隶属关系:1个肠道微生物与健康计划,Quadram Institute Bioscience,Norwich Research Park,Norwich,NR4 7AU,英国。2伯爵研究所,诺里奇研究公园,诺里奇,NR4 7UZ,英国。3东安格利亚大学医学与健康科学学院,诺里奇研究园,诺里奇,NR4 7TJ,英国。4当前隶属关系:谢菲尔德大学生物医学科学系,英国S10 2TN。5感染,免疫与炎症研究所免疫生物学中心,医学院,兽医医学与生命科学学院,格拉斯哥大学,G12 8TA,英国。6 Department of Microbiology, Immunology, and Cancer Biology, University of Virginia, Charlottesville, VA, 22908, USA 7 Molecular Targeting Unit, Department of Research, Fondazione IRCCS Instituto Nazionale di Tumori, Milan, 20133, Italy 8 Department of Internal Medicine, Division of Molecular Oncology, Washington University in St Louis, St. Louis, MO, 63110, USA.9 ZIEL生命科学学院肠道微生物组主席 - 慕尼黑技术大学食品与健康研究所,德国85354,德国弗莱里10号生物科学学院,东安格利亚大学,诺里奇研究公园,诺威奇,诺里奇,NR4 7TJ,英国NR4 7TJ。9 ZIEL生命科学学院肠道微生物组主席 - 慕尼黑技术大学食品与健康研究所,德国85354,德国弗莱里10号生物科学学院,东安格利亚大学,诺里奇研究公园,诺威奇,诺里奇,NR4 7TJ,英国NR4 7TJ。
1 诺维奇医学院医学系,东英吉利大学,诺福克 NR4 7TJ,英国 2 诺福克和诺维奇大学医院 NHS 基金会心脏病学系,诺福克 NR4 7UY,英国 3 谢菲尔德大学感染、免疫与心血管疾病系,谢菲尔德 S10 2RX,英国 4 谢菲尔德教学医院 NHS 基金会临床放射学系,谢菲尔德 S10 2JF,英国 5 诺森比亚医疗基金会,诺森比亚专科护理急救医院,诺森伯兰 NE23 6NZ,英国 6 莱顿大学医学中心放射学系、图像处理分部,莱顿 2333 ZA,荷兰 7 上海交通大学医学院上海儿童医学中心放射学系,上海市东方路 1678 号200127,中国 8 新加坡国家心脏研究所,新加坡国家心脏中心,5 Hospital Drive,新加坡 169609,新加坡 9 心血管科学,杜克-新加坡国立大学医学院,8 College Road,新加坡 169856,新加坡 * 通讯地址:p.garg@uea.ac.uk
a quadram institute bioscience, Norwich Research Park, Norwich NR4 7UQ, United Kingdom B Department of Pathobiology, University of Guelph, Guelph N1G 2W1, Canada C Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba R3E 3R2, Antibioresistance and bacterial virulence, ANSES- University of Lyon, Lyon 69007, France e Intestin microbes In fl ammation and susceptibility of the host (M2ISH), Faculty of Medicine, Clermont Auvergne University, Clermont- Ferrand 63001, France F National Reference Center for Antibiotics, Center Hospitalier universitaire-Ferrand, Clermont- Ferrand 63000, France G Institute of Microbiology and Epizootics, School of Veterinary Medicine, Freie柏林大学,柏林大学,14163年,德国H兽医阻力研究中心(TZR),柏林弗里大学兽医医学院,柏林,柏林,柏林14163医学微生物学和传染病,Max Rady医学院,Rady Health Secunty of Manitoba,Manitizization of Manitizistion of Manitizization of Winnipeg,Manitoba Rytoba,Manitoba Rynipeba,Manitoba Rybar3e999999999。抗生素单元监测抗生素的抵抗力,联邦保护和食品安全,柏林12277,德国K东安格利亚大学,诺里奇NR4 NR4 7TJ,英国
3 MPGS 卡特里克 ITC DL9 3JS 4 MPGS 迪什福斯机场 YO7 3EZ 5 MPGS 爱丁堡 - 德雷格霍恩 EH13 9QW 6 MPGS 爱丁堡 - 雷德福德 EH13 9QW 7 MPGS 哈罗盖特 HG3 2SE 8 MPGS 因弗内斯 IV2 7TD 9 MPGS 金洛斯 IV36 3UH 10 MPGS 莱康菲尔德 HU17 7LX 11 MPGS 洛查斯 KY16 0JX 12 MPGS 佩尼库克 EH26 0NP 13 MPGS 里彭 HG4 2RD 14 MPGS 斯特伦萨尔 YO32 5SW 15 MPGS 瑟斯克 YO7 3EY 16 MPGS 约克 YO10 4HD 17 MPGS 巴辛伯恩 SG85 5LX 18 MPGS 布拉姆科特 CV11 6QN 19 MPGS 切斯特 NP16 7YG 20 MPGS 奇尔韦尔 NG9 5HA 21 MPGS 科尔切斯特 CO2 7UT 22 MPGS 科特斯莫尔 LE15 7BQ 23 MPGS 唐宁顿 TF2 8LS 24 MPGS 格兰瑟姆 NG31 7TJ 25 MPGS 金顿 CV47 2UL 26 MPGS 梅尔顿莫布雷 LE13 0GX 27 MPGS 北拉芬汉姆 LE15 8RL 28 MPGS 斯塔福德 ST18 0AQ 29 MPGS 斯旺顿莫利 NR20 4QD 30 MPGS 特恩希尔 TF9 3QE 31 MPGS 瓦蒂瑟姆** IP7 7RA 32 MPGS 威顿 PR4 3JQ 33 MPGS 温比什 CB10 2YA 34 MPGS 伍德布里奇 IP12 3LU 35 MPGS 阿宾登 OX13 6JA
1 School of International Development, University of East Anglia, Norwich Research Park, Norwich NR4 7TJ, UK 2 Centre for the Synthesis and Analysis of Biodiversity (CESAB), French Foundation for Research on Biodiversity (FRB), 34000 Montpellier, France 3 Fund for Scientific Research (FNRS), 1000 Brussels, Belgium 4 Institute for the Analysis of Change in Contemporary and Historical社会,加州大学卢旺分校,1348年,比利时5号卢旺林 - 纽约州5塔塔社会科学研究所,印度孟买6印度6号国际环境与发展研究所,伦敦,英国7国际环境与发展研究所7气候变化,48940 Leioa,西班牙10植物学和生物多样性研究系,维也纳大学,维也纳大学,奥地利1030,奥地利1030号,11335 Leuphana University,Leuphana University,21335 L€Uneburg,德国12个实验室12实验室de ciencias de ciencias de ciencias de la sostenibis de sostenibis decolitad nocion nocion nocion nocion nocion nocion nocion nocion nocion nocion nocion nociogin” de Me´ xico, Mexico City, Me´ xico 13 Central Department of Sociology, Tribhuvan University, Kirtipur, Kathmandu 44618, Nepal 14 Amazon Frontlines, Lago Agrio, Ecuador 15 Ikerbasque Basque Foundation for Science, 48009 Bilbao, Spain *Correspondence: neil.nawson@uea.ac.uk (N.M.D.),brendan.coolsaet@uclouvain.be(b.c。)https://doi.org/10.1016/j.oneear.2024.05.001https://doi.org/10.1016/j.oneear.2024.05.001
2 启示 3 4 5 Evgeny S. Gerasimov a# 、 Dmitry A. Afonin a# 、 Oksana A. Korzhavina a 、 Julius Lukeš b,c 、 Ross Low d 、 Neil Hall d 、 6 Kevin Tyler e 、 Vyacheslav Yurchenko f * 、 Sara L. Zimmer g * 7 8 9 a 分子生物学系,罗蒙诺索夫莫斯科国立大学,莫斯科 119234,俄罗斯 10 jalgard@gmail.com (ESG)、afoninmsu@outlook.com (DAA)、korzhavina.oksana.bio.msu@gmail.com 11 (OAK) 12 13 b 寄生虫学研究所,生物中心,捷克科学院,370 05 捷克布杰约维采,捷克14 jula@paru.cas.cz (JL) 15 16 c 南波西米亚大学科学学院,370 05 捷克布杰约维采,捷克 17 18 d 厄尔汉姆研究所,诺维奇研究园区,诺维奇 NR4 7UZ,英国 19 Ross.Low@earlham.ac.uk(RL),neil.hall@earlham.ac.uk(NH) 20 21 e 诺维奇医学院,东英吉利亚大学,诺维奇 NR4 7TJ,英国 22 K.Tyler@uea.ac.uk(KT) 23 24 f 生命科学研究中心,俄斯特拉发大学科学学院,710 00 俄斯特拉发,捷克 25 vyacheslav.yurchenko@osu.cz(VY) 26 27 g 明尼苏达大学医学院,德卢斯校区,明尼苏达州德卢斯,55812,美国 28 szimmer3@d.umn.edu (SLZ) 29 30 # 平等贡献 31 * 通信地址 32 33
1英国东安格利亚大学诺里奇医学院,英国诺里奇NR4 7TJ; 2瑞典哥德堡大学医学院Sahlgrenska学院分子与临床医学系; 3瑞典LinköpingLinköpingUniversity物理治疗部医学与健康科学系; 4临床,麻醉和心血管科学系,内科,意大利罗马萨皮恩扎大学; 5意大利拉丁美洲萨皮恩扎大学医学外科科学与生物技术系; 6 Mutiterranea Cardiocentro,意大利那不勒斯; 7英国皇家布罗姆普顿医院和英国伦敦帝国学院; 8比利时哈塞尔特杰萨医院的心脏中心哈塞尔特; 9比利时哈塞尔特大学哈塞尔特大学的Reval/Biomed(康复研究中心); 10 DZHK(德国心血管研究中心),德国柏林合作伙伴网站; 11弗里德·斯普林格(Friede Springer),德国柏林柏林大学医学的Charité的心血管预防中心; 12 Deutsches Herzzentrum derCharité,KlinikFürKardiologie,Angiologie und Intensivmedizin,Benjamin-Franklin校园(CBF),Charité大学医学柏林,12203柏林,德国,德国; 13伯尔尼大学医院心脏病学系 - 瑞士伯尔尼大学的Inselspital; 14大学运动医学,预防与康复研究所,以及奥地利萨尔茨堡的Paracelsus医科大学分子运动医学与康复研究所; 15西班牙马德里马德里大学医学院医学系; 16西班牙马德里的圣安德烈斯初级保健中心; 17诺福克和诺里奇大学医院心脏病学系,诺里奇NR4 7UY,英国
收到日期:2020 年 2 月 21 日;接受日期:2020 年 5 月 28 日;发布日期:2020 年 6 月 19 日 作者隶属关系:1 英国东英吉利大学生物科学学院,诺里奇研究园区,诺里奇,诺福克 NR4 7TJ,英国;2 英国斯特拉斯克莱德大学斯特拉斯克莱德药学和生物医学科学研究所,格拉斯哥大教堂街 161 号,G4 0RE,英国;3 英国兰开夏郡 Edge Hill 大学生物系,L39 4QP;4 英国诺里奇约翰英纳斯中心分子微生物学系,NR4 7UH。 *通讯作者:Thomas C. McLean,T.mclean@uea.ac.uk 关键词:ActinoBase;放线菌;抗生素;发展;方法学;微生物生态学;调节;特殊代谢物;链霉菌;共生。缩写:antiSMASH,抗生素和次级代谢物分析壳;ARTS,抗生素耐药性靶向搜索者;BCI,巴罗科罗拉多岛;BGC,生物合成基因簇;c-di-GMP,3',5'-环二鸟苷酸;ChIP-seq,染色质免疫沉淀测序;DSB,双链断裂;EHEC,肠出血性大肠杆菌;EPEC,肠致病性大肠杆菌;GMC,共同进化的地理马赛克理论;GNPS,全球天然产物社会分子网络;GPA,糖肽抗生素;GPA,糖肽抗生素;HMM,隐马尔可夫模型;ISBA,放线菌生物学国际研讨会;LEE,肠细胞消除位点;MAG,宏基因组组装基因组;NRPS,非核糖体肽合成酶; PKS,聚酮合酶;RiPP,核糖体合成和翻译后修饰肽;SNP,单核苷酸多态性;TCS,双组分系统;T3SS,III 型分泌系统;WGS,全基因组测序。† 这些作者对本作品的贡献相同 000944 © 2020 作者
1 伯尔尼大学医院 Inselspital 心脏病学系,伯尔尼大学弗莱堡大街 46 号,3010 瑞士伯尔尼; 2 心脏病学服务,圣玛丽亚大学医院/里斯本北大学医院中心 (CHULN),里斯本学术医学中心 (CAML),里斯本大学心血管中心 (CCUL),Avenida Professor Egas Moniz,1649-035 里斯本,葡萄牙; 3 摩纳哥公国世界田径协会卫生与科学部,6-8 Quai Antoine 1er,98007 Monaco,摩纳哥; 4 心脏康复科,ASST,Via Medaglie D'Oro, 9, 26013 Crema,意大利; 5 斯皮利初级保健中心,克里特岛区域卫生系统,斯皮利 740 53,希腊; 6 意大利锡耶纳大学医学生物技术系、心脏病学系,Viale Mario Bracci 16,53100 锡耶纳; 7 Med-Ex 医学与运动,法拉利车队医疗合作伙伴,Via Vittorio Veneto 108,00187 罗马,意大利; 8 罗马大学医学科学与生物技术系,Corso della Repubblica 97,04100 Latina,意大利; 9 Mediterranea Cardiocentro,Via Orazio, 2,意大利那不勒斯 80122; 10 爱尔兰国家心血管健康与预防研究所,莫约拉巷,纽卡斯尔,戈尔韦 H91 FF68,爱尔兰; 11 荷兰乌得勒支 3584 CX 尤利乌斯健康科学与初级保健中心和乌得勒支大学医学中心; 12 康复和二级预防部,Corentin Celton 医院,巴黎大学中心公共医院,Parvis Corentin Celton 4,92130 Issy-les-Moulineaux,巴黎,法国; 13 洛桑大学医院 (CHUV) 内科部,Rue du Bugnon 46, 1011 洛桑,瑞士; 14 欧洲预防中心,杜塞尔多夫医疗中心,Luise-Rainer-Straße 6-10,40235 杜塞尔多夫,德国; 15 伦敦大学圣乔治医院心血管临床学术组,伦敦 SW17 0RE,英国; 16 意大利皮亚琴察 29121 帕尔马大学 Guglielmo da Saliceto 医院心脏科; 17 英国东英吉利大学心血管医学系,诺里奇研究园区,诺里奇 NR4 7TJ; 18 爱尔兰国立高威大学国家心血管健康与预防研究所,爱尔兰高威 H91 TK33 大学路; 19 伦敦帝国理工学院国家心肺研究所,伦敦 SW3 6LY,英国; 20 哈瑟尔特心脏中心和哈瑟尔特大学,比利时 3500 哈瑟尔特;以及 21 慕尼黑工业大学伊萨尔右岸大学医院、德国心血管研究中心预防和运动医学系,Georg-Brauchle-Ring 56,80992 慕尼黑,德国
