背景:几种属于伽马变形菌的细菌种群具有内在的 A 类 β-内酰胺酶基因,这些基因可能是进一步传播和获得其他革兰氏阴性菌种的来源。我们在此描述了 KSA-1 A 类 β-内酰胺酶,该基因是在环境肠杆菌目物种 Kosakonia sacchari 的染色体内发现的,该物种最近还被鉴定为 MCR 样粘菌素抗性决定簇的前体。方法:使用 GenBank 数据库进行计算机分析,在 K. sacchari SP1 的染色体内发现了 A 类 β-内酰胺酶基因(GenBank 登录号 WP_017456759)。相应的蛋白质 KSA- 1 与 Citrobacter koseri 的内在 CKO-1 有 63% 的氨基酸同一性,与 TEM-1 有 53% 的氨基酸同一性。使用 K. sacchari DSM 100203 参考菌株作为模板,扩增 bla KSA-1,克隆到质粒 pUCp24 中并在大肠杆菌 TOP10 中表达。从纯化的酶中获得最小抑制浓度和动力学参数。结果:K. sacchari 菌株 SP1 仅对氨基、羧基和脲基青霉素产生抗性。一旦在大肠杆菌中产生,KSA-1 就会表现出典型的克拉维酸抑制广谱 β-内酰胺酶,并伴有特殊的替莫西林抗性特征。使用纯化的 KSA-1 提取物进行动力学测定,结果显示对青霉素和哌拉西林以及弱广谱头孢菌素具有高水解率。抑制常数的测定表明,克拉维酸、他唑巴坦和阿维巴坦的 50% 抑制浓度分别为 2.2、3 和 1.8 nM。对 bla KSA-1 基因周围序列的分析未发现任何可能参与该物种获得这种 β-内酰胺酶基因的移动元素。结论:KSA-1 是一种 A 类广谱 β-内酰胺酶,与已知的广谱或广谱 Ambler A 类 β-内酰胺酶远亲,对替莫西林具有高度耐药性。bla KSA-1 基因可被视为该物种固有的。© 2024 作者。由 Elsevier Ltd 代表国际抗菌化疗协会出版。这是一篇根据 CC BY 许可开放获取的文章(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)
图2铃声肝炎病毒的基因组表征。(a)左,Ringtail Hepadnavirus(RTHBV)的基因组组织。右:上插入,前S1区域。人类乙型肝炎病毒(HBV)中的必要NTCP结合结构域被突出显示。点表示相同的氨基酸残基。右:较低的插入,比较翻译的前核心和N末端核心结构域。(b)铃声肝病毒(RTHV)的基因组组织。RTHV的结构蛋白颜色为绿色,而非结构性(NS)蛋白为蓝色。 与样本CO-09/924相比,RTHV样本CO-08/923之间的差异显示为黑线,而非同义替代品则显示为橙色三角形。 RTHV内部核糖体入口位点(IRES)和3'UTR的预测结构。 pk,pseudoknot。 (c)RTHBV与其他正腺病毒的成对核苷酸序列距离的比较。 序列距离使用SSE使用300的滑动窗口和80个核苷酸的步长计算。 LHB,大表面蛋白。 (d)RTHV与其他肝病病毒的成对氨基酸序列距离的比较。 序列距离使用SSE使用400个氨基酸的滑动窗口计算。RTHV的结构蛋白颜色为绿色,而非结构性(NS)蛋白为蓝色。与样本CO-09/924相比,RTHV样本CO-08/923之间的差异显示为黑线,而非同义替代品则显示为橙色三角形。RTHV内部核糖体入口位点(IRES)和3'UTR的预测结构。pk,pseudoknot。(c)RTHBV与其他正腺病毒的成对核苷酸序列距离的比较。序列距离使用SSE使用300的滑动窗口和80个核苷酸的步长计算。LHB,大表面蛋白。(d)RTHV与其他肝病病毒的成对氨基酸序列距离的比较。序列距离使用SSE使用400个氨基酸的滑动窗口计算。病毒缩写,名称(GenBank登录号):RTHBV,Ringtail Hepadnavirus(MZ393519); GSHV,松鼠肝炎病毒(K02715.1); LFBHBV,长指的蝙蝠乙型肝炎病毒(JX941466); RLBHBV,圆形蝙蝠乙型肝炎病毒(NC_024443); TMBHBV,制造帐篷蝙蝠乙型肝炎病毒(NC_024445); AGSHV,北极松鼠肝炎病毒(U29144); TFOHBV,太极肝炎B病毒(MK620908); DMHBV,家猫B病毒(MH307930); HBV,乙型肝炎病毒(AP007263); EQHBV,马乙型肝炎病毒(MT134279); HCV,肝病毒C(M62321);懒惰HV(MH844501); NRHV1,Hepacivivirus G(KJ950938);松鼠HV,肝病毒P(MG211815); RTHV,Ringtail Hepaciviviarus(MZ393518)
研究指南博士 - (当前注册为02,完成为05); B.Tech / B.Sc.(19/04) - 完成; M. Tech/M.Sc。(14) - 完成。奖项和奖学金1。M.Sc的全印度入学考试考试。生物技术(1999),由新德里的Jawaharlal Nehru大学(JNU)进行。 2。 1999-2001在M. Sc期间授予了研究生奖学金。 生物技术系(DBT)的生物技术,政府科学技术部。 印度,印度。 3。 科学与工业研究委员会(CSIR)进行的国家资格测试(NET),(2000,2001)。 4。 2004-2006授予CSIR高级研究员,5。 从TIGR,CSIR,DST和INSA授予的旅行赠款,在第7届计算基因组学年会议上介绍海报”,美国弗吉尼亚州雷斯顿,由基因组研究所(TIGR)组织,2004年10月21日,2004年10月21日。。 6。 从2 nd晋级曲霉菌病(AAA2006)的全部奖学金,2006年2月22日,希腊雅典。 7。 “最佳海报奖”,Tarun Kumar Patel,Rajesh Anand,Bhupendra N Tiwary,Jata Shankar*。 通过三座四极质谱检测黄曲霉毒素在黄曲霉菌株中的产生。 2013年2月16日至17日,2013年2月16日至17日,《微生物多样性:探索,保护与应用》(C.G. ) ),印度。 (海报), *通讯作者)8。 '奖学金奖学金第7奖,反对曲霉病(AAA2016),2016年3月3日,英国曼彻斯特。 9。生物技术(1999),由新德里的Jawaharlal Nehru大学(JNU)进行。2。1999-2001在M. Sc期间授予了研究生奖学金。 生物技术系(DBT)的生物技术,政府科学技术部。 印度,印度。 3。 科学与工业研究委员会(CSIR)进行的国家资格测试(NET),(2000,2001)。 4。 2004-2006授予CSIR高级研究员,5。 从TIGR,CSIR,DST和INSA授予的旅行赠款,在第7届计算基因组学年会议上介绍海报”,美国弗吉尼亚州雷斯顿,由基因组研究所(TIGR)组织,2004年10月21日,2004年10月21日。。 6。 从2 nd晋级曲霉菌病(AAA2006)的全部奖学金,2006年2月22日,希腊雅典。 7。 “最佳海报奖”,Tarun Kumar Patel,Rajesh Anand,Bhupendra N Tiwary,Jata Shankar*。 通过三座四极质谱检测黄曲霉毒素在黄曲霉菌株中的产生。 2013年2月16日至17日,2013年2月16日至17日,《微生物多样性:探索,保护与应用》(C.G. ) ),印度。 (海报), *通讯作者)8。 '奖学金奖学金第7奖,反对曲霉病(AAA2016),2016年3月3日,英国曼彻斯特。 9。1999-2001在M. Sc期间授予了研究生奖学金。生物技术系(DBT)的生物技术,政府科学技术部。印度,印度。 3。 科学与工业研究委员会(CSIR)进行的国家资格测试(NET),(2000,2001)。 4。 2004-2006授予CSIR高级研究员,5。 从TIGR,CSIR,DST和INSA授予的旅行赠款,在第7届计算基因组学年会议上介绍海报”,美国弗吉尼亚州雷斯顿,由基因组研究所(TIGR)组织,2004年10月21日,2004年10月21日。。 6。 从2 nd晋级曲霉菌病(AAA2006)的全部奖学金,2006年2月22日,希腊雅典。 7。 “最佳海报奖”,Tarun Kumar Patel,Rajesh Anand,Bhupendra N Tiwary,Jata Shankar*。 通过三座四极质谱检测黄曲霉毒素在黄曲霉菌株中的产生。 2013年2月16日至17日,2013年2月16日至17日,《微生物多样性:探索,保护与应用》(C.G. ) ),印度。 (海报), *通讯作者)8。 '奖学金奖学金第7奖,反对曲霉病(AAA2016),2016年3月3日,英国曼彻斯特。 9。印度,印度。3。科学与工业研究委员会(CSIR)进行的国家资格测试(NET),(2000,2001)。4。2004-2006授予CSIR高级研究员,5。从TIGR,CSIR,DST和INSA授予的旅行赠款,在第7届计算基因组学年会议上介绍海报”,美国弗吉尼亚州雷斯顿,由基因组研究所(TIGR)组织,2004年10月21日,2004年10月21日。6。从2 nd晋级曲霉菌病(AAA2006)的全部奖学金,2006年2月22日,希腊雅典。7。“最佳海报奖”,Tarun Kumar Patel,Rajesh Anand,Bhupendra N Tiwary,Jata Shankar*。通过三座四极质谱检测黄曲霉毒素在黄曲霉菌株中的产生。 2013年2月16日至17日,2013年2月16日至17日,《微生物多样性:探索,保护与应用》(C.G. ) ),印度。 (海报), *通讯作者)8。 '奖学金奖学金第7奖,反对曲霉病(AAA2016),2016年3月3日,英国曼彻斯特。 9。通过三座四极质谱检测黄曲霉毒素在黄曲霉菌株中的产生。2013年2月16日至17日,2013年2月16日至17日,《微生物多样性:探索,保护与应用》(C.G.),印度。(海报), *通讯作者)8。'奖学金奖学金第7奖,反对曲霉病(AAA2016),2016年3月3日,英国曼彻斯特。9。从DST提供Jata Shankar,Raman Thakur,Shanu Hoda,Shraddha Tiwari,Pooja Vijayaraghavan的旅行赠款。蛋白质组谱为曲霉的发芽和继发代谢物的生物合成提供了分子见解。第5届国际分析蛋白质组学大会(V ICAP 2017)。 3 rd - 2017年7月6日| Caparica |葡萄牙(口头邀请)专业机构的成员:美国过敏,哮喘和免疫学学院(AAAAI),国际人类和动物真菌学学会(ISHAM)终身会员;印度免疫学协会(LM/IIS/530/12/16)生命会员:印度真菌学会(LM-21-16)期刊的临时审稿人NO = 40对NCBI GenBank数据库(总数= 1000)贡献(总= 1000)登录号:Isocitrate lyase(Isocitrate Lyase(Isocitrate)(AY5223574)核苷型核苷型(AY523574)核苷diphosate Kinase Kinasse(AY523574)233 (AY289197)热休克蛋白(AY551909硫胺素生物合成,蛋白质(AY792973))鸟苷酸激酶AY523574)多泛素(AY817687) BM037654 BQ079382,BQ276244,BM378043- BM378045,BM500121- BM500124第5届国际分析蛋白质组学大会(V ICAP 2017)。3 rd - 2017年7月6日| Caparica |葡萄牙(口头邀请)专业机构的成员:美国过敏,哮喘和免疫学学院(AAAAI),国际人类和动物真菌学学会(ISHAM)终身会员;印度免疫学协会(LM/IIS/530/12/16)生命会员:印度真菌学会(LM-21-16)期刊的临时审稿人NO = 40对NCBI GenBank数据库(总数= 1000)贡献(总= 1000)登录号:Isocitrate lyase(Isocitrate Lyase(Isocitrate)(AY5223574)核苷型核苷型(AY523574)核苷diphosate Kinase Kinasse(AY523574)233 (AY289197)热休克蛋白(AY551909硫胺素生物合成,蛋白质(AY792973))鸟苷酸激酶AY523574)多泛素(AY817687) BM037654 BQ079382,BQ276244,BM378043- BM378045,BM500121- BM500124
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摘要 从埃及土壤和食物来源中分离出产生磷脂酶 C (PLC) 的细菌。通过 16S rRNA 测序,将一种强效假单胞菌分离物鉴定为 P. fluorescens MICAYA,并以基因登录号 (OQ231499) 记录在 GenBank 中。通过 Plackett Burman 和中心复合设计进行优化发现,豆粕、酵母提取物、NaCl 和蛋黄显著提高了磷脂酶 C 的产量。Michaelis-Menten 动力学确定了 K m 为 0.4 mg/ml 蛋黄,V max 为 287 U/ml。Box Behnken 设计确定了 395 U/ml 磷脂酶 C 产量的最佳 pH 值为 6.5、0.55 g/l CaCO 3、1.05% 蛋黄、48.5°C。该磷脂酶对人成纤维细胞表现出低细胞毒性。磷脂酶 C 浓度(0.2-1 ml)可有效脱胶芝麻、洋甘菊、西洋菜、荷荷巴油、橄榄、黑种草和蓖麻油。磷脂酶 C 浓度为 0.4-0.8 ml/L 时磷脂减少率最高。荧光假单胞菌磷脂酶 C 提供了一种可生物降解的化学脱胶替代方法。总之,统计优化成功提高了磷脂酶 C 的产量。表征发现该酶在碱性 pH、中等温度和蛋黄底物下效果最佳。已证明多种植物种子油具有生物脱胶能力。进一步固定化和蛋白质工程可以提高磷脂酶 C 的工业效用。关键词:磷脂酶 C;荧光假单胞菌;培养基优化;油脱胶;酶动力学。 _____________________________________________________________________________________________________________ 1. 简介 磷脂酶 (PLC) 水解磷脂骨架中的磷酸二酯键,根据所涉及的具体磷脂种类产生 1,2-二酰基甘油和磷酸单酯。微生物磷脂酶是催化磷脂水解的酶。由于其广泛的底物特异性、温和条件下的高活性以及易于大规模生产,它们具有广泛的工业应用 [1]。磷脂酶已被用于修改磷脂结构以生产特定脂质、脱胶植物油、合成化妆品成分、改善面团的烘焙特性、产生风味和香气等 [2]。真菌、细菌和酵母等微生物来源的磷脂酶比植物和动物来源具有优势,因为它们可以通过发酵以高产量和纯度生产 [3]。最有效的真菌生产者是黑曲霉、环青霉和少根根霉。黑曲霉可产生高产量的磷脂酶 A1 和 A2 [4]。固定化黑曲霉磷脂酶 A2 对植物油的重复脱胶表现出良好的稳定性 [5]。最常见的细菌生产者是假单胞菌和芽孢杆菌。铜绿假单胞菌和蜡状芽孢杆菌产生胞外磷脂酶 C [6,7]。枯草芽孢杆菌分泌磷脂酶 A2,并且已经通过基因改造以提高产量。在稳定期,荧光假单胞菌可以产生各种具有抗菌潜力的次级代谢物,例如氢氰酸 (HCN)、绿脓杆菌素 (Pit) 和 2,4-二乙酰间苯三酚 (Phi),以及铁螯合代谢物 [8]。绿脓杆菌素、水杨酸和绿脓杆菌素。蛋白酶、磷脂酶 C 和脂肪酶是从各种环境中分离的荧光假单胞菌菌株产生的三种细胞外酶的例子 [9]。在稳定生长期测定的磷脂分解活性水平最高,表明生长阶段依赖机制负责诱导这些酶。此外,酵母生产者是隐球菌,它被固定化并用于大豆油脱胶。 Candida rugosa 是一种脂肪酶和磷脂酶生产者,固定化 C. rugosa 脂肪酶用于结构化脂质的生产 [10]。微生物磷脂酶,如磷脂酶 A1、A2、C 和 D,在脱胶、油脂酯交换、卵磷脂生物合成和废水处理应用中表现出良好的应用前景 [11]。它们的酶水解导致磷脂部分水解,使胶的分离更容易 [12]。响应面法 (RSM) 被有效地用于各种微生物产品的优化和建模 [13]。该方法结合了统计和数学技术,用于模型构建、评估几个独立变量的影响并获得变量的最优值。因此,本研究的目的是利用响应面法的统计方法优化荧光假单胞菌磷脂酶 C 的生产和表征,并研究其在某些植物油脱胶中的应用。油脂的酯交换、卵磷脂的生物合成和废水处理应用 [11]。它们的酶水解导致磷脂的部分水解,使胶的分离更容易 [12]。响应面法 (RSM) 被有效地用于各种微生物产品的优化和建模 [13]。该方法结合了统计和数学技术,用于模型构建、评估几个独立变量的影响并获得变量的最优值。因此,本研究的目的是利用响应面法的统计方法优化荧光假单胞菌磷脂酶 C 的生产和特性,并研究其在某些植物油脱胶中的应用。油脂的酯交换、卵磷脂的生物合成和废水处理应用 [11]。它们的酶水解导致磷脂的部分水解,使胶的分离更容易 [12]。响应面法 (RSM) 被有效地用于各种微生物产品的优化和建模 [13]。该方法结合了统计和数学技术,用于模型构建、评估几个独立变量的影响并获得变量的最优值。因此,本研究的目的是利用响应面法的统计方法优化荧光假单胞菌磷脂酶 C 的生产和特性,并研究其在某些植物油脱胶中的应用。
本文是Gilroy R,Ravi A,Getino M,Pursley I,Horton DL等人的后续作品。peerj 2021; 9:e10941,详细介绍了文化收藏中的登录号,以确保33种新物种的名称符合《国际命名法》的规则,该规则是有效出版文化物种名称所需的原核生物规则。现在建议以下物种名称被认为是有效发表的:卵石杆菌sp。nov。,节肢动物Gallicola sp。nov。NOV。,诺维奇西斯杆菌 NOV。,Brevibacterium Gallinarum sp。 nov。,brevundimonas guildfordensis sp。 nov。,cellulomonas avistercoris sp。 nov。 nov。,comamonas avium sp。 NOV。,Corynebacterium Gallinarum sp。 nov。,cytobacillus stercorigallinarum sp。 nov。,Escherichia whittamii sp。 nov。,kaistella pullorum sp。 nov。,luteimonas colneyensis sp。 NOV。,微区公社。 11月,gallinarum sp。 NOV。,微分细菌sp。 NOV。 nov。,ochrobactrum gallinarum sp。 NOV。,Oerskovia Douganii sp。 NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,诺维奇西斯杆菌NOV。,Brevibacterium Gallinarum sp。 nov。,brevundimonas guildfordensis sp。 nov。,cellulomonas avistercoris sp。 nov。 nov。,comamonas avium sp。 NOV。,Corynebacterium Gallinarum sp。 nov。,cytobacillus stercorigallinarum sp。 nov。,Escherichia whittamii sp。 nov。,kaistella pullorum sp。 nov。,luteimonas colneyensis sp。 NOV。,微区公社。 11月,gallinarum sp。 NOV。,微分细菌sp。 NOV。 nov。,ochrobactrum gallinarum sp。 NOV。,Oerskovia Douganii sp。 NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,Brevibacterium Gallinarum sp。nov。,brevundimonas guildfordensis sp。nov。,cellulomonas avistercoris sp。nov。nov。,comamonas avium sp。NOV。,Corynebacterium Gallinarum sp。 nov。,cytobacillus stercorigallinarum sp。 nov。,Escherichia whittamii sp。 nov。,kaistella pullorum sp。 nov。,luteimonas colneyensis sp。 NOV。,微区公社。 11月,gallinarum sp。 NOV。,微分细菌sp。 NOV。 nov。,ochrobactrum gallinarum sp。 NOV。,Oerskovia Douganii sp。 NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,Corynebacterium Gallinarum sp。nov。,cytobacillus stercorigallinarum sp。nov。,Escherichia whittamii sp。nov。,kaistella pullorum sp。nov。,luteimonas colneyensis sp。NOV。,微区公社。 11月,gallinarum sp。 NOV。,微分细菌sp。 NOV。 nov。,ochrobactrum gallinarum sp。 NOV。,Oerskovia Douganii sp。 NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,微区公社。11月,gallinarum sp。NOV。,微分细菌sp。 NOV。 nov。,ochrobactrum gallinarum sp。 NOV。,Oerskovia Douganii sp。 NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,微分细菌sp。NOV。 nov。,ochrobactrum gallinarum sp。 NOV。,Oerskovia Douganii sp。 NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。nov。,ochrobactrum gallinarum sp。NOV。,Oerskovia Douganii sp。 NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,Oerskovia Douganii sp。NOV。,Oerskovia Gallyi sp。 11月,Oerskovia Merdavium sp。 11月,Oersko-通过Rustica sp。 NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,Oerskovia Gallyi sp。11月,Oerskovia Merdavium sp。11月,Oersko-通过Rustica sp。NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。 11月,Phocaeicola Gallinarum sp。 nov。 nov。 11月,Serpens Gallinarum sp。 nov。,solibacillus粪便sp。 nov。NOV。,Paenibacillus Gallinarum sp。11月,Phocaeicola Gallinarum sp。nov。nov。11月,Serpens Gallinarum sp。nov。,solibacillus粪便sp。nov。11月,Gallician Sporing sp。 11月,sporing Quadrami sp。 nov。,stenothopomomas pennii sp。 nov。和Urbann可以。11月,Gallician Sporing sp。11月,sporing Quadrami sp。 nov。,stenothopomomas pennii sp。 nov。和Urbann可以。11月,sporing Quadrami sp。nov。,stenothopomomas pennii sp。nov。和Urbann可以。
