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World File Search System种群的
引用详情：Luo,J., Wei,C., Liu,H. 等人。MaizeCUBIC：玉米合成种群的综合变异数据库。数据库 (2020) 卷。
MaizeCUBIC 是一个免费数据库，描述了玉米 CUBIC 群体（24 个创始种和 1404 个近交后代）的基因组变异、基因表达、表型和数量性状位点 (QTL)。该数据库不仅包含之前已鉴定的超过 1400 万个单核苷酸多态性 (SNP) 和 43000 个插入/缺失信息，还包含本研究中新鉴定的 660000 个结构变异 (SV) 和 600000 个新序列，代表了多样化群体的全面高密度变异图谱。基于这些基因组变异，该数据库将显示每个后代的镶嵌结构，反映亲本基因组之间的高分辨率重组。该数据库还包括在五个地点对亲本和后代测量的总共 23 个农艺性状，这些地点代表了中国玉米的主要种植区。为了进一步探索基因型-表型关系，采用了两种不同的全基因组关联研究 (GWAS) 方法来剖析 23 种农学性状的遗传结构。此外，还开发了基本局部比对搜索工具和引物设计工具，以促进后续分析和实验验证。所有原始数据和相应的分析结果都可以通过用户友好的在线查询和 Web 界面动态可视化以及可下载文件访问。这些数据和工具为玉米和其他作物的遗传和基因组研究提供了宝贵的资源。
秘鲁亚马逊南部马德雷德迪奥斯九个香柏树种群的遗传 (AFLP) 多样性
香雪松是最重要的新热带木材物种之一，在其自然分布的许多地方，都受到森林砍伐和不可持续砍伐的威胁。有关遗传变异模式的信息有助于指导重新造林和遗传保护活动。然而，到目前为止，秘鲁或南美洲其他地区还没有这样的信息。在本研究中，基于扩增片段长度多态性 (AFLP) 标记，报告了该物种九个秘鲁种群之间和种群内部的遗传多样性。总体多样性水平很高 (Ht = 0.22)，这与广泛分布、寿命长的热带物种的预期一致，也与之前在中美洲进行的研究一致。种群内多样性水平高于之前报告的该物种的水平 (Hs = 0.13–0.21)。分子变异分析揭示了位于不同河流的两个种群组之间以及位于同一河流的种群之间存在遗传差异。群体之间的差异大于群体内的差异。遗传和地理距离显著相关。种群间相对强烈的遗传差异可能与所研究种群的河岸、本质上是一维的空间分布模式有关。在相对未受干扰的种群和被砍伐的种群之间，多态性位点的百分比没有发现差异。在秘鲁亚马逊地区相对较小的一部分物种范围内存在明显的遗传分化，这表明在使用原产地以外的种子时需要谨慎。出于遗传保护的目的，在秘鲁亚马逊地区每个主要流域采集（异地）或保护（就地）种群可能是明智的做法。# 2007 Elsevier BV 保留所有权利。