摘要欧洲面临蓝胞菌病毒(BTV)血清型的定期介绍和重新引入,最近通过在野土中的血清型3的入侵而举例说明。尽管将疾病载体的长距离风散布,Culicoides spp。被认为是病毒介绍途径,但在风险评估中仍然被研究了。开发了一个定量风险评估框架,以估计BTV-3从撒丁岛侵入欧洲大陆的风险,该病毒自2018年以来一直存在。我们使用了大气传输模型(杂交单颗粒拉格朗日综合轨迹)来推断昆虫载体的空气传播分散的可能性。流行病学疾病参数量化了撒丁岛载体种群中病毒的流行及其在新区域引入后的第一次传播。假设最大持续时间为24小时,撒丁岛引入BTV的风险仅限于地中海盆地,主要影响意大利半岛,西西里,马耳他和科西嘉岛的西南地区。风险延伸到意大利的北部和中部地区,巴利阿里群岛以及法国大陆和西班牙,主要是最大持续时间长于24小时。关于矢量流条件和杂物复合物特异性参数的其他知识可以改善模型的鲁棒性。我们的框架为BTV介绍风险提供了空间和时间见解,是指导全球监视和准备对Epizootics的准备的关键工具。
摘要欧洲面临蓝胞菌病毒(BTV)血清型的定期介绍和重新引入,最近通过在野土中的血清型3的入侵而举例说明。尽管将疾病载体的长距离风散布,Culicoides spp。被认为是病毒介绍途径,但在风险评估中仍然被研究了。开发了一个定量风险评估框架,以估计BTV-3从撒丁岛侵入欧洲大陆的风险,该病毒自2018年以来一直存在。我们使用了大气传输模型(杂交单颗粒拉格朗日综合轨迹)来推断昆虫载体的空气传播分散的可能性。流行病学疾病参数量化了撒丁岛载体种群中病毒的流行及其在新区域引入后的第一次传播。假设最大持续时间为24小时,撒丁岛引入BTV的风险仅限于地中海盆地,主要影响意大利半岛,西西里,马耳他和科西嘉岛的西南地区。风险延伸到意大利的北部和中部地区,巴利阿里群岛以及法国大陆和西班牙,主要是最大持续时间长于24小时。关于矢量流条件和杂物复合物特异性参数的其他知识可以改善模型的鲁棒性。我们的框架为BTV介绍风险提供了空间和时间见解,是指导全球监视和准备对Epizootics的准备的关键工具。
为了充分发挥基因编辑技术在临床治疗中的巨大潜力,需要彻底评估靶向编辑和非预期编辑的后果。然而,目前缺乏一种全面、流水线化、大规模且经济的工作流程来检测基因组编辑结果,特别是插入或删除大片段。在这里,我们描述了一种通过对条形码长距离 PCR 产物进行纳米孔池测序来有效准确地检测 CRISPR-Cas9 编辑后的多个基因变化的方法。为了克服纳米孔测序的高错误率和插入缺失,我们开发了一种流程,通过对纳米孔扩增子测序 (GREPore-seq) 的读取进行 grepping 来捕获条形码序列。GREPore-seq 可以检测 NHEJ 介导的双链寡脱氧核苷酸 (dsODN) 插入,其准确度与 Illumina 下一代测序 (NGS) 相当。GREPore-seq 还可以识别 HDR 介导的大基因敲入,这与 FACS 分析数据高度相关。还检测到了 HDR 编辑后的低水平质粒骨架插入。我们建立了一个实用的工作流程来识别遗传变化,包括量化 dsODN 插入、敲入、质粒骨架插入和 CRISPR 编辑后的大片段缺失。该工具包用于对汇集的长扩增子进行纳米孔测序,在评估靶向 HDR 编辑和超过 1 kb 的意外大插入缺失方面应具有广泛的应用。GREPore-seq 可在 GitHub 上免费获取(https://github.com/lisiang/GREPore-seq)。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证未通过同行评审获得证明)是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。它是制作
使用长读数据获得的高质量基因组不仅可以更好地了解杂合性水平、重复内容以及与使用短读技术获得的基因组相比更准确的基因注释和预测,而且还可以帮助了解单倍型分化。近年来,长读测序技术的进步使得为非模式生物生成此类高质量组装成为可能。这使我们能够重新审视基因组,而使用前几代数据和组装软件将其组装到染色体规模上一直存在问题。线虫是后生动物中种类最多、种类最多的动物门之一,但对其研究仍然很少,许多以前组装的基因组都是碎片化的。使用 Nanopore R10.4.1 和 PacBio HiFi 获得的长读长,我们生成了 Mermithidae 科二倍体线虫的高度连续组装体,目前尚未获得该科的密切相关基因组,以及 Panagrolaimidae 科三倍体线虫的折叠组装体和分阶段组装体。这两个基因组之前都已分析过,但碎片组装体的支架大小与组装前的长读长长度相当。我们的新组装体说明了长读长技术如何更好地表示物种基因组。我们现在能够根据更完整的基因和转座因子预测进行更准确的下游分析。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年11月17日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.11.15.566914 doi:Biorxiv Preprint
。CC-BY-NC 4.0国际许可证的永久性。是根据作者/资助者提供的预印本(未经Peer Review的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2023年10月18日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2023.06.05.543687 doi:Biorxiv Preprint
人们已经采用了多种方法来辨别人类的情绪,包括分析语音模式和语调( Moriyama 和 Ozawa,2003;Zeng 等人,2009)。然而,值得注意的是,这种身体状态很容易被操纵或模仿( Schuller 和 Schuller,2021)。面部表情及其变化通常用于情绪识别;然而,这些表情可以被个人有意修改,这对准确辨别他们的真实情绪提出了挑战( Aryanmehr 等人,2018; Dzedzickis 等人,2020; Harouni 等人,2022)。 EEG(脑电图)是一种通过测量大脑内集体神经活动产生的电压变化来监测大脑活动的技术(San-Segundo 等人,2019 年;Dehghani 等人,2020 年、2022 年、2023 年;Sadjadi 等人,2021 年;Mosayebi 等人,2022 年)。脑电图是大脑活动和功能的反映,具有多种应用,包括但不限于情绪识别(Dehghani 等人,2011a、b、2013;Ebrahimzadeh 和 Alavi,2013;Nikravan 等人,2016;Soroush 等人,2017、2018a、b、2019a、b、2020;Bagherzadeh 等人,2018;Alom 等人,2019;Ebrahimzadeh 等人,2019a、b、c、2021、2022、2023;Bagheri 和 Power,2020;Karimi 等人,2022;Rehman 等人,2022;Yousefi 等人,2022, 2023 年)。
如图1所示,实验在由80km光纤轴级联构成的480km光纤链路上进行。传输系统的发射机和接收机分别放置在链路的两端,在光纤链路上放置双向掺铒光纤放大器(Bi-EDFA)。实验结果如图2所示,当PLL关闭时,传输系统的频率稳定度为4.65×10 -14 @ 1s和4.66×10 -17 @ 10,000s。当PLL关闭时,传输系统的频率稳定度为1.54×10 -13 @ 1s和1.17×10 -16 @ 10,000s。实验结果表明,对于长距离频率传输,PLL可以明显提高传输系统的频率稳定度。从接收机恢复出的同步频率信号的频率稳定度比铯钟的稳定度要好,满足了长距离频率传输的需要。
研究小组分析了 506 名参加新加坡“健康成长” (GUSTO) 队列研究的儿童自出生以来的数据。当孩子 12 个月大时,研究人员要求家长报告每周工作日和周末的平均屏幕使用时间。然后,根据每天的屏幕使用时间,将儿童分为四组:少于一小时、一至两小时、两至四小时和超过四小时。在 18 个月大时,研究人员还使用脑电图 (EEG) 收集大脑活动,这是一种跟踪大脑活动变化的高灵敏度工具。除了接受脑电图检查外,每个孩子还参加了各种认知能力测试,以测量他们在 9 岁时的注意力持续时间和执行功能(有时称为自我调节技能)。