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World File Search System菌门
卵菌门致病疫霉菌
事实证明，CRISPR-Cas 编辑系统是功能基因组学研究的有力工具，但它们在许多非模型物种中的有效性仍然有限。在马铃薯和番茄病原菌疫霉菌中，之前开发了一种编辑系统，该系统表达毛螺菌科细菌 Cas12a 内切酶 (LbCas12a) 和来自 DNA 载体的引导 RNA。然而，该方法效率低下。基于编辑受疫霉菌生长和内切酶催化的最佳温度不匹配限制的假设，我们测试了两种策略，将两个目标基因的编辑频率提高了约 10 倍。首先，我们发现 LbCas12a (D156R) 中的突变可以促进编辑，据报道，这种突变可以在更宽的温度范围内扩大其催化活性。其次，我们观察到，在较高温度下瞬时孵育转化组织可以增强编辑效果。这些修改应该使 CRISPR-Cas12a 更适用于研究 P. infestans 及其亲属中的基因和蛋白质功能，特别是在较低温度下生长最佳的物种。
使用单克隆抗体分析粘液虫（粘菌门：粘孢子门）孢子抗原
摘要：开发了一种采用 Percoll™ 梯度离心法从大西洋鲑 Salmo salar 的体肌组织中纯化 Kudoa thyrsites 孢子的方法。然后用高度纯化的孢子免疫近交系 BALB/c 小鼠，以衍生分泌 Kudoa 特异性单克隆抗体 (mAb) 的杂交瘤。通过免疫荧光显微镜和流式细胞术对 mAb 进行分析表明，几种 mAb 对 K. thyrsites 孢子表面的抗原具有特异性，而其他 mAb 与 K. thyrsites、K. paniformis 和 K. crumena 孢子的极性荚膜或极性细丝发生反应。使用表面结合 mAb 对孢子裂解物进行免疫印迹，结果显示 46 至 >220 kDa 的宽条带，而针对极性荚膜和极性细丝抗原的特异性 mAb 检测到不同分子量的更清晰条带，具体取决于 Kudoa 物种。K. thyrsites 孢子表面抗原的主要表位被证明是碳水化合物，这是由其对无水三氟甲烷磺酸处理的敏感性和对蛋白酶 K 处理的抗性决定的。使用 K. thyrsites 特异性 mAb 对分离的、完整的、透化的疟原虫和含有疟原虫的体细胞肌肉组织薄切片进行免疫荧光显微镜检查，发现在产生孢子的疟原虫和受感染的大西洋鲑鱼肉中都有孢子的强烈标记。通过免疫印迹法检测到的孢子只有 100 个，表明这些 mAb 具有用于开发基于现场的诊断测试的潜力。