XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System通路
依赖 PLL2 的伤口反应激活使系统素与其他免疫信号通路区分开来
然后，我们对磷酸肽丰度谱进行了 k 均值聚类，以比较两种细胞培养物之间蛋白质磷酸化的动态变化（图 1d，扩展数据图 2a）。在簇 2 和簇 3 中观察到了最大的差异，其特征是在系统素处理后 1 分钟内磷酸化迅速且短暂地下降。这些簇中不到 20%（198）的肽来自 syr1，而来自系统素反应野生型的肽则超过 80%（1036）（图 1c）。然后，我们检查了这 1036 个肽在 syr1 细胞中是否显示出随时间变化的磷酸化变化，如果是，它们属于哪个簇。我们在除 2 和 3 之外的所有簇中都发现了它们；它们都没有在处理后 1 分钟显示出系统素引起的丰度下降（图 1e）。数据表明，SYR1 介导的系统素反应以细胞蛋白质快速、瞬时去磷酸化为特征，这意味着蛋白磷酸酶在系统素信号传导早期就被激活。
依赖 PLL2 的伤口反应激活使系统素与其他免疫信号通路区分开来
然后，我们对磷酸肽丰度谱进行了 k 均值聚类，以比较两种细胞培养物之间蛋白质磷酸化的动态变化（图 1d，扩展数据图 2a）。在簇 2 和簇 3 中观察到了最大的差异，其特征是在系统素处理后 1 分钟内磷酸化迅速且短暂地下降。这些簇中不到 20%（198）的肽来自 syr1，而来自系统素反应野生型的肽则超过 80%（1036）（图 1c）。然后，我们检查了这 1036 个肽在 syr1 细胞中是否显示出随时间变化的磷酸化变化，如果是，它们属于哪个簇。我们在除 2 和 3 之外的所有簇中都发现了它们；它们都没有在处理后 1 分钟显示出系统素诱导的丰度下降（图 1e）。数据表明，SYR1 介导的系统素反应以细胞蛋白质快速、瞬时去磷酸化为特征，这意味着蛋白磷酸酶在系统素信号传导早期就被激活。
针对去分化脂肪肉瘤中的 MDM2-p53 通路
去分化脂肪肉瘤 (DDLPS) 是一种恶性脂肪生成癌症，预后不良。DDLPS 肿瘤对化疗和放疗的敏感性较低，需要更有效的治疗方法。从遗传学上讲，DDLPS 的特点是肿瘤突变负担低，染色体结构异常频繁，包括 12q13-15 染色体区域和 MDM2 基因的扩增，这是 DDLPS 的定义特征。MDM2 蛋白是一种 E3 泛素连接酶，靶向肿瘤抑制因子 p53 进行蛋白酶体降解。人类恶性肿瘤中的 MDM2 扩增或过度表达与细胞周期进展和预后较差有关。因此，MDM2 - p53 相互作用作为 DDLPS 和其他恶性肿瘤的治疗靶点引起了人们的兴趣。MDM2 通过疏水蛋白相互作用与 p53 结合，这种相互作用很容易被合成类似物所利用。已经开发了多种药物，包括 Nutlins（如 RG7112）和小分子抑制剂（包括 SAR405838 和 HDM201）。临床前体外和动物模型已显示出抑制 MDM2 的良好效果，可导致 p53 强效再激活和癌细胞死亡。然而，多项早期临床试验未能证明抑制 MDM2 通路对 DDLPS 有益。耐药机制正在阐明，新型抑制剂和联合疗法目前正在研究中。本综述概述了针对 DDLPS 中 MDM2 的这些策略。
基于 FACS 的全基因组 CRISPR 筛选确定 DNA 损伤信号通路的关键调节因子
DNA 损伤激活信号通路对于协调多个细胞过程至关重要，必须严格调控这些过程才能维持基因组稳定性。为了提供全面、公正的 DDR 信号通路观点，我们在人类细胞系中进行了 30 次基于荧光激活细胞分选的全基因组 CRISPR 筛选，使用识别不同内源性 DNA 损伤信号蛋白的抗体来识别参与 DNA 损伤反应 (DDR) 的关键调节剂。我们发现蛋白酶体介导的加工是细胞触发喜树碱和依托泊苷诱导的 DDR 信号的早期和先决条件事件。此外，我们还确定 PRMT1 和 PRMT5 是调节 ATM 蛋白水平的调节剂。此外，我们发现 GNB1L 是 DDR 信号的关键调节剂，因为它作为辅助伴侣分子，专门调节 PIKK 蛋白。总的来说，这些筛查为进一步研究 DDR 提供了丰富的资源，可能有助于深入了解针对这些 DDR 通路以改善治疗结果的策略。
肠道本能：利用益生菌的力量在溃疡性结肠炎中驯服致病信号通路
溃疡性结肠炎（UC）是一种慢性炎症性肠病（IBD），其特征是大肠的粘膜内膜持续炎症，导致症状令人衰弱和生活质量降低。新兴证据表明，肠道菌群的失衡在UC发病机理中起着至关重要的作用，并且各种信号通路与免疫反应失调有关。益生菌是给宿主带来健康益处的活微生物，引起了人们对恢复肠道微生物平衡和改善UC炎症的潜力的极大关注。最近的研究阐明了益生菌调节这些信号通路的机制，通常是通过产生抗炎分子并促进调节性免疫细胞功能。例如，益生菌可以通过稳定Kappa B alpha（IκBα）的抑制剂来抑制核因子-κB（NF-κB）途径，从而抑制促炎细胞因子的产生。同样，益生菌可以调节Janus激酶/信号转录器和转录激活因子（JAK/STAT）信号通路，从而抑制了STAT1和STAT3的激活，从而减少了炎症反应。在调节UC中调节致病信号通路时，更好地理解益生菌的潜在机制将为开发更有效的基于益生菌的疗法铺平道路。In this review, we explore the mechanistic role of probiotics in the attenuation of pathogenic signaling pathways, including NF- κ B, JAK/STAT, mitogen-activated protein kinases (MAPKs), Wnt/ β -catenin, the nucleotide-binding domain (NOD)-, leucine- rich repeat (LRR)- and pyrin domain-containing protein 3 （NLRP3）UC中的炎性体，Toll样受体（TLR），白介素23（IL-23）/IL-17信号通路。
情感上涉及的神经通路...
情绪是由于一个人的生理学变化而产生的，这是由于对任何环境变化的适当反应而产生的。情绪决定了一个人的行为。在某种情况下的刺激会发展成为愤怒，我们的口头提示变化，变得侮辱或粗鲁。同样，当收到好消息时，会注意到诸如幸福之类的感觉。通常不太可能发展负面情绪。情绪是进化优势的产物，负责产生我们可以用于生存的环保反应。表现出情感的能力的一部分是检测周围人的情绪和反应的社交技巧。但是，随着情况变得更加细微和复杂，情绪的转变经常发生。人类影响内部情绪和其他人的倾向是情感调节过程（ER）过程的产物[1]。
揭示相互作用：在胰腺胚胎发生的背景下探索胰腺癌的信号通路
由于诊断延迟和肿瘤生物学侵袭性，胰腺癌仍然是一种致命疾病。据报道，致癌基因和风险因素会影响胰腺胚胎发生中的信号通路，从而导致胰腺癌的发生。尽管使用啮齿动物模型的研究已经获得了有见地的信息，但是人类胰腺组织的稀缺使得人们很难理解人类胰腺的发育方式。IPF1/PDX1、HLXB9、PBX1、MEIS、Islet-1 等转录因子和 Hedgehog、TGF-β 和 Notch 等信号通路正在指导胰腺器官发生。上述通路中的任何紊乱都可能导致胰腺癌。TP53：和 CDKN2A 是肿瘤抑制基因，TP53 突变和 CDKN2A 体细胞缺失是胰腺癌的驱动因素。本综述阐明了胰腺癌所涉及的复杂信号机制、胰腺发育中的相同信号通路、当前针对信号分子的治疗方法以及危险因素在促进胰腺癌中的作用机制。
尼沃单抗到达复发性胶质母细胞瘤患者的脑病变部位，诱导 T 细胞活性并上调检查点通路
胶质母细胞瘤 (GBM) 是一种恶性程度较高的脑肿瘤，预后较差。尽管免疫疗法正在被探索作为 GBM 患者的潜在治疗选择，但目前尚不清楚全身免疫疗法是否能够达到并改变脑内的肿瘤微环境。我们评估了在手术前 1 周接受抗 PD-1 免疫检查点抑制剂 nivolumab 的患者的免疫特征，并与未接受过 nivolumab 治疗而接受挽救性切除术的对照患者进行了比较。我们观察到 nivolumab 与脑内肿瘤内和组织驻留 T 细胞结合的饱和水平，这意味着 nivolumab 的饱和水平可以到达脑肿瘤。在 nivolumab 治疗后，在肿瘤驻留 T 细胞群中观察到 T 细胞活化和增殖的显著变化，并且外周 T 细胞上调趋化因子受体
分子通路利用从细胞系到肿瘤和患者来源的异种移植的转移学习增强药物反应预测
计算模型已成功预测癌细胞系数据中的药物敏感性，为指导精准医疗创造了机会。然而，将这些模型转化为肿瘤仍然具有挑战性。我们提出了一种新的迁移学习工作流程，该工作流程基于源自基因组特征的分子通路，将药物敏感性预测模型从大规模癌细胞系转移到肿瘤和患者来源的异种移植。我们进一步计算特征重要性以确定对药物反应预测最重要的途径。我们在肿瘤（AUROC = 0.77）和三阴性乳腺癌患者来源的异种移植（RMSE = 0.11）上获得了良好的表现。利用特征重要性，我们强调了 ER-Golgi 运输通路与乳腺癌患者依维莫司敏感性之间的关联以及 II 类组蛋白去乙酰化酶和白细胞介素-12 在三阴性乳腺癌药物反应中的作用。通路信息支持将药物反应预测模型从细胞系转移到肿瘤，并可以提供预测背后的生物学解释，作为临床环境使用的垫脚石。
在不同发育阶段的后代小鼠海马中，砷暴露对PI3K/AKT/NF-κB信号通路的影响
本研究的主要目的是探索砷对磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（AKT）/核转录因子-κB（NF-κB）信号途径的影响。砷（Naaso 2）的剂量为0、15、30或60 mg/l的雌性小鼠及其幼犬。通过EMSA评估NF-κB的核转运水平。实时RT-PCR用于测量AKT，NF-κB和PI3K mRNA水平。PI3K，P-AKT，抑制剂Kappa B激酶（IKK），P-NF-κB，蛋白激酶A（PKA），抑制剂KAPPA B（IκB）和cAMP反应元件结合蛋白（CREB）的蛋白质表达。结果表明，暴露于60 mg/l NaASO 2可以抑制NF-κB产后日（PND）20和PND 40小鼠的NF-κB水平。砷在PI3K，AKT和NF-κB的转录和翻译水平下调。此外，P-IKK，P-IκB，PKA和P-CREB的蛋白质表达也降低了。总的来说，本研究的结果表明，砷可以下调PI3K/AKT/NF-κB信号传导途径，尤其是在PND 40上，这可能与认知障碍有关。