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World File Search System赖氨酸
蛋白质蛋白结合物
a Department of Chemistry, University of Cambridge, Lensfield Road, CB2 1EW Cambridge, UK b Instituto de Medicina Molecular, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, Avenida Professor Egas Moniz, 1649-028 Lisboa, Portugal *Email: gb453@cam.ac.uk Dek: A tyrosine-targeting bioconjugation reaction导致CAS9蛋白质肽结合物显示出细胞递送增加20倍。https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscentsci。0 C00940链接到“靶向酪氨酸靶向生物偶联反应”的链接残基半胱氨酸和赖氨酸是生物偶联化学的无可争议的拥护者。靶向其他氨基酸已被吹捧为改善蛋白质肽和蛋白质 - 蛋白质缀合物的合成的潜在方法，这些方法经过广泛研究，以其潜在的治疗能力，并用作理解生物学功能的工具。现在，加利福尼亚大学伯克利分校的一组研究人员针对溶剂曝光的酪氨酸残留物，以开发一种准备这种共轭物的方法。1，由于蛋白质的化学毒素不同，蛋白质肽和蛋白质 - 蛋白质结合物的合成可能很棘手，从而提出化学选择性和现场特异性挑战。2生物正交化学的使用已成功克服了其中的一些挑战，但通常需要冗长的合成才能掺入不自然的氨基酸。同时，使用天然蛋白质功能通常仅限于N-或C末端，或导致无选择的标记亲核残基（例如半胱氨酸或赖氨酸）。酶酪氨酸酶用于将溶剂暴露的酪氨酸残基氧化为Quinone官能团。由于这些原因，人们非常有兴趣扩展允许仔细阐述蛋白质体系结构的方法的工具箱。在他们在ACS Central Science发表的最新作品中，由Francis，Doudna和Fellman领导的团队描述了一种耦合两种生物分子的方法，分别含有酪氨酸和半胱氨酸残留物。随后，该组与硫化成分反应，从而导致两种底物之间形成新的共价键（图1）。这是基于团队以前在利用原位形成的奎因酮功能的经验，目的是与存在于脯氨酸残基和苯胺等生物分子上的其他亲核试剂的反应。3,4虽然大多数蛋白质通常贡献半胱氨酸或赖氨酸残基作为生物偶联反应的亲核成分，但形成了亲电矫正剂量子酮的形成，代表了一种有趣的Umpolung方法，具有潜力，可以扩展蛋白质生物偶联化学空间。
特刊“表观遗传景观的氧化还原调控”“氧化应激介导的组蛋白翻译后修饰的改变”
2-HG：D-2-羟基戊二酸。4-HNE：4-羟基-2-壬烯醛。4-ONE：4-氧代-2-壬烯醛。BEAS-2B：用 Ad12-SV40 2B 转化的支气管上皮。CAF-1：染色质组装因子-1。CYP2E1：细胞色素 P450 家族 2 亚家族 E 成员 1。DDR：DNA 损伤反应。DSB：双链断裂。EMT：上皮间质转化。ER：雌激素受体。EWS：尤文氏肉瘤。GLO1：乙二醛酶 1。GSH：谷胱甘肽。GSNO：亚硝基谷胱甘肽。HAT：组蛋白乙酰转移酶。HDACi：组蛋白去乙酰化酶抑制剂。HDACs：组蛋白去乙酰化酶。HFD：组蛋白折叠域。 HIRA：组蛋白细胞周期调节剂。HMT：组蛋白甲基转移酶。HUVEC：人脐静脉内膜细胞。IDH：异柠檬酸脱氢酶。IL：白细胞介素。jmjCs：jumonji 蛋白。LOXL2：赖氨酰氧化酶样 2。LSD1：赖氨酸特异性脱甲基酶 1。LTQ：赖氨酸酪氨酸醌结构域。MGO：甲基乙二醛。MnSOD：锰超氧化物歧化酶。MS：质谱法。NAC：n-乙酰半胱氨酸。NSCLC：非小细胞肺癌。ONOO -：过氧亚硝酸盐。oxiPTMs：氧化翻译后修饰。PARP：聚 ADP 核糖聚合酶。PDXs：患者来源的异种移植。PTMs：翻译后修饰。 RNOS：活性氧和活性氮氧化物。ROS：活性氧。SAHF：衰老相关异染色质灶。SAM：S-腺苷甲硫氨酸。SLE：系统性红斑狼疮。TNBC：三阴性乳腺癌细胞。V/ST：伏立诺他/替莫唑胺。α-KG：α-酮戊二酸
更新结果和更长期的跟踪...
ALL，急性淋巴细胞白血病；AML，急性髓细胞白血病；CNS，中枢神经系统 CR，完全缓解；CRc，CR 综合；CRh，CR 伴部分血液学恢复；CRi，CR 伴不完全血液学恢复；CRp，CR 伴不完全血小板恢复；CYP3A4i，细胞色素 P450 3A4 抑制剂；DOR，缓解持续时间；KMT2Ar，赖氨酸 N-甲基转移酶 2A 重排；MLFS，形态学无白血病状态；MPAL，混合表型急性白血病；NPM1m，核磷蛋白 1 突变；ORR，总体反应率；PR，部分缓解；q12h，每 12 小时一次；RP2D，推荐的 2 期剂量；R/R，复发/难治。
针对CTNNB1突变体肝细胞癌的MMP9恢复CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫，并提高抗PD-1功效
抽象目标在肝细胞癌（HCC）中的功能增益（GOF）CTNNB1突变（CTNNB1 GOF）会导致明显的免疫逃脱和对抗PD-1的抗性。在这里，我们旨在研究CTNNB1 GOF HCC介导的免疫逃生的机制，并提出一种新的治疗策略，以增强HCC中的抗PD-1功效。设计RNA测序，以识别与免疫逃逸相关的CTNNB1 GOF的关键下游基因。一种体外共培养系统，鼠皮下或原位模型，有条件的基因敲除小鼠中的自发性肿瘤模型和流式细胞术在肿瘤进展和免疫逃逸中探索基质金属肽酶9（MMP9）的生物学功能。单细胞RNA测序和蛋白质组学用于深入了解MMP9的潜在机制。结果MMP9在CTNNB1 GOF HCC中显着上调。MMP9抑制了CD8 + T细胞的浸润和细胞毒性，这对于CTNNB1 GOF驱动抑制性肿瘤免疫微环境（时间）和抗PD-1耐药至关重要。从机械上讲，CTNNB1 GOF下调的Sirtuin 2（SIRT2），导致促进β-蛋白酶/赖氨酸/赖氨酸脱甲基酶4D（KDM4D）复合形成，从而促进了MMP9的转录激活。从HCC介导的Slingshot蛋白磷酸酶1（SSH1）从CD8 + T细胞中脱落的MMP9分泌，从而抑制了C-X-C基序趋化因子受体3（CXCR3）介导的G蛋白酶受体介导的细胞内介导的G蛋白摄入受体信号传导。此外，MMP9阻断重塑了时间并增强了抗PD-1治疗在HCC中的敏感性。结论CTNNB1 GOF通过激活MMP9的分泌引起抑制时间。靶向MMP9重塑时间并增强CTNNB1 GOF HCC中的抗PD-1功效。
评论文章：Wnt 信号是否是治疗骨关节炎的一个有吸引力的目标？
骨关节炎是影响全球数百万人的最常见的慢性关节疾病，也是导致疼痛和残疾的主要原因。肥胖发病率的增加和人口老龄化是两个因素，表明骨关节炎在社会层面的影响将进一步增加。目前，还没有药物可以同时控制关节的结构损伤或相关的疼痛。越来越多的证据支持 Wnt 信号通路在该疾病中起重要作用的观点。目前的概念基于遗传和功能研究，表明严格调节软骨中的 Wnt 信号对于保持关节健康至关重要。在这篇综述中，我们讨论了这个概念是如何演变的，并深入了解了 Wnt 信号的调节，特别是 Wnt 调节剂，如卷曲相关蛋白和 DOT1 样组蛋白赖氨酸
氨基酸，定量随机，尿液
Test Includes: Taurine, threonine, serine, asparagine, hydroxyproline, glutamic acid, glutamine, aspartic acid, ethanolamine, sarcosine, proline, glycine, alanine, citrulline, alpha-aminoadipic acid, alpha-amino-n-butyric acid, valine, cystine, cystathionine, methionine,异亮氨酸，亮氨酸，酪氨酸，苯丙氨酸，β-丙氨酸，β-氨基糖酸，鸟氨酸，碱性，赖氨酸，1-甲基组织，组氨酸，3-甲基激素，三甲基激素，精氨酸氨基糖苷，精氨酸糖酸酸，异糖酸酯，异糖素，粘膜酸氨基酸氨基酸盐，硫糖酶蜂窝状菌株， - 糖胞和蜂窝状菌株，糖胞和糖胞和蜂窝状菌株，色氨酸和精氨酸。在NMOL/mg肌酐中报道。
甲状腺癌治疗中的表观遗传靶点及其抑制剂
摘要：尽管基于关键致癌突变的生物靶向疗法在局部晚期或转移性甲状腺癌的治疗中取得了重大进展，但耐药性的挑战促使我们探索其他潜在有效的靶点。本文回顾了甲状腺癌中的表观遗传修饰，包括 DNA 甲基化、组蛋白修饰、非编码 RNA、染色质重塑和 RNA 改变，并更新了用于治疗甲状腺癌的表观遗传治疗药物，例如 DNMT（DNA 甲基转移酶）抑制剂、HDAC（组蛋白去乙酰化酶）抑制剂、BRD4（含溴结构域蛋白 4）抑制剂、KDM1A（赖氨酸脱甲基酶 1A）抑制剂和 EZH2（zeste 同源物 2 增强子）抑制剂。我们得出结论，表观遗传学有望成为甲状腺癌的治疗靶点，值得进一步进行临床试验。
通过 LC-MS 和 -MS/MS 对抗体药物偶联物 (ADC) 进行高通量、全面表征
抗体药物偶联物 (ADC) 属于一类日益壮大的高度靶向生物制药药物。它们结合了特异性结合肿瘤表面抗原的单克隆抗体和通过化学接头连接的高效细胞毒性药物 (1)。使用半胱氨酸或赖氨酸残基作为结合位点的 ADC 具有高度异质性，其表征带来了分析挑战 (2)。质谱法是 ADC 开发过程中常规分析的首选工具。在这里，我们描述了两种用于表征 ADC 的分析工作流程，结合了强制降解分析。在第一个工作流程中，ADC 的高通量表征允许在 Bruker MaXis II™ETD 仪器的天然和还原条件下使用设计的 SEC-HPLC-MS 方法每天分析多达 48 个样本，然后使用 Biopharma Compass ® 进行全自动数据分析
前列腺癌和骨组织共培养研究的模型
结果表明，与玻璃和聚-L赖氨酸涂层的玻璃相比，Cellbind®塑料可以用作优质的底物，因为它支持了更好的细胞生长和增殖。在该基材上，细胞成功形成了单层，这对于将模型应用于共培养研究至关重要。发现使用透析膜可减少模型中培养的两个不同细胞系的分化谱的差异，包括通过各种矿化测定法分析它们的有效分化的变化。PC3细胞与骨模型共培养的图像分析显示，骨组织成熟与癌细胞增殖之间存在相关性：癌细胞在更成熟的骨组织中表现出降低的增殖。需要进一步的研究来复制这些发现，并通过额外的骨骼成熟测定法和可能延长培养期，以确保模型的功能。