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World File Search System酵母
用裂殖酵母和日本裂殖酵母发酵的苹果酒的挥发性特征的差异
摘要：本研究研究了两株粟酒裂殖酵母菌株（NCAIM Y01474 T 和 SBPS）和两株日本裂殖酵母菌株（DBVPG 6274 T、M23B）发酵苹果汁的能力，并与酿酒酵母 EC1118 进行了比较，以了解它们对苹果酒挥发性化合物的影响。裂殖酵母的乙醇耐受性和脱酸能力使其成为常用酿酒酵母发酵剂的潜在替代品。尽管时间过程不同（10-30 天），但所有菌株均可完成发酵过程，裂殖酵母菌株降低了苹果汁中的苹果酸浓度。结果表明，每种酵母对苹果酒的挥发性成分都有不同的影响，使用主成分分析可以分离最终产品。苹果酒的挥发性成分在醇、酯和脂肪酸的浓度方面表现出显著差异。具体来说，絮凝剂菌株 S. japonicus M23B 增加了乙酸乙酯（315.44 ± 73.07 mg/L）、乙酸异戊酯（5.99 ± 0.13 mg/L）和异戊醇（24.77 ± 15.19 mg/L）的含量，而 DBVPG 6274 T 使苯乙醇和甲硫醇的含量分别增加到 6.19 ± 0.51 mg/L 和 3.72 ± 0.71 mg/L。在 S. cerevisiae EC1118 发酵的苹果酒中检测到大量萜烯和乙酯（例如辛酸乙酯）的产生。这项研究首次证明了 S. japonicus 在苹果酒酿造中的应用可能性，可以为产品提供独特的芳香味”。
基因丢失和顺式调控新陈代谢塑造了有尖酵母 Hanseniaspora uvarum 中的核心组蛋白基因进化
尽管核心组蛋白基因的蛋白质序列保守，但它们表现出显著的顺式调控机制多样性。然而，这种调控周转的动态和意义尚不清楚。在这里，我们描述了芽殖酵母中 4 亿年来核心组蛋白基因调控的进化史。我们发现，由反式调控因子 Spt10 介导的典型核心组蛋白调控模式很古老，可能出现于 3.2 亿至 3.8 亿年前，并且在大多数现存物种中都是固定的。出乎意料的是，我们发现 Hanseniaspora 属在其快速进化的谱系中出现了一种新的核心组蛋白调控模式，这与其旁系同源核心组蛋白基因的 1 个拷贝丢失同时发生。我们表明，通过组蛋白控制区中的顺式调控变化，祖先的 Spt10 组蛋白调控模式被衍生的 Mcm1 组蛋白调控模式所取代，并且这种重新布线事件发生时反式调控因子 Mcm1 本身没有变化。最后，我们研究了转基因 Hanseniaspora uvarum 的细胞周期和组蛋白合成的生长动力学。我们发现 H. uvarum 分裂迅速，大多数细胞在 60 分钟内完成一个细胞周期。有趣的是，我们观察到 H. uvarum 中组蛋白和 DNA 合成之间的调控耦合丢失了。我们的结果表明，核心组蛋白基因调控在芽殖酵母中早已固定，但在 Hanseniaspora 快速进化谱系中却发生了很大分化。
氮酶辅因子生物合成，使用在酿酒酵母的线粒体中产生的蛋白质
抽象的生物氮固定，惰性N 2向代谢可触发的NH 3的转化仅由某些称为重18zotrophs的微生物进行，并由氮酶催化。a [7fe-9s-c-mo- r- homocitrate] - cofactor（指定为femo-CO）提供了催化位点，用于降低mo依赖性氮酶的n 2。因此，在模型真核生物（例如酿酒酵母）中实现FEAMO-CO形成，这是使它们具有MO依赖性生物氮固定能力的重要里程碑。femo-CO组装中的中心播放器是脚手架蛋白Nifen，在该蛋白质中，NIFB的[8FE-9S-C]前体的nifb-Co处理。先前的工作确定可以在酿酒酵母线粒体中产生NIFB-CO。在当前的工作中，在酿酒酵母中表达了来自不同重18zotrophs的Nifen基因的库，针对线粒体，并针对产生可溶性硝基蛋白质复合物的能力进行了调查。许多这样的nifen变体在重生A. vinelandii中异源产生时，都支持FEMO-CO形成。然而，其中只有三个以可溶性形式积聚在有氧培养的酿酒酵母的线粒体中。在体外FEAM-CO合成测定中有两个变体活跃。Nifen，Nifb和NIFH蛋白（所有这些物种都从酿酒酵母线粒体中产生并纯化），以建立成功的FEMO-CO生物合成途径。这些发现表明，将各种种间氮酶Feemo-CO组件组件结合在一起可能是一种有效的，也许是实现和优化真核眼球生物体中氮固定的唯一方法。
标题：使用自动化平台Lustro作者和分支机构在酵母中进行高通量光遗传学实验：Zachary P. Harmer 1和Meg
摘要：该协议描述了如何使用自动化平台卢斯特罗来进行酵母中光遗传系统的高通量表征。摘要：光遗传学通过遗传编码的光敏感蛋白来精确控制细胞行为。但是，优化这些系统以实现所需的功能范围通常需要许多设计建造测试周期，这是耗时且劳动力的。为了解决这个问题，我们设计了Lustro，该平台将光刺激与实验室自动化相结合，以实现光学遗传系统的高通量筛选和表征。lustro使用配备有照明设备，摇动设备和板读取器的自动化工作站。编程机器人臂以在设备之间移动微孔板，以刺激光遗传学菌株并测量其响应。在这里，我们提出了一种使用lustro来表征酿酒酵母中的基因表达控制的光遗传系统的方案。该协议描述了如何设置Lustro的组件，将照明设备与自动化工作站集成在一起，并提供用于编程照明设备，板块读取器和机器人的说明。简介：光遗传学是一种强大的技术，它使用光敏感蛋白来控制高精度1-3的细胞行为。但是，原型遗传构建体并识别最佳照明条件可能很耗时，这使得很难优化光遗传系统4、5。高通量方法快速筛选并表征了光遗传系统的活性，可以加速设计建造循环的原型构造，
NEM1-SPO7/PAH1磷酸酶级联酶级别需要酿酒酵母Spo7 spo7的基本尾巴，脂质合成
酿酒酵母NEM1 - Spo7蛋白质磷酸酶复合物脱磷酸化，从而在核/内质网膜上激活PAH1。pah1，一种磷酸磷酸酶，催化磷酸化磷酸化以产生二酰基甘油，是脂质代谢中最高度调节的酶之一。在脂质磷酸酶反应中产生的二酰甘油醇用于合成储存在脂质滴剂中的三酰基甘油。NEM1 - SPO7/PAH1磷酸酶级联反应的破坏会导致过多的生理缺陷。spo7是NEM1 - SPO7复合物的调节亚基，是NEM1催化功能所需的，并且与PAH1的酸性尾巴相互作用。SPO7包含三个保守的同源区（CR1 - 3），对于与NEM1相互作用很重要，但其与PAH1相互作用的区域尚不清楚。Here, by deletion and site-speci fi c mutational analyses of Spo7, we revealed that the C-terminal basic tail (residues 240-259) containing fi ve argi- nine and two lysine residues is important for the Nem1 – Spo7 complex – mediated dephosphorylation of Pah1 and its cellular function (triacylglycerol synthesis, lipid droplet formation, maintenance of核/内质网膜形态和温度升高时的细胞生长）。合成肽的戊二醛交联分析表明，Spo7碱性尾巴与PAH1酸性尾巴相互作用。这项工作使我们对酵母脂质合成中SPO7功能和NEM1 - SPO7/PAH1磷酸酶级联的理解促进了我们的理解。
使用的酵母衍生成分的安全评估...
状态：暂定公开评论的暂定报告上次面板评论：12月4日至2023年发布日期：2024年1月10日，从上述发布日期（即2024年3月10日，2024年3月10日）提供了60天的所有感兴趣的人，以对此安全评估发表评论，并确定应包含或提供可以公开并包括公开和包括并包括并包括并包括并包括并包括并包括并包括的其他公开数据。可以在不识别包含该成分的化妆品的源或商品名的情况下提交信息。将在公开会议上讨论提交给《化妆品成分评论》（CIR）的所有未发表的数据，任何有兴趣的方都可以审查，并且可以在同行评审的科学杂志中引用。请向CIR执行董事Bart Heldreth博士提交数据，评论或请求。化妆品成分安全成员的专家小组是：主席，Wilma F. Bergfeld，M.D.，F.A.C.P。; Donald V. Belsito，医学博士; David E. Cohen，医学博士;柯蒂斯·D·克拉森（Curtis D. Klaassen）博士； Allan E. Rettie博士；大卫·罗斯（David Ross）博士； Thomas J. Slaga博士； Paul W. Snyder，D.V.M.，博士；和Susan C. Tilton博士化妆品成分评论（CIR）执行董事是Bart Heldreth博士，高级主任是Monice Fiume。此安全评估是由CIR高级科学分析师/作家M.S. Priya Cherian编写的。
酵母 Pah1 磷脂酸磷酸酶的催化核心功能揭示了其膜定位和活性控制的结构见解
PAH1 编码的磷脂酸 (PA) 磷酸酶是生产储存脂质三酰甘油的主要二酰甘油来源，也是酿酒酵母中从头合成磷脂的关键调节剂。Pah1 的催化功能取决于其膜定位，这是通过多种蛋白激酶的磷酸化和 Nem1-Spo7 蛋白磷酸酶复合物的去磷酸化来介导的。全长 Pah1 由催化核心（N-LIP 和 HAD 样结构域、两亲螺旋和 WRDPLVDID 结构域）和非催化调节序列（内在无序区域、RP 结构域和酸性尾部）组成，用于磷酸化和与 Nem1-Spo7 相互作用。催化核心如何调节 Pah1 定位和细胞功能尚不清楚。在本研究中，我们分析了 Pah1 的一种变体（即 Pah1-CC（催化核心）），它仅由催化核心组成。在低拷贝质粒上表达的 Pah1-CC 无需 Nem1-Spo7 即可补充 pah1 Δ 突变体表型（例如核/ER 膜扩张、三酰甘油水平降低和脂滴形成）。Pah1-CC 的细胞功能由其与膜部分主要相关的 PA 磷酸酶活性支持。尽管 Pah1-CC 具有功能性，但它在蛋白质和酶学特性方面与 Pah1 不同，包括过表达毒性、与热休克蛋白的关联以及 V max 值的显著降低。这些关于 Pah1 催化核心的发现增强了对其膜定位和活性控制结构要求的理解。
酵母的调控进化机制 - NSF-PAR
1 密歇根大学分子、细胞与发育生物学系，密歇根州安娜堡，美国 2 密歇根大学生态与进化生物学系，密歇根州安娜堡，美国 通讯作者 Patricia J. Wittkopp，wittkopp@umich.edu 生态与进化生物学系 分子、细胞与发育生物学系 4010 生物科学大楼 1105 北大学大道 密歇根大学，密歇根州安娜堡 48109-1048 美国 电话：+1-734-763-1548 所有作者电子邮件地址 siddiqm@umich.edu (MAS) wittkopp@umich.edu (PJW) 简称：酵母的调控进化机制 关键词：基因表达、调控网络、顺式调控、选择、突变 摘要 酵母调控变异的研究——在新的突变水平、物种内的多态性和物种间的分化——为真核生物基因表达进化的分子和进化过程提供了深刻见解。酵母基因组越来越容易被操纵，表达也越来越容易以高通量方式量化，这最近加速了对多个进化时间尺度上的顺式和反式调控变异的机制研究。例如，这些研究确定了影响其进化命运的顺式和反式突变性质的差异，通过实验表征了顺式和反式调控变异发挥作用的分子机制，并说明了调控网络如何在有或没有基因表达变化的物种之间出现分歧。
益生菌编程：布拉氏酵母菌中饮食反应性基因表达和定植控制
图 1. PGM2 的修复使 S. boulardii 能够代谢半乳糖 (a) 该图说明了 Sb 中的半乳糖利用途径，其中失活的 PGM2 酶导致有毒中间体积累。(b) 工程化的 SbGal⁺ 途径显示 PGM2 活性的恢复，从而实现高效的半乳糖代谢。(c) 野生型 Sb MYA-796 和基因修复的 Sb MYA-796 (SbGal⁺) 在具有各种碳源的完全合成培养基 (CSM) 中的生长比较。数据显示 SbGal⁺ 在 2% 半乳糖上的生长得到改善，证明了 PGM2 修复的好处（橙色突出显示）。在木糖和乳糖等不利用半乳糖代谢途径的替代糖上，Sb 和 SbGal⁺ 之间的生长差异很小甚至没有。 SbGal ⁺ 在棉子糖与葡萄糖共存时，生长增强，表明该菌株在肠道等复杂的糖环境中具有提高性能的潜力。值代表在所示培养基中生长 36 小时的三个生物重复的终点光密度的平均值。
多中心评估生物防病毒关节感染面板，用于检测滑液样品中细菌，酵母和AMR基因
摘要BioMérieux生物防病毒关节感染（JI）面板是一种在体外诊断测试中，用于同时且快速（〜1 H）检测39个潜在病原体，直接从滑膜流体（SF）样品中直接从滑膜流体（SF）样品中。三十一种或微生物组以及几个AMR基因。这项研究是为了评估生物病毒JI面板的调节清除率，提供了对1,544个前瞻性收集的剩余SF样品的多中心评估，与生物体或聚合酶链反应（PCR）和AMR基因的生物体或聚合酶链反应（PCR）相比，具有性能（SOC）培养的数据。生物通道JI面板的灵敏度均为90.9％或更高，除六种生物外，所有AMR基因的灵敏度为100％。生物通道JI面板的特异性为98.5％或更高，用于检测所有生物体，而所有AMR基因的检测百分比（NPA）为95.7％或更高。BioFire JI面板对SOC培养物进行了改进，其较短的时间可以使生物体和AMR基因具有出色的敏感性/PPA和特定的ITY/NPA，并且预计在各种临床情况下都可以及时且可操作的诊断信息，以供联合感染。