多态毒素是细菌战争的武器,用于限制竞争对手、帮助亲属选择和塑造细菌群落。多态毒素系统 (PTS) 在革兰氏阴性细菌中得到了充分研究,但对革兰氏阳性细菌的研究有限。在枯草芽孢杆菌中,已报道了几种毒素免疫蛋白对,包括 YeeF-YezG、YobL-Y、obK YxiD- YxxD。很少有研究描述这些毒素-免疫对的结构/机制细节。这种毒素需要 VII 型分泌系统。我们已经证明 YeeF 的 C 端结构域 (YeeF-CT) 含有具有 DNase 活性的毒素。YeeF-CT 的表达会导致大肠杆菌的生长缺陷并导致形态变化。而毒素-免疫对的共表达可恢复正常的细菌生长。在这里,我们报告了 YeeF-CT 与其同源抗毒素 YezG 结合的晶体结构,分辨率为 2.1 Å。晶体结构表明,毒素 (YeeF-CT) 在与其同源免疫蛋白 (YezG) 结合后会发生重大构象变化。比较结构分析表明,毒素的六个 β 片层(核酸酶活性所必需的)在与免疫蛋白结合后被撕裂成两个子域。这种机制不同于其他 II 型毒素-抗毒素系统,其中抗毒素的内在无序区域与毒素的活性位点结合,从而在空间上阻断其底物的结合。我们目前正在研究这种毒素-免疫蛋白对的结构指导详细表征。
构建进化的细菌底盘通常依赖于功能蛋白的定向进化。1 进化的蛋白质替代宿主中的天然对应物,从而形成具有特定表型的进化细菌底盘,2 例如大肠杆菌中进化的RpsE和酵母中的PfDHFR分别赋予壮观霉素抗性 3 和乙胺嘧啶抗性 4。然而,外源DNA的替代会影响宿主的安全性,这限制了宿主在某些领域的应用,特别是在食品工业中。因此,期望宿主自身的蛋白质得到进化。蛋白质定向进化的技术框架已经从体外发展到体内。5 – 7 定向进化的典型策略是随机诱变、半理性设计和理性设计。它们都严重依赖于从基因克隆、体外诱变、异源或整合的几个迭代步骤的过程
letctin是一个哺乳动物聚糖结合蛋白的家族,与众多细胞过程的调节剂有关,包括细胞迁移,凋亡和免疫调节。该家族的几个成员,例如Galectin-1,表现出细胞表面和细胞内功能。有趣的是,lectectin-1可以在内膜系统,核或细胞质以及细胞表面中找到。对细胞隔室之间的半流量运输(包括其非常规分泌和内在化过程)的机制知之甚少。在这里,我们确定了外源乳糖素1进入细胞的途径,并探索了其作为蛋白质和siRNA疗法的递送载体的能力。我们使用了以抗体 - 药物缀合物为模型的Galectin-1-Toxin结合物作为全基因组CRISPR筛查中的选择工具。我们发现Galectin-1以聚糖依赖性的方式与内体 - 溶酶体运输受体Tortilin相互作用,从而调节Galectin-1运输到溶酶体。此外,我们表明可以利用该途径来传递功能性siRNA。这项研究阐明了lectectin-1被细胞内在化的机制,并提出了通过lectectin-1偶联的细胞内药物递送的新策略。
Callogenesofene是用于体外次生代谢产生和间接器官发生的最强大的生物技术方法之一。可以通过应用机器学习(ML)和优化算法的组合来获得对呼应和优化方案的全面知识。在当前的研究中,p的call灭响应(即call灭率和愈伤组织新鲜重量)。caerule。使用多层感知器(MLP)。此外,将开发的模型集成到遗传算法(GA)中,以优化PGRS和Explant类型的浓度,以最大程度地提高卡尔生成反应。此外,进行了敏感性分析,以评估每个输入变量对卡尔生成响应的重要性。结果表明,在训练和测试集中,MLP具有高预测精度(R 2> 0.81),用于建模所有研究参数。基于优化过程的结果,将从补充有0.52 mg/l IBA的培养基中培养的叶植物中获得最高的卡生成率(100%),加上0.43 mg/l NAA,加上1.4 mg/l 2,4-D 2,4-D Plus 0.2 mg/l bap。敏感性分析的结果表明,PGRS外源应用对call菌的外源性的影响。gentally,结果表明,MLP和GA的组合可以显示出具有前瞻性的辅助工具,以优化和预测体外培养系统,并因此应对巴西列拉组织培养中目前面临的几个挑战。
炭疽菌是一种革兰氏阳性细菌,可能导致包括人类在内的野生和家庭伴侣之间的危害威胁性疾病(1)。B.炭疽病可以形成孢子,在不利条件下实现长期生存。先前已经报道了从储存到60年的土壤中分离植物的息肉。 由于其致病性特征,炭疽芽孢杆菌被认为是用于进行生物果或生物恐怖主义的最严重和威胁性的药物之一(3,4)。 In our previous study, 3 of 24 soil samples collect- ed from a World War II (WWII) site in northeastern China (Appendix Figure 1; https://wwwnc.cdc.gov/ EID/article/30/12/23-1520-App1.pdf) tested positive for B. anthracis using RPA/CRISPR-Cas12a, real-time PCR, and metagenomic analysis ( 5 )。 值得注意的是,这些阳性样品是从731单元(45°36′55.940'n,126°38′33.738'e)的位点获得的,这是日本军队经营的前bacteria实验室(5)。 我们从距离第二次世界大战实验室遗迹的0.5 km,3 km和5 km内的12个收集地点中收集了24个样品(附录图2)。 但是,我们在新收集的样品中没有检测到炭疽芽孢杆菌的痕迹,这意味着我们以前发现的阳性样品可能不是源自局部自然来源。 Using polymyxin B-lysozyme-EDTA-thallous ac- etate agar and API 50CHB-API 50CH biochemical re- agents (BioMérieux, https://www.biomerieux.com), we successfully isolated and identified a B. anthracis strain (named BA20200413YY) from one of the soil samples. 形态学,溶血和生化先前已经报道了从储存到60年的土壤中分离植物的息肉。由于其致病性特征,炭疽芽孢杆菌被认为是用于进行生物果或生物恐怖主义的最严重和威胁性的药物之一(3,4)。In our previous study, 3 of 24 soil samples collect- ed from a World War II (WWII) site in northeastern China (Appendix Figure 1; https://wwwnc.cdc.gov/ EID/article/30/12/23-1520-App1.pdf) tested positive for B. anthracis using RPA/CRISPR-Cas12a, real-time PCR, and metagenomic analysis ( 5 )。值得注意的是,这些阳性样品是从731单元(45°36′55.940'n,126°38′33.738'e)的位点获得的,这是日本军队经营的前bacteria实验室(5)。我们从距离第二次世界大战实验室遗迹的0.5 km,3 km和5 km内的12个收集地点中收集了24个样品(附录图2)。但是,我们在新收集的样品中没有检测到炭疽芽孢杆菌的痕迹,这意味着我们以前发现的阳性样品可能不是源自局部自然来源。Using polymyxin B-lysozyme-EDTA-thallous ac- etate agar and API 50CHB-API 50CH biochemical re- agents (BioMérieux, https://www.biomerieux.com), we successfully isolated and identified a B. anthracis strain (named BA20200413YY) from one of the soil samples.形态学,溶血和生化
广泛的害虫,主要是鳞翅目(毛毛虫),双翅目(蚊子和黑蝇)和鞘翅目(甲虫幼虫)(Sanchis 2011)。bt的特征是在孢子形成过程中生产,内毒素蛋白(称为哭泣的蛋白),这些蛋白会积聚并形成晶体包含体。昆虫必须消耗/摄取这些哭泣的蛋白质,才能感受到其作用,直到昆虫死亡。在摄入后,昆虫中肠内的碱性条件会导致晶体的溶解化,从而将其转化为有毒的核心碎片(Sansinenea 2019)。这些有毒蛋白与位于昆虫中肠上皮细胞上的受体(糖蛋白或糖蛋白)结合(Bravo等人2011)。结合后,毒素会改变其构象,从而使其插入细胞膜并形成阳离子选择通道(Bravo等。2013)。当形成足够的这些通道时,几个阳离子进入了细胞。这会导致细胞内部的渗透不平衡,从而导致中肠上皮完整性的丧失。这使碱性肠道果汁和细菌可以通过中肠地下膜,杀死昆虫。当用作喷雾剂时,这些毒素无效地防止昆虫攻击植物的根或植物的内部部分(Sanahuja等人。2011)。这些局限性引发了人们对开发新的遗传修饰植物和细菌表达哭泣和其他BT-杀虫基因的兴趣,以便提供更有效的毒素递送系统来控制这些昆虫(Azizoglu和Karabörklü2021)。2021; Lazarte等。在生物技术技术(例如基因工程)中的持续进展,具有计算生物学的能力,导致了有关BT的发展和发现。在这种情况下,全球各个研究小组对寻找具有新的抑制活性范围和高水平的毒性毒素的新型哭泣毒素非常感兴趣,这是针对虫害的一种替代品,这种毒性毒性具有更高的抗药性水平(Hou等人 2019; Crickmore等。 2021)。 结果,使用术基因组数据,遗传修饰(GM)微生物的发展的持续菌株改善正在成为不可避免的能够实现非本地基因表达和改善本机生产国以发展遗传学改善菌株的工具包(Liu等人(Liu等)(Liu等人。 2017; Azizoglu等。 2020)。 今天的新一代方法,例如模拟和动态研究,2019; Crickmore等。2021)。结果,使用术基因组数据,遗传修饰(GM)微生物的发展的持续菌株改善正在成为不可避免的能够实现非本地基因表达和改善本机生产国以发展遗传学改善菌株的工具包(Liu等人(Liu等)(Liu等人。2017; Azizoglu等。2020)。今天的新一代方法,例如模拟和动态研究,
药物治疗类别:止泻微生物 Enterogermina ® 是一种制剂,由 4 种克劳氏芽孢杆菌孢子菌株(SIN、O/C、T、N/R)的悬浮液组成,这些菌株天然存在于肠道中,无致病性。口服时,克劳氏芽孢杆菌孢子由于对化学和物理因素具有很强的抵抗力,可穿过酸性胃液屏障,毫发无损地到达肠道,在那里转化为具有代谢活性的营养细胞。孢子天生就能在高温和胃酸中存活。在体外验证模型中,克劳氏芽孢杆菌孢子可在模拟胃环境(pH 1.4-1.5)中存活长达 120 分钟(存活率为 96%)。在模拟肠道环境(胆汁和胰酶盐水 - pH 8)的模型中,克劳氏芽孢杆菌孢子表现出进一步繁殖的能力
在自然界中越来越多的抗生素抗性菌株选择,寻找替代性抗菌策略的搜索变得越来越重要。肠球菌CUS粪cv167是本公告中突出的菌株,已经证明了对各种病原体的体外活性,包括金黄色葡萄球菌,表皮球菌,apisterpococcus agalactiae,链球菌,链球菌Uberis uberis uberis,coliica coli coli coli coli coli,使用斑点测定法(1)的抑制活性结果如图1。该细菌是从2022年2月在巴西米纳斯Gerais的Coronel Xavier Chaves的牛奶罐中存储在散装牛奶箱中的原始牛奶样品中分离出来的。用于细菌分离,将1 ml等分试样的牛奶样品串联在磷酸盐缓冲溶液(pH 6.2; Merck,德国)中串联稀释(10°至10°),并将100 µL铺在M17琼脂(美国Sigma-Aldrich,USA)上。在35°C下孵育48小时后,将分离的细菌菌落条纹划分到新鲜的M17琼脂上以进行纯化。分离株指定的CV167被识别为无氧化氢酶活性的革兰氏阳性球菌。然后使用苯酚 - 氯仿法提取细菌的DNA(2)。使用Nanodrop 1000 UV/VIS(Thermo Scientific,Massachusetts,EUA)评估了DNA数量和质量,并使用Illumina DNA Prep套件制备了测序文库。使用Illumina NextSeq 2000平台上的300 bp配对末端测序对DNA进行了测序,从而产生了1,169倍的序列深度。修剪过程导致仅删除1.37%的读数。确认fastQC 0.12.1(3)最初用于评估测序数据的质量,该质量总共产生了11,863,824读。这些读取使用三型0.39(4)进行修剪,并具有以下参数:尾随:10;领导:10;滑动窗口:4:20;最小长度为50 bp。使用黑桃3.15.4(5)进行简短读数的从头组装,将覆盖范围参数设置为“自动”,而K-Mers则将21、33、55、77、99和127。较短的重叠群从最终组装中排除了500 bp。使用Quast 5.2.0(6)评估组装质量。总共产生了61个重叠群,合并长度为2,736,418 bp,鸟嘌呤 - 环氨酸(GC)含量为37.93%,N50的N50为156,530。基因组完整性,揭示了杆菌类的完整性99.3%。
演讲者传记Nancy M. Allen Lapointe是杜克大学医学的兼职副教授,也是杜克 - 马尔戈利斯卫生政策中心的教职员工。她是一名研究人员和心血管临床药剂师,在健康成果研究,健康服务研究,证据综合,药物管理和保护人类研究对象方面拥有丰富的经验。她的临床和研究工作一直集中在患者安全上,主要是心血管疾病患者。这包括减少药物错误,改善药物依从性,安全有效地将证据转化为临床实践,比较治疗疗法的安全性和有效性,评估风险交流和缓解策略的有效性以及探索健康政策与患者安全之间的接口。在与杜克 - 马尔戈利斯(Duke-Margolis)合作之前,她曾是杜克大学医学副教授和杜克临床研究所的医学副教授,杜克大学杰出研究中心研究中心计划主任,杜克大学卫生系统IRB主席,杜克大学卫生系统的计划主任,杜克大学教育和研究中心的杜克大学卫生系统主管,杜克大学教育和研究中心的专业研究和分析中心,杜克大学的主要研究和杜克大学的杜克大学。她还是UNC药学院的临床副教授,坎贝尔大学药学院和健康科学学院的药学实践兼职教授。然后,她收到了MHS,重点是杜克大学的比较有效性研究。艾伦·拉普罗特(Allen Lapointe)博士在普渡大学(Purdue University)获得了药学学士学位和药学博士学位,并在杜克大学医学中心(Duce University Center),药学系获得了药学居住地,并在心脏病学系的杜克大学医学中心(Duke University Medical Center)的心脏病学临床药学奖学金中获得了临床药学奖学金。