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埃塞俄比亚腹泻儿童及其暴露环境中弯曲杆菌种群的出现和多样性
弯曲杆菌是一种主要的人畜共患食源性病原体，对公共卫生构成重大威胁，尤其是对儿童和免疫功能低下人群。然而，关于埃塞俄比亚弯曲杆菌感染发生和来源的数据仍然很少。本研究使用全基因组测序评估了腹泻儿童弯曲杆菌的发生、多样性和与潜在暴露源之间的关系。通过基于病例的追踪，在 2021 年 11 月至 2023 年 1 月期间从哈拉尔镇和克尔萨区收集了动物、食物和环境样本。使用选择性培养基鉴定弯曲杆菌，并使用 Illumina NextSeq 550 仪器提取和测序 DNA。使用生物信息学工具分析序列读数。暴露源中弯曲杆菌的总体患病率为 5.5%，其中城市为 6.0%，农村为 5.0%。家庭样本中检测到弯曲杆菌的可能性比市场样本高 1.8 倍（8.7%；OR = 1.8；95% CI：0.7–4.5）。食品中弯曲杆菌的出现率为 4.2%，肉类、奶类和其他食品类别之间没有显著差异。与猪相比，有家禽时环境中被弯曲杆菌污染的可能性高 5.8 倍（17.7%；OR = 5.8；CI：1.1–30.6）。序列分析发现弯曲杆菌属多样性较低，仅包含空肠弯曲菌和大肠弯曲菌，其特征是 8 种不同的序列类型（ST）。从系统发育上看，大多数测序的病例分离株与来自看护人、环境暴露或两者的分离株聚集在一起。总之，在腹泻儿童的各种接触源中都检测到了弯曲杆菌，其在 Kersa 和 Harar 之间或食物中的发生率没有显著差异。大多数分离株具有共同的 MLST 谱并聚集在一起，表明多种媒介参与了病原体的传播。建议进行归因模型支持的基于基因组的综合研究，以确定每种来源的相对贡献。
增强了全球侵入性埃及埃及种群的Zika病毒易感性
Aubry，F。等。（2020）增强了全球侵入性埃及埃及种群的寨卡病毒易感性。Science，370（6519），pp。991-996。（doi：10.1126/science.abd3663）。这是作者的最终接受版本。此版本和已发布的版本之间可能存在差异。，如果您想从中引用出版商的版本，建议您咨询出版商的版本。
基因组知识的圈养育种可以减少近亲抑郁症和动物园种群的遗传负荷
fi g u r e 1从单个粉红色鸽子的原始阅读中，粉红色依赖性耗竭（PPCADD）分数的每单核苷酸多态性（SNP）粉红色鸽子的产生管道。Snakemake（Mölder等，2021）管道用作输入主体个体的测序读数，受试者物种参考基因组以及CADD分数和参考基因组（即鸡肉，Chcadd分数（Groß，Bortoluzzi等，2020）和Galgal6参考基因组（Warren等，2017））。管道分为六个部分，对应于管道的部分（https：//github。com/saspe ak/loadlift）。（1）（黄色）使用Phyluce从参考基因组中提取UCE。（2）（深蓝色）映射个体的测序读取到参考基因组，以指示10×Chromium读取数据（本文中使用）和Illumina读取数据的两种平行方法。（3）（浅蓝色）变体呼叫UCES中的SNP。（4）（浅灰色）创建链文件，用于从鸡基因组转化注释。（5）（深灰色）Chcadd得分转换为粉红色鸽子（主题物种）注释。（6）（绿色）床文件和UCE站点的交集到每个站点PPCADD（主题物种）分数（红色）。
景观水平的人类干扰导致热带森林中哺乳动物种群的丧失和收缩
Ilaria Greco ID 1 *，Lyelic Beaudrot 2.3，Chris Sutherland 4，Simone Tenan 5，Syone 2.3，Daniel Gorzynski 6，Ahumada 13，Rajan Amin 14，Megan Baker-Watton 1 Cremonesi 1 Cremonesi 1 Cremonesi 1 Cremonesi 1 Cremonesi 23：Adeline Fayolle 22:28，Adeline Fayolle 22:28，Davy Fonty Harry 31 22 Alys Granados 32.33，Patrick A. Jansen 34.35，Jayasilan Mohd-Azlan 11，Caspian Johnson Marcelo Magio 21：41,42，Emanuel H. Martin 43，Adriano Martinole版本28，Patrics C. Wright C. Wright C. Wright 25.50，C.
本地猪Zona Pellucida（PZP）对内华达州的弗吉尼亚范围自由式烟草种群的免疫调整功效
摘要：在北美，由于迅速发展的范围限制越来越多地在野马栖息地上加入，并且需要有效但人道的生殖管理。人口（> 3500）和领土大小（≈300,000英亩）的最大自由漫游野马肥力控制计划位于内华达州的弗吉尼亚州范围内。来自现场研究的数据研究了通过远程飞镖传递到该人口中母马的猪Zona pellucida（PZP）免疫感应。分析旨在通过治疗对年度出生率和人口人群的影响来衡量功效，并评估治疗频率和针对这些变量的调味。分析包括MARES的月度数据（2019年1月至2022年12月； 48个月），其特征是累积疫苗接种数量分为四个分类，考虑到该疫苗在疫苗后6，12-，12个月和18个月期内没有疗效或损失损失；从泡沫数据中，那个月出现和构思的可能性；从年龄开始，成熟或不成熟（<1岁）。以每月的时间间隔表现出来的成熟母马数量的下降速度和趋势显示，年度季节性繁殖峰值显着下降，没有观察到小囊季节或持续时间的变化。在四年内，人口覆盖率超过了70％，与泡沫降低了58％，受孕率仅为10％。疫苗接种的母马比例增加：假设衰减率为12个月，该系统平均达到≈1.0疫苗接种/母马/年，为有助于最佳管理实践的治疗频率提供了强有力的建议。
与肠道健康相关的细菌种群的短暂抑制对于CROH儿童的独家肠内营养成功至关重要
美国芝加哥卢里儿童医院，美国伊利诺伊州60611，美国B Biophysical Sciences计划，芝加哥大学，芝加哥大学，伊利诺伊州60637，美国芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学，伊利诺伊州60637，美国芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学芝加哥，芝加哥，伊利诺伊州60637，美国F有机体和生态系统，Earlham Institute，Norwich，NR4 7UZ，英国G G12 8QQ，G12 8QQ，G12 8QQ，G12奥尔登堡大学环境，26129，德国奥尔登堡，J Alfred-Wegener海洋与极地研究所，27570德国Bremerhaven，德国K Helmholt k Helmholtz功能性海洋生物多样性研究所，德国26129德国Oldenburg，德国Oldenburg，德国，德国，作者： 60611，美国。电子邮件：jrunde@ luriechildrens.org; A. Murat Eren，博士，Helmholtz功能海洋生物多样性研究所，德国奥尔登堡26129。电子邮件：meren@hifmb.de电子邮件：meren@hifmb.de
树木种植园对西高止生物多样性热点中流行蜥蜴的种群的影响和生态学的栖息
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是制作
通过变性梯度凝胶电泳分析聚合酶链反应扩增的基因编码复杂微生物种群
我们描述了一种分析复杂微生物种群遗传多样性的新型分子方法。该技术基于通过变性梯度凝胶电泳 (DGGE) 分离编码 16S rRNA 的聚合酶链式反应扩增基因片段，这些片段的长度相同。对不同微生物群落的 DGGE 分析表明，分离模式中存在多达 10 个可区分的条带，这些条带很可能来自构成这些种群的许多不同物种，从而生成了种群的 DGGE 图谱。我们表明，可以识别仅占总种群 1% 的成分。使用针对硫酸盐还原菌 16S rRNA 的 V3 区特异性的寡核苷酸探针，可以通过杂交分析识别某些微生物种群的特定 DNA 片段。对在有氧条件下生长的细菌生物膜的基因组 DNA 进行分析表明，尽管硫酸盐还原菌具有厌氧性，但它们仍存在于这种环境中。我们获得的结果表明，该技术将有助于我们了解未知微生物种群的遗传多样性。
2023 年 11 月 20 日理事会条例 (EU) 2023/2638 ...
(7) 条例 (EU) 2016/1139 涵盖某些鱼类种群，而 ICES 建议这些鱼类种群的捕捞量为零。但是，如果 TAC 设定在建议的水平，则在混合渔业中捕捞所有渔获物（包括这些鱼类种群的副渔获物）的义务将导致“窒息物种”现象。窒息物种是一种配额不足的物种，即使它们仍有其他物种的配额，也可能导致一艘或多艘渔船停止捕捞。因此，为这些鱼类种群的副渔获物设定特定的 TAC 是适当的，以便在维持渔业（鉴于未能维持渔业可能产生的严重社会经济影响）和实现这些鱼类种群良好生物状态的需要之间取得平衡，同时考虑到在最大可持续捕捞量下在混合渔业中捕捞所有鱼类种群的难度。这些副渔获物的 TAC 应设定在确保这些鱼类种群死亡率降低的水平，提供改善选择性的激励措施并避免这些鱼类种群的副渔获物。为了减少已设定副渔获物总可捕获量 (TAC) 的鱼类捕捞量，应将捕捞这些鱼类的渔业的捕捞机会固定在有助于脆弱鱼类种群生物量恢复到可持续水平的水平。
秘鲁亚马逊南部马德雷德迪奥斯九个香柏树种群的遗传 (AFLP) 多样性
香雪松是最重要的新热带木材物种之一，在其自然分布的许多地方，都受到森林砍伐和不可持续砍伐的威胁。有关遗传变异模式的信息有助于指导重新造林和遗传保护活动。然而，到目前为止，秘鲁或南美洲其他地区还没有这样的信息。在本研究中，基于扩增片段长度多态性 (AFLP) 标记，报告了该物种九个秘鲁种群之间和种群内部的遗传多样性。总体多样性水平很高 (Ht = 0.22)，这与广泛分布、寿命长的热带物种的预期一致，也与之前在中美洲进行的研究一致。种群内多样性水平高于之前报告的该物种的水平 (Hs = 0.13–0.21)。分子变异分析揭示了位于不同河流的两个种群组之间以及位于同一河流的种群之间存在遗传差异。群体之间的差异大于群体内的差异。遗传和地理距离显著相关。种群间相对强烈的遗传差异可能与所研究种群的河岸、本质上是一维的空间分布模式有关。在相对未受干扰的种群和被砍伐的种群之间，多态性位点的百分比没有发现差异。在秘鲁亚马逊地区相对较小的一部分物种范围内存在明显的遗传分化，这表明在使用原产地以外的种子时需要谨慎。出于遗传保护的目的，在秘鲁亚马逊地区每个主要流域采集（异地）或保护（就地）种群可能是明智的做法。# 2007 Elsevier BV 保留所有权利。