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生长阶段特异性基因的转录组谱图...
肝发育和免疫功能的机制。使用加权基因共表达网络分析（WGCNA），我们分析了10天（n = 3），2个月（n = 10），6个月（n = 6）和10个月（n = 10）hanwoo犊牛的肝样品，以鉴定生长阶段的基因模块。我们确定了与免疫反应，代谢过程和细胞外基质组织有关的重要基因表达模式，尤其是在关键发育阶段。这些发现表明，肝功能的动态转移，尤其是早期的免疫调节，这是由于免疫相关的HUB基因DOCK2的参与而强调的，并且随着犊牛成熟而增强了代谢活性。这些结果有助于了解肝脏特异性发育和
CSFα-突触核蛋白种子扩增测定阳性与疾病的关联 UC Riverside 从不同溶剂加工的有机太阳能电池的效率同样高的效率揭示了形态控制的关键因素 2024年诺贝尔生理学或医学奖 通过IFNγ诱导的NRF2还原加剧的神经毒性小胶质细胞激活 科学期刊 无线可编程的，皮肤整合的热... 在多种核酸检测中荧光微球的最新进展 tau纤维诱导纳米级膜损伤，并在溶酶体处核定胞质tau 血清素能抗抑郁药停药的影响... 迷幻和“内部治疗师”：神话或机制？ 解开tau 肠道微生物组的重塑和代谢组谱可改善蛋白质起搏，并进行间歇性禁食与连续热量限制 粘液产生，宿主 - 微生物组相互作用，激素敏感性和先天免疫反应在人宫颈芯片中建模 劳伦斯·伯克利国家实验室 CIS基因调节的系统解码定义上下文... 干细胞分泌组治疗可改善全体代谢，降低肥胖并促进老年小鼠的骨骼肌功能 圣地亚哥UC
注意：对于SAA转换器，在转换时间点之前和之后提供了队列特征（即分别使用CSF 𝛼 -SYN SAA-的最后一个时间点，分别与CSF 𝛼 -SYN SAA +的第一个时间点）。n（％），用于连续变量的中位数（IQR）。在支持信息中，表S1提供了临床和生物标志物数据的数据计数和百分比。缩写：β，淀粉样蛋白β； ADAS-COG11，阿尔茨海默氏病评估量表认知子量表11-项目； Ancova，协方差分析；方差分析，方差分析； apoe，载脂蛋白E； CDR-SB，临床痴呆评级盒子的总和； CSF，脑脊液；铜，认知没有受损； MCI，轻度认知障碍； MMSE，小型国会考试； PACC，临床前阿尔茨海默氏症的认知复合材料； p-tau181，磷酸化的tau181; SAA，种子扩增测定法。皮尔森的卡方测试。b单向方差分析。c Fisher精确测试。d Ancova针对年龄，性别，教育，诊断和APOE进行了调整。e Ancova针对年龄，性别，教育，APOE，诊断和CSFAβ42状态进行了调整。f逻辑回归针对年龄，性别，教育，诊断和APOE进行了调整。g配对t检验：所有连续变量； McNemar测试：所有二进制变量；配对标志测试：诊断。
UC Riverside 从不同溶剂加工的有机太阳能电池的效率同样高的效率揭示了形态控制的关键因素 2024年诺贝尔生理学或医学奖 通过IFNγ诱导的NRF2还原加剧的神经毒性小胶质细胞激活 科学期刊 无线可编程的，皮肤整合的热... 在多种核酸检测中荧光微球的最新进展 tau纤维诱导纳米级膜损伤，并在溶酶体处核定胞质tau 血清素能抗抑郁药停药的影响... 迷幻和“内部治疗师”：神话或机制？ 解开tau 肠道微生物组的重塑和代谢组谱可改善蛋白质起搏，并进行间歇性禁食与连续热量限制 粘液产生，宿主 - 微生物组相互作用，激素敏感性和先天免疫反应在人宫颈芯片中建模 劳伦斯·伯克利国家实验室 CIS基因调节的系统解码定义上下文... 干细胞分泌组治疗可改善全体代谢，降低肥胖并促进老年小鼠的骨骼肌功能 圣地亚哥UC
有机太阳能电池（OSC）的功率转化效率超过20％，这是形态优化起着重要作用的进步。普遍认为，加工溶剂（或溶剂混合物）可以帮助优化形态，从而影响OSC效率。在这里，我们开发了对一系列加工溶剂的强大耐受性的OSC，所有设备的高功率转换效率均约为19％。通过研究溶液状态，膜的形成动力学以及经过实验和计算的处理膜的特征，我们确定控制形态的关键因素，即受体材料的侧链与溶剂链的侧链以及供体和受体材料之间的相互作用之间的相互作用。我们的工作为形态控制的长期问题和有效指南提供了新的理解，以将OSC材料设计用于实用应用，在这种应用中，大规模加工需要绿色溶剂。
Scooby：在单细胞分辨率下从DNA序列中对多模式基因组谱进行建模
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年9月23日。 https://doi.org/10.1101/2024.09.19.19.613754 doi：Biorxiv Preprint
自闭症和自闭症特征的尿液代谢组谱 - 一项双胞胎研究
目前，自闭症诊断没有可靠的生物标志物。自闭症的异质性和几个共同存在的条件是建立这些疾病的关键挑战。在这里，我们使用了基于质谱的未靶向尿液代谢组学来研究自闭症诊断的代谢差异和自闭症的双胞胎队列中的自闭症特征（n = 105）。我们在双胞胎的尿液样本中鉴定了208个代谢产物。在控制其他神经脱发状况时，未检测到自闭症诊断的明确代谢驱动因素。但是，我们确定了几种代谢产物的名义重大变化。例如，在自闭症组中，苯基丙酮酸（P = 0.019）和牛磺酸（P = 0.032）升高，而肉碱（P = 0.047）降低。我们还解释了共享因素，例如双对中的遗传学，并报告其他代谢物差异。基于自闭症诊断的名义显着代谢产物，富含九种和脯氨酸代谢途径（p = 0.024）。通过社会响应量表第二版和代谢物差异衡量，我们还研究了定量自闭症性状之间的关联，并确定了更多名义上有特殊的代谢物和途径。在双对中观察到吲哚-3-actate和自闭症性状之间的显着正相关（调整后的P = 0.031）。因此，尿液生物标志物在自闭症中的效用尚不清楚，来自不同研究人群的混合发现。
代谢组谱图揭示了不同茶品种质量的组成差异
抽象茶厂在生物活性化合物中丰富，包括类黄酮，氨基酸，生物碱，萜类化合物和脂质，这些主要影响茶质量和口味。尽管有许多关于不同茶品种的代谢产物的研究，但其生物合成和调节的组成差异仍然是未知的。在这项研究中，使用靶向的代谢组学广泛的代谢组学，包括192个黄酮和28 neminds和28 amino，从根尖的芽中检测到505种代谢产物（'shuchazao'：'scz'：'scz'：'scz'：'huangkui'：'hk'和'hk'和'zijuan'：'zj'：'zj'。代谢产物分析表明，黄酮醇和花色苷主要以三种品种的糖苷形式分布，其中花青素及其糖苷主要在“ ZJ”中积累，表明与颜色属性有相关性。EGCG成为三种品种中最丰富的Flavan-3-ols化合物。l-茶氨酸代表主要的游离氨基酸，与1叶相比，主要集中在顶端芽中，但同样，脂质与游离氨基酸相似，主要是在三个品种的顶端芽中积聚。这些发现为遗传和代谢物多样性提供了宝贵的见解，从而增强了我们对茶叶特定代谢物的生物合成的理解。
无标签的定量热蛋白质组谱分析揭示了目标转录因子，其活动由MC3R信号调节
摘要：使用离子动力增强的LC-MS提供无标记定量的热蛋白质组分析，提供了多功能数据集，提供有关蛋白质差异表达，热稳定性和转录因子活性的信息。我们开发了一种多维数据分析工作流程，用于无标记的定量热蛋白质组分析（TPP）实验，该实验结合了基因集富集分析的各个方面，差异蛋白蛋白表达分析以及从LC- MS数据中推断转录因子活性的推断。我们将其应用于黑色素质素3受体（MC3R）激活的信号传导过程，这些激动剂源自促蛋白酶素皮质素激素：ACTH，α -MSH和γ -MSH。获得的信息用于绘制MC3R下游的信号通路，并推断出负责配体治疗的细胞反应的转录因子。使用我们的工作流程，我们确定了差异表达的蛋白质并研究了它们的热稳定性。我们在总共298个蛋白质中发现了由MC3R激活导致的热稳定性改变的蛋白质。在这些中，几种蛋白质是转录因子，表明它们是参与MC3R信号级联的下游目标调节剂。我们发现转录因子CCAR2，DDX21，HMGB2，SRSF7和TET2的热稳定性改变了。MC3R信号级联中的这些明显的目标转录因子在免疫反应中起着重要作用。此外，我们推断了数据集中确定的转录因子的活动。这种综合方法生成复杂这是使用贝叶斯统计数据使用我们使用无标签定量LC-MS获得的差异表达数据完成的。通过我们观察到的磷酸化肽丰度，在我们的生物学管道中验证了推断的转录因子活性，这突出了转录因子调节中翻译后修饰的重要性。我们的多维数据分析工作流程允许对MC3R激活下游的信号过程进行全面表征。它提供了有关蛋白质差异表达，热稳定性和关键转录因子活性的见解。本研究中生成的所有蛋白质组学数据均可在DOI上公开获取：10.6019/pxd039945。■引入蛋白质 - 配体相互作用在几乎所有生物过程中都起着至关重要的作用，这使得他们的研究对于不足的细胞功能和发展疗法至关重要。已经开发了许多方法来表征这些相互作用，通常集中于配体亲和力。然而，随访蛋白 - 配体相互作用与其下游效应（包括跨文字组，蛋白质组学和翻译后修饰（PTM）变化）非常重要。热蛋白质组分析（TPP）已成为一种有价值的技术，可以深入了解蛋白质功能，蛋白质 - 蛋白质相互作用，甚至预测与生理相关环境中的不良药物影响。1，2 TPP基于蛋白质 - 配体相互作用的内在特性，例如，当配体结合稳定蛋白质结构并因此增加了其熔化温度时。1，2详细使用，TPP采用了多步方法，包括配体处理，加热，提取，纯化，消化和LC -MS分析。