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野火和收获北方森林后土壤碳积累的生物控制：评论
ta b le 1报道了通过野火或在北方森林中的清晰切割开始的有机视野C积累率。每种干扰类型的研究（火灾与偶数管理）的排名从最低到最高的C累积速率排名。列“关系”是指响应曲线，线性，驼峰形，抛物线或渐近线的形状。渐变是指随时间下降的C积累模式，而抛物线关系最初会减少然后增加。当发现渐近关系时，在可能的区分时，在括号中报告了近似拐点。报告的累积率是估计涵盖整个时间序列的平均值，除了达到渐近线的关系，在这种情况下，使用渐近线的时间来估计平均率。当关系是渐近的，但是在时间序列中未达到渐近线时，则使用整个时间序列来估计平均值。用于两个荟萃分析的数据包括表格中列出的研究组合，非链式索物参考和未发表的数据。搜索方法和参考文献在支持信息中报告。
CD74抑制剂DRHQ改善了Aβ积累的5xFAD小鼠模型的认知和线粒体功能
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年1月30日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.01.29.577832 doi：Biorxiv Preprint
clopyralid对生物化性和亚硝酸盐积累的扰动：长期性能和生物学机制
除草剂clopyralid的污染物（3,6-二氯-2-吡啶 - 羧酸，CLP）对生态系统构成了潜在的威胁。然而，普遍缺乏研究CLP对生物衍生过程扰动的研究，其生物反应机制尚不清楚。在此，对CLP的长期暴露进行了系统的研究，以探索其对硝化性能和动态微生物反应的影响。结果表明，CLP的低浓度（<15 mg/ L）最初引起严重的亚硝酸盐积累，而在长期适应后，CLP的浓度较高（35 E 60 mg/ L）没有进一步的影响。这项机械研究表明，CLP减少了亚硝酸盐还原酶（NIR）活性，并抑制了代谢活性（碳代谢和氮代谢），从而导致氧化应激和膜损伤，从而导致亚硝酸盐的积累。但是，经过80天以上的适应，几乎没有在60 mg/L Clp的情况下发现亚硝酸盐积累。提出，细胞外聚合物物质（EPS）的分泌在15 mg/l Clp时从75.03 mg/g VSS增加到60 mg/l Clp的109.97 mg/g VSS，从而增强了微生物细胞的保护和改善的NIR活性和改善的NIR活性和代谢活性。此外，Mi-Crobial社区的生物多样性和丰富性经历了U形过程。最初硝化和代谢相关的微生物的相对丰度最初降低，然后随着与EPS和N-酰基 - 糖烯内酯分泌有关的微生物的富集而回收。©2021作者。这些微生物保护了微生物免受有毒物质的影响，并调节了它们之间的相互作用。这项研究揭示了成功暴露于CLP后的硝化生物反应机制，并为分析和治疗含除草剂的废水提供了适当的指导。由Elsevier B.V.代表中国环境科学研究所，中国环境科学学院出版。这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
RNA 结合蛋白的功能筛选可识别促进或限制 CD138+ 浆细胞积累的基因
B 细胞向浆细胞的转变需要对转录组进行大量重新编程。这在一定程度上是通过转录因子和表观遗传调节因子的作用实现的，它们在分层系统中发挥作用，控制分化的时间及其与细胞外信号的协调。信号转导途径和转录后调节因子的整合进一步赋予了该系统内的动态控制。转录后控制的核心作用是由微小 RNA 介导的，例如 Mir148a ( Porstner et al., 2015 ) 和 Mir155 ( Lu et al., 2014 ) 促进浆细胞分化，而 Mir125b ( Gururajan et al., 2010 ) 抑制浆细胞分化。RNA 结合蛋白 (RBP) 在转录过程中或转录后发挥作用，影响表达基因的质量和数量。
使用智能手机驱动的，快速积累的社区源数据来促进生物多样性监测
摘要生态系统服务部分源自生物学多样性，是对人类社会的基本支持。但是，人类活动对生物多样性造成了损害，最终危害了这些关键的生态系统服务。停止自然损失并减轻这些影响需要全面的生物多样性分配数据，这是实施Kunming-Montreal全球生物多样性框架的要求。为了有效地从公众那里收集物种观察，我们在日本启动了“生物群体”移动应用程序。通过采用物种识别算法和游戏化元素，该应用程序自2019年推出以来已收集> 600万的观察结果。但是，社区采购的数据经常表现出空间和分类偏见。物种分布模型（SDMS）在适应这种偏见的同时推断物种分布。我们研究了Biome数据的质量以及合并数据如何影响SDM的性能。物种鉴定精度超过鸟类，爬行动物，哺乳动物和两栖动物的95％，但是种子植物，软体动物和鱼类得分低于90％。对日本的132种陆地动植物的分布进行了建模，并通过将我们的数据纳入传统的调查数据来提高其准确性。对于濒危物种，传统的调查数据需要> 2,000个记录以构建准确的模型（Boyce指数≥0.9），尽管将两个数据源混合在一起时仅需要CA.300记录。独特的数据分布可能解释了这一进步：生物群落数据统一涵盖了城市 - 自然梯度，而传统数据则偏向自然区域。将多个数据源结合起来提供了对日本物种分布的见解，有助于保护区域名称和生态系统服务评估。提供一个平台来积累社区来源的分布数据和改进数据处理协议，不仅有助于保存自然生态系统，还将有助于检测物种分布变化和测试生态理论。
性别对疾病活动和多发性硬化症中疾病活动积累的定量作用
量化多发性硬化症（MS）活动性和严重程度的性别差异的抽象目的以及自临床发作以来疾病持续时间和时间的依赖。从1996年以来，所有丹麦公民都接受了复发性MS的发作，他们接受了每年或双年度对照访问，并强制通知丹麦多发性硬化症登记册。是女性的反可能性。使用加权通用线性模型分析了扩展的残疾状态量表（EDSS）得分的变化，我们在不同EDSS端点的男性和女性之间使用了加权COX回归。结果我们包括3028名男性和6619名女性。加权女性：男性复发率比为1.16（95％CI：1.10至1.22），但在50岁之后，差异消失了。男性（95％CI：0.05至0.08）的EDSS年度增加为0.07，女性为0.05（95％CI：0.04至0.06）； p = 0.017。以女性为参考，达到EDSS 4的HR为1.34（95％CI：1.23至1.45; P <0.001），到达EDSS 6的HR为1.43（95％CI：1.28至1.61; P <0.001）。性别之间的诊断延迟没有显着差异。结论女性的炎症性疾病活动比更年期时代的男性更具炎症性疾病活性，表明性激素可能发挥作用。男性比女性更受MS的神经退行性成分的约束，特别是在45岁之后。
乳糖仿形的酵母菌含有高脂肪酸积累的酵母菌，未经靶向的生物镜头
抽象的生物探测可以发现具有有趣的生态特征和有价值的生物技术特征的新酵母菌菌株和物种，例如将不同的碳源从工业侧转化为生物蛋白酶UCT的能力。在这项研究中，我们在热带西非进行了未靶向的酵母菌生物镜头，收集了1,996株分离株，并在70种不同的环境中确定了它们的生长。该系列包含许多分离株，具有吸收几种具有成本效益且可持续的碳和氮源的潜力，但我们专注于含有203种能够生长在乳糖上的菌株的特征，乳糖是乳制品的主要碳源，这是乳制品行业丰富的侧流奶酪乳清中的主要碳源。通过内部转录的间隔测序对乳糖映射菌株，我们从腹部和基本肌菌群中鉴定了30种不同的酵母菌物种，以前没有证明其中有一些在乳糖上生长，有些是新物种的候选者。观察到的生长和细胞外乳糖酶活性的生长和比率差异表明，酵母菌使用一系列不同的策略来代谢乳糖。值得注意的是，几种基质菌酵母，包括apiotirichum mycotoxinivorans，Papiliotrema laurentii和Moesziomyces natararcitus，积累了多达40％的细胞干重的脂质，证明它们可以将乳糖转化为重大生物含量的生物产物。
积累的宏基因组研究揭示了正粘液病毒的近期迁移、全基因组进化和未被发现的多样性
摘要 宏基因组学研究通过超越公共卫生或经济利益宿主来发现许多新型病毒。然而，得到的病毒基因组往往不完整，而且分析主要表征了病毒在其动态中的分布。在这里，我们整合了从宏基因组学研究中积累的数据，以揭示正粘病毒科（包括流感病毒在内的 RNA 病毒家族）案例研究的地理和进化动态。首先，我们使用正粘病毒科武汉蚊病毒 6 的序列来追踪其宿主的迁移。然后，我们研究正粘病毒基因组的进化，发现该家族成员之间的基因获得和丢失，特别是负责细胞和宿主向性的表面蛋白。我们发现武汉蚊病毒 6 的表面蛋白表现出加速的非同义进化，暗示抗原进化，即脊椎动物感染，并且属于具有高度分化的表面蛋白的更广泛的 quaranjavirid 组。最后，我们量化了正粘病毒的发现进展，并预测仍有许多不同的正粘病毒科成员有待发现。我们认为，无论是否发现新病毒，只要研究设计能够解析完整的病毒基因组，持续的宏基因组研究将对了解病毒及其宿主的动态、进化、生态学大有裨益。
由目标aid基础编辑技术产生的高胡萝卜素番茄突变体的表型表征
我们先前的研究表明，靶AID是改进的CRISPR/CAS9系统，促进基础编辑是靶向多个基因的有效工具。针对类胡萝卜素积累的三个基因SLDDB1，SLDET1和SLCYC-B是针对的，并且先前通过Target-AID获得了等位基因变异。在这项研究中，我们表征了新等位基因对植物生长和水果发育以及类胡萝卜素积累的影响，在分离后交叉种群中或组合在无效的自我隔离线中。只有在三个靶基因中携带纯合取代的线和单个突变的隔离后交叉种群的表征，从而隔离了SLDDB1的两个等位基因版本，一种与SLDET1相关，另一个与SlcyC-B分离出来。所有编辑的线都显示出类胡萝卜素积累的变化，对每个单个突变都有添加作用。这些结果表明，目标AID基础编辑技术是创建靶基因的新等位基因变异以改善番茄中类胡萝卜素积累的有效工具。
