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HD-ZIP II转录因子通过将生长素信号与Fez/Sombrero途径联系起来，控制拟南芥根的远端干细胞命运
在多细胞生物中，特定组织是由干细胞的特定种群通过不对称细胞分裂的循环产生的，其中一个女儿经历了分化，另一个女儿维持增生特性。在拟南芥根中，哥伦氏菌 - 一种保护和定义干细胞生态位位置的重力感应组织 - 代表了组织的典型例子，该组织的组织仅由增殖和分化之间的平衡决定。柱状细胞通过二元细胞命运开关衍生自单层干细胞，该开关由多个独立的调节输入精确控制。在这里，我们表明HD-ZIP II转录因子（TFS）HAT3，ATHB4和AHTB2冗余地调节了拟南芥根中的小肠干细胞命运和图案。HD-ZIP II TFS通过充当FEZ/ SMB电路的效应子，同时通过干扰生长素信号来抵消激素诱导的分化，从而促进Columella干细胞增殖。总体而言，我们的工作表明HD-ZIP II TFS连接两个相对的平行输入，以调整柱状干细胞中增殖与分化之间的平衡。
联合起来为USV创建通信系统
Sea-Kit International Ltd技术技术总监Peter Walker说：“ Sea-Kit的团队打算将我们经过验证的USV设计与强大的通信系统耦合，即使在最恶劣的海上条件下运作。在离岸能源领域工作的每个人都在追求更大的效率。我们希望通过创新来破坏当前的市场产品，从而使USV控制USV，并从船上的设备中可靠地检索传感器数据，同时还降低了成本和碳足迹。与埃塞克斯大学（University of Essex）的伙伴关系融入了他们庞大的网络科学和AI知识库，我们期待与那里的团队合作。”
生成 AI 价值的路径：让飞轮运转起来
一个世纪前，亨利·福特 (Henry Ford) 曾指出，当他的客户想要“更快的马”时，他就会给他们 T 型车。如今，早期的生成式 AI 用例往往侧重于提高现有解决方案和工作方式的效率——相当于更快的马。虽然飞轮框架可以帮助通过这种方法推动价值，但必须记住，更大的奖励是存在的。大多数企业不会将所有注意力都集中在边际改进上，而是希望根据可用的新选项彻底重新思考最佳解决方案是什么。为了避免在未来两到三年内陷入巨大的技术和流程债务问题，在评估未来价值和制定早期 GenAI 战略时，有必要密切关注长期重大颠覆和重塑的潜力。
将线粒体代谢，发育时机和人脑进化联系起来
发育时机的变化是器官形状和功能进化的重要因素。这对于人脑发育尤其引人注目，与其他哺乳动物相比，在大脑皮层水平上延长了大量的延长，导致脑新脑。在这里，我们回顾了最新发现，这些发现表明线粒体和代谢有助于皮质神经元发育节奏的物种差异。线粒体显示特定物种的发育时间线和代谢活动模式，与神经元成熟的速度高度相关。增强人皮质神经元中的线粒体活性会导致其加速成熟，而其还原导致小鼠神经元的成熟率降低。与其他全球和基因特异性机制一起，线粒体因此充当神经元发育节奏的细胞沙漏，因此可能有助于人脑本体发育的物种特异性特征。
方法将机器学习与基于结构的蛋白质设计结合起来，以预测和设计蛋白质的翻译后修饰
蛋白质的翻译后修饰（PTM）在其功能和可行性中起着至关重要的作用。这些修饰会影响蛋白质折叠，信号传导，蛋白质 - 蛋白质相互作用，酶活性，结合亲和力，聚集，降解等等。迄今为止，已经描述了超过400种PTM，代表了远远超出遗传编码氨基酸的化学多样性。这种修饰对蛋白质的成功设计构成了挑战，但也代表了使蛋白质工程工具箱多样化的主要机会。为此，我们首先训练了人工神经网络（ANN），以预测十八种最丰富的PTM，包括蛋白质糖基化，磷酸化，甲基化和脱氨酸。在第二步中，这些模型是在计算蛋白建模套件Rosetta中实现的，该模型允许与现有协议的灵活组合来建模修饰的位点并了解它们对蛋白质稳定性和功能的影响。最后，我们开发了一种新的设计协议，该协议可以最大化或最大程度地减少修改特定站点的预先指定的概率。我们发现，基于ANN预测和基于结构的设计的这种组合可以使现有和引入新颖PTM的修改。我们工作的潜在应用包括但并不包括对表位的聚糖掩盖，从而加强了通过phos-odylation加强蛋白质 - 蛋白质相互作用，还可以保护蛋白质免受脱氨基责任的影响。我们的作品为Rosetta的蛋白质工程工具箱添加了新颖的工具，该工具允许PTM的理性设计。这些应用对于设计新蛋白质治疗剂的设计尤其重要，在这种蛋白质疗法的设计中，PTM可以彻底改变蛋白质的治疗特性。
生物膜中的丝状是自私的吗？基于个体的建模将微生物生长策略与形态学联系起来，使用新的和模块化ID
微生物群落都是在所有宜居环境中都发现的，并且经常在随着时间的推移而自组织的空间结构中进行组合。只能通过将实验与数学建模相结合，才能理解，预测和管理。如果个人异质性，局部相互作用和适应性行为引起人们的关注，基于个体的模型特别适合。 在这里，我们介绍了完全过度拖拉的软件平台，这是微生物群落的基于个体的动态，模拟Idynomics 2.0，它使研究人员能够指定一系列不同的模型而无需编程。 关键的新功能和改进是：（1）实质上增强的易用性（图形用户界面，模型规范的编辑器，单位转换，数据分析和可视化等）。 （2）提高性能和可伸缩性，可实现3D生物膜中多达1000万代理的模拟。 （3）动力学可以用任何算术函数指定。 （4）代理属性可以从正交模块中组装出来，以进行挑选和混合灵活性。 （5）基于力的机械互动框架，实现了吸引力和非球员形态，作为推动算法的替代方案。 新的Ildynomics 2.0进行了一次密集测试，从单位测试到一组日益复杂的数值测试以及基于硝基化生物膜的标准基准3。基于个体的模型特别适合。在这里，我们介绍了完全过度拖拉的软件平台，这是微生物群落的基于个体的动态，模拟Idynomics 2.0，它使研究人员能够指定一系列不同的模型而无需编程。关键的新功能和改进是：（1）实质上增强的易用性（图形用户界面，模型规范的编辑器，单位转换，数据分析和可视化等）。（2）提高性能和可伸缩性，可实现3D生物膜中多达1000万代理的模拟。（3）动力学可以用任何算术函数指定。（4）代理属性可以从正交模块中组装出来，以进行挑选和混合灵活性。（5）基于力的机械互动框架，实现了吸引力和非球员形态，作为推动算法的替代方案。新的Ildynomics 2.0进行了一次密集测试，从单位测试到一组日益复杂的数值测试以及基于硝基化生物膜的标准基准3。第二个测试案例是基于在BACSIM中实施的“生物膜促进利他主义”研究，因为由于合作个体之间的积极反馈，竞争结果对发展的空间结构非常敏感。我们通过添加形态来扩展了这一案例研究，以发现（i）丝状细菌构成球形细菌，无论生长策略如何，以及（ii）在竞争竞争的不合作丝中，因为细丝可以逃脱彼此之间更强大的竞争。总而言之，新的改进的Idynomics 2.0加入了越来越多的平台，用于基于微生物社区的基于个人的模型，具有我们讨论的特定优势和缺点，为用户提供了更广泛的选择。
社论：将微生物驱动的关键过程与河流，沿海地区和近岸地区的碳和氮循环联系起来
河口，沿海和近岸地区是连接陆地和海洋生态系统的关键区域。自然过程和强大的人为活性都会影响这些区域中的物质转化，能量流以及微生物和矿物质相互作用（Lazar等，2017； Cooke等，2020； Liu等，2020）。微生物群落是包括碳和氮在内的生物地球化学周期的主要动力之一，并且在河口，沿海和近海生态系统的生态平衡调节中起着重要作用（Shiozaki等人，2016年； Sohm等，2016）。由于微生物和生物地球化学周期之间的紧密相互关系，有必要对这些环境中的耦合机制和生态影响进行更深入的探索。这个跨学科的主题旨在了解微生物群落在有机物分解，营养转化和温室气体排放等过程中的作用（Lin and Lin，2022; Zhang等，2023）。通过研究这些关键过程背后的微生物驱动因素，我们可以深入了解河口，沿海和近海生态系统的功能和韧性及其对环境变化的反应。本研究主题中的七种文章涵盖了世界各地的各种环境，从河口和盐沼到海水和氧气最小区域，重点关注微生物社区特征以及相关的碳和氮气循环过程。niu等。本研究主题包括有关微生物分类学和功能性漏洞的研究，可以为微生物驱动的生物地球化学过程提供基本的理解。综合了有关分布模式，组装机制，共汇率关系以及细菌的生态功能的信息
欧洲的政治经济学计划2024年3月12日AI和工作的未来：将生成AI与社会，经济和劳动力市场政策联系起来
本讨论文件着重于通过催化自动化，增强和“平台化”动力学来说明生成AI影响蓝色和白领工人的潜力。在解决这些现象时，这项研究的主要目的是促进建设性的对话，从交叉的角度来解决生产AI对劳动力和劳动力市场的影响，并提出具体的政策建议，以确保在欧洲成功且公平地采用AI。具体来说，这项研究概述了需要进一步研究结构性不平等的相互作用以及AI带来的收益的公平分配，以提高AI和雇主在采用AI之前和期间的社交对话，并投资于雇员的包容性高技能和重新设置计划。
将基因组生物标志物结合起来指导非小细胞肺癌Joris van de haar 1,2,3，Joanne M. Mankor 4，Karlijn Hummelink 5
摘要◥目的：在非小细胞肺癌（NSCLC）中指导免疫检查点阻断（ICB）治疗的STK11，KEAP1和EGFR改变的临床值仍然有争议，因为一些拟议的抗药性生物标志物显示出耐用的ICB反应。这种疾病迫切需要更多特定的组合生物标志物方法。ExperimentalDesign: Todevelopacombinatorialbiomarkerstra- tegy with increased speci fi city for ICB unresponsiveness in NSCLC, we performed a comprehensive analysis of 254 patients with NSCLC treated with ligand programmed death-ligand 1 (PD-L1) blockade monotherapy, including a discovery cohort of 75 patients subjected to whole-genome sequencing (WGS), and独立的验证队列，由169名患者进行肿瘤非正式面板序列。在低（<10 muts / mb）或高（≥10cuts / mb）肿瘤突变负担（TMB）的背景下，评估了STK11 / KEAP1 / EGFR改变的特定级别的ICB反应性。
将战略规划与预算联系起来
• 核心作用 – 财政规划 – 确保财政可持续性、有效资源调动和根据政府目标分配预算。 • 扩大核心作用 – 一些财政部还负责经济发展和规划 • 支持作用 – 政府内部关于新政策举措和投资的性价比、财务可行性和可持续性的专业知识来源（财政部财务职能领导作用）。 • 协调作用 – 与政府中心密切合作，支持跨政府优先事项（例如国家基础设施、气候、数字化等）的融资。