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World File Search System菅义伟
使用 CRISPR 阵列分离器增强 Cas12a 多基因调控
图 1. crRNA 性能受上游间隔物的 GC 含量影响 (A) CRISPR-Cas12a 操纵子由 Cas 基因和一个 CRISPR 阵列组成。(B) 每个 crRNA 由一个重复序列和一个间隔物组成。预处理重复序列包含一个 ~16-18-nt 片段，此处称为 CRISPR 分隔符，该片段由 Cas12a 和一种未知酶切除。(C) 在哺乳动物细胞中表达 Cas12a 阵列时，之前已省略了分隔符。我们想了解分隔符是否有助于使 crRNA 免受间隔物中二级结构的负面影响。(D) 我们设计了由两个 crRNA 组成的 CRISPR 阵列，第一个具有非靶向无义间隔物，第二个靶向 GFP 启动子，该启动子在 HEK293T 细胞中基因组整合。(E) 实验设置；分析 GFP 荧光作为阵列性能的衡量标准。 (F) CRISPR 阵列可以显示出对无义间隔物的组成的超敏感性。在极端情况下，将最后一个核苷酸从 T 替换为 G 可能导致 GFP 激活几乎完全终止。(G) 51 个 CRISPR 阵列的文库，其中第一个 crRNA 包含一个具有不同 GC 含量的无义间隔物，第二个 crRNA 靶向 GFP。无义间隔物的 GC 含量与 GFP 荧光之间存在强烈的负相关性。每个点代表 51 个 CRISPR 阵列中的一个（三个重复）。根据阵列启用的 GFP 荧光水平将阵列分为三组。框表示在 I 和 J 中分析的两组。(HJ) 对于每个组，计算了滑动 5-nt 窗口的平均 GC 含量。性能最佳的阵列是无义间隔物在其 3' 端恰好具有低 GC 含量的阵列。一些阵列因其无义间隔物的 GC 含量 ( G ) 而显示出意外的高或低 GFP 活性。这些阵列在其无义间隔物的 3' 端含有低 ( I ) 或高 ( J ) GC 含量，这表明最后几个碱基的 GC 含量是阵列性能的重要预测因素。HJ 中的阴影区域表示标准误差。( K ) 了解无义 crRNA 中 3-nt 区域 GC 含量的预测能力 (方法)。( L ) 显示预测的二级结构 (-Δ(最小自由能)) 和 51 个无义间隔物的 GC 含量之间关系的图。
从小分子到基于核酸的方法
摘要：无义突变是一种基因突变，会产生过早终止密码子 (PTC)，导致蛋白质被截断和有缺陷，引发囊性纤维化、1 型神经纤维瘤病、Dravet 综合征、Hurler 综合征、β 地中海贫血、遗传性骨髓衰竭综合征、杜氏肌营养不良症，甚至癌症等疾病。这些突变还会触发一种称为无义介导的 mRNA 衰减 (NMD) 的细胞监视机制，从而降解含有 PTC 的 mRNA。NMD 的激活可以减轻细胞中蛋白质被截断、有缺陷和可能有毒的后果。由于大约 20% 的单点突变都是致病的无义突变，因此该领域受到广泛关注，并在近年来取得了显著进展，这并不奇怪。事实上，自从我们上次对该主题进行审查以来，已经有新的无义抑制方法的例子被报道出来，即促进 PTC 翻译读通或抑制 NMD 通路的新方法。通过这篇审查，我们更新了无义抑制领域的最新技术，重点关注具有治疗潜力的新型方式，例如小分子（读通剂、NMD 抑制剂和分子胶降解剂）；反义寡核苷酸；tRNA 抑制剂；ADAR 介导的 RNA 编辑；靶向假尿苷化；和基因/碱基编辑。虽然自上次审查以来，这些不同的方式在其开发阶段都取得了显着进展，但每种方式都有优点（例如，易于递送和特异性）和缺点（制造复杂性和脱靶效应潜力），我们在此讨论。
语言概念的视觉类比及其含义
摘要 许多视觉生成人工智能 (AI) 模型使用文本“提示”作为输入来指导生成图像的开发。将文本转换为图像利用了语用学和语义学，这会对输出产生影响。为了促进更精确的提示，我们提出了文本相似性的三维向量空间，它使用文本表示、听觉表示和含义相似性作为轴。接下来，我们表明两个单词之间含义相似并不一定会导致相应的 AI 生成的这些单词图像之间视觉相似。我们利用八个图像生成器为抽象和具体的同义词、反义词和上义词-下义词对生成图像，并将它们的图像-图像 CLIPScore 与它们对应的文本-文本 CLIPScore 进行比较，从而定量地证明了这一点。在所有模型和关系类型中，文本与文本和图像与图像相似度的平均相似度同义词从 92.8% 下降到 70.1%，反义词从 89% 下降到 58.9%，上义词-下义词对的平均相似度从 85.6% 下降到 68.1%。
人工感觉记忆 | DR-NTU
DOI：10.1002/（（请添加稿件编号）） 文章类型：评论 人工感觉记忆 万昌金、蔡平强、王明、钱燕、黄伟*、陈晓东* 万昌金博士、蔡平博士、王明博士、陈晓东教授 柔性设备创新中心（iFLEX）、马克斯普朗克 - NTU 人工感官联合实验室、南洋理工大学材料科学与工程学院，新加坡南洋大道 50 号，639798 电子邮件：chenxd@ntu.edu.sg 钱英教授、黄伟教授 有机电子与信息显示重点实验室和先进材料研究所、南京邮电大学江苏省国家先进材料协同创新中心（SICAM），南京市文源路 9 号，210023，中国 黄伟教授 西北工业大学陕西柔性电子研究所，西安， 710072 中国 电子邮件: iamwhuang@nwpu.edu.cn 摘要
视觉眼假体及其未来发展之路
自从 20 世纪 60 年代针对先天性或后天性眼部缺陷患者以及眼球痨或凹陷无功能性眼球患者引入以来，义眼一直是一种流行的康复方式。制造定制义眼的材料、技术和工艺方面的各种进步（包括使用植入物、磁性扩张瞳孔等）旨在满足患者的期望和提高生活质量。然而，在使用传统或改良的义眼时，功能仍然是一个挑战。用于治疗视力不佳或完全丧失的眼科患者的治疗方法包括视网膜假体，如仿生眼、杜雷特植入物，它们是恢复视觉通路中断情况下部分视力的有前途的替代方案。光遗传学、光伏刺激、基因疗法等生物医学工程概念有可能彻底改变治疗方式，以恢复此类患者的形态、美观和功能。
针对 DHODH（嘧啶从头生物合成中的限速酶）的新型强效抑制剂，可广谱抗 RNA 病毒，包括新出现的冠状病毒 SARS-CoV-2
熊瑞 2, † , 张雷克 3, † , 李世良 2, † , 孙元 3 , 丁敏一 2 , 王勇 1 , 赵永亮 1 , 吴艳 3 , 尚伟娟 3 , 蒋夏明 3 , 单继伟 2 , 沉子豪 2 , 童一 2 , 徐柳新 2 , 陈宇 1 , 英乐刘 1 , 邹刚 4 , Dimitri Lavillete 4 , 赵振江 2 , 王锐 2 , 朱丽丽 2 , 肖耕夫 3 , 兰柯 1 , 李洪林 2,* , 徐克 1,4,* 1 武汉大学生命科学学院病毒学国家重点实验室,
香港迈向净零排放电力系统的途径
• 蔡志强，电能实业 • 谢志云，香港特别行政区政府环境局 • 马雅燕，香港浸会大学 • 戴维斯·博克，香港科技大学 • 陈德博，中国水资源研究所 • 周文忠，香港生产力促进局 • 罗范椒芬 • 伊莎贝尔·卡雷拉·扎马尼洛，斯坦福大学地球能源与环境科学学院 • Jim Taylor、Jeanne Ng、吕志和，中华电力香港有限公司 • 许志凯，新加坡国家发展部宜居城市中心 • Lisa Genasci，ADM 资本基金会 • 邝伟，陈家俊，香港中华煤气有限公司 • 方伟，顾宇，阳光电源股份有限公司 • 梁曦，中英（广东）CCUS 中心 • 杨晓亮，中国油气气候投资公司 • 徐远，香港中文大学 • 苏兆龙、刘慧、张文（实习生）、田中美（实习生）、Justine萧伟强 (实习生)