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艾伦古代 DNA 资源 (AADR) - David Reich 实验室
艾伦古代 DNA 资源 (AADR)：古代人类基因组精选概要 Swapan Mallick 1,2,3 、Adam Micco 1,3 、Matthew Mah 1,3 、Harald Ringbauer 4,5, 、Iosif Lazaridis 1,4 、Iñigo Olalde 1,6 Nick Patterson 2,4 和 David Reich 1,2,3,4 1 哈佛大学遗传学系医学院，波士顿，MA 02115，美国。 2 麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所，剑桥，MA 02142，美国。 3 霍华德休斯医学研究所，波士顿，MA 02115，美国。 4 哈佛大学人类进化生物学系，剑桥，MA 02138，美国。 5 马克斯·普朗克进化人类学研究所，莱比锡 04103，德国。 6 BIOMICs 研究小组，巴斯克大学，01006 维多利亚，西班牙。通信地址：shop@genetics.med.harvard.edu 和 reich@genetics.med.harvard.edu。已有两百多篇论文报告了古人类的全基因组数据。虽然绝大多数原始数据都是完全公开的，证明了古基因组学界对开放数据的承诺，但原始数据和元数据的格式各不相同。因此需要统一的管理和一个集中的、版本控制的汇编，供研究人员下载、分析和参考。自 2019 年以来，我们一直在维护艾伦古 DNA 资源 (AADR)，旨在提供全球已发表古人类 DNA 数据的最新、精选版本，这些数据包含超过一百万个单核苷酸多态性 (SNP)，几乎所有古代个体都经过了检测。自首次发布以来，AADR 已公开发布六次，并于 2022 年底突破了 10,000 多名拥有全基因组数据的古代个体的门槛。本文旨在作为 AADR 的可引用描述。第一批全基因组古代 DNA 数据于 2010 年发布 [1-3]。然而，直到 2015 年，随着全新世基因组大规模研究的出现、针对目标单核苷酸多态性 (SNP) 的古代 DNA 文库溶液中富集 [4-6] 以及用于处理古代 DNA 文库的自动化协议和液体处理机器人的引入 [7, 8]，拥有全基因组数据的个体数量才开始迅速增加。2010 年至 2014 年间，每年平均发布约 10 名拥有全基因组数据的个体的数据。2015 年至 2017 年间，这一数字增加到每年约 200 人。自 2018 年以来，每年都有数千名个体的数据被发表（图 1）。迄今为止，古代 DNA 数据集中在欧亚大陆西部，但越来越多的数据来自世界其他地区（图 2）。分析古代 DNA 的一个挑战是个体分布在许多独立的研究中。因此，虽然超过 99% 的个体的原始序列数据在公共存储库中完全可用 [9]，但上传的数据以多种格式存在，元数据也是如此，例如考古、年代、和地理信息。有些资源
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此外，我有责任： • 告知学院我的需求。 • 填写必要的注册表格以申请便利设施和支持服务。 • 向学院提供我的残疾证明，以便根据《美国残疾人法案》（ADA）获得便利设施。 • 与每位教师一起审查我想在他们的课程中使用哪些经批准的便利设施。 • 当我需要阅读器或私人测试室时，至少提前三个工作日向 Learning Commons – Testing Services 或 Student Services of PA 预约。 • 遵守有关便利设施和服务请求的所有政策和程序。 • 努力尽可能独立。 • 以礼貌和尊重的态度对待教职员工。 • 积极参与课程活动，对我的教育承担个人责任。 • 审查我的便利设施并了解其限制。如果我有任何疑问，我将尽快联系 AADR 办公室。 • 当我不再需要所要求的便利设施时，通知 AADR。 • 如果教师没有提供商定的便利设施，请联系 AADR。 • 如果我的需求未得到满足，请向 AADR 报告任何申诉。
2024年2月Geelsu Hwang，博士家庭地址
2024 IADR Innovation in Oral Care Awards 2023 Finalist, Discovering the Future Grant Program, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA 2023-25 Visiting Professor, Department of Chemical and Biomolecular Engineering, College of Engineering, Yonsei University, Seoul, South Korea 2022 Schoenleber pilot grant, University of Pennsylvania, School of Dental Medicine,费城，宾夕法尼亚州2021决赛入围者，科学中心的QED验证验证计划（来自参与机构的早期生命科学技术的商业化和商业援助），费城，宾夕法尼亚州2021年宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚大学的宾夕法尼亚大学，宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学，宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学校园研究，乔瑟夫奖学金，jose and jose rabinialssy in Corce forcorce of josen in Corce in Corce in Corce in Corce in Corrice of Acressirial in Corce forcorce。宾夕法尼亚州费城牙科医学，2016年AADR旅行奖，宾夕法尼亚州牙科医学院，宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚大学牙科医学学院，宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学，2014年AADR旅行奖，宾夕法尼亚州牙科研究静修学院，宾夕法尼亚大学，宾夕法尼亚大学，宾夕法尼亚大学，宾夕法尼亚州宾夕法尼亚大学，宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州纽约市校园，纽约市。 2004年，2004年韩国首尔大学博士奖学金，2002 - 03年，韩国首尔Yonsei大学的本科奖学金
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