先前的研究已经讨论了Sanhe和荷斯坦奶牛之间的血清代谢与哺乳性表现之间的关联,发现这两种品种的代谢谱与平等不同。由于瘤胃是奶牛营养吸收和生产转化的中心器官,因此在相同饮食条件下观察到的差异是否与瘤胃微生物组的结构有关,尚不清楚。这项研究测量了四个奇偶族的Sanhe Cows(S1/S2/S3/S4)和Holstein Cows(H1/H2/H3/H4)的明显消化率和瘤胃发酵参数,并使用高通量测序技术产生了全面的瘤胃象征性型菌群数据集。在S组之间观察到干物质消化率(P = 0.001)和氨氮(P = 0.024)的显着差异,S1中各种VFA含量的趋势较高(0.05 H组在粗蛋白消化率上显示出显着差异(p = 0.001),H1中的较高的异价酸含量(p = 0.002)以及H3中最低的乙酸盐与丙酸丙酸酯与丙酸酯比(P = 0.002)。 元基因组测序结果表明瘤胃微生物组模式和代谢变化之间的一致性,S1与S2/S3/S4明显不同,H1和H2与H3和H4不同。 瘤胃微生物组的物种组成在Sanhe和Holstein Cow之间相似,但注意到丰度的差异。 根瘤菌<肾小球>,新甲基脂肪酸群和心摩肌在S1,H1和H2中更为丰富,并且在这些阶段中,自噬 - 触及植物 - 病原体相互作用和内吞作用等途径显着富集。H组在粗蛋白消化率上显示出显着差异(p = 0.001),H1中的较高的异价酸含量(p = 0.002)以及H3中最低的乙酸盐与丙酸丙酸酯与丙酸酯比(P = 0.002)。元基因组测序结果表明瘤胃微生物组模式和代谢变化之间的一致性,S1与S2/S3/S4明显不同,H1和H2与H3和H4不同。瘤胃微生物组的物种组成在Sanhe和Holstein Cow之间相似,但注意到丰度的差异。根瘤菌<肾小球>,新甲基脂肪酸群和心摩肌在S1,H1和H2中更为丰富,并且在这些阶段中,自噬 - 触及植物 - 病原体相互作用和内吞作用等途径显着富集。多方的Sanhe奶牛的ATP结合盒转运蛋白途径的丰度更高。此外,诸如GH84和GH37之类的Cazymes与差异性生理指标和牛奶性状显着相关。总而言之,这项研究揭示了Sanhe和不同奇偶群体的瘤瘤菌与代谢特征之间的复杂关系,这表明瘤胃微生物组的结构的变化可能是影响乳头奶牛泌乳性能和代谢差异的关键因素。
这项现场研究旨在调查西孟加拉邦大学(WBSU)校园内季节性变化,相对丰度和生物多样性,从2022年1月至1222年12月。使用“皮带传输”方法,进行了一项系统的调查,以记录整个四个季节在不同栖息地之间的odonate物种的存在和分布。总共已经记录了42种odonate物种,其中最多的物种是libellulidae(62%)的记录,其次是coenagrionidae(26%),platycnemididae(5%),Aeshnoidea(5%)和Gomphidae(2%),提供了良好的洞察力和多样性的洞察力。结果表明,odonate的丰度有明显的季节性模式,在季风后和季风季节中,物种组成和相对丰度的差异很大。这些发现强调了考虑季节性动态在理解Odonate人群及其对环境变化的反应中的重要性。这项研究有助于我们对大学环境中的Odonate生态的理解,并强调了持续监测和保护工作的重要性,以保护WBSU校园内存在的多样化的Odonate社区。这项研究所获得的见解对生物多样性保护和栖息地管理具有影响,强调大学校园的相关性是支持丰富的odonate多样性的有价值的生态壁ches。
摘要:控制了受冻土影响的湖泊中浮游动物的丰度和生物多样性的环境物理和化学因素是鲜为人知的,但它们确定了水生生态系统对正在进行的气候变化和水变暖的反应。在这里,我们评估了Bolshezemelskaya Tundra湖中浮游动物社区的当前状态(NE Europe的Permafrost Peatlands),并提供有关浮游动物的组成和结构的新信息。结果表明,浮游动物群落的结构受到湖泊形态特征和大植物湖泊过度增长程度的影响。根据浮游动物的定量发展水平,大多数苔原湖是贫营养类型的,平均湿生物量高达1 g/m 3。在小融化池塘的浮游动物群落中观察到的物种数量最多,其面积高达0.02 km 2,并且长满了大植物。对影响湖泊的形成的因素的分析表明,浮游动物的物种组成和定量特征是通过pH和水矿化控制的。与60年前收集的该地区湖泊的文献数据获得的结果比较表明,这些湖泊的生态系统处于稳定状态。总体而言,这些新见解将提高我们对控制浮游动力学的因素的知识,以独特但相当丰富的欧洲苔原的热力学湖泊,并受到持续的气候变暖。
抽象问题:线性栖息地是陆生和水生的走廊,可以是自然的或人为的。在这里我们问:两种类型的线性栖息地(道路和河流)的交集如何影响植物物种的多样性,成分和生态属性?地点:法国南部。方法:我们研究了道路河交叉点(桥梁),以测试路边和河滨植物群落中物种的组成,α和β多样性以及对桥梁影响的反应。我们还使用空间预测因子(空间特征向量图)来评估桥梁是否影响定向空间过程(上游向上河轴)结构社区组成。结果:我们表明,桥梁周围的植被与物种组成和生态偏好以及α和β多样性的植被不同于桥梁。我们还发现,桥梁河流和道路植物群落中物种的生态偏好融合。由于不同的干扰方案,桥梁的物种β多样性的周转成分较低,因此导致生物均匀化。然而,我们的结果表明,桥梁对影响物种组成的方向空间过程的影响可以忽略不计。结论:桥梁作为河流和道路的植物社区选择力的强烈影响表明,不应忽略桥梁。我们的发现将有助于开发对两种类型的线性栖息地的更有效管理,以保护其托管的植物物种以及相关的生态功能和所提供的生态系统服务。
人类肠道(肠道微生物组)中的微生物生态系统对我们的健康起着关键作用。肠道微生物组组成中的破坏与多种疾病有关,这些疾病不限于胃肠道疾病。实际上,通过微生物 - 脑轴轴(肠道微生物组和大脑之间的双向通信系统),驻留在我们肠道中的微生物也会影响心理健康和健康。宏基因组测序可深入了解物种组成及其功能潜力,但专用工具对于微生物组甲状脑轴系统的系统分析和解释至关重要。我们组装了人类肠道微生物神经活性的参考目录,这使我们能够对肠道微生物组与生活质量和抑郁质量之间的联系进行首次人口水平的研究(Valles-Colomer等,2019)。在这个项目中,候选人将1)扩大人类肠道微生物的神经活性的参考目录到最近描述的微生物元素衍生的化合物,这些化合物可以影响宿主健康(小组中的博士生合作),而2)在公共系统中进行了序列和神经系统疾病之间的关联研究,并在公共系统疾病之间进行了社会研究,并进行了新的序列研究。该项目将在Microbiome Research Group的Mireia Valles-Colomer教授的监督下进行,这是UPF(PRBB校园)的年轻而充满活力的团队。
从森林区域传输的空气中微生物可以通过形成冰核来影响云形成。然而,尚不清楚空气传播微生物在森林地区的垂直运输。在夏季,秋季和冬季,我们在三个高度上收集了三个高度的气溶胶,[地面(2 m),冠层顶部(20 m)和高于树冠(500 m)],以分析垂直分布在森林上的机载微生物群落。在夏季和秋季,微生物颗粒在森林区域(顶部和地面)保持相似的浓度,并降低到上面顶篷区域的微生物浓度的1/10。冬季的颗粒浓度表示有效的垂直混合在500 m以下。高通量DNA测序表明,空气中的微生物群落由与衰减植物垃圾降解相关的陆地和浮游物种组成。无论三个季节如何,上面的树冠都由门静脉细菌和富公司的耐大气应激细菌主导。与细菌不同,琼脂菌的蘑菇型真菌成员的相对丰度超过了冠层,主要是在整个夏季和冬季,而霉菌型真菌dothideymosycetes物种经常在秋天的所有三个高度上发现。从三个高度的空气样品中获得的镰刀菌,假单胞菌和芽孢杆菌分离物,表明水滴冷冻中的冰成核的高活性
<实用方法>肺(左上和下叶,右上和下叶),肾脏(左肾脏,右肾脏),肝脏和脾脏被从溺水的身体中取出。将每个器官切成30 mg,将其浸入100 L提取物SYBRGREEN提取物N-Amp™Plant PCR试剂盒(美国Sigma-Aldrich)中,并在95°C孵育10分钟。之后,使用浸泡解决方案作为模板进行实时PPCR。实时PCR的反应混合物(总量为20·L)如下:模板4·L,Sybrgreenextract- n-amppcrReadyMix 10·L,底漆(前向,反向)2·l,引用1·L,rnaseednasefree Water 1·L 1·L。当前生产的引物是Nitzschia 18 S RRNA,Fragilariaα-微管蛋白,Navicula IBP,Naviculaβ-肌动蛋白,Fragilariaβ-微管蛋白,RBCL和23 S rRNA,靶向生活在许多海洋和河流中的植物Planchon。在上述底漆被证明是有用的之后,我们计划为针对海洋和河流(例如海水Chaetoceros)的浮游植物物种准备底漆,并试图估计溺水位置。这使得可以在一定程度上恢复在溺水中发现的浮游植物的物种组成。作为对照,从发现溺水物体的位置收集水,并检查放大效率是否有差异。最后,我们认为,通过创建一个麦克风阵列,其中排列了多个植物浮游生物的DNA部分序列,我们可以以高精度恢复浮游生物物种。
微生物群落,例如居住在人类肠道中的群落高度多样而复杂,许多人对健康和疾病具有重要意义。这些微生物群落的效果和功能不仅取决于其物种组成和多样性,而且还取决于转录水平的动态细胞内和细胞间状态。因此,完全需要能够获取单微粒分辨率的RNA测序信息,以便完全需要对复杂的微生物群落以及其宿主进行全面了解。在这里,我们报告了能够鉴定人类样品中的大物种品种的基于液滴的SmRNA-Seq(单微粒RNA测序)的发展和利用,我们将其命名为Smrandom-Seq2。与三个人类肠道样品中的Smrandom-seq2一起设计为细菌和噬菌体测序数据的三型调制计算管道,我们建立了人类肠道肠道微生物组的单细菌转录景观,其中包括29,742个单微生物和329个独特的物种。发现了Prevotella and Roseburia属中物种之间的不同自适应反应,以及在phascalcoltctcoltctobacterium accinatium succinatutens中的内在适应性策略异质性。此外,我们确定了人类肠道微生物组中数百种新型的宿主 - 含量转录活性关联。我们的结果表明Smrandom-Seq2是一种高通量和高分辨率的SMRNA-SEQ技术,在现实词的情况下非常适应复杂的微生物群落,并希望在理解人类微生物组中有新的观点。
背景肺癌是全球癌症死亡的主要原因[1]。非小细胞肺癌(NSCLC)约占肺癌的85%[2]。目前,NSCLC的主要治疗方法是化疗、手术、放疗和靶向治疗[3],但五年生存率低至18%,且可能导致严重的副作用和耐药性[4,5]。因此,迫切需要开发治疗非小细胞肺癌的有效药物。地球总物种的25%由海洋物种组成。这些化合物中的许多具有特殊的生物活性和化学结构,可作为许多疾病的潜在药物[6,7]。这些海洋植物提取物大多已被证实具有抗癌[8,9]、抗炎[10,11]、抗病毒[12,13]等作用。从海洋植物提取物中提取的海洋药物受到越来越多的关注。褐藻是海洋中的一种大型藻类。岩藻固醇是褐藻乙醇提取物中的一种藻类植物固醇,已被证实具有多种生物活性,包括抗氧化[14-16]、抗炎[17-19]、抗癌[20]、抗菌[21]、抗抑郁[22]等。先前的研究报道了岩藻固醇在抗宫颈癌[20]、抗白血病[23]、抗结直肠癌[24]等方面的作用,但关于岩藻固醇治疗非小细胞肺癌的机制研究很少,其潜在的治疗靶点和相关途径尚未详细报道。
对乡村森林储量物种的物种组成及其驱动因素的抽象理解,可以为有效的恢复策略和Miombo Woodlands的可持续森林管理提供足够的发展。这项研究评估了人类干扰以及环境变量对木本植物物种组成的影响,使用24平方图在最近宣布的坦桑尼亚东部Adromontane生物多样性热点的最近被宣布的乡村森林储备中的24平方图。排序分析技术使用规范对应分析来识别重要的植被梯度和解释木本植物物种组成的空间变化的重要因素。结果表明,记录了779种单独的木质植物,其中379个是幼苗(48.6%),102个树苗(13.1%)和298名成年人(38.3%)。最主要的三种植物物种是Brachystegia spiciformis(42.2%),弗希尔赫斯(Diverhynchus)condyocarpon(9%)和B. boehmii(8.7%),而最少的是Multidentia crassa和diospyros squrosa,每个物种的总丰度低于1%。翼龙Angolensis,但只有很少的个体。冠层覆盖物和土壤pH是解释木本植物物种组成的空间变化的两个最重要的变量。这些结果强调,乡村森林对于保存本地和受威胁的树种很重要,改善的管理应阻止所有改变冠层和土壤ph自然条件的实践,以保护其余的乡村森林,生物多样性和农村生计。关键字:Miombo;人类干扰;环境变量;冠层盖;物种