(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2024年8月20日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.08.19.607671 doi:biorxiv Preprint
结果:衰老伴随着表观遗传标记的各种改变,包括DNA甲基化(非CPG区域中的全球低甲基化和CPG岛的高甲基化),染色质的重排(整体减少组蛋白和组蛋白的重新分布和组织纳修饰)和NCRNA(尤其是miRNA)。表观遗传学是一种可逆的分子机制,可允许治疗干预措施改善或逆转与衰老相关的发病机理。可以开发基于化学的表观遗传操作和基于生活方式的表观遗传重编程策略来改善或逆转与衰老相关的条件。
已经认识到了基因组三维结构的变化的影响,但固体癌组织研究受到限制。Here, we performed integrated deep Hi-C sequencing with matched whole-genome sequencing, whole-genome bisulfite sequencing, 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) sequencing and RNA sequencing across a cohort of 80 biopsy samples from patients with metastatic castration-resistant prostate cancer.在基因表达,5-甲基胞嘧啶/5HMC甲基化以及A和B(开放和闭合)染色质区室之间的结构变异与突变率中存在显着差异。肿瘤的一个子集在AR基因座表现出耗尽的区域染色质接触,与肉瘤外圆形DNA(ECDNA)有关,对AR信号抑制剂的反应较差。我们还确定了与甲基化结构,基因表达和预后差异差异相关的拓扑亚型。我们的数据表明,DNA相互作用可能易于结构变体形成,以复发性TMPRSS2 - ERG融合为例。这种全面的综合测序工作代表了独特的临床肿瘤资源。
牙科植入物被认为是替代缺失牙齿的最先进的选择,而几项研究证明了很高的长期成功率。但是,此过程的成功取决于几个因素,而骨整合最关键之一。鉴于此,这项研究的一般目标是了解2型糖尿病对牙科植入物骨整合的影响。这项研究的拟议方法是文学评论,在科学文章的数字数据库中进行了一项调查:PubMed,Scielo,Google学术,期刊Capes。鉴于这项研究提出的主题,可以通过数据库中的研究看到,在2型糖尿病患者中,愈合过程,尤其是骨骼存在障碍,因为巴西这种病经常存在。关键字:生活质量,骨整合植入物,糖尿病。
编辑:固体肿瘤的领域在靶向和免疫疗法方面取得了巨大进步。 然而,在解决表观遗传改变时所做的差异要少得多。 一名32岁的妇女出现了痛苦,呕吐和便秘,并被发现有一个大而复杂的左卵巢肿块。血清钙水平为16.7 mg每分解蛋白(参考范围为8.5至10.5)。 卵巢切除术的组织病理学结果表明,尽管接受了多模态疗法,但卵巢高钙血症类型的小细胞癌(SCCOHT)是一种罕见的,侵略性的妇科癌,尽管收到了24个月的总体生存率。 scCOHT类似于儿童盲肿瘤,其特征是编码BRG1 – BAF190的Smarca4肿瘤抑制基因的病理学双重损失,该基因是SWI-SNF染色质重塑复合体的一个组成部分,导致了表观遗传重新编织和Malig-nant-Nant-Nant转换。 SWI -SNF复合物中 1个致病变异与近20%的人类癌症有关。 2肿瘤基因组测序显示Smarca4的双重损失,两个编辑:固体肿瘤的领域在靶向和免疫疗法方面取得了巨大进步。然而,在解决表观遗传改变时所做的差异要少得多。一名32岁的妇女出现了痛苦,呕吐和便秘,并被发现有一个大而复杂的左卵巢肿块。血清钙水平为16.7 mg每分解蛋白(参考范围为8.5至10.5)。卵巢切除术的组织病理学结果表明,尽管接受了多模态疗法,但卵巢高钙血症类型的小细胞癌(SCCOHT)是一种罕见的,侵略性的妇科癌,尽管收到了24个月的总体生存率。scCOHT类似于儿童盲肿瘤,其特征是编码BRG1 – BAF190的Smarca4肿瘤抑制基因的病理学双重损失,该基因是SWI-SNF染色质重塑复合体的一个组成部分,导致了表观遗传重新编织和Malig-nant-Nant-Nant转换。1个致病变异与近20%的人类癌症有关。2肿瘤基因组测序显示Smarca4的双重损失,两个
与宾夕法尼亚大学(UPENN)合作,库祖佐祖卫生科学大学(Kuhes)实施的ADARD项目旨在研究马拉维加速衰老的模式和多因素危险因素。该项目的广泛目标是确定生命过程逆境,健康行为和遗传倾向的影响,以加速表观遗传衰老和ADRD风险。该项目将重点介绍两个具体的目的:1)评估现有和新颖的表观遗传生物标志物的衰老,并测试其与生活过程逆境,健康行为以及潜在的遗传易感性的关系,以及2)测试(EPI)基因组和行为因素在许可环境中有助于(EPI)基因组和行为因素在多大程度上导致认知性下降和ADR的风险。该项目嵌套在马拉维家庭和健康(MLSFH)项目的纵向研究中,该项目一直在2018年以来一直关注来自巴拉卡,姆奇尼和朗菲的定义家庭的基于人群的人群,从家庭成员那里收集社会人口统计学,健康状况和上下文数据。从2024年到2028年,MLSFH的现有生活课程的社会和上下文数据将得到基因组和表观基因组数据以及对衰老和认知状况的纵向评估的补充。
。cc-by-nd 4.0国际许可在A未获得Peer Review的认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人(该版本发布于2024年7月26日。; https://doi.org/10.1101/2023.05.10.10.540289 doi:biorxiv Preprint
单细胞CRISPR筛选将遗传扰动与转录状态联系起来,但是将这些诱导的变化与其调节基础相连的高通量方法受到限制。在这里,我们引入了多种颗粒式seq,扩展了单细胞CRISPR筛选,以同时测量扰动诱导的基因表达和染色质访问性的变化。我们在人RPE-1细胞中的13个染色质重塑剂的CRISPRI筛选中应用多个颗粒式seq,通过改进的方法通过捕获来自核RNA的条形码转录的改进方法,使SGRNA身份有效地分配到单核。我们将表达和可及性测量组织到描述扰动对细胞状态的综合效果的一致程序中,发现ARID1A和SUZ12敲低诱导了富含发育特征的程序。扰动的假次分析将可访问性的变化与基因表达的变化联系起来,突出了多模式pro填充的价值。 总体而言,我们的方法提供了一个可扩展的实现系统,以剖析调节逻辑基础细胞状态。扰动的假次分析将可访问性的变化与基因表达的变化联系起来,突出了多模式pro填充的价值。总体而言,我们的方法提供了一个可扩展的实现系统,以剖析调节逻辑基础细胞状态。
DNA,并将标本存储在-80°C下。DNAM分析是在杜克大学Yongmei Liu博士的实验室进行的。Bisulfite的转化。500ng的DNA。数据是在Illumina Infinium甲基化甲基甲基甲虫v1.0上产生的(CAT#WG317-1001,Illumina,Illumina,San Diego,CA,美国)。使用制造商方案将总共4 µL的硫酸硫酸硫酸含量转换为DNA与Illumina Beadchip杂交。样品被变性并放大过夜20-24小时。样品的碎片,沉淀和重悬于过夜孵化之后,然后与史诗般的珠奇普杂交16-24小时。然后洗涤珠奇普,以去除任何未脑的DNA,并用核苷酸标记以将引物扩展到DNA。按照Infinium HD甲基化协议,使用Illumina Iscan系统(Illumina,Illumina,San Diego,CA,USA)对珠奇普进行成像。
• Our bodies are made up of billions of cells • Each cell contains genetic material in the form of DNA • DNA contains ~22,000 genes • Genes determine traits • Each gene is a set of instructions (code) to make a protein with a specific function • Two copies of each gene • DNA sequence (code) is made up of 4 bases • “Genetics” refers to the DNA code