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World File Search System酵母
有益微生物酵母芽孢杆菌GP-P8的潜力，可抑制炭疽病病原体和胡椒植物生长促进
这项研究是为了筛选针对colletotrichum acutatum，colletotrichum dematium和colletotrichum coccodes的抗真菌性抗真菌性。细菌ISO从胡椒土壤中的GP-P8晚期GP-P8在体外双重培养测定中的平均抑制率为70.7％有效。16S rRNA基因测序分析结果表明，有效的细菌分离株是锡安森。还进行了GP-P8的生化表征。根据结果，蛋白酶和纤维素，铁载体产生，磷酸盐溶解，淀粉水解和吲哚-3-乙酸的产生。使用特定的引物，涉及抗生素产生的基因，例如ITURIN，富霉素，艰难蛋白，比蛋白，杆菌蛋白，杆菌素，表面蛋白，大乳糖素，大糖锡和芽孢杆菌，以及siamensis gp-p8中也被检测到。通过固相微萃取/气相色谱 - 质谱法（SPME/GC-MS）对挥发性有机化合物的鉴定和分析表明，分离株GP-P8产生了乙酰酸和2,3-丁烷二醇。体内测试表明，GP-P8 SIG极大地降低了由阿司霉菌引起的炭疽病疾病，并增强了胡椒植物的生长。
氧合影响酵母菌属和Scheffersomyces
©作者2024。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
隔离和鉴定Caleb中的酵母...
摘要背景宫颈癌是由人类乳头瘤病毒（HPV）引起的，并且仍然是一个主要的公共卫生问题。有几种诊断方法。知道它们的比较有用性可能有助于制定适当的策略，以便在资源受限的环境中早期发现该妇科癌症。目的本研究旨在评估人乳头瘤病毒（HPV）E6/E7 mRNA测定，HPV DNA测试和细胞学在印度第三三级护理中心检测高级宫颈病变和侵入性宫颈癌的功效。方法在这项基于医院的研究中总共招募了106名妇女，并接受了分子测试（HPV DNA测试和mRNA分析），细胞学测试和阴道镜引导的活检。组织病理学诊断被认为是黄金标准。结果我们观察到，在106名参与者中，有56名在HPV DNA或E6/E7 mRNA阳性的情况下具有异常结果，有或没有异常细胞学，或者在组织病理学上证实了恶性/恶性病变。47.2％（50/106）和32％（34/106）的女性分别为HPV DNA和E6/E7 mRNA阳性。 33％（35/106）妇女患有异常细胞学，29.2％（31/106）在组织学确认的CIN II和更高的病变上。 对CIN III+病变的细胞学和HPV DNA的敏感性和特异性分别为92％，90.4％和88％和68％。 在检测CIN II +病变时，发现MRNA测定比其他测试更敏感（96％）和特异性（93.3％）。 结论E6/E7 mRNA分析似乎优于HPV DNA检测和细胞学检测，在检测高级宫颈病变和浸润性癌中。47.2％（50/106）和32％（34/106）的女性分别为HPV DNA和E6/E7 mRNA阳性。33％（35/106）妇女患有异常细胞学，29.2％（31/106）在组织学确认的CIN II和更高的病变上。对CIN III+病变的细胞学和HPV DNA的敏感性和特异性分别为92％，90.4％和88％和68％。在检测CIN II +病变时，发现MRNA测定比其他测试更敏感（96％）和特异性（93.3％）。结论E6/E7 mRNA分析似乎优于HPV DNA检测和细胞学检测，在检测高级宫颈病变和浸润性癌中。它可以用作HPV DNA测试或细胞学的替代方案，以进行宫颈癌筛查，并有助于减少阴道镜的负载。
系统鉴定植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域
Niklas F.C. Hummel，1，2，3，4 Kasey Markel，1，2，3 Jordan Stefani，5 Max V. Staller，5，6，7 *和Patrick M. Shih 1，2，2，2，3，3，8，9，9，9， * 1工厂和微生物系，加利福尼亚大学，伯克利大学，CA 94720，CA 94720，USAD CACTUTTE 94608，美国3美国3环境基因组学和系统生物学部，劳伦斯·伯克利国家实验室，伯克利，CA 94720，美国4美国4号生物学系，Technische Universit，Darmstadt，64287 Darmstadt，DARMSTADT，DARMSTADT，DEMANY DEMANY，DEMANY 5 MATILIA of CALICALIA of CALICATION of CALICATIA美国伯克利，加利福尼亚州94720，美国7 Chan Zuckerberg Biohub-San Francisco，旧金山，CA 9415，美国8 Innovative Genomics Institute，加利福尼亚大学，伯克利分校，CA 94720，美国94720，美国9铅联系 *通讯 ），pmshih@berkeley.edu（p.m.s.） https://doi.org/10.1016/j.cels.2024.05.007Niklas F.C.Hummel，1，2，3，4 Kasey Markel，1，2，3 Jordan Stefani，5 Max V. Staller，5，6，7 *和Patrick M. Shih 1，2，2，2，3，3，8，9，9，9， * 1工厂和微生物系，加利福尼亚大学，伯克利大学，CA 94720，CA 94720，USAD CACTUTTE 94608，美国3美国3环境基因组学和系统生物学部，劳伦斯·伯克利国家实验室，伯克利，CA 94720，美国4美国4号生物学系，Technische Universit，Darmstadt，64287 Darmstadt，DARMSTADT，DARMSTADT，DEMANY DEMANY，DEMANY 5 MATILIA of CALICALIA of CALICATION of CALICATIA美国伯克利，加利福尼亚州94720，美国7 Chan Zuckerberg Biohub-San Francisco，旧金山，CA 9415，美国8 Innovative Genomics Institute，加利福尼亚大学，伯克利分校，CA 94720，美国94720，美国9铅联系 *通讯），pmshih@berkeley.edu（p.m.s.）https://doi.org/10.1016/j.cels.2024.05.007
系统鉴定植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域
Niklas F.C. Hummel，1，2，3，4 Kasey Markel，1，2，3 Jordan Stefani，5 Max V. Staller，5，6，7 *和Patrick M. Shih 1，2，2，2，3，3，8，9，9，9， * 1工厂和微生物系，加利福尼亚大学，伯克利大学，CA 94720，CA 94720，USAD CACTUTTE 94608，美国3美国3环境基因组学和系统生物学部，劳伦斯·伯克利国家实验室，伯克利，CA 94720，美国4美国4号生物学系，Technische Universit，Darmstadt，64287 Darmstadt，DARMSTADT，DARMSTADT，DEMANY DEMANY，DEMANY 5 MATILIA of CALICALIA of CALICATION of CALICATIA美国伯克利，加利福尼亚州94720，美国7 Chan Zuckerberg Biohub-San Francisco，旧金山，CA 9415，美国8 Innovative Genomics Institute，加利福尼亚大学，伯克利分校，CA 94720，美国94720，美国9铅联系 *通讯 ），pmshih@berkeley.edu（p.m.s.） https://doi.org/10.1016/j.cels.2024.05.007Niklas F.C.Hummel，1，2，3，4 Kasey Markel，1，2，3 Jordan Stefani，5 Max V. Staller，5，6，7 *和Patrick M. Shih 1，2，2，2，3，3，8，9，9，9， * 1工厂和微生物系，加利福尼亚大学，伯克利大学，CA 94720，CA 94720，USAD CACTUTTE 94608，美国3美国3环境基因组学和系统生物学部，劳伦斯·伯克利国家实验室，伯克利，CA 94720，美国4美国4号生物学系，Technische Universit，Darmstadt，64287 Darmstadt，DARMSTADT，DARMSTADT，DEMANY DEMANY，DEMANY 5 MATILIA of CALICALIA of CALICATION of CALICATIA美国伯克利，加利福尼亚州94720，美国7 Chan Zuckerberg Biohub-San Francisco，旧金山，CA 9415，美国8 Innovative Genomics Institute，加利福尼亚大学，伯克利分校，CA 94720，美国94720，美国9铅联系 *通讯），pmshih@berkeley.edu（p.m.s.）https://doi.org/10.1016/j.cels.2024.05.007
saccharomyces boulardii，一种新型的酵母益生菌...
背景：多囊卵巢综合征（PCOS）是生殖年龄妇女中最常见但最复杂的内分泌病之一，伴随着代谢改变。肠道菌群已被发现在PCOS的病理生理学和进一步发展中起着至关重要的作用。现有医疗管理的广泛副作用使得有必要不断寻找有效且安全的选择。saccharomyces boulardii，唯一具有独特特性的真核生物益生菌是唯一的酵母益生菌。假设：这项初步研究评估了Boulardii S. boulardii对PCOS-IR（具有胰岛素耐药性）大鼠模型的功效。材料和方法：在所有处女雌性Wistar大鼠中诱导了PCOS，其中1 mg/kg/kg/day的letrozole和高脂饮食（40％）饮食（40％），除了对照组21天。然后将大鼠与1.8×10 7 cfu /kg /day的冻干的S. boulardii共同使用。结果：S。boulardii通过恢复卵巢形态和代谢参数来防止PCOS进一步发展。结论：但是，这种机制可以归因于S. boulardii对PCOS的营养不良和代谢改变的可能归因。关键字：多囊卵巢综合征，糖疗法，胰岛素抵抗，letrozole，肠道微生物群，益生菌，代谢综合征。印度生理学和盟友杂志（2023）； doi：10.55184/ijpas.v75i03.194 ISSN：0367-8350（PRINT）
酿酒酵母的代谢工程用于生产canthaxanthin，Zeaxanthin和astaxanthin
摘要：自然化合物的可持续生产在当今的工业景观中越来越重要。这项研究研究了酿酒酵母的代谢工程，以有效的类胡萝卜素的有效生物合成：canthaxanthin，Zeaxanthin和astaxanthin。利用量身定制的父母酵母菌菌株SP_BC，我们通过筛选和识别CRTW和CRTZ酶变体来优化类胡萝卜素途径。Bradyrhizobium sp。的CRTW变体。达到了425.1±69.1 µg/L的canthaxanthin滴度，而Pantoea ananatis的CRTZ变体获得了70.5±10.8 µ g/l的Zeaxanthin滴度。此外，我们通过探索所有三个研究的类胡萝卜素和细胞器腔室的酶融合策略来优化类胡萝卜素的产生，专门用于增强astaxanthin合成。我们通过将最佳基因构建体整合到酵母基因组中并删除GAL80基因，从而进一步改善了类胡萝卜素的产生，从而可以将蔗糖用作碳源。在5 L生物反应器发酵中评估了工程菌株SP_BC-CAN001 ∆ GAL80，使用蔗糖获得了60.36±1.51 mg/l的明显canthaxanthin滴度。这项研究最终确定了酿酒酵母作为有效类胡萝卜素生物合成的可行平台，并且在该酵母菌系统中首次将蔗糖的生存能力作为碳素产生的碳源说明。这些发现为以工业规模的可持续性，具有成本效益的类胡萝卜素生产铺平了道路。
Komagataella phaffii（毕赤酵母）作为一种强大的酵母...
Komagataella phaffii (K. phaffii) (Pichia pastoris)，也称为生物技术酵母，是一种在生物技术和制药行业中具有多种应用的酵母菌种。这种甲基营养酵母作为重组蛋白的生产平台引起了人们的极大兴趣。它具有许多优点，包括有效的分泌表达，便于纯化异源蛋白，细胞密度高，生长迅速，翻译后变化，以及整合到基因组中的稳定基因表达。在过去的三十年里，K. phaffii 还被精炼为一个适应性强的细胞工厂，可以在实验室环境和工业规模上生产数百种生物分子。事实上，迄今为止，使用 K. phaffii 表达方法已经生成了 5000 多种重组蛋白，占细胞总蛋白的 30% 或总释放蛋白的 80%。除了已获得许可的 300 多种工业工艺外，K. phaffii 还用于制造 70 多种商业产品。其中包括对工业生物技术有用的酶，包括木聚糖酶、甘露聚糖酶、脂肪酶和植酸酶。其他是生物制药，包括人血清白蛋白、胰岛素、乙肝表面抗原和表皮生长因子。与其他表达系统相比，这种酵母还被认为是合成亚单位疫苗的特殊宿主，而亚单位疫苗最近已被替代疫苗类型所取代，例如灭活/杀死和减毒活疫苗。此外，通过多层次优化方法，如密码子偏好、基因剂量、启动子、信号肽和环境因素，可以实现重组蛋白的高效生产。因此，尽管 K. phaffii 表达系统高效、简单且工艺流程明确，但仍需确定理想条件，因为这些条件会根据目标蛋白而变化，以确保最高的重组蛋白生成量。本综述介绍了 K. phaffii 表达系统、其在工业和生物制药蛋白质生产中的重要性，以及一些高效蛋白质生产的生物加工和遗传改造策略。K. phaffii 最终将继续作为一种强大的表达系统在研究领域和工业应用中做出贡献。
益生菌编程：工程化布拉氏酵母菌中的饮食反应性基因表达和定植控制
摘要：布拉氏酵母菌 (Sb) 是一种新兴的益生菌底盘，用于将生物分子递送到哺乳动物肠道，作为唯一的真核益生菌，具有独特的优势。然而，精确控制 Sb 中的基因表达和肠道停留时间仍然具有挑战性。为了解决这个问题，我们开发了五个配体响应基因表达系统并修复了 Sb 中的半乳糖代谢，从而实现了该菌株中的可诱导基因表达。通过设计这些系统，我们可以构建 AND 逻辑门，控制蛋白质的表面展示，并启动小鼠肠道对饮食糖的反应，从而产生蛋白质。此外，修复半乳糖代谢扩大了 Sb 在肠道内的栖息地，并实现了对肠道停留时间的半乳糖响应控制。这项工作通过控制其体内基因表达水平和胃肠道内的定位，为 Sb 精确给药开辟了新途径。关键词：合成生物学、酵母、微生物组 ■ 简介
酵母的代谢工程，用于从头生产Kratom单二烯吲哚生物碱
来自Mitragyna Speciosa（MIAS）（MIAS）（MIAS）（“ Kratom”）（例如Mitragynine和Speciogynine）是阿片类药物受体配体的新型脚手架，用于治疗疼痛，成瘾和抑郁症。虽然在东南亚用作刺激性和疼痛管理物质已有数百年的历史，但这些精神活性的生物合成途径直到最近才被部分阐明。在这里，我们通过重建了来自普通MIA前体的五步合成途径，从而证明了酿酒酵母中的mitragynine和speciogynine，该途径由普通MIA PRECURSOR严格sillitersitor构成带有真菌性比喻的4-偶生酶，以绕过一个不知名的kratom kratom hydroxylase sydroxylase。在优化培养条件下，从葡萄糖中获得了〜290 µg/l kratom mias的滴度。铅生产菌株的无靶向代谢组学分析导致鉴定出众多的分流产物，这些分流产物是由严格os子氨酸合酶（Str）和二氢核南氨酸合酶（DCS）的活性得出的，突显了它们作为酶工程的候选物，以进一步改善kratom mias Mias在YEAST中的生产。最后，通过喂养氟化的色胺并表达人类的裁缝酶，我们进一步证明了氟化和羟基化的Mitragynine衍生物的产生，并在药物发现运动中可能采用潜在的应用。总的来说，这项研究引入了一个酵母细胞工厂平台，用于具有具有治疗潜力的复杂天然和新型Kratom MIAS衍生物的生物制造。