计算机视觉中。为了加快优化过程并提高了大图的可伸缩性，Strandmark和Kahl引入了一种分裂方法，将图形分为多个子图中，以在共享和分布式内存模型中进行并行计算。然而，该平行算法（平行BK-Algorithm）在迭代次数上没有多项式结合，在某些情况下，由于其子问题的多个最佳解决方案，因此在某些情况下被认为是无代数的。为了补救这个非交流问题，在本文中，我们首先引入了一种合并方法，能够合并任何相邻的子图纸，这些子图几乎无法达成对其在平行BK-Algorithm中重叠区域的一致性。基于图形切割的伪树状表示形式，我们的合并方法被证明是有效地重用这些子图中的所有计算流动。通过分裂和合并，我们进一步提出了一种动态平行和分布式图切割算法，并保证在预定义的迭代次数中与全球最佳溶液收敛。本质上，本文提供了一个通用框架，以允许采用更复杂的分裂和合并策略来进一步提高性能。我们的动态平行算法通过广泛的实验结果验证。
来自静息状态脑功能网络重叠群落结构改变的生物标志物可用于检测阿尔茨海默病
图 4：在不同 k 值下检测到的社区的层次结构。（A）上图和下图分别显示了 k 从 5 到 16 变化时 AD 和 NC 得出的社区层次结构的树状图。X 轴表示不同的簇，Y 轴表示簇之间的距离。截止距离设置为 0.5，其中所有社区合并为每组 16 个簇。这些簇涵盖 11 个常见的 RSN，包括视觉网络 (VN)、眶额皮质 (OFC)、显着网络 (SN)、DMN、执行控制网络 (ECN)、左/右额顶叶网络 (L/RFP)、感觉运动网络 (SEN)、边缘系统 (LIM)、腹侧注意网络 (VAN) 和基底神经节 (BG)。两组之间每个 RSN 的相似性显示在底部，每个 RSN 用一种颜色标记。 (B) 和 (C) 分别通过对 AD 组和 NC 组的每个簇内的社区进行平均来显示结果簇。列表示社区指数，行表示矩阵表示中的节点指数。红色框突出显示了两组在簇内层次结构方面的差异。
保守西非车前草的遗传多样性（Musa ...
摘要：评估种质的遗传多样性对于声音种质管理及其在育种计划中的成功利用至关重要。这项研究旨在估计车前草配件之间的遗传多样性，并使用简单序列重复（SSR）标记在基因型之间建立关系。SSR标记物在20个车前草附属物中扩增了21个等位基因，每个位点3.50等位基因和主要等位基因频率（平均值±SD，0.80±0.34）。多态信息内容（PIC）和香农的多样性指数分别为0.054至0.919和0.000至1.864。分子方差分析（AMOVA）表明，种群中基因型之间发生了88％的遗传变异，人群之间观察到最小的变异。这会导致区分种群时的NEI遗传距离和FST值可以忽略不计。基因流速明确证明了采用共同主导标记的功效，正如主坐标分析（PCOA）和树状图所证明的那样。这项研究表明，在车前草种群中的20个车前草配件之间存在明显的遗传差异，并建立了新的集群群体，为未来在育种计划中使用提供了宝贵的见解。
_____________________________________________________________________________________________________ *Corresponding author: E-mail: navyashreeshakti
通过CTAB方法提取，这是一种获得高质量DNA的公认方案。量化DNA样品，以确保通过25 SSR引物扩增的一致模板浓度。PCR扩增，然后进行琼脂糖凝胶电泳，以分离和可视化SSR带模式，然后根据频带的存在或不存在二进制矩阵格式记录。在所使用的SSR引物中，有9个是多态性的，产生了13个可记分标记，突出了基因型之间的遗传变异性。跨SSR基因座的多态性信息含量（PIC）值，XTXP145基因座的最高PIC值为0.998，表明其在基因型之间区分的高歧视能力和信息性。遗传相似性指数，并通过使用算术平均值（UPGMA）方法对数据进行群集分析。所产生的树状图将基因型分为七个主要簇，以50％的相似性阈值分组，强调了所研究的高粱基因型中存在的遗传多样性。群集I包含单个基因型SVD-1272R，而群集II包括七个具有亚集群形成的基因型。群集III包括一个未分组的基因型SPV-486。群集IV包括八种基因型，而簇V，VI和VII均包含一个单一的未分组基因型。该树状图说明了高粱基因型之间的遗传多样性和关系，基于相似性指数。1。这项研究的结果证实了SSR标记在评估遗传多样性方面的功效，并强调了它们在旨在提高干旱耐受性的繁殖计划中的潜在效用。关键字：高粱； SSR;图片底漆；相似性指数。简介高粱[高粱双色（L.）Moench]，被称为“小米之王”，其谷物尺寸较大，是Kharif（Rainy）和Rabi（Postrainy）季节种植的一种关键谷物作物。在印度，马哈拉施特拉邦，卡纳塔克邦和安得拉邦是产生高粱的主要国家，占国家产出的80％，占全球生产的约16％。尽管只有5％的高粱区域被灌溉，但毛毛高粱对于印度半岛的雨林地区至关重要。干旱应力对高粱的生理和生化过程产生负面影响，需要改善干旱耐受性特征，例如根生长，叶片发育和用水效率[2]。然而，由于谷物填充和圆锥花槽大小的应力程度相互作用，这些特征的表型选择是复杂的[3]。要应对这些挑战，评估高粱基因型的遗传多样性[4]和干旱耐受性至关重要[5]。栽培物种中的遗传多样性是提高作物生产率和质量以及发展耐药性品种的宝贵资源。分子标记物，尤其是简单的序列重复（SSR），为评估遗传变异和鉴定耐旱基因型提供了强大的方法[6]。SSR标记，由于其高可重现性和多重变化，对于基因组映射和标记 -
两亲性磷枝胶束胶胶蛋白抑制剂和阿霉素用于增强三重阴性乳腺癌治疗
摘要：通过不同的作用机制对癌症进行化学/基因治疗的组合已经出现，以增强癌症的治疗功效，并且由于缺乏高效和生物相容性的纳米载体，仍然仍然是一项具有挑战性的任务。在这项工作中，我们报告了一种新的纳米系统，基于两亲性磷齿状（1-C12G1）胶束胶束，以用于三层microRNA-21抑制剂（miR-21i）和阿霉素（DOX）（DOX），用于三重阴性乳腺癌的联合治疗。制备了长线性烷基链和十个质子化吡咯烷表面基的两亲磷齿状树状，并证明在水溶液中形成胶束，并具有103.2 nm的水动力大小。胶束被证明是稳定的，能够封装具有最佳负载含量（80％）和封装效率（98％）的抗癌药物DOX，并且可以压缩miR-21i以形成双流线物以使其具有良好的稳定性，以抗退化。1-C12G1@dox/miR-21i流媒体的共传递系统具有pH依赖性的DOX释放曲线，并且可以很容易被癌细胞吞噬以抑制它们，因为它们在静脉内静脉内注射后被进一步验证，该抗癌机构得到了进一步验证，以处理静脉内的三重乳液模型。具有在研究剂量下经过验证的生物相容性，可以开发出开发的两亲性磷状胶束，以作为一种有效的纳米医学制剂，用于协同癌症治疗。
在光收集树枝状聚合物中揭示直接和间接的能量转移途径
摘要：轻度收获和分子内能量漏斗是自然光合作用的基本过程。可以通过研究能够模仿自然系统的人工轻度收获天线的研究来解密调节此类过程效率的主要结构，动态和光学特性的全面知识。树枝状聚合物是一些探索最多的人工轻度收获分子。然而，它们必须是良好的和高度分支的共轭结构，从而产生分子内能梯度，以保证有效和单向能量转移。在此，我们探索了负责在大型，复杂的聚（苯基 - 乙烯烯）树突中型中高度有效的能量漏斗的不同机制的贡献，其建筑的设计尤其旨在使最初吸收的光子朝着空间上吸收的光子降低其表面，从而避免了环境，从而使最初吸收的光子朝着空间上的局部局限于环境，从而避免了环境。为此，通过使用非绝热激发态分子动力学来模拟非辐射光诱导的能量弛豫和重新分布。以这种方式，定义了先前由时间分辨光谱法报道的激子迁移的两个可能的直接和间接途径。我们的结果刺激了在基于分子的光子设备中应用的新合成树状聚合物的未来发展，在这些光子设备中，可以通过在不同分子内能传递途径之间的详细平衡之间的变化来预测光发射效率的增强。■简介
PDF 1.27 M-环境，生物多样性和土壤安全
ighen引入了水稻基因型以及两个局部品种的2020年和2021年的两个局部品种，在Sakha农业研究站的实验农场，Sakha，Sakha，Kafr El-Sheikh，埃及，谷物产量和相关的农艺学特征。方差分析显示，在评估的所有生长参数中，水稻基因型之间存在非常显着的差异。大多数研究的水稻基因型的谷物产量高于支票品种，AFR0280，AFR278-2-2和AFR278-8分别在两个季节下平均产量为14.26、14.03和14.00（T/HA）。基因型方差大于环境方差。表型变异系数（PCV）接近基因型系数变异（GCV），这表明遗传因子对所研究特征表达的影响。对所有研究字符观察到的高宽义遗传力（> 85％），这表明这些特征是通过加性基因作用遗传的，并且可以通过直接选择来增强。谷物的产量与植物高度，叶（长度和宽度），叶片面积，圆锥花序长，初级分支，圆锥花序，每个圆锥花序的尖峰和每个圆锥花序填充的晶粒。根据簇分析获得的树状图将二十种水稻基因型根据产量及其成分性状分为四个簇。因此，建议这些字符可以用作在水稻育种程序中选择理想基因型的表型标记。