背景信息APEX1(也称为APE,APE1,HAP1和REF-1)属于DNA修复酶AP/EXOA家族。这是一种多功能蛋白,在细胞对氧化应激的反应中起着核心作用。APEX1的两个主要活动是在DNA修复和转录因子的氧化还原调节中。APEX核酸酶是一种具有apurinic/apyrimidinic(AP)核酸内切酶,3- prime,5-Prime-脱核酸酶,DNA 3-Prime Repair二酯酶和DNA 3-Prime-phosprime-磷酸酶活性的DNA修复酶。另一方面,APEX1还发挥可逆的核氧化还原活性来调节DNA结合亲和力和转录因子的转录活性,通过控制其DNA结合结构域的氧化还原状态,例如暴露于IR后的FOS/JUN AP-1复合物。APEX1通过与负钙反应元件(NCARES)结合来参与甲状旁腺激素(PTH)表达的钙依赖性下调。当在Lys-6和Lys-7处进行乙酰化时,APEX1刺激YBX1介导的MDR1启动子活性,从而导致耐药性。它也充当了一种控制单链RNA代谢的内核酸酶。它通过优先在MYC编码区域决定因素(CRD)的UA和CA二核苷酸之间切割来调节MYC mRNA更新。与NMD1相关,APEX1在细胞周期进程过程中在RRNA质量控制过程中起作用。
癌症将直接影响超过三分之一人口的生活。DNA损伤反应 (DDR) 是一个复杂的系统,涉及损伤识别、细胞周期调控、DNA 修复以及最终的细胞命运决定,在癌症病因和治疗中发挥着核心作用。涉及 DDR 靶向的两种主要治疗方法包括:采用抗癌基因毒性剂的组合疗法;以及合成致死,利用散发性 DDR 缺陷作为癌症特异性治疗的机制。尽管许多 DDR 蛋白已被证明“无法用药”,但基于片段和结构的药物发现 (FBDD、SBDD) 已推进了治疗剂的鉴定和开发。FBDD 已促成 4 种药物(另有约 50 种药物处于临床前和临床开发阶段),而据估计,SBDD 已促成 200 多种 FDA 批准药物的开发。基于蛋白质 X 射线晶体学的片段库筛选,特别是针对难以捉摸或“无法用药”的靶标,可以同时生成命中结果以及蛋白质-配体相互作用和结合位点(正构或变构)的详细信息,从而为化学可处理性、下游生物学和知识产权提供信息。使用一种新型的高通量基于晶体学的片段库筛选平台,我们筛选了五种不同的蛋白质,命中率约为 2 e 8%,晶体结构约为 1.8 至 3.2 Å。我们考虑了当前的 FBDD/SBDD 方法和一些设计针对 DDR 核酸酶减数分裂重组 11(MRE11,又名 MRE11A)、无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶 1(APE1,又名 APEX1)和 flap 核酸内切酶 1(FEN1)的抑制剂的示例性结果。© 2020 作者。由 Elsevier Ltd. 出版。这是一篇根据 CC BY-NC-ND 许可协议 ( http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ ) 开放获取的文章。
癌症将直接影响超过三分之一人口的生活。DNA损伤反应 (DDR) 是一个复杂的系统,涉及损伤识别、细胞周期调控、DNA 修复以及最终的细胞命运决定,在癌症病因和治疗中发挥着核心作用。涉及 DDR 靶向的两种主要治疗方法包括:采用抗癌基因毒性剂的组合疗法;以及合成致死,利用散发性 DDR 缺陷作为癌症特异性治疗的机制。尽管许多 DDR 蛋白已被证明“无法用药”,但基于片段和结构的药物发现 (FBDD、SBDD) 已推进了治疗剂的鉴定和开发。FBDD 已促成 4 种药物(另有约 50 种药物处于临床前和临床开发阶段),而据估计,SBDD 已促成 200 多种 FDA 批准药物的开发。基于蛋白质 X 射线晶体学的片段库筛选,特别是针对难以捉摸或“无法用药”的靶标,可以同时生成命中结果以及蛋白质-配体相互作用和结合位点(正构或变构)的详细信息,从而为化学可处理性、下游生物学和知识产权提供信息。使用一种新型的高通量基于晶体学的片段库筛选平台,我们筛选了五种不同的蛋白质,命中率约为 2 e 8%,晶体结构约为 1.8 至 3.2 Å。我们考虑了当前的 FBDD/SBDD 方法和一些设计针对 DDR 核酸酶减数分裂重组 11(MRE11,又名 MRE11A)、无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶 1(APE1,又名 APEX1)和 flap 核酸内切酶 1(FEN1)的抑制剂的示例性结果。© 2020 作者。由 Elsevier Ltd. 出版。这是一篇根据 CC BY-NC-ND 许可协议 ( http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ ) 开放获取的文章。
