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科学海洋钻孔发现超深日本沟槽中的动态碳循环
在所谓的超级地震中进行灾难，就像2011年发生在毁灭性的tohoku-oki地震期间。与地震相关的海底变形和摇动可以重新探测大量的沉积物和新鲜的有机碳，随后通过重力流动到哈达尔沟槽盆地的末端水槽中。为了研究巨型地震的长期历史并研究地震在超深水环境中的作用，IODP Expedition 386团队已收集并分析了58个从孔中取出的58个沉积物核心，该孔在500千万千万千千万英寸的500千万英寸井下的15个地点深37.82米处。“这些操作探险成就取得了成功的深度提交采样，在海平面以下7445-8023 m之间的水深下水，在50多年的科学海洋钻井和训练中创下了两个新记录。”“我们已经在8023米的水深下方的最深的水位位置，并从海拔8060.74米处恢复了最深的亚海水平样品”。
转移性结直肠癌治疗治疗反应评估通过无细胞DNA的超深测序和匹配的白细胞
摘要◥目的：循环肿瘤DNA（CTDNA）具有指导疗法选择并监测转移性癌症患者的治疗反应。然而，种系和克隆造血 - 相关的改变可能会混淆无细胞DNA（CFDNA）中肿瘤突变的鉴定，通常需要对肿瘤组织进行其他测序。当前的研究评估了是否可以通过将CFDNA的超深靶向测序分析与患者匹配的白细胞（WBC）衍生的DNA相结合，从而以肿瘤组织进行基于CTDNA的治疗反应监测。实验设计：使用一项超深的靶向测序液体活检分析，分析了52例转移性结直肠癌患者的52例转移性结直肠癌患者，共有183cfDNA和49个WBC样品以及28个组织样品。
基于探路器的超深地下公共空间安全疏散模型
近年来,许多城市加大了地下公共空间的开发利用,但安全疏散问题制约了地下空间的开发,设计一套适合超深地下公共空间的安全疏散模型迫在眉睫。本文从建筑设计的角度,构建了一种将下沉式避难所与自行设计的安全疏散系统(SES)相结合的安全疏散模型,并与其他模型的效果进行了比较。随后,在Pathfinder上对重庆轨道交通10号线红土地站的安全疏散模型进行了仿真。结果表明,将下沉式避难所与SES相结合的安全疏散模型对于超深地下公共空间人员疏散是可行的,该研究为超深地下公共空间的安全疏散技术提供了新的思路。
原创文章 使用基于捕获的超深度靶向测序技术在未接受治疗的 p 患者中识别出广泛的可操作变异
摘要：精准医疗需要准确的多基因临床诊断。在目前的临床实践中，靶向新一代测序 (NGS) 对手术标本变异调用的最低置信阈值设定为 2%-5%。然而，很少有研究使用基于捕获的超深度靶向测序来识别广泛的可操作变异，其检测限 (LOD) 为 1%。对 372 例来自未经治疗的原发性肺腺癌患者的手术标本进行了 AmoyDx® Essential NGS 面板的基于捕获的超深度靶向测序（带 UMI 的双索引测序接头），以检测与每位患者相关的可操作的体细胞驱动突变。报告了单核苷酸变异、插入/缺失事件和重排。进行了扩增-阻滞突变系统 (ARMS) 检测和荧光原位杂交 (FISH) 以验证 EGFR 和 ALK、ROS1 和 RET 融合中的热点突变。在可测序的非同义变异中，80.5% (352/437) 的样本被鉴定为可操作变异，最常见的是 EGFR 突变 (59.7%, 261/437)，其次是 KRAS 突变 (5.5%, 24/437)、PIK3CA 突变 (3.7%, 16/437)、ALK 重排 (3.4%, 15/437)、BRAF 突变 (2.7%, 12/437)、ERBB2 突变 (2.5%, 11/437) 和 RET 重排 (2.3%, 10/437)。共计 7.2% (28/372) 的样本具有多个可操作突变。在 93 例未发生 EGFR、KRAS 或 BRAF 突变的三阴性病例中，26 例（28%）检测到基因融合。在 328 份样本中，318 份样本（97.0%）的 EGFR ARMS 检测结果与 NGS 一致，32 份样本中，30 份样本（93.8%）的 ALK/ROS1/RET 融合基因 ARMS/FISH 检测结果与 NGS 一致。在这里，我们证明了基于捕获的超深度靶向测序方法（其 LOD 为 1%）可以分析初治肺腺癌患者手术标本中多种可操作变异，这突出了初治患者进行基因组分析的必要性。