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World File Search System毒力
毒力表型是由病原体倍性和遗传背景相互作用产生的
图 1 白色念珠菌遗传背景对健康宿主适应性有不同的影响。 （a）未感染（仅暴露于大肠杆菌食物源，灰色）或感染不同白色念珠菌菌株（图例中所示）的健康野生型线虫宿主种群的生存曲线。误差线表示±SE。每个处理中分析的宿主数量（n）如表 S1 所示。使用生存曲线的成对比较和 Log-rank（Mantel-Cox）检验来检验统计学显着性。星号表示与未感染对照相比具有统计学显着性（* 表示 p < .05；**** 表示 p < .0001）。具有相同字母的白色念珠菌处理没有显著差异，而具有不同字母的处理在统计学上存在差异。 (b) 宿主谱系生长的箱线图，以 7 天内产生的单个创始宿主的 F1 和 F2 后代的总种群大小表示。方框表示 25 到 75 分位数，平均值表示为一条线。误差线是标准化的数据范围，圆圈表示异常值。未感染对照处理的平均值和 95% 置信区间分别用灰色虚线和阴影灰色方框表示。使用单因素方差分析检验统计显著性。星号表示与未感染对照相比的统计差异（* 表示 p < .05；*** 表示 p < .001）。事后 Dunn 多重比较检验表明，字母相同的白色念珠菌处理没有显著差异，而字母不同的处理有统计学差异。 （c）感染白色念珠菌的宿主成年期第 1-3 天（正常繁殖时间）产生的（d）宿主幼虫总数和宿主幼虫百分比。数据和统计分析与（b）相同。（e）二倍体（dip）和四倍体（tet）白色念珠菌菌株在第 7 天的宿主存活率（彩色符号表示特定的白色念珠菌遗传背景）。使用 Wilcoxon 配对符号秩检验检验统计学意义，并标明 p 值。（f）感染白色念珠菌二倍体和四倍体菌株的宿主的谱系生长、（g）幼虫数量和（h）繁殖时间。数据和统计分析与（e）相同
通过泛基因组学揭示人类真菌病原体的基因组多样性和毒力
AU：请确认所有标题级别均正确显示：真菌在所有主要生物群系中普遍存在，它们在其中发挥有益作用，但它们也可以感染植物、昆虫和动物。值得注意的是，只有一小部分真菌会导致人类感染致命的感染。随着现代医学的进步，面临真菌感染风险的患者数量增加，人类致病真菌对人类的威胁越来越大。这些感染相关的死亡率通常很高，主要是由于治疗方法有限和抗真菌耐药性增加。真菌病原体与大多数微生物一样，表现出广泛的遗传多样性，并且在同一物种的菌株之间表现出相应的广泛表型差异，包括不同程度的毒力。这些差异对真菌病原体毒力的累积影响仍不太清楚。然而，更好地了解导致毒力差异的基因组差异最终可能会改善人类真菌感染的管理。
白垩式介导的呼吸道氧化酶柔韧性控制M.结核病毒力
结果79 80 Chalkophore缺乏结核分枝杆菌上调81对铜剥夺的响应中的呼吸链成分82 83以了解结核分枝杆菌中二甲依替替替替特里利的功能，我们检查了84
蚊子中的疟原虫毒力及其对GMM疟疾控制程序的引入和功效的影响
对疟疾控制的遗传修饰蚊（GM）方法的生态可行性的怀疑态度得到了支持。然而，考虑到不感染的可能的适应性优势也需要评估转基因蚊子的净适应性时，将其引入自然种群中。因此，了解Ma-raLia寄生虫是否对其向量有毒，如果是的，那么对于预测GM方法的成功而言，直接相关。在这里，我们总结了疟疾寄生虫对其蚊子的所有已知的破坏作用，并讨论了它们对自然界中疟疾 - 难治基因的引入的影响。除了div>我们审查了转基因产生醒目的作用方式，并推测疟原虫对这种杀戮机制的进化反应。最后，讨论了当前候选GM表型，BORH对蚊子和Hurnans的毒力意义。
一种高效敲除肺炎克雷伯菌毒力质粒基因的方法
Chang 等，2012；Fazili 等，2016；Rossi 等，2018）。研究表明，赋予 hvKp 高毒力表型的最典型的毒力因子由位于毒力质粒上的基因编码，其中包括 iuc/iro（铁载体 aerobactin/salmochelin 的生物合成基因）、rmpA/rmpA2（增加荚膜产量的调节剂）和 peg-344（功能未知的代谢转运蛋白）（Russo and Marr，2019）。因此，大型毒力质粒上毒力基因的丢失将显著降低 hvKp 的毒力。尽管对hvKp毒力机制的研究已经取得了很大进展，但仍有许多问题尚未揭示：例如，毒力基因之间如何相互作用，它们如何调控hvKp的高毒力表型，以及毒力因子如何与宿主免疫系统相互作用。针对hvKp毒力质粒的有效基因编辑方法对于理解这些未知机制至关重要。目前，对hvKp毒力质粒进行基因敲除的报道很少，主要依赖于随机转座子插入和自杀质粒介导的同源重组（Cheng等，2010；
用于检测细胞内病原体毒力基因的多重 CRISPR 干扰工具
在没有靶标切割的情况下，催化失活的 dCas9 通过在空间上阻止 CRISPR (cr)RNA 指向的给定基因上的 RNA 聚合酶活性来施加转录基因抑制。这种基因沉默技术称为 CRISPR 干扰 (CRISPRi)，已用于各种细菌物种以检测基因，主要是单独或成对检测。在这里，我们在病原体 Legionella pneumophila 中开发了一个多路复用 CRISPRi 平台，能够同时沉默多达十个基因。通过将强进行性启动子与重复/间隔序列上游的 boxA 元素相结合，克服了 Rho 依赖性转录终止对前体 crRNA 表达的限制。使用针对毒力蛋白编码基因的 crRNA，我们证明 CRISPRi 不仅在无菌培养基中生长期间完全发挥作用，而且在巨噬细胞感染期间也完全发挥作用，并且 CRISPRi 的基因耗竭完全重现了缺失菌株的生长缺陷。重要的是，通过改变重复/间隔序列中 crRNA 编码间隔序列的位置，我们的平台实现了目标的逐渐消耗，这反映在表型的严重性上。因此，多重 CRISPRi 有望用于大量探测大量基因，以破译 L. pneumophila 和其他细菌病原体的毒力策略。
保守的开关控制艰难梭菌中的毒力，孢子形成和运动
孢子形成是人类肠病毒梭菌艰难梭菌的环境存活和传播所必需的。在所有细菌孢子的形成器中，通过激活主反应调节剂SPO0A来调节孢子形成。但是，直接调节c的因素和机制。艰难梭菌SPO0A活性未定义。在研究良好的芽孢杆菌物种中，Spo0a被Spo0e（一种小磷酸酶）直接灭活。了解c中的spo0e函数。艰难梭菌，我们创建了SPO0E直系同源物的无效突变，并评估了孢子形成和生理学。SPO0E突变体产生了更多的孢子，表明Spo0e抑制c。艰难梭菌的孢子形成。出乎意料的是，SPO0E突变体也表现出增加的运动性和毒素产生，并增强动物感染的毒力。我们发现SPO0E与SPO0A以及毒素和运动调节剂RSTA相互作用。SPO0A，SPO0E和RSTA之间的直接相互作用构成了以前未知的分子开关，该开关将孢子形成与运动性和毒素产生。在b中对Spo0e功能进行了重新研究。枯草液显示，SPO0E诱导运动性，证明SPO0E调节了发散特征之间的运动性和孢子形成。此外，SPO0E的3D结构分析揭示了c0e和结合伙伴之间的特定和独家相互作用。艰难梭菌和b。枯草厂可深入了解不同物种之间这种调节机制的保护。
抗菌素抗性和毒力特征的出现在肠球菌物种中脱离了牛奶
1坎皮纳斯大学食品工程学院食品科学与营养系，坎皮纳斯大学13083-862，SP，巴西； beatriz.paschoalini@unesp.br（B.R.P.）; karen_vmn@hotmail.com（k.v.m.n。）; julianatakahashimaffei@gmail.com（J.T.M.）2动物生产和预防兽医学系，兽医学院，动物科学学院，萨克州立大学，巴西SP，SP，BOTUCATU，BOTUCATU，18618-681； helio.langoni@unesp.br（H.L.）; felipefreitasguimaraes@hotmail.com（F.F.G。）3兽医医学与动物科学学院，哥伊联邦大学，校园路，GOI-NIA 74690-900，巴西GO； claricegebara@ufg.br（C.G。）; natyllane@hotmail.com（N.E.F.）4兽医医学与动物科学学院动物营养与生产系，萨尔·保罗大学（USP），pirassununga 13635-900，SP，巴西； mveiga@usp.br（M.V.D.S.）; filis1999@hotmail.com（c.e.f.）5农业科学中心，圣卡塔琳娜州大学，巴西SC 88520-000； roberto_kappes2.8@hotmail.com 6坎普纳·格兰德（Campina Grande）联邦坎皮纳·格兰德（Campina Grande）的农业食品科学技术中心，巴西PB 58840-000； mnygoncalves@gmail.com *通信：ncirone@unicamp.br;电话。： +55-19-3251-4012
CRIPSR 案例系统：细菌毒力、基因组编辑和抗菌素耐药性中的生物学作用
摘要 | 本综述旨在研究 CRISPR Cas 系统及其在基因组编辑、细菌毒力和抗生素耐药性中的作用。CRISPR Cas 系统是原核生物（细菌和古细菌）免疫系统的一个组成部分，可提供针对病毒感染的保护。当细菌识别其内部的病毒 DNA 时，细菌会将病毒 DNA 的小片段整合到其基因组中称为 CRISPR 基因座的特定位点。在 CRISPR 基因座插入病毒 DNA 可以通过序列特异性适应性免疫机制记住、诊断和清除病毒感染。CRISPR Cas 系统可持续对抗病毒基因组中发生的突变，帮助病毒逃脱基于细菌 CRISPR Cas 的免疫系统。CRISPR Cas 系统是原核微生物的分子机制。它作为细菌对抗噬菌体、质粒和外来基因组元素的天然适应性免疫系统。大多数原核生物使用其 CRIPR Cas 系统来增强其细胞膜的完整性，从而抑制抗菌剂从宿主体渗透到细菌细胞。 CRISPR Cas 系统还可以通过抑制细菌免疫受体（例如 TLR）的活性来帮助细菌逃避宿主免疫系统。CRISPR Cas 系统还可以帮助细菌附着在宿主体内并在宿主体内复制。它可以使致病细菌产生抗生素耐药性，增强其致病性并能在宿主体内存活。
探索氨基酸和肽转运蛋白作为葡萄球菌中毒力和抗生素耐药性的治疗靶标
氨基酸对于维持细胞完整性和代谢稳态至关重要。除了蛋白质合成之外，氨基酸也是核苷酸，脂质和细胞壁成分生物合成的前体。s。金黄色葡萄球菌可以合成许多此类氨基酸，但通常会从外部环境中转移到细胞中[2]。有限的葡萄糖可用性（例如，脓肿中）代表了一个环境，其中肽或氨基酸的分解代谢对金黄色葡萄球菌的生长很重要[3]。生物启动分析揭示了启用s的几种途径。金黄色葡萄球菌可分解多种氨基酸，进而可以生成关键的中央代谢中间体，例如丙酮酸，草乙酸和2-氧化甲酸酯。反映了氨基酸在代谢中的重要性，s。金黄色葡萄球菌具有多种寡肽磁盘，游离氨基酸转运蛋白和蛋白酶以降解宿主蛋白。分析64 s。金黄色葡萄球菌菌株表明，氨基酸代谢基因与pangenome分别相关[4]，表明靶向与核心氨基酸代谢相关的转运蛋白可能具有针对多样化S的更广泛的治疗潜力。金黄色葡萄球菌分离。氨基酸，肽，渗透剂和核苷摄取系统的多样性和冗余也带来了重大挑战。在USA300_FPR3757基因组中至少有292个基因，预计将编码膜转运蛋白，其中120个似乎与氨基酸，渗透剂或核苷转运有关。从历史上看，细菌膜转运的研究生物信息学工具通常有助于识别和预测固定转运蛋白的功能，但是需要实验性工作来验证按测量值运输的底物及其生理角色。