腺苷到肌苷 (A-to-I) 编辑是一种保守的真核 RNA 修饰,有助于发育、免疫反应和整体细胞功能。RNA 编辑模式在不同细胞和组织类型之间可能存在显著差异,而过度活跃的 A-to-I 特征则表明存在多种疾病,包括癌症和自身免疫性疾病。由于这些差异具有生物学和临床重要性,因此迫切需要有效的方法来测量细胞 RNA 中的整体 A-to-I 编辑水平。当前的标准方法依赖于 RNA-seq 来间接检测编辑位点,这需要大量时间和材料投入以及大量的计算分析。在这里,我们利用核酸内切酶 V (EndoV)(它特异性地与 RNA 中的肌苷结合)来开发基于蛋白质的化学发光生物测定法,以直接分析 A-to-I RNA 编辑活性。我们之前展示了 EndoV 可以在 RNA 测序之前结合并丰富 A-to-I 编辑的转录本,现在我们利用这一活性构建 EndoV 连接免疫吸附测定 (EndoVLISA),作为一种快速的、基于板的化学发光方法,用于测量细胞 RNA 中的全局 A-to-I 编辑特征。我们首先使用化学合成的寡核苷酸优化和验证我们的测定方法,说明对 RNA 中的肌苷具有高度选择性和灵敏度的检测。然后,我们展示了对处理过的细胞系中肌苷含量的快速检测,证明了与当前标准 RNA 测序方法相当的性能。最后,我们部署了 EndoVLISA 来分析正常和患病人体组织中的差异 A-to-I RNA 编辑特征,说明了我们的平台作为诊断生物测定的实用性。总之,EndoVLISA 方法经济高效、简单易用,并且使用常见的实验室设备,为研究 A-to-I 编辑提供了一种高度可用的新方法。此外,多孔板格式使其成为第一个适用于直接高通量量化 A-to-I 编辑的检测方法,可用于疾病检测和药物开发。
Fanny Leenhardt,Matthieu Gracia,Catherine Perrin,Claudia Muracciole-Bich,BénédicteMarion等。液相色谱 - 潮流质谱测定法,用于在药物相互作用的临床背景下人类血浆中CDK4/6抑制剂定量。药物和生物医学分析杂志,2020,188,pp.113438。10.1016/j.jpba.2020.113438。HAL-03003807V2
背景:炎症性肠病(IBD)是一种影响肠道的持续性,非特异性炎症。牛皮癣是皮肤的长期炎症性疾病。IBD和牛皮癣之间存在合并症的相关性,但是合并症的特定发病机理尚不清楚。材料和方法:在这项研究中,我们分析了来自基因表达综合(GEO)数据库的数据集,并通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定了IBD和牛皮癣的共享基因。然后,应用三种机器学习算法来识别共享的诊断基因。接下来,用ROC曲线评估了共享诊断基因的验证,并确定了AUC。随后,进行了单个样品基因集富集分析(SSGSEA)和免疫浸润分析。此外,我们在药物签名数据库(DSIGDB)中获得了潜在的药物,例如Coremine数据库中的7种传统中药,这可能会对IBD和牛皮癣的合并症具有治疗作用。最后,我们通过RT-PCR,Western印迹和免疫组织化学(IHC)方法证实了结肠炎和牛皮癣小鼠组织中共有诊断基因的表达。结果:结果表明,AQP9的两种疾病具有最高的诊断值。AQP9的AUC值为UC的AUC值为93.681%,CD的AUC值为89.629%,在内部验证数据集中,牛皮癣的AUC值为78.689%。在外部验证数据集中,AQP9的AUC值为UC的AUC值为90.394%,CD的AUC值为93.909%,牛皮癣的AUC值为90.909%,为82.906%。免疫浸润分析和SSGSEA表明,AQP9可能通过参与NF-kappab信号通路并调节免疫细胞分化来影响IBD和牛皮癣的疾病过程。此外,与对照组相比,AQP9的表达水平始终验证,在IBD中显示上调和牛皮癣下调。结论:这项研究揭示了IBD和牛皮癣合并症的共享诊断基因和潜在机制,为探索合并症机制和治疗目标的未来研究提供了新的方向。
建议引用推荐引用kay,亚历山大; Vasiliu,ANCA;卢西亚的Carratala-Castro; Mtafya,Bariki;门德斯·雷耶斯(Mendez Reyes),何塞·尤伯托(Jose Euberto); Maphalala,Nontobeko;穆加姆,希尔西亚; Mulengwa,Durbbin;尼斯,塔拉;贝伦的萨维德拉;巴查,杰森; Maphalala,Gugu; Mejia,Rojelio; Mtetwa,Godwin; Acacio,Sozinho; Manjate,Patricia; Mambuque,Edson; Nosisa的志Ba;诺克万达哥达; Ziyane,Mangaliso; Ntinginya,Nyanda Elias;兰格,克里斯托夫;基尔奇纳(H Lester); Dinardo,Andrew R; Garcia-Basteiro,Alberto L;曼达拉卡斯,安娜·玛丽亚;和Stool4TB全球合作伙伴关系,“基于粪便的定量PCR测定法对青少年和成人的结核病诊断:一项跨国,前瞻性诊断准确性研究”(2024)。教职员工出版物。1687。https://digitalcommons.library.tmc.edu/baylor_docs/1687
除了调节5-羟色胺转运外,选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRIS)还具有其他多种可能导致临床作用的机制,而后来的某些动作促使SSRIS促进了非精神病学指征的SSRIS。在最近对SSRIS氟紫氧胺,氟西汀和舍曲林的研究中,我们发现,与其他两个SSRI不同,舍曲林与SIGMA 1受体的逆激动剂(S1RS)急性浓度下的其他两个SSRIS急性抑制LTP。在当前的研究中,我们追求了大鼠海马切片中LTP调节的机制。我们发现,舍曲林部分抑制了由N-甲基-D-天冬氨酸受体(NMDARS)介导的突触反应,通过对含有Glun2b亚基的NMDAR的影响。选择性S1R拮抗剂(NE-100),而不是S1R激动剂(084年前)阻止对NMDAR的影响,即使以前证明了两个S1R配体可以防止LTP抑制。然而,NE-100和084年前,都阻止了舍曲林对单次试验学习的不利影响。由于S1RS在调节内质网应激中起着重要作用,我们检查了细胞应激的抑制剂是否改变了舍曲林的作用。我们发现,与内源性神经类固醇合成的抑制剂一样,两种应激抑制剂Isrib和槲皮素可以防止LTP抑制作用,它们是细胞胁迫的稳态调节剂。这些研究强调了舍曲林,S1R和神经固醇对海马功能的复杂作用,并且与理解治疗和不良药物作用具有相关性。
2.8 Relative Transcript Abundance measured by Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR): ................................................................................ 26
腐烂的传感器在加速我们对动物生态学的理解方面一直是关键的,提供了具有高级基本生态学理论和知情保护行动的多种数据(Snape等,2018; Nickel等,2021; Nickel等,2021; Vonbank et al。,2023; West et al。,2024)。起源于主要用于跟踪动物位置和运动的工具,动物损坏的传感器已经演变为涵盖能够监视动物环境,行为和内部状态的广泛设备(Wilmers等,2015)。动物磨损的加速度计 - 衡量运动平面加速变化的传感器 - 已用于估计各种研究系统和问题的能量支出,并推断动物行为(请参阅Halsey等人。(2011); Fehlmann et al.(2017)).通过在开阔海洋中发现大型上层鱼类产卵行为的检测到表征难以捉摸的陆地捕食者的狩猎和能量(Clarke等,2021; Wang等,2015),加速度计在生态学上已成为一个有价值的工具,并在生态学上已经大大扩展了跨越的生态范围,以前跨越了跨越的生态范围,并具有跨越的范围,并具有跨越的范围,并具有跨越的范围。 (Studd et al., 2021).加速度计捕获动物行为的实用性在于它们捕获与特定运动或与不同行为不同的特定运动或姿势相对应的不同波形模式的能力(Brown等,2013)。用于分类动物行为的机器学习模型包括来自古典机器学习分类器的多样性,例如支持向量机(Martiskainen然而,与其他传感器方式(例如GPS或温度传感器)提供的直接测量相反,加速度计数据的相对抽象的性质可以使波形的解释具有挑战性。因此,用加速度计数据识别行为通常需要将原始加速度计数据与已知行为配对,以创建标记的数据集,这些数据集可用于学习感兴趣的不同行为的特定波形模式(Brown等,2013)。由于可以收集的大量加速度计数据以及行为特征之间的微妙区别,手动检测到看不见的加速度计数据中的不同行为可能具有挑战性。为了克服这一问题,机器学习技术越来越被利用,以学习从标记的数据集中采取不同行为的加速度计模式(Chakravarty等,2019; Garde等,2021; Otsuka et al。,2024)。
此概况说明了我们的Go Greener计划中的产品包含。该程序标识了Qiagen投资组合中的产品,这些产品与我们的传统产品相比更加环保。与标准面板相比,QIASEQ靶向DNA Pro面板通过切割移液步骤减少塑料废物,从而减少了需要减少68%的移液器尖端。所需的试剂数量也较低,尤其是对于索引板,它已经从两个单独的板转变为一个具有独特双索引(UDIS)的单个板。面板的稳定性有所改善,从7个月的保质期提高到12个月。
准确的EV量化对于确保大规模细胞外囊泡(EV)制造过程中的质量,一致性和安全性至关重要。在上游阶段,EV定量允许监测影响EV产量和质量的细胞培养条件,而在下游阶段,它有助于控制EV纯化的效率和纯度。纳米颗粒跟踪分析是EV定量最常用的方法,而由于纳米化污染物(例如蛋白质聚集体)的干扰,它面临着显着的局限性,尤其是在粗制样品中(例如细胞培养基)。为了解决这个问题,我们开发了一种高度特定,准确的ELISA分析,即使在粗制样本中量化了电动汽车。使用超纯电EV标准样品,该测定法显示了EV检测的可靠定量结果,以支持方法开发以及对大规模EV制造的过程中的控制。该测定法的检测范围为4.1E7至3E10 EVS/mL,LOD为1.04E7 EVS/mL,LOQ为3.21E7 EVS/ML。因此,我们将此测定法开发为测试套件,并证明该EV定量ELISA试剂盒能够确保杂质的最小干扰并支持工艺发展和EV生产中的过程中的控制。
在两个空间维度中,准长范围超导的熔化是通过涡流 - 抗抗反应对的增殖和解开,这是一种被称为Berezinskii-Kosterlitz-kosterlitz-thoubles-thouble(bkt)的现象。尽管已经在大量测量中观察到了这种过渡的特征,但是这些实验通常是复杂的,模棱两可的,无法解决涡流解开过渡的丰富物理。在这里,我们表明局部噪声磁力测定法是一种灵敏的无创探针,可以提供有关比例依赖性涡流动力学的直接信息。尤其是通过解决磁噪声的距离和温度依赖性,可以实验研究涡流气体的重新归一化组流程,并跟踪原位涡旋的发作。特别是,我们预测(i)噪声对温度的非单调依赖性和(ii)局部噪声几乎与BKT转变处的样品 - 探针距离无关。我们还表明,噪声磁力测定法可以区分高斯超导订单参数的流量与拓扑涡流闪光,并可以检测到未结合的涡流的出现。BKT过渡时的弱距离依赖性也可以用来将其与准粒子背景噪声区分开。我们的预测可能在许多非常规超导体的实验范围内。