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World File Search System转座酶
PiggyBac™转座酶
高活性 piggyBac 转座酶可促进小基因和大基因稳定整合到目标基因组中。该载体不可再生，不能在细菌中繁殖。SPB-100 – 改进的超级 piggyBac 转座酶 mRNA。序列已进行密码子优化（与 SPB-003 相比），以提供更好的 mRNA 稳定性和哺乳动物系统中的蛋白质表达。piggyBac 转座酶 mRNA 适用于无法有效转染载体 DNA 的细胞。SPB-200 – 良好制造级超级 piggyBac 转座酶 mRNA。序列已进行密码子优化，以提供更好的 mRNA 稳定性和哺乳动物系统中的蛋白质表达。piggyBac 转座酶 mRNA 适用于无法有效转染载体 DNA 的细胞。它非常适合将细胞系用于下游制造的应用，即需要 GMP 起始材料的研究和主细胞库。
CHOlympian 平台结合转座酶...
平台，我们首先利用 Cas-CLOVER 开发了一种敲除谷氨酰胺合成酶 (GS) 基因的新型悬浮 CHO K1 细胞系。广泛使用的 GS 敲除策略允许在用于 GS 拯救的相同质粒构建体上引入目的基因时对其进行扩增。大约 35% 的 GS 敲除候选细胞的两个等位基因都被 Cas-CLOVER 灭活。在建立稳定的 GS 敲除 CHO 细胞系后，我们开始针对利妥昔单抗 2（一种研究充分的 IgG1）进行抗体生产，作为测试案例。使用 piggyBac® 转座酶系统稳定整合了编码具有 GS 标记的利妥昔单抗重链和轻链的构建体。Solentim VIPS
使用CRISPR RNA引导的转座酶
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本于2023年3月21日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.03.18.533263 doi：Biorxiv Preprint
用于转座酶可访问的染色质测序（ATAC-SEQ）
用于转座酶可访问的染色质测序（ATAC-SEQ）的测定法用于理解和绘制细胞中DNA的表观遗传景观。组蛋白和其他蛋白质包装，并通过开放式（白染色质）或封闭（异染色质）构象调节DNA。可以通过ATAC-SEQ评估可及性的变化，并进行比较，以绘制疾病进展，药物治疗或其他实验条件期间的基因组位置和相关基因的变化。将ATAC-SEQ数据与转录组学数据配对可以增强并揭示细胞表型受表观遗传系统调节的新型机制。
使用TcBuster™ (TcB-M™) 转座酶实现高效...
基因组工程工具的快速发展推动了多种免疫和干细胞疗法进入临床试验，目的是产生自体和同种异体疗法。这些疗法中的许多都使用病毒载体来运送治疗货物。然而，病毒介导的疗法具有免疫原性、货物大小限制、整合位点风险、制造延迟的风险，并且成本极高。虽然有两种已知的非病毒转座酶系统 piggyBac ® 和 Sleeping Beauty ™ ，但两者都被专门授权用于细胞疗法，不能用于商业用途。TcBuster-M ™ (TcB-M ™ ) 是一种可商购的非病毒转座酶编辑平台，可克服当前的病毒限制。TcBuster 存在于赤拟谷盗中，是 hAT 转座酶家族的成员。利用定向进化，我们设计了一种高活性突变体 (TcB-M)，使用更少的 mRNA 转座酶和 Nanoplasmid ™ DNA 转座子提高了转座率。与用于构建 piggyBac 和 Sleeping Beauty 高活性酶的工程努力不同，我们在哺乳动物细胞中使用了一种新型高通量筛选平台。这使我们能够筛选一个包含 >300 万个变体的突变体库，这比用于构建 PiggyBac 或 Sleeping Beauty 的突变体库大得多。这导致构建了用于设计原代免疫细胞的最有效的转座酶系统。TcB-M 允许快速制造细胞，并且细胞制造成本有限。目前，从载体图谱到 GMP 转座子的 TcB-M 时间约为 6-8 个月。由于 TcB-M 受货物尺寸的限制较少，我们可以设计大型多顺反子转座子，以便在各种细胞类型中稳定地递送多种蛋白质，包括原代 T 细胞和 NK 细胞、间充质干细胞和诱导性多能干细胞 (iPSC)。此外，TcB-M 可以轻松与内切酶（如 CRISPR 试剂）结合，以生成组合敲除/过表达编辑细胞产物。改进的 TcB-M 使原代 T 细胞和外周血来源的 NK 细胞中的货物整合率超过 60%，而不会牺牲细胞生长或克隆优势问题。最后，我们对慢病毒、piggyBac 和 Sleeping Beauty 工程化 CAR-T 进行了直接比较，表明 TcB-M 工程化 CAR-T 具有同等或更高的整合百分比。TcB-M 还具有更安全的整合特性，因为与慢病毒相比，它更随机地整合到基因组中，而没有对活性位点的偏好。总体而言，TcB-M 是一种广泛可用、经过验证的非病毒基因编辑技术，可在多种细胞类型中递送大量或难以处理的治疗物质。TcB-M 减少了许多病毒介导的编辑障碍，从而可以更快地生成关键的治疗方法并将其推向市场。
人脑发育所需的转座酶衍生基因
1分子药理学计划，斯隆·凯特林研究所，纪念斯隆·凯特林癌症中心，纽约，纽约，10021； 2儿科学系的发展肿瘤中心，纪念斯隆·凯特林癌症中心；纽约，美国，10021； 3巴塞罗那10超级计算中心（BSC），西班牙巴塞罗那，08034； 4小儿运动障碍计划，巴罗神经学研究所，凤凰城儿童医院以及儿童健康，神经病学，遗传学和细胞和分子医学部门，凤凰城，亚利桑那州； 5纽约州纽约市威尔·康奈尔医学院药理学系，10021； 6数学基因组学计划，系统生物学和生物医学信息学部门，哥伦比亚15大学，纽约，纽约； 7 Csiro Health and Biosecurity，澳大利亚澳大利亚澳大利亚E-Health Research Center，澳大利亚布里斯班； 8协助Publique-Hôpitauxde Paris，DépartementdeGénétique，HôpitalPitié-Salpêtrière，法国巴黎，巴黎； 9法国Picardie Jules Verne大学多模式分析研究小组； 10儿科神经生理学单元，法国阿米斯皮卡迪大学医院； 11凤凰儿童医院，亚利桑那州凤凰城； 20 12 Hacettepe University，医学院儿童健康研究所，土耳其安卡拉儿科代谢系； 13洛杉矶新奥尔良路易斯安那州泽维尔大学物理与计算机科学系； 14InstitucióCatalanade Recerca I EstudisAvançats（ICREA），西班牙巴塞罗那，15个儿科，药理学和生理学和生物物理学，Weill Cornell医学院康奈尔大学医学院研究生院；纽约，美国。25
人类大脑发育所需的转座酶衍生基因
卢兹·朱比尔·萨帕特 1,2 , 萨拉·A·刘易斯 3 , 罗德里戈·洛佩兹·古铁雷斯 4 , 山田真希子 1,2 , 2 埃利亚斯·罗德里格斯-福斯 5 , 默斯·普拉纳斯-菲利克斯 5 , 丹尼尔·卡梅伦 1,2 , 菲利普·德马雷斯特 1 , 阿尼卡 3 纳比拉 6 , 海伦·穆勒 1,2 , 俊飞赵 7、Paul Bergin 6、Casie Reed 1、Tzippora Chwat-4 Edelstein 8,9、Alex Pagnozzi 10、Caroline Nava 11、Emilie Bourel-Ponchel 12,13、Patricia Cornejo 14、5 Ali Dursun 15、R. Köksal Özgül 15、Halil礼萨金枪鱼阿卡尔 15 号Maroofian 16 , Henry Houlden 16 , Huma 6 Arshad Cheema 17 , Muhammad Nadeem Anjum 17 , Giovanni Zifarelli 18 , Miriam Essid 19 , Meriem 7 Ben Hafsa 19 , Hanene Benrhouma 19 , Carolina Isabel Galaz Montoya 20 , Alex Proekt 21 ,小兰 8 赵 8，尼古拉斯·D·索奇 1，马修·海耶斯 22，伊夫·比戈特 23，劳尔·拉巴丹 7，大卫·托伦茨 5,24，9 克劳迪娅·L·克莱曼 4,25，迈克尔·C·克鲁尔 3，米克洛斯·托特 6，亚历克斯·肯特西斯 1,2,5,26 * 10
高活性转座酶的发现和语言模型指导设计
传统上，合成生物学仅限于在自然界中进行生物勘探，然后进行重构和优化。随着生成式 AI 方法应用于蛋白质设计的发展，可以增强采样的自然多样性，以生成自然界中未见过的功能序列 8–10。例如，RFdiffusion 11 与设计催化位点的新方法相结合，创造了具有新折叠的活性合成丝氨酸水解酶 12。有趣的是，最近使用蛋白质大语言模型来生成 CRISPR-cas9，这是一种与 DNA 和 RNA 结合的非常复杂的多结构域蛋白质，它在自然界中并不存在，但在基因编辑应用中效果很好 8。此类模型的发展为扩展自然目录之外的生物多样性以及利用生成式 AI 为生物技术创建具有更高活性的基因编写器开辟了非常令人兴奋的机会。
Tagify™ i5 UMI 适配器加载转座酶 24/96 ...
简介 seqWell 的 Tagify™ i5 UMI 适配器负载转座酶试剂旨在催化通过 Tn5 转座酶用寡核苷酸有效载荷片段化和标记 DNA 的反应。具体而言，这些试剂可提供由全长、与 Illumina 兼容的 P5/i5/UMI/R1 引发序列组成的寡核苷酸，这些序列还包含 10 个碱基的条形码和 10 个碱基的唯一分子标识符 (UMI) 区域。这些试剂可作为靶向测序检测的一部分加入，例如 UDiTaS 1 或 RGen-Seq 2 应用、CRISPR QC 以及细胞和基因工程 QC。该产品以 24 种或 96 种不同的条形码 UMI 试剂形式提供。本用户指南介绍了试剂的一般用途，并非旨在作为特定文库制备方法的完整协议。建议个人用户查看其应用程序 3 并根据需要进行修改。
基于快速转座酶的总DNA文库制备和使用Minion
处理化学药品和生物剂时，您需要始终穿安全设备，包括实验室外套，手套和安全护目镜。虽然用于小麦感染的主要生物学剂是澳大利亚常见的病原体，但您必须将它们视为普遍关注的感染剂。谨慎对待他们。请勿将其从实验室中删除。不要通过衣服散布它们。使用专用的笔记本和笔在迷你研究项目中做笔记。在实验室中不要将任何东西放在嘴里。每次离开实验室时洗手。