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World File Search System第三纪
来自 Landsat ETM + 中东地区的线纹频率 ...
多光谱 Landsat 7 ETM+ 分析为传统测绘提供了先前的研究。为地质测绘提供了宝贵的帮助。卫星收集的遥感图像 地质和地理状况：研究区域位于北纬 33°30 和 34° 之间，通过全景图显示，它们位于北纬 4°30 和南经 5°。东北部恢复了中阿特拉斯高原作为数字线性延伸的存在和重要性，主要包括景观中的地质不连续性、下侏罗纪白云质石灰岩的“线性”英语和线性“排列”（下和中莱阿斯），克服了法语系列 [1]。由三叠纪红色页岩和玄武岩组成 [4-7]。这些线纹与结构相关，其特征是板状结构，更多断层和元素，如断层、裂缝、褶皱轴和褶皱，呈单调的地貌。这是一个大型的喀斯特高原岩性接触。它们导致地形不同阶段，俯瞰 Sais 平原，在海拔 1000 米以上的洼地、排水和植被异常 [2]。 它被 NE-SW 断层和 [3] 穿过。然而，在几乎所有情况下，Tizi n'Tratten 的提取和分离，卫星图像将这些结构与 Atlas Pleated 的东南部中线纹分离，由北中阿特拉西断层 (ANMA) 表示。水平非常高 [1]。北部和西北部的界限由里夫南部的第三纪和第四纪覆盖层以及有趣的技术线纹和走廊决定（图1）。
预测使用机器学习模型用流动机处理的颅内动脉瘤的不完全闭塞
客观的颅内囊力瘤是血管畸形，导致80％的非创伤性脑出血。最近，流动分流已被用作侵入性较少的手术治疗替代方案。但是，在25％的病例中，他们在6个月后无法完全闭塞。在这项研究中，作者使用Ma-Chine学习（ML）构建了一种工具，以预测与流动机处理后6个月后6个月后的动脉瘤闭塞结果。包括2011年1月至2017年12月之间在第三纪转介中心接受管道栓塞装置治疗的616名患者中，总共667例动脉瘤。为了构建预测工具，进行了两个实验。在第一个实验中，使用与患者风险因素和动脉瘤形态学特征相关的26个特征，将六种ML算法（支持向量机[SVM]，决策树，随机森林[RF]，K-Nearest邻居，XGBoost和Catboost培训）。在第二个例外情况下，使用Shapley添加说明（SHAP）分析在RF模型上提取的前10个功能进行了训练。结果结果表明，即使使用特征子集（83％的精度），即使在LR模型的SVM模型vs 62％的SVM模型与62％的SVM模型vs 62％的精度相比，SVM模型的准确性为89％（精度为83％）。塑形分析表明，年龄，高血压，吸烟状况，分支血管受累，动脉瘤颈部和较大的直径尺寸是有助于准确预测的最重要特征。在这项研究中得出结论，开发了一种基于ML的工具，该工具成功地预测了经过流动转移治疗的颅内动脉疫苗的结果，从而有助于神经外科医生实践更精致的方法和患者量化的药物。
冰川科学与环境变化 - EPIC
冰盖对边界条件的变化做出动态响应，例如气候变化、基底热条件和底层基岩的均衡调整。这些导致冰盖向新的平衡演变。涉及长达 10 4 年的长响应时间尺度，由冰厚度与年质量周转率的比率、床的物理和热过程以及影响冰粘度和地幔粘度的过程决定。反馈过程可能会放大或减轻冰盖对强迫的调整，或者内部不稳定性可能会因动态流动状态的变化而导致冰量快速变化，从而使冰盖的响应变得更加复杂。开发冰流数值模型的主要动机是为了更好地了解冰盖和冰川的空间和时间行为，并预测它们对外部强迫的响应。冰盖动力学建模提供了一个强大的框架，可以定量研究过去和未来环境中冰盖与气候系统之间的复杂相互作用。冰流模型通常基于描述冰川流动的基本物理定律和假设。冰盖模型类别的顶端是所谓的三维热机械模型，它们能够描述真实冰盖随时间变化的流动和形状。这些模型类似于气候科学其他分支中开发的一般环流模型。它们的发展紧随计算机能力、冰芯和沉积物钻探、遥感和地球物理年代测定技术等领域的技术进步，这些技术进步既提供了所需的计算手段，也提供了输入和验证这些模型所需的数据。此类模型已应用于格陵兰岛和南极洲现有的冰盖，以及第四纪冰河时期覆盖北半球大陆的冰盖。典型的研究集中在第三纪冰盖形成的机制和阈值（Huybrechts，1994a；DeConto & Pollard，2003）、冰期-间冰期旋回期间冰盖的形式和范围（Marshall 等人，2000；Ritz 等人，
引用：Kohler K，Nwe Myint PP，Wynn S等。改善缅甸创伤性脑损伤护理的系统方法：Li
抽象目标创伤性脑损伤（TBI）是一个全球的健康问题，在脆弱的卫生系统中，在低资源环境中的管理和缺乏获得专业服务的访问所阻碍。改进是复杂的。我们旨在开发一种混合方法方法，以基于当地人的生活经验来了解TBI途径，并在定量方法中支持并确定潜在的改进目标。设计我们描述了一种基于叙事探索，参与式图表，数据收集和离散事件模拟（DES）的系统方法，该系统方法由国际研究合作组织进行。设置该研究是在2019 - 2020年（在SARS-COV2大流行之前）设置在缅甸仰光综合医院的第三纪神经病中心。参与者定性工作涉及40名研讨会参与者和64名受访者，以探讨包括员工，患者和亲戚在内的各种利益相关者的观点。1个月的回顾性入院快照涵盖了85个手术神经术的入院。结果概述了TBI途径，围绕TBI的管理定义了曾经接纳为神经外科单元的系统边界。回顾性数据显示，死亡率为18％，对家庭的71％出院和11％的转诊率。des用于调查该系统，显示其易于患者人数的小小费，关键点是CT扫描和观察病房的床。叙事访谈，参与式图解和DES代表了国际合作伙伴关系中可交付的一套可能的方法。这个探索模型表明，观察病房床至30的适度扩展将消除流量限制，并指出变化的可能后果。结论可以通过模拟来支持改善资源贫乏环境中TBI护理的系统方法，并通过定性工作来支持，以在相关人员的直接经验中扎根。调查结果可以支持有针对性的改进投资，尽管资源限制并存，同时表明风险随之而来。
语义和几何蛋白
抽象蛋白质工程是合成生物学的关键方面，涉及现有蛋白质序列中氨基酸的修改12，以实现新颖或增强的功能13和物理性能。准确预测蛋白质变异效应需要彻底了解蛋白质序列，结构和功能。深度学习方法在指导蛋白质修饰方面具有出色的性能，可改善16个功能。然而，现有方法主要依赖于蛋白质序列，蛋白质序列在有效地编码氨基酸局部环境的几何方面时面临17个挑战，而18通常在捕获与蛋白质折叠稳定性，内部分子19相互作用和生物功能有关的关键细节方面经常缺乏。此外，在预测蛋白质热稳定性方面的20种方法中缺乏基本评估，尽管它是一种关键的物理特性，在实践中经常研究21种。为了应对这些挑战，本文介绍了一个新颖的22个预训练框架，该框架整合了蛋白质初级23和第三纪结构的顺序和几何编码器。该框架通过24模拟野生型蛋白上的自然选择来指导突变方向，并根据其25个效果来评估变异效应以执行特定功能。我们使用三个基准26评估提出的方法，其中包括300多个深突变扫描测定法。Pytorch 32实现可在https://github.com/tyang816/protssn上获得。33与其他零击28学习方法相比，预测结果在广泛的实验中展示了27个出色的表现，同时又在可训练的参数方面保持最低成本。这项29项研究不仅提出了一个有效的框架，以实现更准确，更全面的30个预测，以促进有效的蛋白质工程，而且还增强了Silico评估中的31系统，以使未来的深度学习模型更好地与经验要求保持一致。
使用MMSEQS2
通过计算工具从参考数据库中检索进化相关的序列（HO-MOLOGS）已经实现了许多生物学的进步（1-4）。在基于序列的蛋白质同源性范式上构建这些工具（5，6），通过搜索类似的氨基酸性序列来检测数百万到数十亿参考条目中输入查询的同源物。在数十年中，同源性搜索对于推断蛋白质特性至关重要（7-9），例如二级结构预测（10），检测蛋白质残基对之间的直接耦合（11）和第三纪结构预测，长期以来对生物学的巨大挑战（12）。特定的远程同源物已被证明是对当代深度学习方法（如Alphafold2等）（13 - 15）（13-15）的输入，以预测准确的结构（16-18）。要检索远程同源物，需要在数据库中查询和参考序列之间检测对成对的相似性的敏感工具。从理论上讲，可以通过应用基于动态编程的，间隙的史密斯 - 水手-GotoH算法（19，20）来找到高灵敏度，以在每个查询参考对准时找到最佳路径（对准）（21）。但是，参考序列数据库的不断增长的大小（17）使这种详尽的方法不切实际。结果，基于启发式的方法，例如BLAST（1），PSI-BLAST（22），MMSEQS2（4）和DIAMOND（3），在执行计算价格昂贵的间隙计算之前，融合了预滤波技术，以修剪大多数不同的序列。这通常是通过采用种子和扩展策略来完成的，其中简短的k-mer单词（“种子”）被索引和匹配，然后将其扩展到间隙比对。敏感的对准器（2）和hhblits（23）都采用了简化的动态编程方法，该方法在序列对之间的对齐矩阵的所有无间隙路径（严格的对角线）中得分，以找到最高得分的未射程匹配。与基于k的方法不同，是较低的比对的较低结合的近似值，无间隙对准会导致所有对以计算效率为代价的分数。探索了几种方法以达到更高的执行速度，无论启发式如何，例如中央处理单元
听觉处理和相关共激活轨道皮质的年代学取决于音乐专业知识
声音处理的年代和横向化对大脑中听觉刺激的处理的理解显着贡献。There is ample evidence that the temporal hierarchy and the interactions between the right- and left-sided auditory pathways significantly determine the circuits between the peripheral to the cortical level ( Tervaniemi and Hugdahl , 2003 ; Eggermont and Moore , 2012 ), pointing out that the left hemisphere is specialized for temporal processing, whereas the right hemisphere subserves processes domiciled in空间/光谱域（Zatorre和Belin，2001; Poeppel，2003; Boemio等人，2005年； Schönwiesner等。，2005年）。人类听觉皮层被细分为具有多个互连的三个主要部分：核心（主要的听觉皮层），皮带（次级听觉皮层）和正确分子区域（Hackett等人（Hackett等），1998; Rauschecker和Scott，2009年），它们从皮质下边缘投影获得皮质输入（Kraus and Nicol，2005； Wong等人。，2007年； Kraus和Chandrasekaran，2010年； Kraus and Anderson，2014年； Kraus等。，2017年）和来自较高认知水平和触发连接的自上而下的预测（Zatorre等人，2007年； Rauschecker和Scott，2009年）。音乐大脑是显示听觉处理的神经可塑性的绝佳模型（Münte等人，2002年； Wan and Schlaug，2010年）。积极的音乐制作涉及众多对感知，认知，行为和大脑活动的神经过程（Hyde等人。，2009年； Moreno等。，2009年； Skoe等。，2015年； Slater等。，2015年； Habibi等。，2018年至青春期（Tierney等人。，2015年）和成年（Pantev等人，1998; Herdener等。，2010年； Benner等。，2017年；詹姆斯等人。，2020）。此外，在了解神经处理与音乐专业知识（指音乐能力和音乐训练）和杰出的听觉技能方面的关系方面获得了宝贵的见解（Zatorre等人。，2007年； Kraus和Chandrasekaran，2010年； Zatorre and Salimpoor，2013年； Kraus and Anderson，2014年； Wengenroth等。，2014年）。发现，在听觉皮层中心的Heschl Gyri（HG）平均比非音乐家的灰质平均多130％（Schneider等人。，2002）。音乐家还具有扩大的听觉诱发响应模式（Schneider等人，2005年； Benner等。，2017年）。可以通过磁脑摄影（MEG）定位于第一HG的中心部分，包括早期中等潜在的P30和随后发生的P50响应模式，发生在刺激后，刺激性30和50 ms。听觉带和偏对区域的随后的次级N1和第三纪P2响应更多地源于第一hg的周围带区域（Schneider等人，2005年）。晚期听觉诱发领域的P1-N1-P2复合物通常与基本声音感知，注意因素，特征识别和
o r i g i n a l r e s a r c h葡萄牙第三中心的真菌性角膜炎的10年回顾性临床分析
目的：确定第三纪转诊中心真菌角膜炎的微生物特征，危险因素，治疗和手术干预率。方法：从2009年至2019年进行了Centro HospitalArtivertáriodeSãoJoão大学对住院的患者的微生物和医疗记录的回顾性回顾。结果：总体而言，我们的研究中包括43名患者。患者的平均年龄为63.7岁，男性为46.5％。在培养物中分离出22（51.2％）丝状真菌和21（48.8％）酵母。 念珠菌物种（n = 20，46.5％），镰刀菌种（n = 10，23.4％）和曲霉物种（n = 4，9.3％）是最常见的分离物种。 重要的危险因素是隐形眼镜使用（n = 24，55.8％），局部皮质类固醇的长期使用者（n = 19，44.2％）和先前的角膜炎（n = 19，44.2％）。 酵母菌株与丝状皮质类固醇的长期使用者相比，长期使用者的统计学意义更高（p = 0.043）。 24例（55.8％）需要手术干预，其中23例接受了治疗性穿透性角膜造成术。 眼并发症，例如12例患者（27.9％）和5例（11.6％）的眼部并发症。 在处理后，没有发现最佳校正视力（BCVA）的统计学上的显着变化（p = 0.687）。 结论：大多数真菌性角膜炎患者都有相关的危险因素。 丝状和酵母菌物种具有同样普遍的病因。 通常，我们的结果反映出真菌性角膜炎的方法和治疗方法可能是多么困难和挑战。在培养物中分离出22（51.2％）丝状真菌和21（48.8％）酵母。念珠菌物种（n = 20，46.5％），镰刀菌种（n = 10，23.4％）和曲霉物种（n = 4，9.3％）是最常见的分离物种。重要的危险因素是隐形眼镜使用（n = 24，55.8％），局部皮质类固醇的长期使用者（n = 19，44.2％）和先前的角膜炎（n = 19，44.2％）。酵母菌株与丝状皮质类固醇的长期使用者相比，长期使用者的统计学意义更高（p = 0.043）。24例（55.8％）需要手术干预，其中23例接受了治疗性穿透性角膜造成术。眼并发症，例如12例患者（27.9％）和5例（11.6％）的眼部并发症。在处理后，没有发现最佳校正视力（BCVA）的统计学上的显着变化（p = 0.687）。结论：大多数真菌性角膜炎患者都有相关的危险因素。丝状和酵母菌物种具有同样普遍的病因。通常，我们的结果反映出真菌性角膜炎的方法和治疗方法可能是多么困难和挑战。关键字：真菌角膜炎，危险因素，医疗疗法，穿透性角膜生成形术，视觉结果
引用Li L，Guo Y，Gong B，Wang S，Wang MM，Sun P，Jiang S和Yang L（2024）三级淋巴结构与临床结果之间的关联
最近，癌症免疫疗法的令人兴奋的进展已引入了癌症治疗的新时代，尤其是在许多实体瘤的治疗领域中（1）。免疫检查点抑制剂（ICI）主要包括抗胞毒性T-淋巴细胞相关蛋白4（CTLA-4）和反编程的细胞死亡1/编程死亡死亡配体（PD-1/PD-L1）（2）（2）。ICI改善了在实体瘤中的患者存活率，例如黑色素瘤，非小细胞肺癌，转移性尿路癌，肝细胞癌，胃癌（3-6）。但是，并非所有癌症患者都受到免疫疗法的好处。例如，只有大约5％的转移性三阴性乳腺癌患者获得了对PD-1/PD-L1阻断的阳性反应（7，8）。因此，对预测免疫疗法反应的相应生物标志物的研究对癌症患者具有很大的意义。 第三级淋巴结构（TLSS）是在慢性炎症和肿瘤发生过程中在非淋巴组织中形成的异位淋巴器官，其中包括B细胞和T细胞（9）。 TLSS中存在的免疫细胞增强了肿瘤抗原的表现，通过细胞因子扩增信号，并激活CD8+ T细胞以靶向和破坏肿瘤细胞（10，11）。 tlss是触发和维持对肿瘤的局部和全身T和B细胞反应的焦点的关键作用。 已经证明了从几种实体瘤鉴定出的 TLSS与ICIS治疗的癌症患者的结局相关（11-19）。 但是，缺乏用于TLSS评估的统一标准。因此，对预测免疫疗法反应的相应生物标志物的研究对癌症患者具有很大的意义。第三级淋巴结构（TLSS）是在慢性炎症和肿瘤发生过程中在非淋巴组织中形成的异位淋巴器官，其中包括B细胞和T细胞（9）。TLSS中存在的免疫细胞增强了肿瘤抗原的表现，通过细胞因子扩增信号，并激活CD8+ T细胞以靶向和破坏肿瘤细胞（10，11）。tlss是触发和维持对肿瘤的局部和全身T和B细胞反应的焦点的关键作用。TLSS与ICIS治疗的癌症患者的结局相关（11-19）。但是，缺乏用于TLSS评估的统一标准。通常，TLSS的存在或较高的密度表明接受ICIS治疗的癌症患者的预后有利（11-16，18）。值得注意的是，一些研究还报告说，在接受ICIS治疗的癌症患者中，例如头部和颈部鳞状细胞癌和结肠直肠癌的TLSS存在与PFS或OS的存在显着相关（20，21）。各种研究都采用了不同的标准，有些研究将TLSS归类为高密度或低密度（22-24），而其他研究则仅使用TLSS的存在或不存在作为评估的基准（23，25）。此外，TLSS成熟度的程度是某些研究中考虑的因素（26）。这些分类方法中的多样性可能会影响与TLSS相关的预后预测能力。因此，有必要进行更新，更全面的荟萃分析，以探讨用ICIS治疗的癌症患者中三级淋巴结构（TLSS）和临床结果之间的关联。这项研究的主要目的是通过分析通过ICIS治疗的癌症患者的第三纪淋巴样结构（TLS）和临床结果之间的关联来探索与免疫疗法相关患者中的预后生物标志物，以研究接受ICIS治疗的癌症患者的预后价值。