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斑马鱼胚胎的先天免疫信号
由于先天免疫与适应性反应明显分离，因此，外部发育的斑马鱼胚胎代表了一种有用的体内模型，用于识别对细菌感染反应的先天宿主决定因素。在这里，我们对胚胎先天性免疫反应对感染的胚胎免疫反应进行了时间课程的转录组分析研究和基因本体分析，并用两种模型沙门氏菌菌株引起致命感染或衰减反应。对感染的转化反应以及无毒的LPS O-抗原突变菌株均显示出明显的保守性，并在其他脊椎动物模型和人类细胞中检测到的宿主反应，包括编码细胞表面受体的诱导，信号中间体，转录因子和炎症介体的诱导。此外，我们的研究导致鉴定了一系列新型免疫反应基因和感染标志物，其未来功能特征将支持脊椎动物基因组注释。从时间序列和细菌菌株比较中，包括MMP9在内的基质金属蛋白酶基因是最一致的感染反应性基因之一。纯化的沙门氏菌鞭毛蛋白也强烈诱导MMP9表达。使用敲低分析，我们表明该基因是鞭毛蛋白受体TLR5和衔接子MyD88的斑马鱼同系物的下游。此外，鞭毛蛋白介导的其他发病标志物（包括IL1B，IL8和CXCL-C1C）的诱导降低了TLR5敲低时降低，以及假定的负TLR途径调节剂IRAK3的表达。最后，我们表明IL1b，MMP9和IRAK3的诱导需要MyD88依赖性信号传导，而在沙门氏菌感染期间，IFN1和IL8诱导了MyD88独立的诱导。
碳 - 序列化 - 在 - 曼格罗夫 - 芬鱼和 - ...
栖息地结构：红树林的根提供了复杂的结构，为包括鳍鱼在内的各种海洋生物提供了避难和繁殖地。这种栖息地的复杂性增强了生物多样性，并有助于生态系统的整体健康。基于碎屑的食物网络：红树林生态系统基于碎屑，这意味着它们依赖于有机物（碎屑）的营养循环中的分解。鳍鱼通过其喂养活动有助于有机物的细分，释放了可以在沉积物中隔离的碳。蓝色碳：红树林通常被称为“蓝色碳”生态系统，因为它们具有隔离和存储大量碳的能力。红树林鳍鱼通过参与食物网和营养循环过程，间接影响碳动态，从而为此做出了贡献。
缺乏 Sry 的 Amami 棘鼠的哺乳动物性染色体的周转是由于雄性特异性的 Sox9 上调
哺乳动物的性染色体是高度保守的，性别由 Y 染色体上的 SRY 决定。两种特殊的啮齿动物群（其中一些物种缺少 Y 染色体和 Sry）为我们了解新的性基因如何产生并取代 Sry ，从而导致性染色体周转提供了见解。然而，30 多年的深入研究未能揭示这两个谱系中新的性基因的身份。我们在此报告在奄美刺鼠 Tokudaia osim- ensis 中发现了雄性特异性的 Sox9 增强子重复，这种大鼠的雄性和雌性都只有一条 X 染色体（XO/XO），而 Y 染色体和 Sry 完全丢失。我们进行了全面的调查以检测刺鼠中性别特异性的基因组区域。性别相关的基因组差异仅限于雄性特异性的 17 kb 单位重复，该重复位于常染色体上 Sox9 上游 430 kb 处。使用雄性刺鼠细胞进行的 Hi-C 分析表明，重复区域具有与 Sox9 的潜在染色质相互作用。重复单元含有一个与小鼠增强子 14 (Enh14) 同源的 1,262 bp 元件，Enh14 是一种候选 Sox9 增强子，在小鼠中功能冗余。转基因报告小鼠表明，刺鼠 Enh14 可作为小鼠胚胎睾丸增强子发挥作用。用重复的刺鼠 Enh14 替换 Enh14 的 XX 小鼠的胚胎生殖腺显示 Sox9 表达增加，Foxl2 表达减少。我们提出，这种 Sox9 增强子的雄性特异性重复取代了 Sry 功能，从而定义了刺鼠中的一种新型 Y 染色体。
CRISPR/Cas9 介导的胰岛素样肽编码基因突变对脊尾白虾生长的影响
胰岛素样肽（ILP）在脊椎动物的生长、代谢和繁殖中起着关键作用。在甲壳类动物中，一种类型的 ILP，胰岛素样雄激素腺激素（IAG）据报道与性别分化有关。然而，其他类型 ILP 的功能很少报道。在这里，我们在脊尾白虾（EcILP）中鉴定了另一种类型的 ILP，它是果蝇 ILP7 的直系同源物。序列表征和表达分析表明，EcILP 的异二聚体结构和表达谱与脊椎动物的胰岛素/IGF 和昆虫 ILP 相似。利用 CRISPR/Cas9 基因组编辑技术，我们生成了 EcILP 敲除（KO）对虾。EcILP -KO 个体的生长抑制性状和死亡率明显高于正常组。此外，通过RNA干扰（RNAi）敲低EcILP导致生长速度减慢，死亡率增加。这些结果表明EcILP是脊尾棘鱼重要的生长调节剂。
了解微生物生态学和免疫反应
棘阿米巴是一种普遍存在的真核微生物，在捕食过程中识别和吞噬各种微生物方面发挥着关键作用，为微生物动力学和免疫反应提供了见解。一个有趣的观察是，棘阿米巴似乎更喜欢革兰氏阴性菌而不是革兰氏阳性菌，这表明对细菌猎物的识别和反应机制可能存在差异。在这里，我们全面回顾了影响棘阿米巴与细菌相互作用的模式识别受体 (PRR) 和微生物相关分子模式 (MAMP)。我们分析了这些相互作用背后的分子机制，本综述的主要发现是棘阿米巴对装饰有碳水化合物的细菌细胞表面附属物表现出亲和力。值得注意的是，这与温血免疫细胞相似，强调了微生物识别中保守的进化策略。本综述旨在为探索 PRR 和 MAMP 奠定基础。这些见解增强了我们对微生物相互作用的生态和进化动态的理解，并阐明了控制免疫反应的基本原理。利用棘阿米巴作为模型生物，在生态相互作用和免疫学之间架起了一座桥梁，为未来的研究提供了宝贵的视角。
DNA metabarcoding在极夜间揭示了北极两亲植物的多样性，杂食饮食，果冻鱼和鱼作为主要猎物
简介：目前，北极海洋生态系统正在目睹全球最快的身体变化，导致全球和底栖群落和食品网络结构发生转变，这与引入北方物种有关。凝胶状浮游生物或果冻鱼代表了一个特定的一组，其中几种北方物种容易经历显着的极点范围的扩张，并且在持续变化的过程中，北极的种群增加。从历史上看，果冻被认为是一种营养的死胡同，但是使用现代工具的越来越多的研究强调了它们作为海洋食品网中主要猎物的作用。在这项研究中，我们旨在验证果冻和其他后生动物作为北极夜间食品网络中的食物来源的作用，而骨髓资源有限。
NPC 和斑马鱼中方法和工具的开发...
识别导致神经遗传疾病的 DNA 变异的主要瓶颈是 VUS 的功能分析。本研究的目的是通过在 NPC 和斑马鱼中使用 CRISPR/Cas9 基因组编辑来开发一种方法，以对在巨脑回患者中观察到的候选致病变异进行建模。通过 aCGH 和 WES 分析了 20 名巨脑回/无脑回患者的 DNA，并确定了变异的优先级。通过使用 CRISPR/Cas9 基因组编辑在 NPC 和斑马鱼中生成突变系，并与已知在巨脑回/无脑回中发挥作用的三个关键基因（TUBG1、LIS1、DAB1）之一的模型进行了比较。使用 3D 基质胶腔系统 (ICChip) 对 NPC 进行表征，并在 3 dpf 和 5 dpf 时观察到发育中的斑马鱼的表型变化。使用 qPCR 对目标突变系和选定的变体系进行了比较。与对照组相比，在 3 个选定基因的突变 NPC 系中观察到迁移延迟。WES 确定了两个候选变体，CGREF1 和 NOL9。观察到 CGREF1KO 斑马鱼和 CGREF1KONPC 中无脑畸形和小头畸形相关基因和神经元分化基因的表达变化。在 Tubg1 突变斑马鱼中观察到严重的表型，包括小头和小眼，以及肝脏/肠道发育异常。我们的研究结果证明，使用 NPC 和斑马鱼模型可以以省时省钱的方式测试导致与 NPC 迁移相关的缺陷的变异。多组学分析可以进一步将这种方法的使用范围扩展到其他神经遗传缺陷组。该项目由 TUBITAKCOST Action 资助，代码号为 217S944。
whatcom县鱼通道修复，投资组合...
项目背景水资源库存区域1（WRIA 1）是10种无肿的鱼类的所在地，其中包括三只根据《联邦濒危物种法》列为“威胁”的。在WRIA 1中，该县维持一个道路网络，其中包括约974英里，163个桥梁和2500多个涵洞，约有195个涵洞阻止了历史性的无肿块鲑鱼栖息地。该项目包括整个Whatcom县的11个鱼类障碍涵洞的评估和初步设计（图1，表1）。该合同涵盖了可行性和替代性分析，以在11个屏障站点中的每个障碍物中开发首选的交叉替代方案，以通过30％的设计进行。30％的设计将有助于追求该县的进一步融资工作。所有项目地点均位于华盛顿州西北部Whatcom县的非法人区域。预计，这些涵洞中的六（6）个将在第一年进行评估，第二年将进行五（5）个评估。位点在下图中用恒星识别。Whatcom县通过FFY2022国家涵洞删除，替代和修复资助计划（涵盖水生生物有机体通道（AOP）计划）授予了880,000美元的联邦资金。该项目由本地和联邦资金的组合提供资金。
基因工程斑马鱼作为骨骼发育和再生的模型
斑马鱼 (Danio rerio) 是水生脊椎动物，与陆地同类有显著的同源性。虽然斑马鱼在发育和再生生物学方面有着数百年的历史，但随着现代遗传学的出现，它们的实用性呈指数级增长。这在专注于骨骼发育和修复的研究中得到了体现。本文描述了斑马鱼对我们理解软骨、骨骼、肌腱/韧带和其他骨骼组织基础科学的众多贡献，特别关注其在发育和再生中的应用。我们总结了使斑马鱼成为理解骨骼生物学的有力模型的遗传优势。我们还重点介绍了可用于了解斑马鱼骨骼发育和修复的大量现有工具和技术，并介绍了有助于骨骼生物学新发现的新兴方法。最后，我们回顾了斑马鱼对我们理解再生的独特贡献，并强调了不同损伤情况下的不同修复途径。我们得出结论，斑马鱼将继续在骨骼生物学基本细胞机制研究中占据越来越广和越来越深的市场。
约有 30 万包鱼产品在 Shwe 流通...
仰光省 Hline 镇的 Shwe Padauk 鱼市估计，海水和淡水渔业产品的日均销售量为 30 万 viss（1 vis 等于 1.6 公斤）。随着国际原油价格上涨，国内市场燃料油价格也看涨。仰光作为商业中心，贸易往来十分频繁。海水渔业产品主要来自伊洛瓦底省、若开邦、孟邦、德林达依省和沿海地区，通过车辆和船只供应给 Sanpya 和 Shwe Padauk 鱼市。此外，来自伊洛瓦底省、勃固省和仰光省的淡水鱼和虾也每天都涌入市场。每天有南亚鲮、印度鲮、鲥鱼、鳙鱼、大白鲮、鲈鱼、须鲮、鲶鱼、罗非鱼、斑鲶、黑鱼、对虾、虾等20多万包淡水水产品和1.4万包海鲜进入市场，每天水产品流通量约30万包。