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使用唯一分子标识符从下一代测序中改进高分辨率拷贝数变化分析
摘要背景：最近，涉及致癌途径涉及的基因的拷贝数变化（CNV）引起了人们对管理疾病可疑性的越来越多的关注。CNV是肿瘤细胞基因组中最重要的体细胞像差之一。癌基因激活和肿瘤抑制基因失活通常归因于许多癌症类型和阶段的拷贝数增益/扩增或缺失。下一代测序方案的最新进展允许将唯一分子标识符（UMI）添加到每个读取中。每个靶向的DNA片段都用添加到测序引物中的独特随机核苷酸序列标记。umi通过使每个DNA分子在不同的读取群中使每个DNA分子与CNV检测特别有用。结果：在这里，我们提出了分子拷贝数改变（MCNA），这是一种新的甲基动态，允许使用UMI检测拷贝数变化。该算法由四个主要步骤组成：UMI计数矩阵的构建，使用控制样品构建伪参考，log-Ratios的计算，分割以及最后的统计推断异常分段断裂。我们证明了MCNA在患有弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的数据集上取得了成功，我们强调MCNA结果与比较基因组杂交具有很强的相关性。结论：我们提供了MCNA，这是一种新的CNV检测方法，可在https：// gitla b.com/pierr ejuli en.viail ly/mcNA/MCNA/MCNA/MCNA/MCNA/MCNA/MCNA/MCNA/MCNA许可下免费获得。MCNA可以通过使用UMI显着提高CNV变化的检测准确性。
在高分子量DNA提取
数十亿美元致力于推进测序技术。这导致了通过数量级的顺序和基于测序的应用程序爆炸的降低。但是，样品制备过程仍然是一个重要的瓶颈。手动处理样品时，样本质量，费力的协议和高样本成本仍然是可伸缩性和一致性的重要障碍。自动化液体处理程序可实现更高的吞吐量，但实施的重大障碍持续存在：昂贵的方法开发，高资本支出，对多重
高分辨率“地图”揭示了大脑内源性 NMDA 受体的结构和功能复杂性
在《细胞》杂志发表的一项研究中，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心朱树嘉团队与中国科学院上海药物研究所李阳团队解析了成年哺乳动物大脑皮层和海马体中内源性N-甲基-ᴅ-天冬氨酸受体（eNMDAR）的组装和结构。
量表，新颖壁ches的高分辨率微生物分析
（2）都柏林三一学院心理学学院（3）都柏林三一学院三一学院神经科学研究所（4）加利福尼亚大学伯克利分校的心理学系伯克利分校的抽象焦虑与额叶执行功能的缺陷有着牢固的联系。然而，尽管焦虑在学习任务方面的表现受损也与焦虑有关，但焦虑症中强化学习（RL）障碍的计算研究却产生了不同的结果。WM过程会导致与RL过程并行的学习行为，并调节有效的学习率随负载的函数。但是，WM过程通常没有在焦虑和RL的研究中进行建模。在当前的研究中，我们利用了一个实验范式（RLWM），该范式使用多个刺激集尺寸来操纵WM和RL过程在增强学习和保留任务中的相对贡献。使用交互式RL和WM过程的计算模型，我们研究了通过RL或WM中的缺陷来影响生理或认知焦虑症的个体差异。升高的生理学，但没有认知，焦虑评分与所有设置大小的学习和保留测试过程中的表现差异很强。在计算上，较高的生理焦虑评分与降低的学习率和WM衰减率提高显着相关。为了强调对WM对学习的贡献的重要性，我们考虑了在没有WM模块的情况下拟合RL模型的效果。在这里，我们发现，在考虑的10个仅RL模型中的9个中的9个中，至少将较高生理焦虑的学习绩效降低至至少部分错误地归因于随机决策噪声。这些发现揭示了在焦虑中学习的双重过程障碍，这与比认知焦虑表型更生理有关。更广泛地说，这项工作还表明，在研究与心理病理学相关的学习缺陷时，会计WM对RL的贡献的重要性。引言我们从世界经验中学习的能力是成功决策和最终生存的关键要素。以及精神病理学的其他方面，焦虑与学习障碍有关，包括学习较慢和表现降低（1）。增强学习模型（RL;（2）已成功地用于研究跨动物和人类学习的认知机制。将这项工作扩展到临床领域，RL模型已用于研究心理病理学对学习的影响（3）。在这里，关于确切的精确
Castellum在CDP气候排名中获得最高分数，并包括在《可持续性年鉴》中
对项目的气候要求更严格：从2025年开始，所有较大的新结构，扩展和重建旨在将其气候影响降低50％，而使用NOLLCO2标准计算得出的参考建筑物。与当前的建筑法规相比，办公室必须提高能源效率40％，物流必须提高30％，并且所有项目必须配备太阳能光伏系统。目标是使所有项目都是气候中立的。气候风险评估：Castellum分析了其整个财产组合，以识别和管理与气候变化相关的风险，例如洪水，水位和滑坡。目前认为Castellum财产组合中的气候风险为低，目标不是拥有严重气候风险的财产。工作环境：Castellum致力于在员工和承包商中造成零工作场所伤害和与工作相关的疾病。
使用IPSL模型的全球高分辨率模拟中的热带气旋
摘要尽管经过多年的广泛研究，但在我们不断变化的气候中，热带气旋（TC）活性的演变仍然不确定。这部分是因为该问题的答案主要依赖于几十公里的水平分辨率的气候模拟。此类仿真直到最近才能用于大多数建模中心，包括Pierre-Simon Laplace研究所（IPSL）。使用IPSL模型中的最新数值发展，我们执行了一系列仅遵循大气层的历史模拟，这些模拟遵循大气压协议。我们评估将分辨率从200公里增加到25公里对TC活性的影响。与以前的工作一致，我们发现TC活动的系统改善，相对于观察值的分辨率增加。然而，仍然缺乏与分辨率转化的TC频率的明确签名。环地理分布在单个盆地的规模上也有所改善。在北大西洋上尤其如此，在北大西洋上，与观察到的分布的一致在25公里处令人印象深刻。与观测值一致，TC活动与该盆地中的大规模环境和ENSO相关。相比之下，在北太平洋西部的25公里处，TC频率仍然太小，与重新分析相比，发现湿度和涡度的明显偏见。尽管我们发现了几个小弱点，但我们的结果表明，IPSL模型是研究气候时间尺度上TC的合适工具。因此，这项工作为进一步的研究开辟了道路，从而有助于我们对TC气候学的理解。
通过小鼠的整个生命的肠道微生物组的高分辨率时间分析1
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月10日发布。 https://doi.org/10.1101/2022.11.07.515511 doi：Biorxiv Preprint
在河口系统中具有非常高分辨率的遥感图像的潮间带微生物生物量
Microphytobenthos（MPB）对河口初级生产产生了重大贡献，因此量化其生物量对于评估其生态系统功能至关重要。传统的抽样方法是劳动的，在逻辑上具有挑战性，无法提供MPB生物量的全面空间分布图。卫星图像提供了一种可行的替代方法，用于绘制各种时间和空间分辨率的大面积。但是，在该场中使用了与原位采样的少量平方Centi米一致的空间分辨率的成像设备。这使得将现场生物量测量与远程感知的辐射测量值相关联。在这项研究中，在不同高度的无人机（UAV）上安装了两个类似的多光谱传感器，以及在〜1 m高度上获得图像的定制设备上，以收集guadalquivir estuta（SpataLquivir estuta）mudflats mudflats mpb Biofilms的非常高的空间分辨率反射数据。此外，使用高光谱谱仪获得原位反射率进行验证。同时，使用2 mM深度接触Corer方法收集了MPB样品，该方法通过高性能液相色谱（HPLC）分析，以测量主要MPB颜料的浓度。为了评估MPB色素和不同反射率的光谱指数，使用了广义的线性混合效应模型（GLMM），从而实现了叶绿素与所有测试的光谱指数之间的显着正相关关系。这些模型用于绘制微卵巢生物量，在
对速度的需求：一线医院微生物学实验室中的超优化高分辨率爆发分析
。CC-BY 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以显示预印本（未经同行评审认证）的预印本版权持有人此版本发布于2025年2月10日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.04.25321496 doi：medrxiv preprint
基于尖锐的纳米制动尖端的高分辨率光子力显微镜
图1：提示制造和光学设置。a）微加工过程。圆柱颗粒是通过激光干扰光刻产生的，蚀刻了一个石英底物，其中沉积了800 nm厚的SIO 2层。HF的调谐酸变薄会在SIO 2层中产生锋利的尖端。然后将粒子机械地裂解底物。b）切割颗粒的扫描电子显微镜图像，其中一个尖端的对比度已得到增强，以清晰度。尖端的曲率半径为35 nm。c）光学陷阱的示意图，固定粒子并用锋利的尖端扫描样品表面。d）示意性光学设置。L/2: half-wave plate, PBS: polarizer, AOM: acousto-optical modulator, NPBS: non-polarizing beam splitter, Exp: beam expander, T1:1 : one to one telescope, Obj: Objective, Cond: Condenser, PD: photodiode (to acquire S z ), PSD: position sensitive detector (to acquire S x,y ), IRCCD: infra red CCD camera, VISCCD：可见的CCD相机。）