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World File Search System质谱
生物信息学分析师 - 基于质谱的 - 组
计算免疫学研究小组正在寻求生物信息学分析师（具有机器学习和预测性建模的经验），以解决免疫疾病界面处的一系列计算复杂问题。这涵盖了广泛的疾病，包括癌症免疫学和免疫疗法，针对癌症和新兴疾病的疫苗设计以及自身免疫性的未来研究。我们致力于开发利用免疫系统消除该疾病的新免疫疗法。我们的工作和发现有助于改善世界各地患者的治疗和护理。我们的工作旨在开发新型的免疫疗法和疫苗，利用先进的基因组学，转录组学和蛋白质组学管道来研究免疫力。我们使用开发的数据集来更好地了解疫苗设计中的机器学习和人工智能任务的免疫系统。团队由生物学家，统计学家，软件工程师和数据科学家等多元化专业人士组成，在国际上合作以创建新的疗法。该角色在数据科学和高性能计算方面提供了广泛的培训，并访问了顶级超级计算机。我们提供了有竞争力的国际工资和专业增长的机会。与我们一起解决免疫疗法和疾病研究中一些最具挑战性的问题。
使用质谱成像的空间药理学
空间药理学的出现和强大领域可以绘制药物及其代谢产物的空间分布，以及它们对内源性生物分子的影响，包括代谢产物，脂质，脂质，蛋白质，肽和格兰康斯，而无需标记标记。这是通过质谱成像（MSI）来启用的，该成像（MSI）以前在药物发现和发育的各个阶段中提供了无法访问的信息。我们提供了如何实施MSI技术和计算工具来揭示定量空间药物药物和毒理学，组织亚型和相关生物标志物的观点。我们还通过将多模式MSI数据与其他空间技术整合在一起，强调了综合空间药理学的新兴潜力。最后，我们撰写了如何克服挑战，包括提高可重复性和综合注释，以产生强大的结论，以改善药物发现和开发过程。
在啮齿动物脑脊液中优化甲状腺激素和极性代谢物的质谱检测
1田纳西州纳什维尔大学范德比尔特大学分子生理与生物物理学系。11 2肌肉能量实验室，NHLBI，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。12 3宾夕法尼亚州立学院宾夕法尼亚州立大学生物化学与分子生物学系，宾夕法尼亚州立大学13号宾夕法尼亚州立大学生命科学研究所，14 4 4 4 4美国爱荷华州爱荷华大学，爱荷华州，爱荷华州，爱荷华州52242，美国52242。15 5美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院医学系。 16 6加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学。 17 7田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学中心病理学系，美国37232。 18 8约翰·霍普金斯大学医学院病理学系，美国马里兰州巴尔的摩199 9 9儿科部门。 ，美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学医学中心，圣路易斯大学医学院，密苏里州圣路易斯，密苏里州圣20204，密苏里州，圣路易斯大学医学院。 22 11医学系，范德比尔特大学传染病科，纳什维尔，23 tn，37232，美国。 24 12美国俄勒冈州立大学综合生物学系，俄勒冈州科瓦利斯，俄勒冈州97331，美国。 25 13中央显微镜研究机构，爱荷华州，爱荷华州52242，美国26 14 NIAMS，NIH，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。 27 2815 5美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院医学系。16 6加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学。17 7田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学中心病理学系，美国37232。18 8约翰·霍普金斯大学医学院病理学系，美国马里兰州巴尔的摩199 9 9儿科部门。，美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学医学中心，圣路易斯大学医学院，密苏里州圣路易斯，密苏里州圣20204，密苏里州，圣路易斯大学医学院。 22 11医学系，范德比尔特大学传染病科，纳什维尔，23 tn，37232，美国。 24 12美国俄勒冈州立大学综合生物学系，俄勒冈州科瓦利斯，俄勒冈州97331，美国。 25 13中央显微镜研究机构，爱荷华州，爱荷华州52242，美国26 14 NIAMS，NIH，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。 27 28，美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学医学中心，圣路易斯大学医学院，密苏里州圣路易斯，密苏里州圣20204，密苏里州，圣路易斯大学医学院。22 11医学系，范德比尔特大学传染病科，纳什维尔，23 tn，37232，美国。24 12美国俄勒冈州立大学综合生物学系，俄勒冈州科瓦利斯，俄勒冈州97331，美国。25 13中央显微镜研究机构，爱荷华州，爱荷华州52242，美国26 14 NIAMS，NIH，NIH，贝塞斯达，马里兰州，20892年，美国。27 28
利用三重四极杆质谱法定量测定尿液中的 106 种滥用药物
*除 1-(3-氯苯基)哌嗪、25I-NBOMe 和 N-去甲基-他喷他多外，每种目标分析物均使用其自己的标记内标，这三种分析物分别使用内标去甲氯胺酮-d4、氯氮卓-d5 和唑吡坦-COOH-d4。
使用Biocrates的尿液样品的定量代谢组学跨质谱仪平台
MXP量子500套件由系统适用性测试样品和具有已集成的内部标准的专利96井滤板组成。尿液扩展集已用于样品分析，包括： - 校准标准7冻干浓度水平，范围通常在人类尿液中观察到，以进行准确的定量。- 基于尿液的质量控制（QCS）3冻干QC水平，用于性能检查和准确的数据归一化。- 带有相似盐组成和背景信号的样品样品样基质，用于计算检测极限（LOD）。- 仪器特异性方法在预期的尿液代谢物丰度周围优化了MRM。- 样品制备方案修改工作流程，以改善尿液代谢产物的衍生化。
肌酸转运蛋白缺乏症患者的人脑器官的神经元缺损和蛋白质谱变化
1巴黎 - 萨克莱大学，CEA，INRAE，卫生药品和技术系，法国Gif Sur Yvette； 2阿拉伯联合酋长国沙迦大学药学院药学和药物治疗系； 3阿拉伯联合酋长国沙迦大学沙迦医学研究所； 4个Ceres Brain Therapeutics，法国巴黎； 5 ELKH自然科学研究中心酶学研究所和匈牙利布达佩斯塞梅尔维斯大学的分子医学学院； 6美国辛辛那提儿童研究基金会辛辛那提大学医学院和神经病学系儿科学系； 7 Supbiotech/祈祷和非典型感染的研究服务（SEPIA），法国巴黎萨克莱大学CEA弗朗索瓦·雅各布研究所； 8巴黎 - 萨克莱大学，CEA，INRAE，卫生药品和技术系（DMTS），SPI，Bagnols-Sur-Cèze，法国； 9阿拉伯联合酋长国沙迦大学医学院临床科学系；英国伦敦伦敦大学学院外科与介入科学系10分部；1巴黎 - 萨克莱大学，CEA，INRAE，卫生药品和技术系，法国Gif Sur Yvette； 2阿拉伯联合酋长国沙迦大学药学院药学和药物治疗系； 3阿拉伯联合酋长国沙迦大学沙迦医学研究所； 4个Ceres Brain Therapeutics，法国巴黎； 5 ELKH自然科学研究中心酶学研究所和匈牙利布达佩斯塞梅尔维斯大学的分子医学学院； 6美国辛辛那提儿童研究基金会辛辛那提大学医学院和神经病学系儿科学系； 7 Supbiotech/祈祷和非典型感染的研究服务（SEPIA），法国巴黎萨克莱大学CEA弗朗索瓦·雅各布研究所； 8巴黎 - 萨克莱大学，CEA，INRAE，卫生药品和技术系（DMTS），SPI，Bagnols-Sur-Cèze，法国； 9阿拉伯联合酋长国沙迦大学医学院临床科学系；英国伦敦伦敦大学学院外科与介入科学系10分部；
使用合并的微生物学，酶，质谱和元法编码方法
摘要这项研究旨在将海洋真菌财团（曲霉菌CRM 348和laurentii CRM 707）应用于柴油油在微量环境下的柴油污染土壤的生物修复。研究了研究对柴油生物降解，土壤质量和微生物群落结构的生物刺激（BS）和/或生物加工（BA）处理的影响。使用真菌财团以及营养物质（BA/BS）导致TPH（总石油烃）降解比自然衰减（NA）在120天内高42％。在同一时期，BA/BS获得了72％至92％的短链烷烃（C12至C19），而NA仅实现了3％至65％的去除。ba/bs在120天时还显示出长链烷烃（C20至C24）的较高降解效率，分别达到了乙烷和Heneicosane降解的90％和92％。相比之下，在综合群体处理的土壤中观察到了环氧烷的水平（以细菌生物乳化剂和生物表面活性剂为特征）。相反，NA最多显示了这些烷烃分数降解的37％。与NA相比，使用BA/BS处理的5圈PAH Benzo（a）pyre被明显更好地去除（48 vs。占生物降解的38％，从事分解）。metabarcoding分析表明，BA/BS导致土壤微生物多样性的下降，随之而来的是特定微生物群的丰度，包括碳氢化合物降解（细菌和真菌），以及土壤微生物活性的增强。我们的结果突出了柴油机溢出后该财团对土壤处理的巨大潜力，以及大规模测序，酶，微生物学和GC-HRMS分析的相关性，以更好地了解柴油生物修复。
利用质谱来解锁纳米颗粒诱导的炎性体激活的机制
摘要：纳米颗粒（NPS）引起无菌炎症，但潜在的信号通路知之甚少。在这里，我们报告说，人类单核细胞特别容易受到非晶二氧化硅NP的影响，这是通过基于飞行时间（CyTOF）的细胞仪对单细胞基于外周血单核细胞的分析，而NPS的硅烷修饰可减轻其毒性。使用人THP-1细胞作为模型，我们通过纳米级离子质谱法（Nanosims）观察到了二氧化硅NP的细胞内在化，并通过透射电子显微镜证实了这一点。脂质液滴积累也在暴露的细胞中注意到。此外，飞行时间次级离子质谱法（TOF-SIMS）揭示了质膜脂质的特定变化，包括硅胶NP暴露细胞中的磷脂酰胆碱（PC），随后的研究表明，溶血磷脂酰胆碱（LPC）的信号是易溶性的，这表明该信号的流动性是在配体。此外，我们发现硅胶在单核细胞中引起NLRP3炎性体激活，而细胞死亡通过非凋亡，脂质过氧化依赖性机制转化。一起，这些数据进一步了解了我们对无菌炎症机制的理解。关键词：细胞死亡，炎症体，质谱法，单核细胞，二氧化硅纳米颗粒I
基于化学计量学的气相色谱-质谱分析研究人脑肿瘤组织中的农药代谢物，探讨农药暴露与中枢神经系统肿瘤风险因素之间的假定相关性
摘要：农药被广泛使用，导致人类持续接触农药，并可能对健康产生影响。一些与农业工作有关的接触与神经系统疾病有关。自 2000 年代以来，文献中对农药在中枢神经系统 (CNS) 肿瘤发生中的作用的假设进行了更详尽的记录。然而，儿童脑癌的病因仍然很大程度上未知。这项工作的主要目的是根据问卷调查和统计分析从突尼斯斯法克斯哈比卜·布尔吉巴医院中部神经外科住院患者收集的信息，评估农药暴露作为中枢神经系统肿瘤风险因素的潜在作用，这些患者在 2022 年 1 月 1 日至 2023 年 5 月 31 日期间住院。它还旨在通过气相色谱-质谱技术开发一种简单快速的分析方法，用于研究一些收集的人脑肿瘤组织中农药代谢物的痕迹，以进一步强调我们对农药暴露与脑肿瘤发展之间这种相关性的假设。选取有高风险暴露史的患者进行进一步分析。采用化学计量学方法来辨别病理组和对照组之间的内在差异，并通过鉴定导致这种差异的差异表达代谢物来确定有效分离。三个样本显示出农药代谢物的痕迹，这些代谢物大多在早期检测到。一名 10 岁儿童的组织病理学诊断为髓母细胞瘤，27 岁和 35 岁成人的组织病理学诊断为高级别胶质瘤。双变量分析（比值比 >1 和 P 值 <5%）证实了暴露病例患癌症的可能性很大。Cox 比例风险模型显示，50 岁以后的致癌风险是农药毒性的长期影响。我们的研究支持农药暴露与人类脑肿瘤发展风险之间的相关性，表明孕前农药暴露，以及可能的怀孕期间的暴露，与儿童脑肿瘤风险增加有关。这一假设在鉴定出以神经毒性著称的氨基甲酸酯类杀虫剂代谢物痕迹以及以致癌性著称的哒嗪酮、有机氯 (OCs)、三唑类杀菌剂和 N-亚硝基化合物等代谢物痕迹后得到了进一步证实。2D-OXYBLOT 分析证实了杀虫剂的神经毒性作用，可诱导中枢神经系统细胞氧化损伤。在应激降解研究中鉴定出肟代谢物，证实了涕灭威具有脑致癌性。揭示 OC 类“氮丙啶”代谢物可能更好地强调了在早期检测农药代谢物痕迹的理论。总体而言，我们的研究结果促使我们建议限制农药在住宅中的使用，并支持为实现这一目标而制定的公共卫生政策，我们需要在上市后对人类健康影响的监测中保持警惕。
使用在线工艺质谱仪对反应气体或排气的定量分析
在线定量分析工业生产中的反应气体或排气性非常重要，可以提高生产能力和过程。使用定量数学模型与机器学习的线性回归算法相结合，开发了一种用于在线定量分析反应气或排气的方法。准确地估算了反应气体或排气中的组分气体及其含量后，构建了比率矩阵以分离相关的重叠峰。通过在线工艺质谱仪纠正比率矩阵并获得相对灵敏度矩阵，检测到，过滤，归一化和线性回归的比率和校准标准气体。可以建立一个定量的数学模型，以实时获得反应气体或排气的每个组件的含量。该方法的最大定量误差和该方法的相对标准偏差在0.3％和1％以内，在在线量化代表性酵母发酵罐尾气之后。