预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年1月28日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.24.632989 doi:Biorxiv Preprint
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。永久性。预印本(未经同行评审的认证)是作者/资助者,他已授予Medrxiv的许可证,以在2025年2月22日发布的此版本中显示在版权所有者中。 https://doi.org/10.1101/2025.02.19.25322523 doi:medrxiv preprint
牙菌菌生物膜内链球菌与白色链球菌之间的生态相互作用是驱动龋齿发病机理的重要因素。这项研究旨在调查s。mutans c。白色疾病的生长和通过细胞外膜囊泡(EMV)和泛素化调节(一种关键蛋白转化后修饰)的调节。我们建立了一个Transwell共培养模型,以实现s之间的“联系 - 独立”相互作用。mutans and c。白色唱片。s。mutans eMV与c直接关联。白色念珠菌细胞并促进生物膜的形成和生长。Quantertative泛素化分析显示了s。Mutans极大地改变了c。白色唱片。我们确定了整个c的10,661个泛素化位点。白色唱片蛋白质组及其在与翻译,代谢和应激适应性相关的途径中的富集。与s共同培养。突变导致对糖分解代谢和减少功率产生的398种蛋白质上的泛素化上调。s。mutans上调了c的超氧化物歧化酶3。白色念珠菌,诱导其降解和高度增强的活性氧水平,并同时刺激c。白色唱片的生长。我们的发现阐明了EMV和泛素化调制,作为控制s的关键机制。mutans-c。白色唱片相互作用,并为促进性口服生物膜环境提供新的见解。这项研究显着提高了对牙齿斑块营养不良和龋齿发病机理基础的复杂分子相互作用的理解。
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抽象背景:羊毛和生长特征的遗传改善是绵羊行业的主要目标,但其潜在的遗传建筑仍然难以捉摸。To improve our understanding of these mechanisms, we conducted a weighted single-step genome-wide association study (WssGWAS) and then integrated the results with large-scale transcriptome data for five wool traits and one growth trait in Merino sheep: mean fibre diameter (MFD), coefficient of variation of the fibre diameter (CVFD), crimp number (CN), mean staple length (MSL),油腻的羊毛重量(GFW)和活体重(LW)。结果:我们的数据集包括7135个具有表型数据的人,其中1217个具有高密度(HD)基因型数据(n = 372,534)。这些动物的707种基因型是从Illumina Ovine单核苷酸多态性(SNP)54 Beadchip归为HD阵列的。这些特征的遗传力范围从0.05(CVFD)到0.36(MFD),并且特征遗传相关性之间的遗传性范围为-0.44(CNvs。lw)至0.77(GFW与LW)。通过从500个样品中使用RNA-seq数据进行整体化(代表16只动物的87种组织类型),我们检测到与六个特征相关的组织,例如肝,肌肉和胃肠道(GI)是LW的最相关组织,白细胞和巨噬细胞是CN的最相关细胞。对于六个性状,鉴定出54个定量性状基因座(QTL),涵盖了21个卵巢常染色体上的81个候选基因。多个候选基因显示出强大的组织特异性表达,例如通过进行全现象关联研究(PHEWAS)bnc1(与MFD)和CHRNB1(LW)分别在皮肤和肌肉中特别表达。
慢性肝炎(CHB)病毒感染可导致严重的肝病,包括肝硬化和肝细胞癌。由于肝细胞中病毒式封闭的圆形DNA(CCCDNA)的持续存在,丙型肝炎病毒(HBV)的慢性性发生。CCCDNA用作病毒复制的模板,是HBV的核心,在宿主中维持病毒储存库。尽管有治疗性进步,但由于逃避免疫监视,消除CCCDNA仍然难以捉摸。本评论探讨了CCCDNA的形成和维护,突出了影响CCCDNA稳定性和病毒复制的宿主因素。它还讨论了当前的治疗策略,包括基于干扰素的疗法和核苷/核苷酸类似物,旨在抑制病毒复制。新兴疗法(例如基因编辑和分子干预措施)有望直接靶向CCCDNA。目前,研究的重点是制造针对感兴趣的宿主因素的药物,以破坏或清除病毒库。但是,未来的研究应集中于直接针对CCCDNA微型核小体的创新方法,旨在持续的病毒抑制,并有可能治愈HBV感染。
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StormR 是一个 R 包,可轻松从提供的数据库中提取风暴轨迹数据,并生成根据风暴轨迹数据和参数气旋模型重建的地面风场(速度和方向)。然后,StormR 允许我们计算三个汇总统计数据(最大持续风速、功率耗散指数以及在气旋生命周期内达到给定翼速的风的暴露时间)并绘制结果。我们建议使用 IBTrACS(国际气候管理最佳轨迹档案)数据库作为输入( Knapp 等人,2010 年、2018 年)。该数据库提供了自 1841 年以来具有 3 小时时间分辨率的相当全面的热带风暴和气旋记录。但是,只要提供必填字段,就可以使用任何风暴轨迹数据。