转化模型确定了纳米粒子递送的 miRNA-22 与三阴性乳腺癌标准治疗药物之间的协同作用 Prashant Dogra,1,2 Javier Ruiz Ramírez,1 Joseph D. Butner,1 Maria J. Peláez,1 Caroline Chung,3 Anupama Hooda-Nehra,4,5 Renata Pasqualini,4,6 Wadih Arap,4,5 Vittorio Cristini,1,7,8 George A. Calin,9 Bulent Ozpolat,10 Zhihui Wang 1,2,7,* 1 休斯顿卫理公会研究所医学数学项目,美国德克萨斯州休斯顿 77030;2 威尔康奈尔医学院生理学和生物物理学系,美国纽约州纽约 10065; 3 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心放射肿瘤学系,美国德克萨斯州休斯顿 77030;4 新泽西州罗格斯癌症研究所,美国新泽西州纽瓦克 07101;5 罗格斯新泽西医学院医学系、血液学/肿瘤学分部,美国新泽西州纽瓦克 07103;6 罗格斯新泽西医学院癌症生物学分部放射肿瘤学系,美国新泽西州纽瓦克 07103;7 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心成像物理学系,美国德克萨斯州休斯顿 77230;8 威尔康奈尔医学院医学科学研究生院生理学、生物物理学和系统生物学项目,美国纽约州纽约 10065;
每个器官有两个相邻的容器模型,容器之间由毛细管(壁)膜隔开。这是一个集中系统模型,不考虑膜以外的质量传递阻力。该模型的第一个改进是克罗格圆柱体。[4] 毛细血管簇形成毛细管网络。研究人员使用细胞模型,将单位或细胞(在本例中为毛细管)与集合隔离开来。克罗格圆柱体 [4] 表示细胞和分布式系统,可提供更多信息,例如溶质渗透到血管外组织的程度。鉴于克罗格绘制的包括毛细血管在内的血管草图[4],他只能使用圆柱形模型(如图1所示)。此后,出现了其他更像网络的草图,但克罗格圆柱体仍可用作细胞。值得注意的是,在流经填料床时,Happel 的细胞模型 [5 ] 对于组成填料床的每个球体都非常适用,适用于整个系统。Pfeffer 将这种流体流动模型扩展到质量传递。[6 ] 与 Happel 的模型 [4 ] 类似,其中添加单元来表示填料床,假设 Krogh 圆柱体平行添加以组成器官。Brinkman 方程用于求解血管外组织中的流动。由于这些方程的线性,因此可以获得解析解,从而避免使用数值方法求解它们,因为这些方程非常僵硬。[7 ] 比率 ffiffiffi kp = L 非常小,其中 k 是血管外组织的渗透率,L 是毛细管的长度。已有许多关于 Krogh 圆柱体中的质量传递研究报告。 [8-14]然而,研究人员几乎从未考虑过血管外组织中流动的影响,也从未考虑过流场和浓度场的二维性。此前,我们曾考虑过 Krogh 圆柱中的流动,[7]其中血管外组织中的流动使用 Brinkman 方程建模,该方程允许流线弯曲和/或流动在横向具有空间变化。然而,我们几乎没有发现任何流动从小动脉末端离开毛细血管,又从小静脉末端返回,就像 Guyton 和 Hall 所建议的那样。[15]原因是图 1 中的血浆有两条平行的路径
• 尼古拉耶夫和敖德萨两市继续遭到轰炸; • 在克里沃罗格以南,乌克兰军队遏制了俄罗斯装置并发起反击。 • 俄罗斯军队继续加强在赫尔松和扎波罗热地区的阵地
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• 学生成功要素:https://success.rutgers.edu • 学生支持服务:https://www.rutgers.edu/academics/student-support • 学习中心:https://rlc.rutgers.edu/ • 罗格斯大学图书馆:https://www.libraries.rutgers.edu/ • 偏见事件报告:https://studentaffairs.rutgers.edu/bias-incident-reporting • 学生主任 – 学生支持办公室:https://success.rutgers.edu/resource/dean-students- student-support-office • 退伍军人和军事计划和服务办公室:https://veterans.rutgers.edu • 学生健康服务:http://health.rutgers.edu/ • 咨询、酒精和其他药物援助计划和精神病服务 (CAPS):http://health.rutgers.edu/medical-counseling-services/counseling/ • UWill:免费立即获得远程治疗;你可以根据自己的喜好选择治疗师,包括问题、性别、语言、种族。http://health.rutgers.edu/uwill/ • 暴力预防和受害者援助办公室:www.vpva.rutgers.edu/ • 残疾人服务办公室:https://ods.rutgers.edu/ • 基本需求援助(食物、住房和其他必需品):https://ruoffcampus.rutgers.edu/basic-needs • 罗格斯学生食品储藏室:https://ruoffcampus.rutgers.edu/food-pantry
1 南加州大学凯克医学院人口与公共卫生科学系,美国加利福尼亚州洛杉矶 90032;sg_196@usc.edu(SG);ksloan@usc.edu(KS);emilydan@usc.edu(ED);corellan@usc.edu(COG);baezcond@usc.edu(LB-G.)2 华盛顿大学护理学院儿童、家庭和人口健康护理系,美国华盛顿州西雅图 98195;mbyshin@uw.edu 3 南加州大学诺里斯综合癌症中心,美国加利福尼亚州洛杉矶 90033 4 南加州大学南加州大学苏珊·德沃拉克-佩克社会工作学院,美国加利福尼亚州洛杉矶 90089; palinkas@usc.edu 5 罗格斯大学罗伯特伍德约翰逊医学院,美国新泽西州新不伦瑞克 08901;crabtrbf@rwjms.rutgers.edu 6 新泽西州罗格斯癌症研究所,美国新泽西州新不伦瑞克 08901 * 通讯地址:tsuijenn@usc.edu;电话:+1-323-865-3744
1 罗格斯大学系统与计算生物学中心,罗格斯癌症研究所;195 Albany St.,新泽西新不伦瑞克 08901 2 罗格斯大学先进生物技术与医学中心;679 Hoes Lane West,皮斯卡塔韦,新泽西州 08854 *通讯作者。电子邮件:bassel.ghaddar@gmail.com 摘要 围绕癌症微生物组的最新争议凸显了改进人类基因组数据微生物分析方法的必要性。我们开发了 PRISM,一种用于精确识别微生物和从低生物量测序数据中净化的计算方法。PRISM 可消除杂散信号,并在对 62,006 个已知真阳性和假阳性分类群的精选数据集进行基准测试时获得出色的性能。然后,我们使用 PRISM 从 CPTAC 和 TCGA 数据集中检测 8 种癌症类型中的微生物。我们在 CPTAC 中鉴定出胃肠道肿瘤中丰富的微生物组,并在胰腺肿瘤亚群中鉴定出与改变的糖蛋白质组、更广泛的吸烟史和更高的肿瘤复发风险相关的细菌。我们发现其他癌症类型和 TCGA 中的微生物相对稀疏,我们证明这可能反映了不同的测序参数。总体而言,PRISM 并不能取代黄金标准对照,但它可以实现更高置信度的分析,并揭示具有潜在分子和临床意义的肿瘤相关微生物。简介
